MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A plasmid pSERP

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006663	TA	3	6	1032	1037	50 %	50 %	0 %	0 %	57854754
2	NC_006663	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	57854754
3	NC_006663	TA	3	6	2720	2725	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
4	NC_006663	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
5	NC_006663	AT	3	6	3238	3243	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
6	NC_006663	AT	3	6	3483	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	57854756
7	NC_006663	TA	3	6	4552	4557	50 %	50 %	0 %	0 %	57854757
8	NC_006663	TA	3	6	5023	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006663	TA	3	6	5664	5669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006663	AG	3	6	5975	5980	50 %	0 %	50 %	0 %	57854759
11	NC_006663	TA	3	6	6051	6056	50 %	50 %	0 %	0 %	57854759
12	NC_006663	AC	3	6	6254	6259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006663	AT	3	6	6449	6454	50 %	50 %	0 %	0 %	57854760
14	NC_006663	TA	3	6	6956	6961	50 %	50 %	0 %	0 %	57854760
15	NC_006663	CG	3	6	7975	7980	0 %	0 %	50 %	50 %	57854762
16	NC_006663	TA	3	6	8386	8391	50 %	50 %	0 %	0 %	57854762
17	NC_006663	AT	3	6	8757	8762	50 %	50 %	0 %	0 %	57854763
18	NC_006663	GC	3	6	8769	8774	0 %	0 %	50 %	50 %	57854763
19	NC_006663	AT	3	6	8893	8898	50 %	50 %	0 %	0 %	57854763
20	NC_006663	AT	3	6	8918	8923	50 %	50 %	0 %	0 %	57854763
21	NC_006663	CT	3	6	9127	9132	0 %	50 %	0 %	50 %	57854764
22	NC_006663	AT	3	6	9371	9376	50 %	50 %	0 %	0 %	57854764
23	NC_006663	TA	3	6	10399	10404	50 %	50 %	0 %	0 %	57854766
24	NC_006663	AT	3	6	10613	10618	50 %	50 %	0 %	0 %	57854766
25	NC_006663	TA	3	6	11583	11588	50 %	50 %	0 %	0 %	57854767
26	NC_006663	AG	3	6	11593	11598	50 %	0 %	50 %	0 %	57854767
27	NC_006663	CA	3	6	11884	11889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006663	CT	3	6	11981	11986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006663	TA	3	6	12029	12034	50 %	50 %	0 %	0 %	57854768
30	NC_006663	AT	3	6	12248	12253	50 %	50 %	0 %	0 %	57854768
31	NC_006663	TG	3	6	13840	13845	0 %	50 %	50 %	0 %	57854770
32	NC_006663	TA	3	6	14253	14258	50 %	50 %	0 %	0 %	57854770
33	NC_006663	TA	3	6	14554	14559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006663	AG	3	6	14596	14601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006663	TA	3	6	14709	14714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006663	TA	3	6	14757	14762	50 %	50 %	0 %	0 %	57854771
37	NC_006663	AT	3	6	15236	15241	50 %	50 %	0 %	0 %	57854771
38	NC_006663	AT	3	6	15781	15786	50 %	50 %	0 %	0 %	57854772
39	NC_006663	TA	3	6	16288	16293	50 %	50 %	0 %	0 %	57854772
40	NC_006663	AT	3	6	16453	16458	50 %	50 %	0 %	0 %	57854773
41	NC_006663	TA	3	6	16960	16965	50 %	50 %	0 %	0 %	57854773
42	NC_006663	AT	3	6	17055	17060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006663	AC	3	6	17416	17421	50 %	0 %	0 %	50 %	57854774
44	NC_006663	AC	3	6	17472	17477	50 %	0 %	0 %	50 %	57854774
45	NC_006663	AT	3	6	17736	17741	50 %	50 %	0 %	0 %	57854774
46	NC_006663	TA	3	6	18450	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006663	AT	3	6	18964	18969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006663	AT	3	6	19007	19012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006663	GA	3	6	19396	19401	50 %	0 %	50 %	0 %	57854775
50	NC_006663	AT	3	6	20038	20043	50 %	50 %	0 %	0 %	57854776
51	NC_006663	CT	3	6	20295	20300	0 %	50 %	0 %	50 %	57854776
52	NC_006663	TA	4	8	20580	20587	50 %	50 %	0 %	0 %	57854776
53	NC_006663	AT	4	8	20610	20617	50 %	50 %	0 %	0 %	57854776
54	NC_006663	TA	3	6	20915	20920	50 %	50 %	0 %	0 %	57854776
55	NC_006663	AT	3	6	21291	21296	50 %	50 %	0 %	0 %	57854745
56	NC_006663	AT	3	6	21390	21395	50 %	50 %	0 %	0 %	57854745
57	NC_006663	AT	3	6	21417	21422	50 %	50 %	0 %	0 %	57854745
58	NC_006663	AC	3	6	23168	23173	50 %	0 %	0 %	50 %	57854749
59	NC_006663	AG	4	8	23827	23834	50 %	0 %	50 %	0 %	57854749
60	NC_006663	AT	3	6	24372	24377	50 %	50 %	0 %	0 %	57854750
61	NC_006663	AT	4	8	24425	24432	50 %	50 %	0 %	0 %	57854751
62	NC_006663	AT	3	6	25002	25007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006663	TA	3	6	25509	25514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006663	AT	3	6	25604	25609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006663	AG	3	6	26008	26013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006663	AT	3	6	26786	26791	50 %	50 %	0 %	0 %	57854752
67	NC_006663	AT	4	8	26820	26827	50 %	50 %	0 %	0 %	57854752
68	NC_006663	TA	3	6	27097	27102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006663	AT	3	6	27107	27112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.