MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006448	CGC	2	6	168544	168549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55820252
3502	NC_006448	TCG	2	6	168594	168599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820252
3503	NC_006448	TGAA	2	8	168624	168631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_006448	ATG	2	6	168650	168655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_006448	AGCT	2	8	168701	168708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_006448	TAT	2	6	168722	168727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_006448	T	7	7	168768	168774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_006448	A	6	6	168785	168790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_006448	T	7	7	168844	168850	0 %	100 %	0 %	0 %	55820253
3510	NC_006448	TGA	2	6	168876	168881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820253
3511	NC_006448	TGGA	2	8	168960	168967	25 %	25 %	50 %	0 %	55820253
3512	NC_006448	GAA	2	6	169017	169022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820253
3513	NC_006448	ATG	2	6	169059	169064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820253
3514	NC_006448	AG	3	6	169162	169167	50 %	0 %	50 %	0 %	55820253
3515	NC_006448	AAAG	2	8	169168	169175	75 %	0 %	25 %	0 %	55820253
3516	NC_006448	AAGTA	2	10	169182	169191	60 %	20 %	20 %	0 %	55820253
3517	NC_006448	GTTT	2	8	169200	169207	0 %	75 %	25 %	0 %	55820253
3518	NC_006448	T	7	7	169205	169211	0 %	100 %	0 %	0 %	55820253
3519	NC_006448	AAG	2	6	169223	169228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820253
3520	NC_006448	A	6	6	169236	169241	100 %	0 %	0 %	0 %	55820253
3521	NC_006448	TAA	2	6	169259	169264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820253
3522	NC_006448	AAT	3	9	169265	169273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820253
3523	NC_006448	GAT	2	6	169376	169381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820253
3524	NC_006448	TAG	2	6	169385	169390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820253
3525	NC_006448	CCTT	2	8	169420	169427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_006448	ATG	2	6	169434	169439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_006448	A	7	7	169455	169461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_006448	AAAG	2	8	169467	169474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_006448	AAT	2	6	169604	169609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_006448	AGA	2	6	169625	169630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_006448	ATT	2	6	169659	169664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_006448	TAG	2	6	169668	169673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_006448	TAA	2	6	169681	169686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_006448	A	7	7	169685	169691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_006448	GCA	2	6	169737	169742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_006448	TGA	2	6	169772	169777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_006448	AAC	2	6	169802	169807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_006448	TAT	2	6	169816	169821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_006448	TGC	2	6	169883	169888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_006448	TAG	2	6	169915	169920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_006448	ATCA	2	8	169941	169948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_006448	CAG	2	6	169999	170004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820254
3543	NC_006448	CAG	2	6	170086	170091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820254
3544	NC_006448	CAG	2	6	170107	170112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820254
3545	NC_006448	A	6	6	170113	170118	100 %	0 %	0 %	0 %	55820254
3546	NC_006448	CACAA	2	10	170173	170182	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3547	NC_006448	CAAA	2	8	170195	170202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_006448	AAG	2	6	170226	170231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_006448	GTA	2	6	170264	170269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820255
3550	NC_006448	GACA	2	8	170324	170331	50 %	0 %	25 %	25 %	55820255
3551	NC_006448	A	6	6	170360	170365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_006448	A	8	8	170398	170405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_006448	T	6	6	170426	170431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_006448	TTC	2	6	170472	170477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820256
3555	NC_006448	AG	3	6	170706	170711	50 %	0 %	50 %	0 %	55820256
3556	NC_006448	GTT	2	6	170732	170737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820256
3557	NC_006448	GTT	2	6	170753	170758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820256
3558	NC_006448	CTT	2	6	170828	170833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820256
3559	NC_006448	GTT	2	6	170854	170859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820256
3560	NC_006448	TC	3	6	170931	170936	0 %	50 %	0 %	50 %	55820256
3561	NC_006448	CAC	2	6	170996	171001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820256
3562	NC_006448	GAAG	2	8	171032	171039	50 %	0 %	50 %	0 %	55820256
3563	NC_006448	CCTGAA	2	12	171049	171060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55820256
3564	NC_006448	AAT	2	6	171066	171071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820256
3565	NC_006448	T	6	6	171124	171129	0 %	100 %	0 %	0 %	55820256
3566	NC_006448	T	6	6	171138	171143	0 %	100 %	0 %	0 %	55820256
3567	NC_006448	CTC	2	6	171187	171192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820257
3568	NC_006448	TG	3	6	171195	171200	0 %	50 %	50 %	0 %	55820257
3569	NC_006448	TGGC	2	8	171412	171419	0 %	25 %	50 %	25 %	55820257
3570	NC_006448	GAA	2	6	171442	171447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820257
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3573	NC_006448	AACC	2	8	171699	171706	50 %	0 %	0 %	50 %	55820257
3574	NC_006448	T	6	6	171712	171717	0 %	100 %	0 %	0 %	55820257
3575	NC_006448	AGC	2	6	171740	171745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820257
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3579	NC_006448	AGT	2	6	171872	171877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820257
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3582	NC_006448	TCA	2	6	171909	171914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820257
3583	NC_006448	ATG	2	6	171939	171944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820257
3584	NC_006448	GCTG	2	8	172012	172019	0 %	25 %	50 %	25 %	55820257
3585	NC_006448	CAT	2	6	172051	172056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820257
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3587	NC_006448	ATC	2	6	172092	172097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820257
3588	NC_006448	AGCT	2	8	172108	172115	25 %	25 %	25 %	25 %	55820257
3589	NC_006448	CAG	2	6	172120	172125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820257
3590	NC_006448	GAT	2	6	172160	172165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820257
3591	NC_006448	GTTT	2	8	172212	172219	0 %	75 %	25 %	0 %	55820257
3592	NC_006448	ATCA	2	8	172238	172245	50 %	25 %	0 %	25 %	55820257
3593	NC_006448	TTG	2	6	172265	172270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820257
3594	NC_006448	AAC	2	6	172337	172342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820257
3595	NC_006448	GTA	2	6	172361	172366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820257
3596	NC_006448	GAC	2	6	172390	172395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820257
3597	NC_006448	ACC	2	6	172482	172487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820257
3598	NC_006448	T	7	7	172516	172522	0 %	100 %	0 %	0 %	55820257
3599	NC_006448	ATC	2	6	172592	172597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820257
3600	NC_006448	GAG	3	9	172685	172693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820257
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3602	NC_006448	T	7	7	172717	172723	0 %	100 %	0 %	0 %	55820257
3603	NC_006448	TGA	2	6	172784	172789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_006448	A	6	6	172807	172812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_006448	GAT	2	6	172866	172871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_006448	ATA	2	6	172923	172928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820258
3607	NC_006448	TAT	2	6	172946	172951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820258
3608	NC_006448	TCTT	2	8	172969	172976	0 %	75 %	0 %	25 %	55820258
3609	NC_006448	TCA	2	6	173013	173018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820258
3610	NC_006448	GGT	2	6	173210	173215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820258
3611	NC_006448	CTT	2	6	173237	173242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820258
3612	NC_006448	TCT	2	6	173246	173251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820258
3613	NC_006448	GAT	2	6	173256	173261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820258
3614	NC_006448	TGGA	2	8	173262	173269	25 %	25 %	50 %	0 %	55820258
3615	NC_006448	GTA	2	6	173292	173297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820258
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3617	NC_006448	ATC	2	6	173481	173486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820258
3618	NC_006448	CGTAG	2	10	173499	173508	20 %	20 %	40 %	20 %	55820258
3619	NC_006448	CTT	2	6	173522	173527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820258
3620	NC_006448	TGG	2	6	173603	173608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820258
3621	NC_006448	TGA	2	6	173677	173682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820258
3622	NC_006448	A	6	6	173782	173787	100 %	0 %	0 %	0 %	55820258
3623	NC_006448	AGATA	2	10	173854	173863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_006448	CAAT	2	8	173926	173933	50 %	25 %	0 %	25 %	55820259
3625	NC_006448	GGA	2	6	174000	174005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820259
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3627	NC_006448	TCG	2	6	174035	174040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820259
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3657	NC_006448	TTGG	2	8	175682	175689	0 %	50 %	50 %	0 %	55820261
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