MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 47491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007181	TCCAAA	2	12	44521	44532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70605911
1003	NC_007181	GA	3	6	44546	44551	50 %	0 %	50 %	0 %	70605911
1004	NC_007181	CCA	2	6	44630	44635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70605911
1005	NC_007181	TCA	2	6	44688	44693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605911
1006	NC_007181	TGA	2	6	44740	44745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605911
1007	NC_007181	AAG	2	6	44783	44788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605911
1008	NC_007181	AGA	2	6	44809	44814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605911
1009	NC_007181	AG	3	6	44866	44871	50 %	0 %	50 %	0 %	70605911
1010	NC_007181	AGATC	2	10	44900	44909	40 %	20 %	20 %	20 %	70605911
1011	NC_007181	GTCA	2	8	44944	44951	25 %	25 %	25 %	25 %	70605911
1012	NC_007181	TGAA	2	8	45075	45082	50 %	25 %	25 %	0 %	70605911
1013	NC_007181	AT	3	6	45092	45097	50 %	50 %	0 %	0 %	70605911
1014	NC_007181	AAAG	2	8	45160	45167	75 %	0 %	25 %	0 %	70605911
1015	NC_007181	A	6	6	45189	45194	100 %	0 %	0 %	0 %	70605911
1016	NC_007181	GAG	2	6	45215	45220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605911
1017	NC_007181	AGA	3	9	45317	45325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605911
1018	NC_007181	GTTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	70605911
1019	NC_007181	AGGTA	2	10	45370	45379	40 %	20 %	40 %	0 %	70605911
1020	NC_007181	CT	3	6	45409	45414	0 %	50 %	0 %	50 %	70605911
1021	NC_007181	CT	3	6	45454	45459	0 %	50 %	0 %	50 %	70605911
1022	NC_007181	AAT	2	6	45497	45502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605911
1023	NC_007181	GAA	2	6	45514	45519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605911
1024	NC_007181	TCGTT	2	10	45538	45547	0 %	60 %	20 %	20 %	70605911
1025	NC_007181	AT	3	6	45576	45581	50 %	50 %	0 %	0 %	70605911
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1027	NC_007181	CT	3	6	45695	45700	0 %	50 %	0 %	50 %	70605911
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1029	NC_007181	AAG	2	6	45775	45780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605911
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1033	NC_007181	ATG	2	6	45995	46000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605912
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1045	NC_007181	TTTA	2	8	46708	46715	25 %	75 %	0 %	0 %	70605913
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1047	NC_007181	TAG	2	6	46783	46788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605913
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1055	NC_007181	CT	3	6	47599	47604	0 %	50 %	0 %	50 %	70605914
1056	NC_007181	TAT	2	6	47621	47626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605914
1057	NC_007181	T	6	6	47626	47631	0 %	100 %	0 %	0 %	70605914
1058	NC_007181	CTC	2	6	47719	47724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605914
1059	NC_007181	TACT	2	8	47812	47819	25 %	50 %	0 %	25 %	70605914
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1062	NC_007181	CTA	2	6	47971	47976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605914
1063	NC_007181	T	6	6	48024	48029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007181	GCC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_007181	ACC	2	6	48060	48065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_007181	CTAG	2	8	48119	48126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_007181	TTA	2	6	48135	48140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_007181	TTTA	2	8	48363	48370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1075	NC_007181	AAG	2	6	48461	48466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605915
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1092	NC_007181	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_007181	AAT	2	6	49156	49161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_007181	ATC	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_007181	CAA	2	6	49223	49228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007181	ATC	2	6	49302	49307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_007181	TAGA	2	8	49329	49336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007181	ATT	2	6	49393	49398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605917
1101	NC_007181	ACG	2	6	49422	49427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70605917
1102	NC_007181	TGA	2	6	49440	49445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605917
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1107	NC_007181	AT	3	6	49559	49564	50 %	50 %	0 %	0 %	70605917
1108	NC_007181	CTG	2	6	49568	49573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605917
1109	NC_007181	TCGT	2	8	49609	49616	0 %	50 %	25 %	25 %	70605917
1110	NC_007181	AT	3	6	49619	49624	50 %	50 %	0 %	0 %	70605917
1111	NC_007181	TGA	2	6	49626	49631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605917
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1113	NC_007181	TAG	2	6	49700	49705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605917
1114	NC_007181	CTATA	2	10	49743	49752	40 %	40 %	0 %	20 %	70605917
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1118	NC_007181	TTG	2	6	50093	50098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605917
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1122	NC_007181	GGA	2	6	50296	50301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605917
1123	NC_007181	TGAT	2	8	50345	50352	25 %	50 %	25 %	0 %	70605917
1124	NC_007181	TGA	2	6	50394	50399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605917
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1128	NC_007181	TGG	2	6	50585	50590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70605917
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1130	NC_007181	ACTGA	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	70605917
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1451	NC_007181	ATTT	2	8	64665	64672	25 %	75 %	0 %	0 %	70605933
1452	NC_007181	GGTA	2	8	64686	64693	25 %	25 %	50 %	0 %	70605933
1453	NC_007181	AG	3	6	64704	64709	50 %	0 %	50 %	0 %	70605933
1454	NC_007181	TTA	2	6	64735	64740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605933
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1461	NC_007181	AAG	2	6	65051	65056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605934
1462	NC_007181	TGA	2	6	65128	65133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605934
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1497	NC_007181	GAAAG	2	10	66817	66826	60 %	0 %	40 %	0 %	70605938
1498	NC_007181	TTCT	2	8	66914	66921	0 %	75 %	0 %	25 %	70605939
1499	NC_007181	GCT	2	6	67083	67088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605939
1500	NC_007181	TAC	2	6	67095	67100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605939

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