MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006448	AT	3	6	192091	192096	50 %	50 %	0 %	0 %	55820281
4002	NC_006448	T	6	6	192100	192105	0 %	100 %	0 %	0 %	55820281
4003	NC_006448	ATTT	2	8	192135	192142	25 %	75 %	0 %	0 %	55820281
4004	NC_006448	TA	3	6	192171	192176	50 %	50 %	0 %	0 %	55820281
4005	NC_006448	ATT	2	6	192297	192302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820281
4006	NC_006448	TAA	2	6	192307	192312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820281
4007	NC_006448	GAG	2	6	192314	192319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820281
4008	NC_006448	AG	3	6	192318	192323	50 %	0 %	50 %	0 %	55820281
4009	NC_006448	AGG	2	6	192372	192377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820281
4010	NC_006448	T	7	7	192390	192396	0 %	100 %	0 %	0 %	55820282
4011	NC_006448	ACA	2	6	192397	192402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820282
4012	NC_006448	ACC	2	6	192452	192457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820282
4013	NC_006448	T	6	6	192647	192652	0 %	100 %	0 %	0 %	55820282
4014	NC_006448	TGG	2	6	192680	192685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820282
4015	NC_006448	ATT	2	6	192725	192730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820282
4016	NC_006448	TCG	2	6	192766	192771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820282
4017	NC_006448	GGT	2	6	192772	192777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820282
4018	NC_006448	GAG	2	6	192782	192787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820282
4019	NC_006448	CTG	2	6	192875	192880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820282
4020	NC_006448	CTT	2	6	192930	192935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820282
4021	NC_006448	CGA	2	6	192947	192952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820282
4022	NC_006448	TGA	2	6	192976	192981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820282
4023	NC_006448	AAC	2	6	193002	193007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820282
4024	NC_006448	TGA	2	6	193155	193160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820282
4025	NC_006448	CTTT	2	8	193242	193249	0 %	75 %	0 %	25 %	55820282
4026	NC_006448	TTG	2	6	193328	193333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820282
4027	NC_006448	TCTT	2	8	193390	193397	0 %	75 %	0 %	25 %	55820282
4028	NC_006448	TCCAA	2	10	193415	193424	40 %	20 %	0 %	40 %	55820282
4029	NC_006448	TCT	2	6	193443	193448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820282
4030	NC_006448	CT	3	6	193575	193580	0 %	50 %	0 %	50 %	55820282
4031	NC_006448	GGAA	2	8	193623	193630	50 %	0 %	50 %	0 %	55820282
4032	NC_006448	TAT	2	6	193655	193660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_006448	AGA	2	6	193768	193773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820283
4034	NC_006448	CTC	2	6	193829	193834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820283
4035	NC_006448	GCT	2	6	193952	193957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820283
4036	NC_006448	AAGA	2	8	194006	194013	75 %	0 %	25 %	0 %	55820283
4037	NC_006448	GAT	2	6	194018	194023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820283
4038	NC_006448	AAG	2	6	194052	194057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820283
4039	NC_006448	ACC	2	6	194088	194093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820283
4040	NC_006448	ATC	2	6	194136	194141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820283
4041	NC_006448	A	6	6	194184	194189	100 %	0 %	0 %	0 %	55820283
4042	NC_006448	ATG	2	6	194239	194244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820284
4043	NC_006448	TTA	2	6	194335	194340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820284
4044	NC_006448	AAG	2	6	194367	194372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820284
4045	NC_006448	AAG	2	6	194409	194414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820284
4046	NC_006448	CGT	2	6	194523	194528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820284
4047	NC_006448	AACA	2	8	194532	194539	75 %	0 %	0 %	25 %	55820284
4048	NC_006448	TC	3	6	194612	194617	0 %	50 %	0 %	50 %	55820284
4049	NC_006448	GGT	2	6	194619	194624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820284
4050	NC_006448	GATG	2	8	194702	194709	25 %	25 %	50 %	0 %	55820284
4051	NC_006448	CAC	2	6	194742	194747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820284
4052	NC_006448	GTCT	2	8	194768	194775	0 %	50 %	25 %	25 %	55820284
4053	NC_006448	GTT	2	6	194860	194865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820284
4054	NC_006448	ATT	2	6	194913	194918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820285
4055	NC_006448	CTT	2	6	194991	194996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820285
4056	NC_006448	TTC	2	6	194999	195004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820285
4057	NC_006448	GTC	2	6	195005	195010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820285
4058	NC_006448	TGA	2	6	195017	195022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820285
4059	NC_006448	TTGTGG	2	12	195101	195112	0 %	50 %	50 %	0 %	55820285
4060	NC_006448	TGC	2	6	195117	195122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820285
4061	NC_006448	AGT	2	6	195238	195243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820285
4062	NC_006448	TAT	2	6	195273	195278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820285
4063	NC_006448	CT	3	6	195305	195310	0 %	50 %	0 %	50 %	55820285
4064	NC_006448	CTC	2	6	195343	195348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820285
4065	NC_006448	CTT	2	6	195429	195434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820285
4066	NC_006448	TGA	2	6	195464	195469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820285
4067	NC_006448	CAG	3	9	195473	195481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820285
4068	NC_006448	CAT	2	6	195501	195506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820285
4069	NC_006448	CAG	2	6	195515	195520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820285
4070	NC_006448	TATTGG	2	12	195570	195581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	55820285
4071	NC_006448	TTGG	2	8	195583	195590	0 %	50 %	50 %	0 %	55820285
4072	NC_006448	CT	3	6	195595	195600	0 %	50 %	0 %	50 %	55820285
4073	NC_006448	TAT	2	6	195616	195621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820285
4074	NC_006448	CTT	2	6	195666	195671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820285
4075	NC_006448	ATA	2	6	195715	195720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_006448	T	6	6	195769	195774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_006448	AAT	2	6	195789	195794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_006448	A	6	6	195812	195817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_006448	TCAG	2	8	195818	195825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_006448	TGTC	2	8	195836	195843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_006448	CAAAAA	2	12	195855	195866	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4082	NC_006448	GGA	2	6	195867	195872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_006448	TGA	2	6	195965	195970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820286
4084	NC_006448	TTGCC	2	10	196009	196018	0 %	40 %	20 %	40 %	55820286
4085	NC_006448	CAG	3	9	196054	196062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820286
4086	NC_006448	TTTG	2	8	196115	196122	0 %	75 %	25 %	0 %	55820286
4087	NC_006448	CAG	2	6	196132	196137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820286
4088	NC_006448	TCG	2	6	196166	196171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820286
4089	NC_006448	T	6	6	196191	196196	0 %	100 %	0 %	0 %	55820286
4090	NC_006448	T	6	6	196295	196300	0 %	100 %	0 %	0 %	55820286
4091	NC_006448	T	6	6	196381	196386	0 %	100 %	0 %	0 %	55820286
4092	NC_006448	TTA	2	6	196417	196422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820286
4093	NC_006448	TTA	2	6	196426	196431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820286
4094	NC_006448	AAC	2	6	196487	196492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820286
4095	NC_006448	A	6	6	196557	196562	100 %	0 %	0 %	0 %	55820286
4096	NC_006448	TCC	2	6	196632	196637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820286
4097	NC_006448	TGA	2	6	196648	196653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820286
4098	NC_006448	ATC	2	6	196665	196670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820286
4099	NC_006448	GCT	2	6	196740	196745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820286
4100	NC_006448	ACT	2	6	196761	196766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820286
4101	NC_006448	TAA	2	6	196812	196817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820286
4102	NC_006448	GGC	2	6	196843	196848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_006448	A	8	8	196859	196866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_006448	A	6	6	196868	196873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_006448	TA	3	6	196919	196924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_006448	GAAAT	2	10	196957	196966	60 %	20 %	20 %	0 %	55820287
4107	NC_006448	GTT	2	6	197028	197033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820287
4108	NC_006448	CAG	3	9	197047	197055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820287
4109	NC_006448	CAC	2	6	197107	197112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820287
4110	NC_006448	TTA	2	6	197116	197121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820287
4111	NC_006448	TTGG	2	8	197143	197150	0 %	50 %	50 %	0 %	55820287
4112	NC_006448	G	6	6	197149	197154	0 %	0 %	100 %	0 %	55820287
4113	NC_006448	TGG	2	6	197192	197197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820287
4114	NC_006448	AGG	2	6	197219	197224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820287
4115	NC_006448	CAG	2	6	197233	197238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820287
4116	NC_006448	CA	3	6	197325	197330	50 %	0 %	0 %	50 %	55820287
4117	NC_006448	CTT	2	6	197331	197336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820287
4118	NC_006448	ATCA	2	8	197343	197350	50 %	25 %	0 %	25 %	55820287
4119	NC_006448	ACT	2	6	197360	197365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820287
4120	NC_006448	TCA	2	6	197366	197371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_006448	ATC	2	6	197417	197422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_006448	ACA	2	6	197448	197453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_006448	TTC	2	6	197492	197497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820288
4124	NC_006448	TTC	2	6	197529	197534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820288
4125	NC_006448	GAAA	2	8	197623	197630	75 %	0 %	25 %	0 %	55820289
4126	NC_006448	TCT	2	6	197674	197679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820289
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4372	NC_006448	ATC	2	6	210264	210269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820299
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4374	NC_006448	AGG	2	6	210329	210334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820299
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4390	NC_006448	T	6	6	211190	211195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_006448	ACA	2	6	211264	211269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4399	NC_006448	GAGT	2	8	211639	211646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4440	NC_006448	AT	3	6	213394	213399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4462	NC_006448	ATG	2	6	214300	214305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820305
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4469	NC_006448	CAT	2	6	214606	214611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4471	NC_006448	ATA	2	6	214661	214666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_006448	GAT	2	6	214672	214677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4473	NC_006448	AAAG	2	8	214713	214720	75 %	0 %	25 %	0 %	55820306
4474	NC_006448	TTTCT	2	10	214729	214738	0 %	80 %	0 %	20 %	55820306
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4477	NC_006448	ATG	2	6	214904	214909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820306
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4479	NC_006448	TTTCT	2	10	214924	214933	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4480	NC_006448	CTT	2	6	214936	214941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4481	NC_006448	AAG	2	6	214954	214959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4482	NC_006448	TGTT	2	8	214963	214970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4483	NC_006448	TTA	2	6	215016	215021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4484	NC_006448	ATTT	2	8	215039	215046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_006448	CTT	2	6	215071	215076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4486	NC_006448	TTC	2	6	215135	215140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4487	NC_006448	CAT	2	6	215146	215151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4488	NC_006448	CAT	2	6	215161	215166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_006448	CTG	2	6	215188	215193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4490	NC_006448	T	7	7	215264	215270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_006448	GTTT	2	8	215283	215290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4492	NC_006448	GCT	2	6	215322	215327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4493	NC_006448	A	6	6	215373	215378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_006448	CAATC	2	10	215380	215389	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4495	NC_006448	TTG	2	6	215390	215395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_006448	GAAAGA	2	12	215531	215542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820307
4497	NC_006448	AT	3	6	215571	215576	50 %	50 %	0 %	0 %	55820307
4498	NC_006448	GTG	2	6	215690	215695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820307
4499	NC_006448	A	7	7	215754	215760	100 %	0 %	0 %	0 %	55820307
4500	NC_006448	TGG	2	6	215764	215769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820307

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