MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006905	GC	3	6	232819	232824	0 %	0 %	50 %	50 %	62178771
5002	NC_006905	AAC	2	6	232907	232912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178771
5003	NC_006905	G	7	7	232973	232979	0 %	0 %	100 %	0 %	62178771
5004	NC_006905	GCA	2	6	232993	232998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178771
5005	NC_006905	ATC	2	6	233098	233103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178771
5006	NC_006905	TAT	2	6	233198	233203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178771
5007	NC_006905	TGA	2	6	233204	233209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178771
5008	NC_006905	G	6	6	233216	233221	0 %	0 %	100 %	0 %	62178771
5009	NC_006905	A	8	8	233263	233270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_006905	GGC	2	6	233278	233283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_006905	GTT	2	6	233303	233308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_006905	CG	3	6	233346	233351	0 %	0 %	50 %	50 %	62178772
5013	NC_006905	TCT	2	6	233373	233378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178772
5014	NC_006905	TCC	2	6	233439	233444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178772
5015	NC_006905	GAA	2	6	233456	233461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178772
5016	NC_006905	GAA	2	6	233528	233533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178772
5017	NC_006905	CCG	2	6	233547	233552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178772
5018	NC_006905	GAC	2	6	233561	233566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5019	NC_006905	CCT	2	6	233581	233586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178772
5020	NC_006905	GTG	2	6	233619	233624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178772
5021	NC_006905	TTCA	2	8	233663	233670	25 %	50 %	0 %	25 %	62178772
5022	NC_006905	GCC	2	6	233685	233690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178772
5023	NC_006905	CGA	2	6	233766	233771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5024	NC_006905	GAT	2	6	233804	233809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178772
5025	NC_006905	CAGGT	2	10	233820	233829	20 %	20 %	40 %	20 %	62178772
5026	NC_006905	ACG	2	6	233835	233840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5027	NC_006905	GTA	2	6	233843	233848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178772
5028	NC_006905	TCG	2	6	233892	233897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5029	NC_006905	CAG	2	6	233903	233908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5030	NC_006905	GC	3	6	233931	233936	0 %	0 %	50 %	50 %	62178772
5031	NC_006905	GCG	2	6	233959	233964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178772
5032	NC_006905	CGA	2	6	233995	234000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5033	NC_006905	CGC	2	6	234035	234040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178772
5034	NC_006905	GC	3	6	234039	234044	0 %	0 %	50 %	50 %	62178772
5035	NC_006905	CCG	2	6	234094	234099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178772
5036	NC_006905	GC	3	6	234133	234138	0 %	0 %	50 %	50 %	62178772
5037	NC_006905	CAG	2	6	234155	234160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5038	NC_006905	AGC	2	6	234181	234186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5039	NC_006905	TCG	2	6	234247	234252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178772
5040	NC_006905	GC	3	6	234343	234348	0 %	0 %	50 %	50 %	62178772
5041	NC_006905	AT	3	6	234447	234452	50 %	50 %	0 %	0 %	62178772
5042	NC_006905	CAT	2	6	234466	234471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178772
5043	NC_006905	GCC	2	6	234512	234517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178772
5044	NC_006905	CGC	2	6	234550	234555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178772
5045	NC_006905	TCT	2	6	234767	234772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_006905	CGC	2	6	234865	234870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178773
5047	NC_006905	GGC	2	6	234887	234892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178773
5048	NC_006905	GC	3	6	234970	234975	0 %	0 %	50 %	50 %	62178773
5049	NC_006905	T	6	6	235055	235060	0 %	100 %	0 %	0 %	62178773
5050	NC_006905	GC	3	6	235114	235119	0 %	0 %	50 %	50 %	62178773
5051	NC_006905	GGA	2	6	235121	235126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178773
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5053	NC_006905	CGG	2	6	235172	235177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178773
5054	NC_006905	CGGCG	2	10	235313	235322	0 %	0 %	60 %	40 %	62178773
5055	NC_006905	CT	3	6	235329	235334	0 %	50 %	0 %	50 %	62178773
5056	NC_006905	GCG	2	6	235335	235340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178773
5057	NC_006905	CGC	2	6	235348	235353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178773
5058	NC_006905	TAT	2	6	235370	235375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178773
5059	NC_006905	TCA	2	6	235438	235443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178773
5060	NC_006905	ATT	2	6	235485	235490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178773
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5062	NC_006905	ATT	2	6	235551	235556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178773
5063	NC_006905	TGC	2	6	235591	235596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178773
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5065	NC_006905	A	6	6	235638	235643	100 %	0 %	0 %	0 %	62178773
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5067	NC_006905	CGG	2	6	235667	235672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178773
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5071	NC_006905	CTG	2	6	235770	235775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178773
5072	NC_006905	TTA	2	6	235783	235788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178773
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5074	NC_006905	TGCTT	2	10	235807	235816	0 %	60 %	20 %	20 %	62178773
5075	NC_006905	TTC	2	6	235817	235822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178773
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5081	NC_006905	GC	3	6	235979	235984	0 %	0 %	50 %	50 %	62178773
5082	NC_006905	TGCTGG	2	12	236002	236013	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	62178773
5083	NC_006905	GC	3	6	236121	236126	0 %	0 %	50 %	50 %	62178773
5084	NC_006905	GGC	2	6	236153	236158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178773
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5089	NC_006905	TGG	2	6	236512	236517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178774
5090	NC_006905	AACC	2	8	236567	236574	50 %	0 %	0 %	50 %	62178774
5091	NC_006905	CTTC	2	8	236605	236612	0 %	50 %	0 %	50 %	62178774
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5096	NC_006905	AAT	2	6	236947	236952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178775
5097	NC_006905	CGC	2	6	236955	236960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178775
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5099	NC_006905	CAG	2	6	237112	237117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178775
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5105	NC_006905	ATA	2	6	237428	237433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178776
5106	NC_006905	CCG	2	6	237629	237634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178776
5107	NC_006905	GTC	2	6	237638	237643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178776
5108	NC_006905	GAA	2	6	237702	237707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178776
5109	NC_006905	GCG	2	6	237749	237754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178776
5110	NC_006905	CTGC	2	8	237777	237784	0 %	25 %	25 %	50 %	62178776
5111	NC_006905	GGC	2	6	237811	237816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178776
5112	NC_006905	CCAC	2	8	237861	237868	25 %	0 %	0 %	75 %	62178776
5113	NC_006905	CCG	2	6	237920	237925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178776
5114	NC_006905	CGA	2	6	237933	237938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178776
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5116	NC_006905	T	6	6	238005	238010	0 %	100 %	0 %	0 %	62178776
5117	NC_006905	CGGG	2	8	238017	238024	0 %	0 %	75 %	25 %	62178776
5118	NC_006905	GCT	2	6	238036	238041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178776
5119	NC_006905	CGG	2	6	238062	238067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178776
5120	NC_006905	GA	3	6	238092	238097	50 %	0 %	50 %	0 %	62178776
5121	NC_006905	CG	3	6	238107	238112	0 %	0 %	50 %	50 %	62178776
5122	NC_006905	AGC	2	6	238142	238147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178776
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5124	NC_006905	ACC	2	6	238299	238304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178777
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5238	NC_006905	CATA	2	8	243811	243818	50 %	25 %	0 %	25 %	62178781
5239	NC_006905	TCA	2	6	243829	243834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_006905	AAT	2	6	243849	243854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_006905	CCA	2	6	243876	243881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5242	NC_006905	A	7	7	243890	243896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_006905	AGA	2	6	243911	243916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_006905	GCG	2	6	243944	243949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_006905	GTG	2	6	244097	244102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178782
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5248	NC_006905	T	7	7	244185	244191	0 %	100 %	0 %	0 %	62178782
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5373	NC_006905	CAT	2	6	249274	249279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178785
5374	NC_006905	GCA	2	6	249283	249288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178785
5375	NC_006905	TTC	2	6	249296	249301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178785
5376	NC_006905	CCTTCG	2	12	249354	249365	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	62178785
5377	NC_006905	GGC	2	6	249380	249385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178785
5378	NC_006905	CT	3	6	249441	249446	0 %	50 %	0 %	50 %	62178785
5379	NC_006905	CGA	2	6	249490	249495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178785
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5381	NC_006905	AGGC	2	8	249657	249664	25 %	0 %	50 %	25 %	62178785
5382	NC_006905	GTT	2	6	249676	249681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178785
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5385	NC_006905	GAT	2	6	249856	249861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_006905	AAT	2	6	249868	249873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_006905	TCAG	2	8	249896	249903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5388	NC_006905	T	6	6	249972	249977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_006905	ACTG	2	8	249988	249995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5390	NC_006905	GCC	2	6	250025	250030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_006905	CAA	2	6	250074	250079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_006905	GC	3	6	250113	250118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5393	NC_006905	AC	3	6	250144	250149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_006905	AAC	2	6	250182	250187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5395	NC_006905	AC	4	8	250186	250193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5396	NC_006905	GC	3	6	250383	250388	0 %	0 %	50 %	50 %	62178786
5397	NC_006905	CAT	2	6	250402	250407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178786
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5399	NC_006905	AAGCG	2	10	250513	250522	40 %	0 %	40 %	20 %	62178786
5400	NC_006905	GA	3	6	250525	250530	50 %	0 %	50 %	0 %	62178786
5401	NC_006905	GCT	2	6	250532	250537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178786
5402	NC_006905	TTC	2	6	250553	250558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178786
5403	NC_006905	GCTG	2	8	250569	250576	0 %	25 %	50 %	25 %	62178786
5404	NC_006905	AAGA	2	8	250676	250683	75 %	0 %	25 %	0 %	62178786
5405	NC_006905	AAC	2	6	250814	250819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178786
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5409	NC_006905	GTA	2	6	251166	251171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5412	NC_006905	CTGA	2	8	251347	251354	25 %	25 %	25 %	25 %	162139616
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5415	NC_006905	GCT	2	6	251437	251442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139616
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5431	NC_006905	GAAA	2	8	252256	252263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_006905	GCG	2	6	252314	252319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178788
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5448	NC_006905	GTCTG	2	10	253098	253107	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5484	NC_006905	ATGGC	2	10	254686	254695	20 %	20 %	40 %	20 %	62178790
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5491	NC_006905	CG	3	6	254988	254993	0 %	0 %	50 %	50 %	62178790
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5493	NC_006905	T	6	6	255121	255126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_006905	T	6	6	255156	255161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_006905	A	6	6	255334	255339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_006905	TGT	2	6	255347	255352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178791
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5498	NC_006905	ATGG	2	8	255415	255422	25 %	25 %	50 %	0 %	62178791
5499	NC_006905	GTCC	2	8	255486	255493	0 %	25 %	25 %	50 %	62178791
5500	NC_006905	TGC	2	6	255510	255515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178791

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