MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 36918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006449	TAT	2	6	25476	25481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822014
502	NC_006449	TAT	2	6	25511	25516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822014
503	NC_006449	CTAGT	2	10	25531	25540	20 %	40 %	20 %	20 %	55822014
504	NC_006449	ATT	2	6	25586	25591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822014
505	NC_006449	TAAA	2	8	25616	25623	75 %	25 %	0 %	0 %	55822014
506	NC_006449	TAA	2	6	25639	25644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006449	T	6	6	25656	25661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006449	AGT	2	6	25691	25696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006449	TAT	2	6	25703	25708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822015
510	NC_006449	A	6	6	25710	25715	100 %	0 %	0 %	0 %	55822015
511	NC_006449	CAG	2	6	25726	25731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
512	NC_006449	GTG	2	6	25741	25746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822015
513	NC_006449	CAG	2	6	25756	25761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
514	NC_006449	GCT	2	6	25800	25805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822015
515	NC_006449	CAA	2	6	25836	25841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822015
516	NC_006449	CAATC	2	10	25867	25876	40 %	20 %	0 %	40 %	55822015
517	NC_006449	A	6	6	25900	25905	100 %	0 %	0 %	0 %	55822015
518	NC_006449	CAA	2	6	26031	26036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822015
519	NC_006449	CTA	2	6	26047	26052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822015
520	NC_006449	GTT	2	6	26124	26129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822015
521	NC_006449	TAA	2	6	26135	26140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822015
522	NC_006449	TGC	2	6	26180	26185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822015
523	NC_006449	AAG	2	6	26191	26196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822015
524	NC_006449	TAA	2	6	26228	26233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822015
525	NC_006449	ACA	2	6	26247	26252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822015
526	NC_006449	CAA	2	6	26271	26276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822015
527	NC_006449	AGC	2	6	26288	26293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
528	NC_006449	GCT	2	6	26307	26312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822015
529	NC_006449	CTG	2	6	26365	26370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822015
530	NC_006449	CTT	2	6	26452	26457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822015
531	NC_006449	AGC	2	6	26462	26467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
532	NC_006449	CTT	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822015
533	NC_006449	AGC	2	6	26492	26497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
534	NC_006449	TCA	2	6	26580	26585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822015
535	NC_006449	GCA	2	6	26760	26765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
536	NC_006449	GCT	2	6	26793	26798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822015
537	NC_006449	CAG	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
538	NC_006449	TAA	2	6	26891	26896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822015
539	NC_006449	AGC	2	6	26933	26938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822015
540	NC_006449	ATG	2	6	26992	26997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822015
541	NC_006449	GTG	2	6	26998	27003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822015
542	NC_006449	CATCAG	2	12	27028	27039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55822015
543	NC_006449	ATTCA	2	10	27046	27055	40 %	40 %	0 %	20 %	55822015
544	NC_006449	CAT	2	6	27121	27126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822015
545	NC_006449	TGG	2	6	27134	27139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822015
546	NC_006449	ACA	2	6	27170	27175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_006449	TTTTA	2	10	27203	27212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_006449	ATA	2	6	27218	27223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006449	AAT	2	6	27239	27244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006449	A	7	7	27253	27259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_006449	ATTT	2	8	27310	27317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006449	A	6	6	27336	27341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006449	TAG	2	6	27355	27360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006449	GGA	2	6	27368	27373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55822016
555	NC_006449	GTC	2	6	27410	27415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822016
556	NC_006449	AGC	2	6	27428	27433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822016
557	NC_006449	TCA	2	6	27533	27538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822016
558	NC_006449	TTC	2	6	27547	27552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822016
559	NC_006449	CAAT	2	8	27634	27641	50 %	25 %	0 %	25 %	55822016
560	NC_006449	GTT	2	6	27642	27647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822016
561	NC_006449	TTA	2	6	27653	27658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822016
562	NC_006449	GTTG	2	8	27713	27720	0 %	50 %	50 %	0 %	55822016
563	NC_006449	CTC	2	6	27775	27780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55822016
564	NC_006449	ATT	2	6	27841	27846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822016
565	NC_006449	ATG	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822016
566	NC_006449	GTT	3	9	27879	27887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822016
567	NC_006449	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822016
568	NC_006449	CGT	2	6	27966	27971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822016
569	NC_006449	TTGA	2	8	28041	28048	25 %	50 %	25 %	0 %	55822016
570	NC_006449	TGAT	2	8	28054	28061	25 %	50 %	25 %	0 %	55822016
571	NC_006449	CAT	2	6	28126	28131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822016
572	NC_006449	ATA	2	6	28165	28170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822016
573	NC_006449	TTG	2	6	28195	28200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822016
574	NC_006449	AGA	2	6	28223	28228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822016
575	NC_006449	TGAT	2	8	28234	28241	25 %	50 %	25 %	0 %	55822016
576	NC_006449	TGATT	2	10	28265	28274	20 %	60 %	20 %	0 %	55822016
577	NC_006449	AG	3	6	28394	28399	50 %	0 %	50 %	0 %	55822017
578	NC_006449	TCT	2	6	28411	28416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55822017
579	NC_006449	TGA	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822017
580	NC_006449	TAA	2	6	28459	28464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822017
581	NC_006449	TAA	2	6	28608	28613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822017
582	NC_006449	A	6	6	28646	28651	100 %	0 %	0 %	0 %	55822017
583	NC_006449	TAA	2	6	28704	28709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_006449	TCT	2	6	28719	28724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_006449	TCT	2	6	28738	28743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_006449	CTT	2	6	28854	28859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_006449	GCT	2	6	28910	28915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_006449	GAT	2	6	28917	28922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_006449	AAT	2	6	28935	28940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006449	ACCTT	2	10	29009	29018	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
591	NC_006449	TGG	2	6	29041	29046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006449	TTC	2	6	29113	29118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006449	CGT	2	6	29122	29127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_006449	ATG	2	6	29193	29198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006449	ATG	2	6	29251	29256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006449	T	6	6	29382	29387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_006449	AAT	2	6	29427	29432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006449	TAA	2	6	29471	29476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55822018
599	NC_006449	CAAT	2	8	29520	29527	50 %	25 %	0 %	25 %	55822018
600	NC_006449	AGC	2	6	29600	29605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55822018
601	NC_006449	GCT	2	6	29673	29678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822018
602	NC_006449	TTG	2	6	29866	29871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822018
603	NC_006449	ACA	2	6	29880	29885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55822018
604	NC_006449	TTTTG	2	10	29894	29903	0 %	80 %	20 %	0 %	55822018
605	NC_006449	CAAC	2	8	29974	29981	50 %	0 %	0 %	50 %	55822018
606	NC_006449	A	6	6	30036	30041	100 %	0 %	0 %	0 %	55822018
607	NC_006449	TGT	2	6	30053	30058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822018
608	NC_006449	TGA	2	6	30062	30067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822018
609	NC_006449	AACT	2	8	30079	30086	50 %	25 %	0 %	25 %	55822018
610	NC_006449	CTA	2	6	30259	30264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55822018
611	NC_006449	CTG	2	6	30295	30300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822018
612	NC_006449	GAT	2	6	30306	30311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822018
613	NC_006449	A	6	6	30361	30366	100 %	0 %	0 %	0 %	55822018
614	NC_006449	ATT	2	6	30387	30392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822018
615	NC_006449	GCTATT	2	12	30486	30497	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55822018
616	NC_006449	GAA	2	6	30606	30611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822018
617	NC_006449	T	6	6	30715	30720	0 %	100 %	0 %	0 %	55822019
618	NC_006449	GGT	2	6	30727	30732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55822019
619	NC_006449	ATG	2	6	30784	30789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822019
620	NC_006449	ATG	2	6	30797	30802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822019
621	NC_006449	TGC	2	6	30909	30914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55822019
622	NC_006449	ATT	2	6	30942	30947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55822019
623	NC_006449	GAA	2	6	31144	31149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822019
624	NC_006449	GAA	2	6	31219	31224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822019
625	NC_006449	ATGAA	2	10	31247	31256	60 %	20 %	20 %	0 %	55822019
626	NC_006449	TGA	2	6	31278	31283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55822019
627	NC_006449	AAG	2	6	31321	31326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822019
628	NC_006449	AGA	2	6	31368	31373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55822019
629	NC_006449	TCT	2	6	31393	31398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_006449	CTG	2	6	31498	31503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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883	NC_006449	AT	3	6	42653	42658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
884	NC_006449	AT	3	6	42730	42735	50 %	50 %	0 %	0 %	55822028
885	NC_006449	AATT	2	8	42741	42748	50 %	50 %	0 %	0 %	55822028
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889	NC_006449	GTT	2	6	42843	42848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55822028
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