MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 47491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007181	TTA	3	9	23274	23282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605887
502	NC_007181	TCC	2	6	23294	23299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605887
503	NC_007181	TTAAA	2	10	23335	23344	60 %	40 %	0 %	0 %	70605887
504	NC_007181	TC	3	6	23348	23353	0 %	50 %	0 %	50 %	70605887
505	NC_007181	CTC	2	6	23363	23368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605887
506	NC_007181	GAA	2	6	23392	23397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605887
507	NC_007181	CTG	2	6	23407	23412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605887
508	NC_007181	TTTC	2	8	23508	23515	0 %	75 %	0 %	25 %	70605887
509	NC_007181	TCA	2	6	23540	23545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605887
510	NC_007181	TAT	2	6	23613	23618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605888
511	NC_007181	TCC	2	6	23619	23624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605888
512	NC_007181	CTC	2	6	23661	23666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605888
513	NC_007181	GTT	2	6	23698	23703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605888
514	NC_007181	TTA	2	6	23735	23740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605888
515	NC_007181	CGTCCT	2	12	23747	23758	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	70605888
516	NC_007181	GTA	2	6	23783	23788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605888
517	NC_007181	TAT	2	6	23814	23819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605888
518	NC_007181	TAAG	2	8	23847	23854	50 %	25 %	25 %	0 %	70605888
519	NC_007181	AGCT	2	8	23856	23863	25 %	25 %	25 %	25 %	70605888
520	NC_007181	CTG	2	6	23870	23875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605888
521	NC_007181	TTA	2	6	23924	23929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605888
522	NC_007181	AAC	2	6	24004	24009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605888
523	NC_007181	CT	3	6	24024	24029	0 %	50 %	0 %	50 %	70605888
524	NC_007181	CATA	2	8	24071	24078	50 %	25 %	0 %	25 %	70605888
525	NC_007181	T	6	6	24087	24092	0 %	100 %	0 %	0 %	70605888
526	NC_007181	TATT	2	8	24140	24147	25 %	75 %	0 %	0 %	70605888
527	NC_007181	A	6	6	24186	24191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007181	AACG	2	8	24211	24218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_007181	A	6	6	24233	24238	100 %	0 %	0 %	0 %	70605889
530	NC_007181	TAT	2	6	24239	24244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605889
531	NC_007181	TAAA	2	8	24256	24263	75 %	25 %	0 %	0 %	70605889
532	NC_007181	TAT	2	6	24272	24277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605889
533	NC_007181	ATA	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605889
534	NC_007181	TGA	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007181	CATA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_007181	TAT	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007181	TTA	2	6	24530	24535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
538	NC_007181	CAT	2	6	24618	24623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605890
539	NC_007181	AAT	2	6	24641	24646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605890
540	NC_007181	TTTA	2	8	24682	24689	25 %	75 %	0 %	0 %	70605890
541	NC_007181	TC	3	6	24740	24745	0 %	50 %	0 %	50 %	70605890
542	NC_007181	TC	4	8	24776	24783	0 %	50 %	0 %	50 %	70605890
543	NC_007181	AT	3	6	24816	24821	50 %	50 %	0 %	0 %	70605890
544	NC_007181	GA	3	6	24846	24851	50 %	0 %	50 %	0 %	70605890
545	NC_007181	AGA	2	6	24865	24870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605890
546	NC_007181	A	6	6	24933	24938	100 %	0 %	0 %	0 %	70605890
547	NC_007181	TAG	2	6	24982	24987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605890
548	NC_007181	GGA	2	6	25034	25039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605890
549	NC_007181	ATT	2	6	25052	25057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
550	NC_007181	ATA	2	6	25157	25162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605890
551	NC_007181	CTC	2	6	25231	25236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605890
552	NC_007181	GAT	2	6	25243	25248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605890
553	NC_007181	TCC	2	6	25280	25285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605890
554	NC_007181	TTA	2	6	25292	25297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
555	NC_007181	T	8	8	25304	25311	0 %	100 %	0 %	0 %	70605890
556	NC_007181	TTA	2	6	25437	25442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
557	NC_007181	ATT	2	6	25483	25488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
558	NC_007181	ATT	2	6	25559	25564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
559	NC_007181	A	6	6	25586	25591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007181	TGTT	2	8	25592	25599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007181	T	6	6	25613	25618	0 %	100 %	0 %	0 %	70605891
562	NC_007181	CAAAT	2	10	25619	25628	60 %	20 %	0 %	20 %	70605891
563	NC_007181	TAGAA	2	10	25671	25680	60 %	20 %	20 %	0 %	70605891
564	NC_007181	ATT	2	6	25814	25819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
565	NC_007181	CCT	2	6	25863	25868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605891
566	NC_007181	TTA	2	6	25971	25976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
567	NC_007181	CAT	2	6	26014	26019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605891
568	NC_007181	TCCT	2	8	26050	26057	0 %	50 %	0 %	50 %	70605891
569	NC_007181	TCG	2	6	26075	26080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605891
570	NC_007181	TAT	2	6	26092	26097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
571	NC_007181	TAT	2	6	26151	26156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
572	NC_007181	T	6	6	26180	26185	0 %	100 %	0 %	0 %	70605891
573	NC_007181	ATA	2	6	26272	26277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605891
574	NC_007181	TA	3	6	26287	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	70605891
575	NC_007181	GCA	2	6	26303	26308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70605891
576	NC_007181	CTT	2	6	26332	26337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605891
577	NC_007181	ATT	2	6	26372	26377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
578	NC_007181	GATT	2	8	26388	26395	25 %	50 %	25 %	0 %	70605891
579	NC_007181	TTG	2	6	26475	26480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605891
580	NC_007181	A	6	6	26508	26513	100 %	0 %	0 %	0 %	70605892
581	NC_007181	AAGT	2	8	26610	26617	50 %	25 %	25 %	0 %	70605892
582	NC_007181	TCA	2	6	26644	26649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605892
583	NC_007181	CAA	2	6	26832	26837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605892
584	NC_007181	CTAA	2	8	26939	26946	50 %	25 %	0 %	25 %	70605892
585	NC_007181	TCA	2	6	26949	26954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605892
586	NC_007181	TAA	2	6	27007	27012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605892
587	NC_007181	TTTA	2	8	27037	27044	25 %	75 %	0 %	0 %	70605893
588	NC_007181	TAA	2	6	27070	27075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605893
589	NC_007181	CTA	2	6	27089	27094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605893
590	NC_007181	TC	3	6	27100	27105	0 %	50 %	0 %	50 %	70605893
591	NC_007181	TAG	2	6	27150	27155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605893
592	NC_007181	ATA	2	6	27174	27179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605893
593	NC_007181	ATA	2	6	27324	27329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605893
594	NC_007181	TTTCAA	2	12	27357	27368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70605893
595	NC_007181	GTAG	2	8	27400	27407	25 %	25 %	50 %	0 %	70605893
596	NC_007181	ACT	2	6	27472	27477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605893
597	NC_007181	GATC	2	8	27498	27505	25 %	25 %	25 %	25 %	70605893
598	NC_007181	TTA	2	6	27545	27550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605893
599	NC_007181	AAC	2	6	27562	27567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605893
600	NC_007181	CTC	2	6	27570	27575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605893
601	NC_007181	AG	3	6	27591	27596	50 %	0 %	50 %	0 %	70605893
602	NC_007181	TTGG	2	8	27799	27806	0 %	50 %	50 %	0 %	70605894
603	NC_007181	TCA	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605894
604	NC_007181	ATT	2	6	27878	27883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605894
605	NC_007181	CCA	2	6	27927	27932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70605894
606	NC_007181	CATAAA	2	12	28053	28064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
607	NC_007181	ATA	2	6	28065	28070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007181	CAA	2	6	28120	28125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605895
609	NC_007181	A	6	6	28149	28154	100 %	0 %	0 %	0 %	70605895
610	NC_007181	GA	3	6	28206	28211	50 %	0 %	50 %	0 %	70605895
611	NC_007181	T	6	6	28228	28233	0 %	100 %	0 %	0 %	70605895
612	NC_007181	TAA	2	6	28373	28378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605895
613	NC_007181	TCA	2	6	28415	28420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605895
614	NC_007181	TTG	2	6	28453	28458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605895
615	NC_007181	CCTA	2	8	28473	28480	25 %	25 %	0 %	50 %	70605895
616	NC_007181	TAG	2	6	28570	28575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605895
617	NC_007181	TGG	2	6	28580	28585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70605895
618	NC_007181	TAT	2	6	28653	28658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605895
619	NC_007181	GA	3	6	28754	28759	50 %	0 %	50 %	0 %	70605895
620	NC_007181	TCA	2	6	28933	28938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605896
621	NC_007181	ATG	2	6	28977	28982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605896
622	NC_007181	ACA	2	6	28987	28992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605896
623	NC_007181	TAT	2	6	29034	29039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605896
624	NC_007181	GT	3	6	29078	29083	0 %	50 %	50 %	0 %	70605896
625	NC_007181	T	7	7	29102	29108	0 %	100 %	0 %	0 %	70605896
626	NC_007181	CTT	2	6	29130	29135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605896
627	NC_007181	TCT	2	6	29154	29159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605896
628	NC_007181	ATC	2	6	29349	29354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605896
629	NC_007181	TGT	2	6	29365	29370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605896
630	NC_007181	AAAT	2	8	29445	29452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007181	ATT	2	6	29482	29487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007181	ATT	2	6	29495	29500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007181	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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