MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 2403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006576	CT	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006576	TG	3	6	1019	1024	0 %	50 %	50 %	0 %	56750011
3	NC_006576	GA	3	6	1281	1286	50 %	0 %	50 %	0 %	56750011
4	NC_006576	TG	3	6	2371	2376	0 %	50 %	50 %	0 %	56750013
5	NC_006576	TC	3	6	2748	2753	0 %	50 %	0 %	50 %	56750014
6	NC_006576	TC	3	6	3586	3591	0 %	50 %	0 %	50 %	56750014
7	NC_006576	CT	3	6	4060	4065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006576	GT	3	6	4079	4084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006576	CT	3	6	4324	4329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006576	AC	3	6	4526	4531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006576	AG	3	6	4849	4854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006576	GT	3	6	5064	5069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006576	CA	3	6	5253	5258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006576	AC	3	6	5567	5572	50 %	0 %	0 %	50 %	56750015
15	NC_006576	GT	3	6	6672	6677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006576	TC	3	6	8440	8445	0 %	50 %	0 %	50 %	56750017
17	NC_006576	GA	3	6	8962	8967	50 %	0 %	50 %	0 %	56750017
18	NC_006576	TC	3	6	9847	9852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006576	TC	3	6	10166	10171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006576	AG	4	8	14339	14346	50 %	0 %	50 %	0 %	56750023
21	NC_006576	CG	3	6	14511	14516	0 %	0 %	50 %	50 %	56750024
22	NC_006576	AC	3	6	16050	16055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006576	TG	3	6	16116	16121	0 %	50 %	50 %	0 %	56750025
24	NC_006576	CT	3	6	16372	16377	0 %	50 %	0 %	50 %	56750025
25	NC_006576	CT	3	6	17071	17076	0 %	50 %	0 %	50 %	56750025
26	NC_006576	GC	3	6	17313	17318	0 %	0 %	50 %	50 %	56750026
27	NC_006576	TC	3	6	18025	18030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006576	TA	3	6	18540	18545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006576	CT	3	6	19115	19120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006576	TC	3	6	19631	19636	0 %	50 %	0 %	50 %	56750028
31	NC_006576	AG	3	6	19979	19984	50 %	0 %	50 %	0 %	56750029
32	NC_006576	TG	3	6	20649	20654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006576	AG	3	6	20748	20753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006576	AG	3	6	21207	21212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006576	AT	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006576	GA	3	6	22209	22214	50 %	0 %	50 %	0 %	56750030
37	NC_006576	CG	3	6	26593	26598	0 %	0 %	50 %	50 %	56750033
38	NC_006576	GC	3	6	26804	26809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006576	TG	3	6	27070	27075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006576	TG	3	6	32105	32110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006576	AT	3	6	32171	32176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006576	CA	3	6	35517	35522	50 %	0 %	0 %	50 %	56750040
43	NC_006576	AC	3	6	36700	36705	50 %	0 %	0 %	50 %	56750040
44	NC_006576	CT	3	6	37509	37514	0 %	50 %	0 %	50 %	56750040
45	NC_006576	GA	3	6	37568	37573	50 %	0 %	50 %	0 %	56750041
46	NC_006576	CA	3	6	37731	37736	50 %	0 %	0 %	50 %	56750041
47	NC_006576	CG	3	6	39485	39490	0 %	0 %	50 %	50 %	56750041
48	NC_006576	GC	3	6	39528	39533	0 %	0 %	50 %	50 %	56750041
49	NC_006576	CT	4	8	40368	40375	0 %	50 %	0 %	50 %	56750042
50	NC_006576	CA	3	6	40600	40605	50 %	0 %	0 %	50 %	56750042
51	NC_006576	GA	3	6	41156	41161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006576	GC	3	6	42367	42372	0 %	0 %	50 %	50 %	56750043
53	NC_006576	GA	3	6	44094	44099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006576	AG	3	6	44350	44355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006576	AG	3	6	45082	45087	50 %	0 %	50 %	0 %	56750046
56	NC_006576	AG	3	6	45673	45678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006576	CG	3	6	47751	47756	0 %	0 %	50 %	50 %	56750047
58	NC_006576	CG	3	6	49285	49290	0 %	0 %	50 %	50 %	56750049
59	NC_006576	GT	3	6	49340	49345	0 %	50 %	50 %	0 %	56750049
60	NC_006576	GC	3	6	50025	50030	0 %	0 %	50 %	50 %	56750050
61	NC_006576	GA	3	6	51268	51273	50 %	0 %	50 %	0 %	56750051
62	NC_006576	CG	3	6	51349	51354	0 %	0 %	50 %	50 %	56750051
63	NC_006576	GC	3	6	52422	52427	0 %	0 %	50 %	50 %	56750052
64	NC_006576	AC	3	6	53332	53337	50 %	0 %	0 %	50 %	56750052
65	NC_006576	CG	3	6	53482	53487	0 %	0 %	50 %	50 %	56750052
66	NC_006576	GA	3	6	54932	54937	50 %	0 %	50 %	0 %	56750054
67	NC_006576	TC	3	6	61213	61218	0 %	50 %	0 %	50 %	56750059
68	NC_006576	CG	3	6	61644	61649	0 %	0 %	50 %	50 %	56750059
69	NC_006576	GC	3	6	61915	61920	0 %	0 %	50 %	50 %	56750060
70	NC_006576	GC	3	6	62266	62271	0 %	0 %	50 %	50 %	56750060
71	NC_006576	TC	3	6	62919	62924	0 %	50 %	0 %	50 %	56750061
72	NC_006576	GC	3	6	65679	65684	0 %	0 %	50 %	50 %	56750064
73	NC_006576	GC	3	6	67213	67218	0 %	0 %	50 %	50 %	56750066
74	NC_006576	GC	3	6	68398	68403	0 %	0 %	50 %	50 %	56750068
75	NC_006576	CA	3	6	68860	68865	50 %	0 %	0 %	50 %	56750068
76	NC_006576	CG	3	6	68890	68895	0 %	0 %	50 %	50 %	56750068
77	NC_006576	GT	3	6	69260	69265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006576	CG	3	6	69941	69946	0 %	0 %	50 %	50 %	56750069
79	NC_006576	AG	3	6	70824	70829	50 %	0 %	50 %	0 %	56750070
80	NC_006576	CG	3	6	70952	70957	0 %	0 %	50 %	50 %	56750070
81	NC_006576	CG	3	6	71944	71949	0 %	0 %	50 %	50 %	56750071
82	NC_006576	GT	3	6	73067	73072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006576	GC	3	6	74026	74031	0 %	0 %	50 %	50 %	56750073
84	NC_006576	CT	3	6	74955	74960	0 %	50 %	0 %	50 %	56750074
85	NC_006576	AC	3	6	75665	75670	50 %	0 %	0 %	50 %	56750074
86	NC_006576	CT	3	6	76007	76012	0 %	50 %	0 %	50 %	56750074
87	NC_006576	CT	4	8	76068	76075	0 %	50 %	0 %	50 %	56750074
88	NC_006576	GC	3	6	76751	76756	0 %	0 %	50 %	50 %	56750075
89	NC_006576	GC	3	6	77282	77287	0 %	0 %	50 %	50 %	56750075
90	NC_006576	GC	3	6	80618	80623	0 %	0 %	50 %	50 %	56750076
91	NC_006576	AG	3	6	80686	80691	50 %	0 %	50 %	0 %	56750076
92	NC_006576	CT	3	6	81128	81133	0 %	50 %	0 %	50 %	56750076
93	NC_006576	GC	3	6	82075	82080	0 %	0 %	50 %	50 %	56750078
94	NC_006576	CG	3	6	84877	84882	0 %	0 %	50 %	50 %	56750083
95	NC_006576	CG	3	6	85313	85318	0 %	0 %	50 %	50 %	56750083
96	NC_006576	CT	3	6	85571	85576	0 %	50 %	0 %	50 %	56750083
97	NC_006576	GC	3	6	86949	86954	0 %	0 %	50 %	50 %	56750087
98	NC_006576	CG	3	6	87474	87479	0 %	0 %	50 %	50 %	56750087
99	NC_006576	CG	3	6	87688	87693	0 %	0 %	50 %	50 %	56750087
100	NC_006576	GC	3	6	88845	88850	0 %	0 %	50 %	50 %	56750088
101	NC_006576	AT	3	6	88922	88927	50 %	50 %	0 %	0 %	56750088
102	NC_006576	GC	3	6	90116	90121	0 %	0 %	50 %	50 %	56750088
103	NC_006576	GT	3	6	90376	90381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006576	TG	3	6	92594	92599	0 %	50 %	50 %	0 %	56750089
105	NC_006576	TG	3	6	92789	92794	0 %	50 %	50 %	0 %	56750089
106	NC_006576	CA	3	6	93034	93039	50 %	0 %	0 %	50 %	56750089
107	NC_006576	TG	3	6	94530	94535	0 %	50 %	50 %	0 %	161621824
108	NC_006576	CA	3	6	95567	95572	50 %	0 %	0 %	50 %	56750092
109	NC_006576	TC	3	6	96689	96694	0 %	50 %	0 %	50 %	56750094
110	NC_006576	TC	3	6	97984	97989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_006576	CT	3	6	98080	98085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006576	AC	3	6	100739	100744	50 %	0 %	0 %	50 %	56750099
113	NC_006576	CG	3	6	100832	100837	0 %	0 %	50 %	50 %	56750099
114	NC_006576	CT	3	6	102554	102559	0 %	50 %	0 %	50 %	56750101
115	NC_006576	CT	3	6	102623	102628	0 %	50 %	0 %	50 %	56750101
116	NC_006576	AT	4	8	103035	103042	50 %	50 %	0 %	0 %	56750101
117	NC_006576	GC	3	6	108017	108022	0 %	0 %	50 %	50 %	56750105
118	NC_006576	CT	3	6	108844	108849	0 %	50 %	0 %	50 %	56750107
119	NC_006576	CG	3	6	109881	109886	0 %	0 %	50 %	50 %	56750109
120	NC_006576	CA	3	6	111924	111929	50 %	0 %	0 %	50 %	56750111
121	NC_006576	AG	3	6	112230	112235	50 %	0 %	50 %	0 %	56750111
122	NC_006576	AG	3	6	112445	112450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006576	GC	3	6	113434	113439	0 %	0 %	50 %	50 %	161621823
124	NC_006576	GC	3	6	113767	113772	0 %	0 %	50 %	50 %	56750113
125	NC_006576	CT	3	6	114406	114411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006576	CT	3	6	114973	114978	0 %	50 %	0 %	50 %	56750114
127	NC_006576	CG	3	6	118275	118280	0 %	0 %	50 %	50 %	56750117
128	NC_006576	TC	3	6	120613	120618	0 %	50 %	0 %	50 %	56750120
129	NC_006576	CT	3	6	120664	120669	0 %	50 %	0 %	50 %	56750120
130	NC_006576	GC	3	6	121565	121570	0 %	0 %	50 %	50 %	56750121
131	NC_006576	AG	3	6	122470	122475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006576	GC	3	6	122530	122535	0 %	0 %	50 %	50 %	56750122
133	NC_006576	CT	3	6	123639	123644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006576	TC	3	6	123782	123787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_006576	CG	3	6	124358	124363	0 %	0 %	50 %	50 %	56750123
136	NC_006576	TC	3	6	124898	124903	0 %	50 %	0 %	50 %	56750124
137	NC_006576	TA	3	6	126703	126708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006576	GC	3	6	127642	127647	0 %	0 %	50 %	50 %	56750126
139	NC_006576	CT	3	6	127897	127902	0 %	50 %	0 %	50 %	56750126
140	NC_006576	TA	3	6	128860	128865	50 %	50 %	0 %	0 %	56750127
141	NC_006576	GA	3	6	129528	129533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006576	AG	3	6	130386	130391	50 %	0 %	50 %	0 %	56750130
143	NC_006576	TC	3	6	131463	131468	0 %	50 %	0 %	50 %	56750130
144	NC_006576	GA	3	6	135840	135845	50 %	0 %	50 %	0 %	56750134
145	NC_006576	GT	3	6	136436	136441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006576	GC	3	6	137602	137607	0 %	0 %	50 %	50 %	56750136
147	NC_006576	GC	3	6	137755	137760	0 %	0 %	50 %	50 %	56750136
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