MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006905	ATG	2	6	69511	69516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_006905	ATTTG	2	10	69518	69527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_006905	T	6	6	69528	69533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_006905	AT	3	6	69543	69548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_006905	T	7	7	69561	69567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_006905	GTT	2	6	69639	69644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_006905	T	6	6	69643	69648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_006905	GTT	2	6	69649	69654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_006905	GCCA	2	8	69694	69701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_006905	T	6	6	69703	69708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_006905	A	6	6	69805	69810	100 %	0 %	0 %	0 %	62178629
1512	NC_006905	GCC	2	6	69853	69858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178629
1513	NC_006905	ACTG	2	8	69902	69909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_006905	AGTG	2	8	69931	69938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_006905	CGG	2	6	70032	70037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178630
1516	NC_006905	TCCT	2	8	70093	70100	0 %	50 %	0 %	50 %	62178630
1517	NC_006905	CTTA	2	8	70121	70128	25 %	50 %	0 %	25 %	62178630
1518	NC_006905	GAA	2	6	70166	70171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178630
1519	NC_006905	TCT	2	6	70172	70177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178630
1520	NC_006905	CT	3	6	70250	70255	0 %	50 %	0 %	50 %	62178630
1521	NC_006905	CTG	2	6	70319	70324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178630
1522	NC_006905	CAT	2	6	70351	70356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178630
1523	NC_006905	AAG	2	6	70437	70442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178630
1524	NC_006905	ACG	2	6	70448	70453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178630
1525	NC_006905	TGG	2	6	70539	70544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178630
1526	NC_006905	TGG	2	6	70584	70589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178630
1527	NC_006905	GCC	2	6	70599	70604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178630
1528	NC_006905	GGT	2	6	70609	70614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178630
1529	NC_006905	CTG	2	6	70629	70634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178630
1530	NC_006905	CTC	2	6	70730	70735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178630
1531	NC_006905	GCT	2	6	70777	70782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178630
1532	NC_006905	CGG	2	6	70831	70836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178630
1533	NC_006905	GTG	2	6	70868	70873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178630
1534	NC_006905	GCG	2	6	71045	71050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178630
1535	NC_006905	AAT	2	6	71103	71108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178630
1536	NC_006905	TAA	2	6	71115	71120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_006905	ACT	2	6	71205	71210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178631
1538	NC_006905	CCA	2	6	71280	71285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178631
1539	NC_006905	GACC	2	8	71290	71297	25 %	0 %	25 %	50 %	62178631
1540	NC_006905	GTG	2	6	71342	71347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178631
1541	NC_006905	TGC	2	6	71382	71387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1542	NC_006905	GGC	2	6	71396	71401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1543	NC_006905	GC	3	6	71418	71423	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1544	NC_006905	TGGAGC	2	12	71424	71435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62178631
1545	NC_006905	CCG	2	6	71481	71486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178631
1546	NC_006905	CGT	2	6	71510	71515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1547	NC_006905	GAA	2	6	71533	71538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178631
1548	NC_006905	CG	3	6	71554	71559	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1549	NC_006905	GAA	2	6	71582	71587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178631
1550	NC_006905	CAT	2	6	71623	71628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178631
1551	NC_006905	TCCT	2	8	71632	71639	0 %	50 %	0 %	50 %	62178631
1552	NC_006905	CGG	3	9	71656	71664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1553	NC_006905	GAA	2	6	71690	71695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178631
1554	NC_006905	TC	3	6	71716	71721	0 %	50 %	0 %	50 %	62178631
1555	NC_006905	CCAA	2	8	71723	71730	50 %	0 %	0 %	50 %	62178631
1556	NC_006905	CTG	2	6	71735	71740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1557	NC_006905	TGA	2	6	71743	71748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178631
1558	NC_006905	GTG	2	6	71783	71788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178631
1559	NC_006905	CAT	2	6	71809	71814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178631
1560	NC_006905	CGG	2	6	71962	71967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1561	NC_006905	CG	3	6	72030	72035	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1562	NC_006905	CTC	2	6	72043	72048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178631
1563	NC_006905	GCC	2	6	72092	72097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178631
1564	NC_006905	TGA	2	6	72129	72134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178631
1565	NC_006905	CGG	2	6	72145	72150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1566	NC_006905	CCT	2	6	72162	72167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178631
1567	NC_006905	ACC	2	6	72248	72253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178631
1568	NC_006905	TCGG	2	8	72263	72270	0 %	25 %	50 %	25 %	62178631
1569	NC_006905	CGCA	2	8	72290	72297	25 %	0 %	25 %	50 %	62178631
1570	NC_006905	GAC	2	6	72371	72376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1571	NC_006905	CCG	2	6	72397	72402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178631
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1575	NC_006905	CCGT	2	8	72788	72795	0 %	25 %	25 %	50 %	62178631
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1579	NC_006905	GC	5	10	73076	73085	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1580	NC_006905	CG	3	6	73136	73141	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1581	NC_006905	CTGAAG	2	12	73178	73189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62178631
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1583	NC_006905	CTT	2	6	73272	73277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178631
1584	NC_006905	GGC	2	6	73286	73291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1585	NC_006905	TGC	2	6	73374	73379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1586	NC_006905	TGA	2	6	73393	73398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178631
1587	NC_006905	GTGGAC	2	12	73409	73420	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62178631
1588	NC_006905	GGCG	2	8	73477	73484	0 %	0 %	75 %	25 %	62178631
1589	NC_006905	CAG	2	6	73556	73561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1590	NC_006905	TGA	2	6	73599	73604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178631
1591	NC_006905	GCG	2	6	73661	73666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1592	NC_006905	CGTAC	2	10	73667	73676	20 %	20 %	20 %	40 %	62178631
1593	NC_006905	GGC	2	6	73717	73722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1594	NC_006905	GC	3	6	73721	73726	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1595	NC_006905	TAC	2	6	73784	73789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178631
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1598	NC_006905	CCA	2	6	73935	73940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178631
1599	NC_006905	GAA	2	6	73942	73947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178631
1600	NC_006905	GCT	2	6	73960	73965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
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1602	NC_006905	GCT	2	6	74014	74019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1603	NC_006905	GTC	2	6	74115	74120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
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1605	NC_006905	ACC	2	6	74171	74176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178631
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1608	NC_006905	GC	3	6	74220	74225	0 %	0 %	50 %	50 %	62178631
1609	NC_006905	CGG	2	6	74260	74265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178631
1610	NC_006905	ACG	2	6	74273	74278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1611	NC_006905	T	7	7	74427	74433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_006905	TAA	2	6	74489	74494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_006905	TTA	2	6	74573	74578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_006905	TG	3	6	74628	74633	0 %	50 %	50 %	0 %	62178632
1615	NC_006905	GAT	2	6	74677	74682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178632
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1617	NC_006905	GAT	2	6	74806	74811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178632
1618	NC_006905	TGCCAG	2	12	74837	74848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	62178632
1619	NC_006905	GAAA	2	8	74912	74919	75 %	0 %	25 %	0 %	62178632
1620	NC_006905	C	6	6	74957	74962	0 %	0 %	0 %	100 %	62178632
1621	NC_006905	GAT	2	6	74992	74997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178632
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1623	NC_006905	CGGT	2	8	75145	75152	0 %	25 %	50 %	25 %	62178633
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1625	NC_006905	GTA	2	6	75273	75278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178633
1626	NC_006905	CG	3	6	75279	75284	0 %	0 %	50 %	50 %	62178633
1627	NC_006905	CAG	2	6	75298	75303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178633
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