MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006905	CAG	2	6	45977	45982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_006905	GTA	2	6	46021	46026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_006905	ATG	2	6	46033	46038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_006905	AAC	2	6	46116	46121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_006905	ATT	2	6	46148	46153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_006905	AGTA	2	8	46191	46198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006905	AGT	2	6	46213	46218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_006905	ATCA	2	8	46231	46238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_006905	ATT	2	6	46239	46244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006905	TTA	2	6	46267	46272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006905	GGT	2	6	46305	46310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006905	T	6	6	46316	46321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006905	GAAA	2	8	46351	46358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006905	AGGG	2	8	46384	46391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_006905	A	6	6	46399	46404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_006905	A	7	7	46481	46487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_006905	TTG	2	6	46544	46549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178607
1018	NC_006905	AGC	2	6	46609	46614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178607
1019	NC_006905	GCA	2	6	46658	46663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178607
1020	NC_006905	TGA	2	6	46701	46706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178607
1021	NC_006905	CAT	2	6	46714	46719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178607
1022	NC_006905	GC	3	6	46766	46771	0 %	0 %	50 %	50 %	62178607
1023	NC_006905	CTT	2	6	46861	46866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_006905	GCA	2	6	46905	46910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178608
1025	NC_006905	GCG	2	6	46991	46996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178608
1026	NC_006905	TCT	2	6	47036	47041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178608
1027	NC_006905	CATA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	62178609
1028	NC_006905	TCAG	2	8	47154	47161	25 %	25 %	25 %	25 %	62178609
1029	NC_006905	GT	3	6	47173	47178	0 %	50 %	50 %	0 %	62178609
1030	NC_006905	GAA	2	6	47243	47248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178609
1031	NC_006905	GGT	3	9	47269	47277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178609
1032	NC_006905	GCG	2	6	47376	47381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178609
1033	NC_006905	TGTGC	2	10	47389	47398	0 %	40 %	40 %	20 %	62178609
1034	NC_006905	CGC	2	6	47411	47416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178609
1035	NC_006905	CTG	2	6	47453	47458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178609
1036	NC_006905	GAT	2	6	47495	47500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178609
1037	NC_006905	CG	3	6	47519	47524	0 %	0 %	50 %	50 %	62178609
1038	NC_006905	TTA	2	6	47537	47542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178609
1039	NC_006905	GGC	2	6	47600	47605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178609
1040	NC_006905	AGT	2	6	47615	47620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178609
1041	NC_006905	CTG	2	6	47672	47677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178609
1042	NC_006905	CGA	2	6	47716	47721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178609
1043	NC_006905	TGGC	2	8	47868	47875	0 %	25 %	50 %	25 %	62178609
1044	NC_006905	CAA	2	6	47882	47887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178609
1045	NC_006905	CTG	2	6	47900	47905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178609
1046	NC_006905	AGC	2	6	47970	47975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178609
1047	NC_006905	TGA	2	6	47989	47994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178609
1048	NC_006905	T	6	6	48038	48043	0 %	100 %	0 %	0 %	62178609
1049	NC_006905	TGA	2	6	48107	48112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1050	NC_006905	GCG	2	6	48161	48166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178610
1051	NC_006905	GAT	3	9	48208	48216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1052	NC_006905	CAT	2	6	48225	48230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178610
1053	NC_006905	A	6	6	48241	48246	100 %	0 %	0 %	0 %	62178610
1054	NC_006905	A	7	7	48250	48256	100 %	0 %	0 %	0 %	62178610
1055	NC_006905	ATG	2	6	48269	48274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1056	NC_006905	GCA	2	6	48293	48298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1057	NC_006905	CCG	2	6	48461	48466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178610
1058	NC_006905	CAT	2	6	48600	48605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178610
1059	NC_006905	CG	3	6	48607	48612	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
1060	NC_006905	GCGGAA	2	12	48694	48705	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	62178610
1061	NC_006905	ACC	2	6	48829	48834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178610
1062	NC_006905	CTG	2	6	49015	49020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1063	NC_006905	CTG	2	6	49264	49269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1064	NC_006905	GC	3	6	49280	49285	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
1065	NC_006905	A	6	6	49298	49303	100 %	0 %	0 %	0 %	62178610
1066	NC_006905	GCA	2	6	49305	49310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1067	NC_006905	CG	3	6	49354	49359	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
1068	NC_006905	AAG	2	6	49388	49393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178610
1069	NC_006905	GCT	2	6	49560	49565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1070	NC_006905	GGC	2	6	49584	49589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178610
1071	NC_006905	GTG	2	6	49635	49640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178610
1072	NC_006905	GTTTG	2	10	49711	49720	0 %	60 %	40 %	0 %	62178610
1073	NC_006905	CCA	2	6	49730	49735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178610
1074	NC_006905	TCC	2	6	49828	49833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178610
1075	NC_006905	TGA	2	6	49835	49840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1076	NC_006905	CGC	2	6	49949	49954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178610
1077	NC_006905	TGA	2	6	49961	49966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1078	NC_006905	TCG	2	6	50070	50075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1079	NC_006905	CG	3	6	50088	50093	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
1080	NC_006905	CTG	2	6	50098	50103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1081	NC_006905	TGG	2	6	50156	50161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178610
1082	NC_006905	GCA	2	6	50199	50204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1083	NC_006905	GTTC	2	8	50285	50292	0 %	50 %	25 %	25 %	62178610
1084	NC_006905	CAT	2	6	50301	50306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178610
1085	NC_006905	CG	3	6	50343	50348	0 %	0 %	50 %	50 %	62178610
1086	NC_006905	TGA	2	6	50427	50432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1087	NC_006905	ACG	2	6	50489	50494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1088	NC_006905	GTT	2	6	50496	50501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178610
1089	NC_006905	GAA	2	6	50518	50523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178610
1090	NC_006905	CAA	2	6	50571	50576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178610
1091	NC_006905	AAG	2	6	50668	50673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178610
1092	NC_006905	G	6	6	50742	50747	0 %	0 %	100 %	0 %	62178610
1093	NC_006905	TGA	3	9	50751	50759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1094	NC_006905	GCT	2	6	50834	50839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178610
1095	NC_006905	CACTA	2	10	50842	50851	40 %	20 %	0 %	40 %	62178610
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1097	NC_006905	TGA	2	6	50941	50946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178610
1098	NC_006905	GTA	2	6	50988	50993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178611
1099	NC_006905	GCA	2	6	51016	51021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178611
1100	NC_006905	TCC	2	6	51031	51036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178611
1101	NC_006905	GCG	2	6	51133	51138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178611
1102	NC_006905	TGA	2	6	51196	51201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178611
1103	NC_006905	ATC	2	6	51252	51257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178611
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1105	NC_006905	GC	3	6	51262	51267	0 %	0 %	50 %	50 %	62178611
1106	NC_006905	TGT	2	6	51302	51307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178611
1107	NC_006905	CGGCG	2	10	51380	51389	0 %	0 %	60 %	40 %	62178611
1108	NC_006905	AGCGC	2	10	51488	51497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1109	NC_006905	GTG	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_006905	TTCAC	2	10	51635	51644	20 %	40 %	0 %	40 %	62178612
1111	NC_006905	GAT	2	6	51655	51660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178612
1112	NC_006905	CGG	2	6	51668	51673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178612
1113	NC_006905	AGCC	2	8	51695	51702	25 %	0 %	25 %	50 %	62178612
1114	NC_006905	AGC	3	9	51743	51751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178612
1115	NC_006905	AAG	2	6	51764	51769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178612
1116	NC_006905	AAAG	2	8	51774	51781	75 %	0 %	25 %	0 %	62178612
1117	NC_006905	CGC	2	6	51801	51806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178612
1118	NC_006905	GGC	2	6	51861	51866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178612
1119	NC_006905	ATGG	2	8	51907	51914	25 %	25 %	50 %	0 %	62178612
1120	NC_006905	TTG	2	6	52111	52116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178613
1121	NC_006905	GC	3	6	52138	52143	0 %	0 %	50 %	50 %	62178613
1122	NC_006905	TCT	2	6	52258	52263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178613
1123	NC_006905	GC	4	8	52368	52375	0 %	0 %	50 %	50 %	62178613
1124	NC_006905	GAA	2	6	52389	52394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178613
1125	NC_006905	G	6	6	52464	52469	0 %	0 %	100 %	0 %	62178613
1126	NC_006905	TGAT	2	8	52579	52586	25 %	50 %	25 %	0 %	62178613
1127	NC_006905	TCG	2	6	52612	52617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178613
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1129	NC_006905	TGG	2	6	52702	52707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178613
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1356	NC_006905	TTA	2	6	62766	62771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1357	NC_006905	TTAA	2	8	62779	62786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1379	NC_006905	GGCA	2	8	63989	63996	25 %	0 %	50 %	25 %	62178623
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1497	NC_006905	T	6	6	69379	69384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_006905	AAAGAA	2	12	69431	69442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_006905	TTA	2	6	69472	69477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_006905	T	6	6	69496	69501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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