MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 64498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007168	ATTAA	2	10	168200	168209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_007168	A	6	6	168208	168213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_007168	ATTA	2	8	168229	168236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007168	ATA	3	9	168274	168282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_007168	ATT	2	6	168290	168295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_007168	ATGT	2	8	168306	168313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007168	TTA	2	6	168324	168329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007168	AAAG	2	8	168334	168341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_007168	GAG	2	6	168347	168352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_007168	AAC	2	6	168409	168414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725171
4011	NC_007168	TCA	2	6	168433	168438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725171
4012	NC_007168	TGA	2	6	168439	168444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725171
4013	NC_007168	ATG	2	6	168471	168476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725171
4014	NC_007168	CAAA	2	8	168540	168547	75 %	0 %	0 %	25 %	70725171
4015	NC_007168	TAT	2	6	168548	168553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725171
4016	NC_007168	TGA	2	6	168706	168711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725171
4017	NC_007168	GCA	2	6	168728	168733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725171
4018	NC_007168	AT	3	6	168739	168744	50 %	50 %	0 %	0 %	70725171
4019	NC_007168	GAAATT	2	12	168904	168915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725171
4020	NC_007168	TAC	2	6	169084	169089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725171
4021	NC_007168	GGT	2	6	169124	169129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725171
4022	NC_007168	AAG	2	6	169155	169160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725171
4023	NC_007168	GGA	2	6	169166	169171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70725171
4024	NC_007168	ATTT	2	8	169258	169265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007168	GA	3	6	169286	169291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007168	ATT	2	6	169303	169308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725172
4027	NC_007168	TTA	2	6	169338	169343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725172
4028	NC_007168	ATC	2	6	169403	169408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725172
4029	NC_007168	ATA	2	6	169450	169455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725172
4030	NC_007168	TAA	3	9	169460	169468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725172
4031	NC_007168	ATG	2	6	169477	169482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725172
4032	NC_007168	TGA	2	6	169544	169549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725172
4033	NC_007168	TCAT	2	8	169592	169599	25 %	50 %	0 %	25 %	70725172
4034	NC_007168	TGG	2	6	169616	169621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725172
4035	NC_007168	A	6	6	169630	169635	100 %	0 %	0 %	0 %	70725172
4036	NC_007168	TGA	2	6	169754	169759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725172
4037	NC_007168	A	6	6	169881	169886	100 %	0 %	0 %	0 %	70725172
4038	NC_007168	GTG	2	6	169909	169914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725172
4039	NC_007168	ATA	2	6	170161	170166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725172
4040	NC_007168	ATG	2	6	170167	170172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725172
4041	NC_007168	GAA	2	6	170279	170284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725172
4042	NC_007168	TTACA	2	10	170327	170336	40 %	40 %	0 %	20 %	70725172
4043	NC_007168	AGA	2	6	170396	170401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725172
4044	NC_007168	TAG	2	6	170408	170413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725172
4045	NC_007168	GAA	2	6	170460	170465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725172
4046	NC_007168	ACACAT	2	12	170491	170502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70725172
4047	NC_007168	A	7	7	170515	170521	100 %	0 %	0 %	0 %	70725172
4048	NC_007168	AT	3	6	170579	170584	50 %	50 %	0 %	0 %	70725172
4049	NC_007168	ATG	2	6	170614	170619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725172
4050	NC_007168	GAA	3	9	170628	170636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725172
4051	NC_007168	TAAG	2	8	170802	170809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_007168	AAGC	2	8	170875	170882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_007168	ATCT	2	8	170886	170893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_007168	ACT	2	6	170898	170903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_007168	ATT	2	6	170918	170923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725174
4056	NC_007168	AT	3	6	170968	170973	50 %	50 %	0 %	0 %	70725174
4057	NC_007168	CAA	2	6	171080	171085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725174
4058	NC_007168	GT	5	10	171126	171135	0 %	50 %	50 %	0 %	70725174
4059	NC_007168	CTT	2	6	171168	171173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725174
4060	NC_007168	AAT	2	6	171257	171262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725174
4061	NC_007168	AAT	2	6	171382	171387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725174
4062	NC_007168	T	6	6	171560	171565	0 %	100 %	0 %	0 %	70725174
4063	NC_007168	TGA	2	6	171589	171594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725174
4064	NC_007168	AAC	2	6	171723	171728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725174
4065	NC_007168	AAG	2	6	171738	171743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725174
4066	NC_007168	ATTA	2	8	171825	171832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007168	TA	3	6	171831	171836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_007168	AT	3	6	171887	171892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007168	GAC	2	6	171912	171917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007168	TTTA	2	8	171950	171957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_007168	A	6	6	171974	171979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007168	AAG	2	6	172037	172042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725175
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4084	NC_007168	ACT	2	6	172612	172617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725175
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4086	NC_007168	GTA	2	6	172721	172726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725175
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4091	NC_007168	AGC	2	6	172887	172892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725175
4092	NC_007168	ACG	2	6	172930	172935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725175
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4095	NC_007168	AAT	2	6	172988	172993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725175
4096	NC_007168	TA	3	6	173000	173005	50 %	50 %	0 %	0 %	70725176
4097	NC_007168	TAG	2	6	173032	173037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725176
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4099	NC_007168	ACA	2	6	173094	173099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725176
4100	NC_007168	TGG	2	6	173102	173107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725176
4101	NC_007168	TGA	2	6	173147	173152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725176
4102	NC_007168	TGA	3	9	173177	173185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725176
4103	NC_007168	AGA	2	6	173213	173218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725176
4104	NC_007168	ATA	2	6	173299	173304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725176
4105	NC_007168	CAT	2	6	173306	173311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725176
4106	NC_007168	TAA	2	6	173327	173332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725176
4107	NC_007168	TCAAGC	2	12	173369	173380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	70725176
4108	NC_007168	CAA	2	6	173400	173405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725176
4109	NC_007168	GATAT	2	10	173457	173466	40 %	40 %	20 %	0 %	70725176
4110	NC_007168	AG	3	6	173546	173551	50 %	0 %	50 %	0 %	70725176
4111	NC_007168	CAATG	2	10	173552	173561	40 %	20 %	20 %	20 %	70725176
4112	NC_007168	TAA	2	6	173608	173613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725176
4113	NC_007168	ACA	2	6	173697	173702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725176
4114	NC_007168	AGC	2	6	173789	173794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725176
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4116	NC_007168	GAA	2	6	174076	174081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725177
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4118	NC_007168	CAT	2	6	174225	174230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725177
4119	NC_007168	GTG	2	6	174239	174244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725177
4120	NC_007168	TGCA	2	8	174353	174360	25 %	25 %	25 %	25 %	70725178
4121	NC_007168	A	6	6	174421	174426	100 %	0 %	0 %	0 %	70725178
4122	NC_007168	GAA	2	6	174487	174492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725178
4123	NC_007168	TAAA	2	8	174596	174603	75 %	25 %	0 %	0 %	70725178
4124	NC_007168	A	6	6	174601	174606	100 %	0 %	0 %	0 %	70725178
4125	NC_007168	CAA	2	6	174616	174621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725178
4126	NC_007168	CAA	2	6	174697	174702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725178
4127	NC_007168	GAT	2	6	174723	174728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725178
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4213	NC_007168	CGA	2	6	177864	177869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725181
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4231	NC_007168	CA	3	6	178539	178544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4232	NC_007168	ATT	2	6	178615	178620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_007168	A	6	6	178630	178635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_007168	ATGAT	2	10	178670	178679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_007168	AT	3	6	178695	178700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4236	NC_007168	AAT	2	6	178714	178719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_007168	ATAA	2	8	178759	178766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_007168	TGAAA	2	10	178806	178815	60 %	20 %	20 %	0 %	70725182
4239	NC_007168	GAT	2	6	178836	178841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725182
4240	NC_007168	ACA	2	6	178945	178950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725182
4241	NC_007168	AGA	2	6	178962	178967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725182
4242	NC_007168	TCA	2	6	178974	178979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725182
4243	NC_007168	TGA	2	6	179004	179009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725182
4244	NC_007168	GTA	2	6	179017	179022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725182
4245	NC_007168	TGA	2	6	179055	179060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725182
4246	NC_007168	GTA	2	6	179237	179242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725182
4247	NC_007168	AATT	2	8	179261	179268	50 %	50 %	0 %	0 %	70725182
4248	NC_007168	AAG	2	6	179270	179275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725182
4249	NC_007168	AAG	2	6	179288	179293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725182
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4251	NC_007168	GAA	2	6	179518	179523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725182
4252	NC_007168	CA	3	6	179554	179559	50 %	0 %	0 %	50 %	70725182
4253	NC_007168	CAA	2	6	179627	179632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725183
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4259	NC_007168	TTG	2	6	180063	180068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725183
4260	NC_007168	A	6	6	180069	180074	100 %	0 %	0 %	0 %	70725183
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4276	NC_007168	ATT	2	6	180791	180796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725184
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4280	NC_007168	TTGAT	2	10	180867	180876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4282	NC_007168	GTATA	2	10	180957	180966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4283	NC_007168	ATA	3	9	180964	180972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_007168	TA	3	6	180974	180979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_007168	A	6	6	181012	181017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4306	NC_007168	TA	3	6	181912	181917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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