MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006905	ATG	2	6	186349	186354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178731
4002	NC_006905	CGG	2	6	186414	186419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178731
4003	NC_006905	CTG	2	6	186472	186477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178731
4004	NC_006905	GCG	2	6	186623	186628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178731
4005	NC_006905	TGC	2	6	186672	186677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178731
4006	NC_006905	ATG	2	6	186737	186742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178731
4007	NC_006905	CTTT	2	8	186746	186753	0 %	75 %	0 %	25 %	62178731
4008	NC_006905	GAT	2	6	186756	186761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178731
4009	NC_006905	TGG	2	6	186806	186811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178731
4010	NC_006905	T	6	6	186873	186878	0 %	100 %	0 %	0 %	62178731
4011	NC_006905	GGC	2	6	186886	186891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178731
4012	NC_006905	GCT	2	6	186894	186899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178731
4013	NC_006905	CTTT	2	8	186905	186912	0 %	75 %	0 %	25 %	62178731
4014	NC_006905	GGGC	2	8	186926	186933	0 %	0 %	75 %	25 %	62178731
4015	NC_006905	CGTT	2	8	186995	187002	0 %	50 %	25 %	25 %	62178731
4016	NC_006905	GCG	2	6	187060	187065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178731
4017	NC_006905	CGC	2	6	187097	187102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178731
4018	NC_006905	TCGC	2	8	187126	187133	0 %	25 %	25 %	50 %	62178731
4019	NC_006905	GCT	2	6	187144	187149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178731
4020	NC_006905	CCGCT	2	10	187151	187160	0 %	20 %	20 %	60 %	62178731
4021	NC_006905	GCC	2	6	187165	187170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178731
4022	NC_006905	CAC	2	6	187179	187184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178731
4023	NC_006905	CCT	2	6	187208	187213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178731
4024	NC_006905	A	6	6	187222	187227	100 %	0 %	0 %	0 %	62178731
4025	NC_006905	CTT	2	6	187241	187246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178731
4026	NC_006905	ATG	2	6	187266	187271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178732
4027	NC_006905	GAT	2	6	187281	187286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178732
4028	NC_006905	GAA	2	6	187322	187327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178732
4029	NC_006905	CGC	2	6	187374	187379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178732
4030	NC_006905	GGC	2	6	187430	187435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178732
4031	NC_006905	GTG	2	6	187463	187468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178732
4032	NC_006905	CGG	2	6	187543	187548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178732
4033	NC_006905	GC	3	6	187553	187558	0 %	0 %	50 %	50 %	62178732
4034	NC_006905	CGC	3	9	187583	187591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178732
4035	NC_006905	ACG	2	6	187611	187616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178732
4036	NC_006905	CGG	2	6	187772	187777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178732
4037	NC_006905	CTTA	2	8	187787	187794	25 %	50 %	0 %	25 %	62178732
4038	NC_006905	TCG	2	6	187825	187830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178732
4039	NC_006905	GCG	2	6	187872	187877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178732
4040	NC_006905	AAC	2	6	187882	187887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178732
4041	NC_006905	GCT	2	6	187898	187903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178732
4042	NC_006905	TGG	3	9	187978	187986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178732
4043	NC_006905	CG	3	6	188069	188074	0 %	0 %	50 %	50 %	62178732
4044	NC_006905	GC	3	6	188128	188133	0 %	0 %	50 %	50 %	62178732
4045	NC_006905	AGA	2	6	188180	188185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178732
4046	NC_006905	GCGA	2	8	188242	188249	25 %	0 %	50 %	25 %	62178732
4047	NC_006905	CGT	2	6	188267	188272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178732
4048	NC_006905	CGG	2	6	188321	188326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178732
4049	NC_006905	CCG	2	6	188338	188343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178732
4050	NC_006905	GC	3	6	188350	188355	0 %	0 %	50 %	50 %	62178732
4051	NC_006905	GCGG	2	8	188457	188464	0 %	0 %	75 %	25 %	62178732
4052	NC_006905	TG	3	6	188485	188490	0 %	50 %	50 %	0 %	62178732
4053	NC_006905	TAT	2	6	188499	188504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178732
4054	NC_006905	GAG	2	6	188508	188513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178732
4055	NC_006905	GC	3	6	188615	188620	0 %	0 %	50 %	50 %	62178733
4056	NC_006905	TGG	2	6	188624	188629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178733
4057	NC_006905	CAT	2	6	188736	188741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178733
4058	NC_006905	TGAT	2	8	188747	188754	25 %	50 %	25 %	0 %	62178733
4059	NC_006905	CAGGCG	2	12	188797	188808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	62178733
4060	NC_006905	GC	3	6	188835	188840	0 %	0 %	50 %	50 %	62178733
4061	NC_006905	CGC	2	6	188885	188890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178733
4062	NC_006905	GCT	2	6	188943	188948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178733
4063	NC_006905	GCCA	2	8	189207	189214	25 %	0 %	25 %	50 %	62178733
4064	NC_006905	CCG	2	6	189259	189264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178733
4065	NC_006905	TGG	3	9	189305	189313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178733
4066	NC_006905	ATG	2	6	189362	189367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178733
4067	NC_006905	ACA	2	6	189522	189527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178734
4068	NC_006905	GCCA	2	8	189609	189616	25 %	0 %	25 %	50 %	62178734
4069	NC_006905	GGC	2	6	189673	189678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178734
4070	NC_006905	GCG	2	6	189687	189692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178734
4071	NC_006905	GCCCA	2	10	189703	189712	20 %	0 %	20 %	60 %	62178734
4072	NC_006905	CCA	3	9	189710	189718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178734
4073	NC_006905	AAC	2	6	189725	189730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178734
4074	NC_006905	CGT	2	6	189798	189803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178734
4075	NC_006905	ATG	2	6	189823	189828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178734
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4079	NC_006905	G	6	6	190037	190042	0 %	0 %	100 %	0 %	62178734
4080	NC_006905	GAC	2	6	190056	190061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178734
4081	NC_006905	ATT	2	6	190096	190101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178734
4082	NC_006905	GCGCA	2	10	190108	190117	20 %	0 %	40 %	40 %	62178734
4083	NC_006905	CAG	2	6	190134	190139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178734
4084	NC_006905	GC	3	6	190148	190153	0 %	0 %	50 %	50 %	62178734
4085	NC_006905	GCC	2	6	190215	190220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178734
4086	NC_006905	GC	3	6	190245	190250	0 %	0 %	50 %	50 %	62178734
4087	NC_006905	TGA	2	6	190304	190309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_006905	GTA	2	6	190335	190340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178735
4089	NC_006905	GCG	2	6	190366	190371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178735
4090	NC_006905	AGC	2	6	190450	190455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178735
4091	NC_006905	CCA	2	6	190496	190501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178735
4092	NC_006905	CG	3	6	190589	190594	0 %	0 %	50 %	50 %	62178735
4093	NC_006905	TGG	2	6	190642	190647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178735
4094	NC_006905	CA	3	6	190758	190763	50 %	0 %	0 %	50 %	62178735
4095	NC_006905	CCA	2	6	190787	190792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178735
4096	NC_006905	GTTTG	2	10	190817	190826	0 %	60 %	40 %	0 %	62178735
4097	NC_006905	CCT	2	6	191115	191120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_006905	CGG	2	6	191215	191220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178736
4099	NC_006905	AAT	2	6	191237	191242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178736
4100	NC_006905	CGT	2	6	191266	191271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178736
4101	NC_006905	ATG	2	6	191295	191300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178736
4102	NC_006905	CCG	2	6	191301	191306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178736
4103	NC_006905	TAG	2	6	191307	191312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178736
4104	NC_006905	CGC	2	6	191321	191326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178736
4105	NC_006905	CAA	2	6	191419	191424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178736
4106	NC_006905	GCC	2	6	191429	191434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178736
4107	NC_006905	ATCGG	2	10	191499	191508	20 %	20 %	40 %	20 %	62178736
4108	NC_006905	CGT	2	6	191566	191571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178736
4109	NC_006905	TCG	2	6	191595	191600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178736
4110	NC_006905	GGC	2	6	191632	191637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178736
4111	NC_006905	CGC	3	9	191725	191733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178736
4112	NC_006905	CAG	2	6	191768	191773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178736
4113	NC_006905	TCA	2	6	191785	191790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178736
4114	NC_006905	ATAA	2	8	191798	191805	75 %	25 %	0 %	0 %	62178736
4115	NC_006905	TCG	2	6	191808	191813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178736
4116	NC_006905	GGT	2	6	191819	191824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178736
4117	NC_006905	GCG	2	6	191862	191867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178736
4118	NC_006905	GAT	2	6	191876	191881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178736
4119	NC_006905	T	6	6	191899	191904	0 %	100 %	0 %	0 %	62178736
4120	NC_006905	A	7	7	192016	192022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_006905	CAT	2	6	192031	192036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_006905	ATT	2	6	192065	192070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_006905	GGA	2	6	192087	192092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_006905	T	6	6	192144	192149	0 %	100 %	0 %	0 %	62178737
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4234	NC_006905	AACA	2	8	197997	198004	75 %	0 %	0 %	25 %	162139620
4235	NC_006905	ATCCA	2	10	198059	198068	40 %	20 %	0 %	40 %	162139620
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4242	NC_006905	AT	3	6	198253	198258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_006905	AAGT	2	8	198275	198282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4245	NC_006905	A	7	7	198321	198327	100 %	0 %	0 %	0 %	62178742
4246	NC_006905	CGG	2	6	198335	198340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178742
4247	NC_006905	ACC	2	6	198426	198431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178742
4248	NC_006905	TAT	2	6	198437	198442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178742
4249	NC_006905	TAA	2	6	198455	198460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178742
4250	NC_006905	TTTAAC	2	12	198549	198560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	62178742
4251	NC_006905	TTA	2	6	198602	198607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178742
4252	NC_006905	CT	3	6	198699	198704	0 %	50 %	0 %	50 %	62178742
4253	NC_006905	CGC	2	6	198717	198722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178742
4254	NC_006905	TGA	2	6	198724	198729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178742
4255	NC_006905	CGA	2	6	198770	198775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178742
4256	NC_006905	CGG	2	6	198781	198786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178742
4257	NC_006905	CAC	2	6	198848	198853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178742
4258	NC_006905	ATT	2	6	198855	198860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178742
4259	NC_006905	CAC	2	6	198863	198868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178742
4260	NC_006905	TAT	2	6	198911	198916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178742
4261	NC_006905	TGG	2	6	198931	198936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178742
4262	NC_006905	TGG	2	6	199045	199050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178742
4263	NC_006905	GAGC	2	8	199115	199122	25 %	0 %	50 %	25 %	62178742
4264	NC_006905	TAA	2	6	199148	199153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178742
4265	NC_006905	GAA	2	6	199167	199172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178742
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4268	NC_006905	TCA	2	6	199308	199313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178743
4269	NC_006905	TAT	2	6	199330	199335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178743
4270	NC_006905	ATG	2	6	199415	199420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178743
4271	NC_006905	CGT	2	6	199452	199457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178743
4272	NC_006905	T	6	6	199460	199465	0 %	100 %	0 %	0 %	62178743
4273	NC_006905	GAG	2	6	199490	199495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178743
4274	NC_006905	CTG	2	6	199496	199501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178743
4275	NC_006905	ATC	2	6	199526	199531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178743
4276	NC_006905	CGG	3	9	199543	199551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178743
4277	NC_006905	CTG	2	6	199685	199690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178743
4278	NC_006905	CGC	2	6	199749	199754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178743
4279	NC_006905	ACCT	2	8	199757	199764	25 %	25 %	0 %	50 %	62178743
4280	NC_006905	CGG	2	6	199765	199770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178743
4281	NC_006905	GCT	2	6	199789	199794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178743
4282	NC_006905	GCC	2	6	199795	199800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178743
4283	NC_006905	ATG	2	6	199878	199883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178743
4284	NC_006905	GCT	2	6	199925	199930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178743
4285	NC_006905	CTG	2	6	199937	199942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178743
4286	NC_006905	GCGCGG	2	12	199960	199971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178743
4287	NC_006905	GCTTC	2	10	200017	200026	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4288	NC_006905	TC	3	6	200097	200102	0 %	50 %	0 %	50 %	62178744
4289	NC_006905	GAATCT	2	12	200106	200117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	62178744
4290	NC_006905	GGT	2	6	200164	200169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178744
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4292	NC_006905	TGC	2	6	200196	200201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178744
4293	NC_006905	CCG	2	6	200243	200248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178744
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4295	NC_006905	GCT	2	6	200584	200589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178744
4296	NC_006905	TCG	2	6	200622	200627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178744
4297	NC_006905	CGA	2	6	200796	200801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178744
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4300	NC_006905	CGAC	2	8	200985	200992	25 %	0 %	25 %	50 %	62178744
4301	NC_006905	CT	3	6	200996	201001	0 %	50 %	0 %	50 %	62178744
4302	NC_006905	CCTG	2	8	201014	201021	0 %	25 %	25 %	50 %	62178744
4303	NC_006905	TGGTC	2	10	201042	201051	0 %	40 %	40 %	20 %	62178744
4304	NC_006905	A	6	6	201058	201063	100 %	0 %	0 %	0 %	62178744
4305	NC_006905	TGG	2	6	201081	201086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178744
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4308	NC_006905	CG	3	6	201255	201260	0 %	0 %	50 %	50 %	62178745
4309	NC_006905	CAG	3	9	201285	201293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178745
4310	NC_006905	CGA	2	6	201338	201343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178745
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4314	NC_006905	GC	3	6	201463	201468	0 %	0 %	50 %	50 %	62178745
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4319	NC_006905	ATA	2	6	201564	201569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178745
4320	NC_006905	CGC	2	6	201641	201646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178745
4321	NC_006905	CGC	2	6	201672	201677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178745
4322	NC_006905	GGCT	2	8	201688	201695	0 %	25 %	50 %	25 %	62178745
4323	NC_006905	GCC	2	6	201726	201731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178745
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4327	NC_006905	GTG	2	6	201907	201912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178745
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4331	NC_006905	CTG	2	6	202161	202166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178745
4332	NC_006905	TCT	2	6	202183	202188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178745
4333	NC_006905	ATC	2	6	202287	202292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178745
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4335	NC_006905	GAC	2	6	202377	202382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178745
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4344	NC_006905	GCTG	2	8	202895	202902	0 %	25 %	50 %	25 %	62178745
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4352	NC_006905	TATTGA	2	12	203513	203524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	62178745
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4354	NC_006905	TGC	2	6	203666	203671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178745
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4356	NC_006905	AGCGC	2	10	203688	203697	20 %	0 %	40 %	40 %	62178745
4357	NC_006905	ATAA	2	8	203699	203706	75 %	25 %	0 %	0 %	62178745
4358	NC_006905	GTTT	2	8	203766	203773	0 %	75 %	25 %	0 %	62178746
4359	NC_006905	TGA	2	6	203803	203808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178746
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4361	NC_006905	ATA	2	6	203930	203935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178746
4362	NC_006905	TTC	2	6	203946	203951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178746
4363	NC_006905	GT	3	6	204070	204075	0 %	50 %	50 %	0 %	62178746
4364	NC_006905	TGC	2	6	204094	204099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178746
4365	NC_006905	CCAG	2	8	204118	204125	25 %	0 %	25 %	50 %	62178746
4366	NC_006905	GCC	2	6	204155	204160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178746
4367	NC_006905	T	7	7	204183	204189	0 %	100 %	0 %	0 %	62178746
4368	NC_006905	GCG	2	6	204211	204216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178746
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4496	NC_006905	T	6	6	210381	210386	0 %	100 %	0 %	0 %	62178754
4497	NC_006905	CAG	2	6	210397	210402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178754
4498	NC_006905	GGC	2	6	210418	210423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178754
4499	NC_006905	TTC	2	6	210476	210481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178754
4500	NC_006905	ATG	2	6	210494	210499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178754

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