MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006855	GCC	2	6	22354	22359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115488
502	NC_006855	CAT	2	6	22399	22404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115488
503	NC_006855	GC	3	6	22416	22421	0 %	0 %	50 %	50 %	60115488
504	NC_006855	CCG	2	6	22469	22474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115488
505	NC_006855	TTG	2	6	22554	22559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115488
506	NC_006855	GAA	2	6	22579	22584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115488
507	NC_006855	CGG	2	6	22603	22608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115488
508	NC_006855	GAA	2	6	22621	22626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115488
509	NC_006855	TAC	2	6	22637	22642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115488
510	NC_006855	TGA	2	6	22698	22703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115488
511	NC_006855	GAACG	2	10	22759	22768	40 %	0 %	40 %	20 %	60115488
512	NC_006855	GGC	2	6	22796	22801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115488
513	NC_006855	AGAA	2	8	22850	22857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006855	TGCG	2	8	22886	22893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_006855	GCC	2	6	22903	22908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_006855	GCT	3	9	22911	22919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_006855	TGG	2	6	22925	22930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_006855	GCG	3	9	22936	22944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_006855	GTG	2	6	22952	22957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006855	TGT	2	6	23012	23017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006855	TGT	2	6	23066	23071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006855	GGGC	2	8	23105	23112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
523	NC_006855	TGA	2	6	23144	23149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006855	TTAT	3	12	23155	23166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006855	AG	3	6	23168	23173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006855	AAG	2	6	23191	23196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006855	GCA	2	6	23363	23368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_006855	GA	3	6	23373	23378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006855	GAA	2	6	23390	23395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_006855	GGC	2	6	23418	23423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006855	TCC	2	6	23446	23451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_006855	TGG	2	6	23476	23481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006855	CAT	3	9	23534	23542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229037897
534	NC_006855	CGC	2	6	23556	23561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229037897
535	NC_006855	CCG	2	6	23589	23594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229037897
536	NC_006855	GCT	2	6	23626	23631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229037897
537	NC_006855	CGC	2	6	23676	23681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229037897
538	NC_006855	GCT	2	6	23809	23814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229037897
539	NC_006855	GCGG	2	8	23840	23847	0 %	0 %	75 %	25 %	229037897
540	NC_006855	TCGG	2	8	23907	23914	0 %	25 %	50 %	25 %	229037897
541	NC_006855	GGTA	2	8	23950	23957	25 %	25 %	50 %	0 %	229037897
542	NC_006855	AGC	2	6	24120	24125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229037897
543	NC_006855	ACG	2	6	24137	24142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229037897
544	NC_006855	GCA	2	6	24145	24150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229037897
545	NC_006855	GGC	2	6	24153	24158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229037897
546	NC_006855	CGAA	3	12	24179	24190	50 %	0 %	25 %	25 %	229037897
547	NC_006855	TC	3	6	24279	24284	0 %	50 %	0 %	50 %	229037897
548	NC_006855	CGGATT	2	12	24296	24307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229037897
549	NC_006855	GTCA	2	8	24344	24351	25 %	25 %	25 %	25 %	229037897
550	NC_006855	CTGC	2	8	24355	24362	0 %	25 %	25 %	50 %	60115490
551	NC_006855	TGG	2	6	24450	24455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006855	TCA	2	6	24551	24556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_006855	GCCA	2	8	24586	24593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_006855	GACGA	2	10	24632	24641	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
555	NC_006855	CTT	2	6	24663	24668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_006855	TAG	2	6	24702	24707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006855	AGT	2	6	24726	24731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006855	GCT	2	6	24749	24754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_006855	CTTT	2	8	24760	24767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_006855	ATGT	2	8	24768	24775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_006855	CGT	2	6	24804	24809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_006855	T	6	6	24811	24816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006855	TCT	3	9	24833	24841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_006855	TAC	2	6	24960	24965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_006855	ACTT	2	8	24984	24991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_006855	GAC	2	6	25136	25141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115491
567	NC_006855	CTG	2	6	25167	25172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115491
568	NC_006855	ACG	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115491
569	NC_006855	GCG	2	6	25257	25262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115491
570	NC_006855	GTG	2	6	25297	25302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115491
571	NC_006855	CGC	2	6	25370	25375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115491
572	NC_006855	TTC	2	6	25393	25398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115491
573	NC_006855	CTT	2	6	25407	25412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115491
574	NC_006855	CAT	2	6	25419	25424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115491
575	NC_006855	ATC	2	6	25426	25431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115491
576	NC_006855	CGG	2	6	25535	25540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115491
577	NC_006855	CCG	2	6	25541	25546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115491
578	NC_006855	ACT	2	6	25548	25553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115491
579	NC_006855	GC	3	6	25571	25576	0 %	0 %	50 %	50 %	60115491
580	NC_006855	TGG	2	6	25589	25594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006855	CTG	2	6	25681	25686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_006855	GCA	2	6	25745	25750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_006855	CG	3	6	25851	25856	0 %	0 %	50 %	50 %	60115492
584	NC_006855	TTC	2	6	25917	25922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115492
585	NC_006855	TG	3	6	26042	26047	0 %	50 %	50 %	0 %	60115492
586	NC_006855	CACG	2	8	26090	26097	25 %	0 %	25 %	50 %	60115492
587	NC_006855	CCA	2	6	26142	26147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115492
588	NC_006855	TCC	2	6	26170	26175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115492
589	NC_006855	ACTG	2	8	26176	26183	25 %	25 %	25 %	25 %	60115492
590	NC_006855	T	8	8	26223	26230	0 %	100 %	0 %	0 %	60115492
591	NC_006855	TTC	2	6	26275	26280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115492
592	NC_006855	GTG	2	6	26299	26304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115492
593	NC_006855	TAA	2	6	26309	26314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115492
594	NC_006855	TGC	2	6	26400	26405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_006855	A	6	6	26500	26505	100 %	0 %	0 %	0 %	60115493
596	NC_006855	CCG	2	6	26588	26593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115493
597	NC_006855	CCA	3	9	26630	26638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115493
598	NC_006855	TTC	2	6	26661	26666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115493
599	NC_006855	ACCAGC	2	12	26701	26712	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	60115493
600	NC_006855	CAG	2	6	26760	26765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115493
601	NC_006855	GCT	2	6	26798	26803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115493
602	NC_006855	CAC	2	6	26806	26811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115493
603	NC_006855	CCA	2	6	27059	27064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115493
604	NC_006855	CAG	3	9	27066	27074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115493
605	NC_006855	TGA	2	6	27086	27091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115493
606	NC_006855	TC	3	6	27094	27099	0 %	50 %	0 %	50 %	60115493
607	NC_006855	CAG	2	6	27117	27122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115493
608	NC_006855	CATCGT	2	12	27180	27191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	60115493
609	NC_006855	CCCG	2	8	27214	27221	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
610	NC_006855	CTG	2	6	27265	27270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115494
611	NC_006855	GCC	2	6	27341	27346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115494
612	NC_006855	CAC	3	9	27392	27400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115494
613	NC_006855	CCAG	2	8	27450	27457	25 %	0 %	25 %	50 %	60115494
614	NC_006855	CGG	2	6	27589	27594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115494
615	NC_006855	GCA	2	6	27703	27708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115494
616	NC_006855	CGGC	2	8	27714	27721	0 %	0 %	50 %	50 %	60115494
617	NC_006855	TCA	2	6	27769	27774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115494
618	NC_006855	GTC	2	6	27860	27865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115494
619	NC_006855	TGC	2	6	27882	27887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115494
620	NC_006855	C	20	20	27985	28004	0 %	0 %	0 %	100 %	60115495
621	NC_006855	GCT	2	6	28043	28048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115495
622	NC_006855	G	6	6	28053	28058	0 %	0 %	100 %	0 %	60115495
623	NC_006855	TCC	2	6	28106	28111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115495
624	NC_006855	CCA	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115495
625	NC_006855	GC	3	6	28158	28163	0 %	0 %	50 %	50 %	60115495
626	NC_006855	TGA	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115495
627	NC_006855	GGT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115495
628	NC_006855	CTG	2	6	28243	28248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115495
629	NC_006855	CGA	2	6	28295	28300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115495
630	NC_006855	CAT	2	6	28342	28347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115495
631	NC_006855	CCCGCT	2	12	28362	28373	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	60115495
632	NC_006855	GCA	2	6	28379	28384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115495
633	NC_006855	GCT	2	6	28516	28521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115495
634	NC_006855	GACA	2	8	28531	28538	50 %	0 %	25 %	25 %	60115495
635	NC_006855	TCA	2	6	28619	28624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115495
636	NC_006855	CCCGG	2	10	28627	28636	0 %	0 %	40 %	60 %	60115495
637	NC_006855	CGG	2	6	28660	28665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115495
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640	NC_006855	GCTGC	2	10	28788	28797	0 %	20 %	40 %	40 %	60115495
641	NC_006855	CCT	2	6	28810	28815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115495
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654	NC_006855	CCT	2	6	29553	29558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115495
655	NC_006855	GCT	2	6	29583	29588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115495
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663	NC_006855	ATC	2	6	29899	29904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115496
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746	NC_006855	GTCA	2	8	32949	32956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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