MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006905	ATG	2	6	140570	140575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178691
3002	NC_006905	TGGC	2	8	140656	140663	0 %	25 %	50 %	25 %	62178692
3003	NC_006905	ATT	2	6	140681	140686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178692
3004	NC_006905	ATGG	2	8	140760	140767	25 %	25 %	50 %	0 %	62178692
3005	NC_006905	CT	3	6	140797	140802	0 %	50 %	0 %	50 %	62178692
3006	NC_006905	GGT	2	6	140811	140816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178692
3007	NC_006905	CGA	2	6	140861	140866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178692
3008	NC_006905	CAT	2	6	140874	140879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178692
3009	NC_006905	GTGC	2	8	140943	140950	0 %	25 %	50 %	25 %	62178692
3010	NC_006905	TGG	2	6	140951	140956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178692
3011	NC_006905	GTG	2	6	141004	141009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178692
3012	NC_006905	GC	3	6	141034	141039	0 %	0 %	50 %	50 %	62178692
3013	NC_006905	TCG	2	6	141095	141100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178692
3014	NC_006905	TGG	2	6	141125	141130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178692
3015	NC_006905	CTG	2	6	141178	141183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178692
3016	NC_006905	TCG	2	6	141197	141202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178692
3017	NC_006905	GCC	2	6	141271	141276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178692
3018	NC_006905	TGG	2	6	141287	141292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178692
3019	NC_006905	GCG	2	6	141467	141472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178692
3020	NC_006905	TGC	3	9	141491	141499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178692
3021	NC_006905	CTG	2	6	141511	141516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178692
3022	NC_006905	GCG	2	6	141527	141532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178692
3023	NC_006905	TGG	2	6	141539	141544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178692
3024	NC_006905	CAC	2	6	141622	141627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178692
3025	NC_006905	CG	3	6	141653	141658	0 %	0 %	50 %	50 %	62178692
3026	NC_006905	ATT	2	6	141676	141681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178692
3027	NC_006905	CGT	2	6	141755	141760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3028	NC_006905	ATT	2	6	141762	141767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178693
3029	NC_006905	CT	3	6	141786	141791	0 %	50 %	0 %	50 %	62178693
3030	NC_006905	T	6	6	141801	141806	0 %	100 %	0 %	0 %	62178693
3031	NC_006905	CGC	2	6	141823	141828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178693
3032	NC_006905	CGC	2	6	141850	141855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178693
3033	NC_006905	GGC	2	6	141897	141902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3034	NC_006905	ACG	2	6	141907	141912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3035	NC_006905	GCG	2	6	141924	141929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3036	NC_006905	TCG	2	6	141937	141942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3037	NC_006905	CT	3	6	141971	141976	0 %	50 %	0 %	50 %	62178693
3038	NC_006905	GCC	2	6	141984	141989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178693
3039	NC_006905	ACC	2	6	142089	142094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178693
3040	NC_006905	GCG	2	6	142116	142121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3041	NC_006905	GGC	2	6	142140	142145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3042	NC_006905	TGC	2	6	142168	142173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3043	NC_006905	GCG	3	9	142245	142253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3044	NC_006905	GTTTG	2	10	142298	142307	0 %	60 %	40 %	0 %	62178693
3045	NC_006905	GCG	2	6	142320	142325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3046	NC_006905	CAG	2	6	142458	142463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3047	NC_006905	GCG	2	6	142554	142559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3048	NC_006905	CTGGCG	2	12	142560	142571	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	62178693
3049	NC_006905	CG	3	6	142588	142593	0 %	0 %	50 %	50 %	62178693
3050	NC_006905	CAG	2	6	142595	142600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3051	NC_006905	GAC	2	6	142613	142618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3052	NC_006905	GCG	2	6	142716	142721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3053	NC_006905	CTG	3	9	142755	142763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3054	NC_006905	GGC	2	6	142764	142769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178693
3055	NC_006905	GC	3	6	142852	142857	0 %	0 %	50 %	50 %	62178693
3056	NC_006905	CG	3	6	142930	142935	0 %	0 %	50 %	50 %	62178693
3057	NC_006905	TGC	2	6	142954	142959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178693
3058	NC_006905	CGCC	2	8	142963	142970	0 %	0 %	25 %	75 %	62178693
3059	NC_006905	TC	3	6	143057	143062	0 %	50 %	0 %	50 %	62178694
3060	NC_006905	CG	3	6	143079	143084	0 %	0 %	50 %	50 %	62178694
3061	NC_006905	CCT	2	6	143098	143103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178694
3062	NC_006905	GCG	2	6	143117	143122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178694
3063	NC_006905	CG	3	6	143145	143150	0 %	0 %	50 %	50 %	62178694
3064	NC_006905	GCT	2	6	143188	143193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3065	NC_006905	GGC	2	6	143212	143217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178694
3066	NC_006905	TTTG	2	8	143284	143291	0 %	75 %	25 %	0 %	62178694
3067	NC_006905	ACG	2	6	143381	143386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3068	NC_006905	TGC	2	6	143409	143414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3069	NC_006905	GTC	2	6	143426	143431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3070	NC_006905	TGA	2	6	143551	143556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178694
3071	NC_006905	CTG	2	6	143621	143626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3072	NC_006905	GGT	2	6	143647	143652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178694
3073	NC_006905	CAC	2	6	143665	143670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178694
3074	NC_006905	CGG	2	6	143739	143744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178694
3075	NC_006905	CGTAT	2	10	143769	143778	20 %	40 %	20 %	20 %	62178694
3076	NC_006905	TCG	2	6	143779	143784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3077	NC_006905	ATT	2	6	143951	143956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178694
3078	NC_006905	GAA	2	6	143960	143965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178694
3079	NC_006905	TTC	2	6	144005	144010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178694
3080	NC_006905	CG	3	6	144020	144025	0 %	0 %	50 %	50 %	62178694
3081	NC_006905	ACC	2	6	144057	144062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178694
3082	NC_006905	TGC	2	6	144144	144149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178694
3083	NC_006905	TTA	2	6	144227	144232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178694
3084	NC_006905	GGCG	2	8	144321	144328	0 %	0 %	75 %	25 %	62178695
3085	NC_006905	CGG	2	6	144333	144338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178695
3086	NC_006905	CAT	2	6	144367	144372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178695
3087	NC_006905	GCTG	2	8	144398	144405	0 %	25 %	50 %	25 %	62178695
3088	NC_006905	CCG	2	6	144410	144415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178695
3089	NC_006905	GGC	2	6	144510	144515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178695
3090	NC_006905	GGC	2	6	144539	144544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178695
3091	NC_006905	CGG	2	6	144615	144620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178695
3092	NC_006905	GCC	2	6	144625	144630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178695
3093	NC_006905	TGGC	2	8	144694	144701	0 %	25 %	50 %	25 %	62178695
3094	NC_006905	GTG	2	6	144757	144762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178695
3095	NC_006905	CGTTGC	2	12	144791	144802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178695
3096	NC_006905	TGG	2	6	144845	144850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178695
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3098	NC_006905	GCC	2	6	144901	144906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178695
3099	NC_006905	GC	3	6	144950	144955	0 %	0 %	50 %	50 %	62178695
3100	NC_006905	GCA	2	6	144996	145001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178695
3101	NC_006905	GCC	3	9	145030	145038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178695
3102	NC_006905	TGG	2	6	145055	145060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178695
3103	NC_006905	CGC	3	9	145095	145103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178695
3104	NC_006905	GCA	2	6	145146	145151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178695
3105	NC_006905	AGC	2	6	145202	145207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178695
3106	NC_006905	CG	3	6	145253	145258	0 %	0 %	50 %	50 %	62178695
3107	NC_006905	GTT	2	6	145263	145268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178695
3108	NC_006905	CG	3	6	145288	145293	0 %	0 %	50 %	50 %	62178695
3109	NC_006905	AAT	2	6	145399	145404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_006905	GAAT	2	8	145473	145480	50 %	25 %	25 %	0 %	62178696
3111	NC_006905	ACA	2	6	145483	145488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178696
3112	NC_006905	GGT	2	6	145556	145561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178696
3113	NC_006905	ATCAG	2	10	145605	145614	40 %	20 %	20 %	20 %	62178696
3114	NC_006905	CAG	2	6	145646	145651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178696
3115	NC_006905	CGA	2	6	145668	145673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178696
3116	NC_006905	GTC	2	6	145718	145723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178696
3117	NC_006905	TCCT	2	8	146015	146022	0 %	50 %	0 %	50 %	62178696
3118	NC_006905	TTA	2	6	146115	146120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178696
3119	NC_006905	CG	3	6	146150	146155	0 %	0 %	50 %	50 %	62178696
3120	NC_006905	GAT	2	6	146168	146173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178696
3121	NC_006905	GCT	2	6	146188	146193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178696
3122	NC_006905	ACG	2	6	146216	146221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178696
3123	NC_006905	AGA	2	6	146254	146259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178696
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3243	NC_006905	CGAT	2	8	151760	151767	25 %	25 %	25 %	25 %	62178701
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3372	NC_006905	CGT	2	6	158674	158679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178708
3373	NC_006905	GATCA	2	10	158741	158750	40 %	20 %	20 %	20 %	62178708
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3490	NC_006905	GTTG	2	8	165428	165435	0 %	50 %	50 %	0 %	62178715
3491	NC_006905	TGG	2	6	165503	165508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178715
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3493	NC_006905	C	6	6	165526	165531	0 %	0 %	0 %	100 %	62178715
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3495	NC_006905	T	7	7	165597	165603	0 %	100 %	0 %	0 %	62178715
3496	NC_006905	TCG	2	6	165645	165650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178715
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3498	NC_006905	CAG	2	6	165802	165807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178715
3499	NC_006905	GCC	2	6	165811	165816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178715
3500	NC_006905	TCG	2	6	165952	165957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178715

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