MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 100226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006905	AAC	2	6	210551	210556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178754
4502	NC_006905	GGT	2	6	210567	210572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178754
4503	NC_006905	GTT	2	6	210582	210587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178754
4504	NC_006905	GC	3	6	210643	210648	0 %	0 %	50 %	50 %	62178754
4505	NC_006905	GGA	2	6	210650	210655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178754
4506	NC_006905	GC	3	6	210743	210748	0 %	0 %	50 %	50 %	62178754
4507	NC_006905	CTT	2	6	210810	210815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178754
4508	NC_006905	CCG	2	6	210830	210835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178754
4509	NC_006905	GTA	2	6	210868	210873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178754
4510	NC_006905	TCT	2	6	210908	210913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178754
4511	NC_006905	TGT	2	6	210930	210935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178754
4512	NC_006905	GCA	3	9	210939	210947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178754
4513	NC_006905	ATG	2	6	210997	211002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178754
4514	NC_006905	ACG	2	6	211063	211068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178754
4515	NC_006905	CCA	2	6	211071	211076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178754
4516	NC_006905	AAT	2	6	211091	211096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178754
4517	NC_006905	CGC	3	9	211173	211181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178754
4518	NC_006905	CTC	2	6	211327	211332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178754
4519	NC_006905	TAA	2	6	211403	211408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_006905	AG	3	6	211453	211458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_006905	CAT	2	6	211480	211485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_006905	CGC	2	6	211489	211494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_006905	GCA	2	6	211622	211627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139619
4524	NC_006905	CTC	2	6	211629	211634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162139619
4525	NC_006905	ACG	2	6	211657	211662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139619
4526	NC_006905	GCCA	2	8	211805	211812	25 %	0 %	25 %	50 %	162139619
4527	NC_006905	TCG	2	6	211897	211902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139619
4528	NC_006905	ACC	2	6	211903	211908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139619
4529	NC_006905	CGG	2	6	211939	211944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139619
4530	NC_006905	ATA	2	6	211948	211953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162139619
4531	NC_006905	TCGC	2	8	211960	211967	0 %	25 %	25 %	50 %	162139619
4532	NC_006905	CGC	2	6	211991	211996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162139619
4533	NC_006905	CAT	2	6	212003	212008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139619
4534	NC_006905	TGC	2	6	212026	212031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139619
4535	NC_006905	CGG	2	6	212045	212050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139619
4536	NC_006905	CGT	2	6	212087	212092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139619
4537	NC_006905	AGT	2	6	212135	212140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139619
4538	NC_006905	GCCAG	2	10	212162	212171	20 %	0 %	40 %	40 %	162139619
4539	NC_006905	G	6	6	212287	212292	0 %	0 %	100 %	0 %	162139619
4540	NC_006905	GCG	2	6	212359	212364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139619
4541	NC_006905	AGTC	2	8	212426	212433	25 %	25 %	25 %	25 %	162139619
4542	NC_006905	TGC	2	6	212435	212440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139619
4543	NC_006905	AACG	2	8	212493	212500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_006905	CAGC	2	8	212533	212540	25 %	0 %	25 %	50 %	162139618
4545	NC_006905	GGC	2	6	212584	212589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139618
4546	NC_006905	TTC	2	6	212646	212651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139618
4547	NC_006905	TCT	2	6	212656	212661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139618
4548	NC_006905	CTC	2	6	212717	212722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162139618
4549	NC_006905	GCGCG	2	10	212728	212737	0 %	0 %	60 %	40 %	162139618
4550	NC_006905	GGC	2	6	212759	212764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139618
4551	NC_006905	CTT	2	6	212950	212955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139618
4552	NC_006905	ACGC	2	8	213094	213101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_006905	TAA	2	6	213114	213119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_006905	GTTC	2	8	213156	213163	0 %	50 %	25 %	25 %	62178757
4555	NC_006905	T	6	6	213171	213176	0 %	100 %	0 %	0 %	62178757
4556	NC_006905	GCA	2	6	213297	213302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178757
4557	NC_006905	ACC	2	6	213311	213316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178757
4558	NC_006905	GCC	2	6	213332	213337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178757
4559	NC_006905	CTT	2	6	213567	213572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178757
4560	NC_006905	AATG	2	8	213607	213614	50 %	25 %	25 %	0 %	62178757
4561	NC_006905	CGT	2	6	213751	213756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178757
4562	NC_006905	TGA	2	6	213768	213773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178757
4563	NC_006905	A	6	6	213782	213787	100 %	0 %	0 %	0 %	62178757
4564	NC_006905	ATT	3	9	213853	213861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178758
4565	NC_006905	ACG	2	6	213934	213939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178758
4566	NC_006905	CGG	3	9	213965	213973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178758
4567	NC_006905	TGGC	2	8	213987	213994	0 %	25 %	50 %	25 %	62178758
4568	NC_006905	GCA	2	6	214000	214005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178758
4569	NC_006905	AAC	2	6	214042	214047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178758
4570	NC_006905	GC	4	8	214063	214070	0 %	0 %	50 %	50 %	62178758
4571	NC_006905	CAA	2	6	214088	214093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178758
4572	NC_006905	CG	3	6	214096	214101	0 %	0 %	50 %	50 %	62178758
4573	NC_006905	CAC	2	6	214124	214129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178758
4574	NC_006905	GC	4	8	214210	214217	0 %	0 %	50 %	50 %	62178758
4575	NC_006905	CGC	2	6	214268	214273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178758
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4577	NC_006905	GCG	2	6	214308	214313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178758
4578	NC_006905	GC	5	10	214330	214339	0 %	0 %	50 %	50 %	62178758
4579	NC_006905	GTC	2	6	214340	214345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178758
4580	NC_006905	A	6	6	214361	214366	100 %	0 %	0 %	0 %	62178758
4581	NC_006905	GCG	2	6	214425	214430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178759
4582	NC_006905	AAAG	2	8	214432	214439	75 %	0 %	25 %	0 %	62178759
4583	NC_006905	GCC	2	6	214478	214483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
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4585	NC_006905	CGC	2	6	214518	214523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
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4587	NC_006905	CGGGG	2	10	214546	214555	0 %	0 %	80 %	20 %	62178759
4588	NC_006905	TCC	2	6	214611	214616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178759
4589	NC_006905	CGT	2	6	214628	214633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178759
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4591	NC_006905	TGAA	2	8	214674	214681	50 %	25 %	25 %	0 %	62178759
4592	NC_006905	GC	4	8	214711	214718	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4593	NC_006905	GTG	2	6	214751	214756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178759
4594	NC_006905	GC	3	6	214993	214998	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4595	NC_006905	TGA	2	6	215047	215052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178759
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4597	NC_006905	CCCGCC	2	12	215237	215248	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	62178759
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4599	NC_006905	CG	3	6	215356	215361	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4600	NC_006905	TCAG	2	8	215394	215401	25 %	25 %	25 %	25 %	62178759
4601	NC_006905	GC	3	6	215416	215421	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4602	NC_006905	GC	3	6	215425	215430	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4603	NC_006905	GAC	2	6	215433	215438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178759
4604	NC_006905	CTG	2	6	215462	215467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178759
4605	NC_006905	GCGG	2	8	215485	215492	0 %	0 %	75 %	25 %	62178759
4606	NC_006905	TTG	2	6	215537	215542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178759
4607	NC_006905	CTGG	2	8	215587	215594	0 %	25 %	50 %	25 %	62178759
4608	NC_006905	GCC	2	6	215599	215604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
4609	NC_006905	GCC	2	6	215621	215626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
4610	NC_006905	TAT	2	6	215634	215639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178759
4611	NC_006905	GC	3	6	215649	215654	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4612	NC_006905	GC	3	6	215673	215678	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
4613	NC_006905	GGC	2	6	215692	215697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178759
4614	NC_006905	GGC	2	6	215719	215724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178759
4615	NC_006905	GCC	2	6	215756	215761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
4616	NC_006905	GCC	2	6	215765	215770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
4617	NC_006905	CGC	2	6	215796	215801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178759
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4619	NC_006905	GTA	2	6	215825	215830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178759
4620	NC_006905	GCA	2	6	215854	215859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178759
4621	NC_006905	CAG	2	6	215867	215872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178759
4622	NC_006905	GC	3	6	215913	215918	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
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4624	NC_006905	CG	3	6	215959	215964	0 %	0 %	50 %	50 %	62178759
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4736	NC_006905	TTCAA	2	10	220434	220443	40 %	40 %	0 %	20 %	62178761
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4745	NC_006905	A	6	6	220869	220874	100 %	0 %	0 %	0 %	62178761
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4748	NC_006905	ATGCGT	2	12	221033	221044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	62178761
4749	NC_006905	GC	3	6	221070	221075	0 %	0 %	50 %	50 %	62178761
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4753	NC_006905	GGAAT	2	10	221188	221197	40 %	20 %	40 %	0 %	62178761
4754	NC_006905	CGG	2	6	221215	221220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178761
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4865	NC_006905	A	7	7	225823	225829	100 %	0 %	0 %	0 %	62178764
4866	NC_006905	CAATAT	2	12	225887	225898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4867	NC_006905	CTGTC	2	10	225954	225963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4868	NC_006905	AAG	2	6	226000	226005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4869	NC_006905	GC	3	6	226049	226054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4999	NC_006905	TTA	2	6	232715	232720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178771
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