MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006448	CAT	2	6	119359	119364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820212
2502	NC_006448	GTG	2	6	119422	119427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820212
2503	NC_006448	TGG	2	6	119443	119448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820212
2504	NC_006448	ATG	2	6	119451	119456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820212
2505	NC_006448	T	7	7	119462	119468	0 %	100 %	0 %	0 %	55820212
2506	NC_006448	ATG	2	6	119469	119474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820212
2507	NC_006448	ATG	2	6	119514	119519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820212
2508	NC_006448	TAT	2	6	119622	119627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_006448	GGTGAT	2	12	119668	119679	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_006448	TCG	2	6	119684	119689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_006448	TCC	2	6	119748	119753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820213
2512	NC_006448	CGGTT	2	10	119763	119772	0 %	40 %	40 %	20 %	55820213
2513	NC_006448	GA	3	6	119846	119851	50 %	0 %	50 %	0 %	55820213
2514	NC_006448	A	6	6	119872	119877	100 %	0 %	0 %	0 %	55820213
2515	NC_006448	CAG	2	6	119964	119969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820214
2516	NC_006448	CAA	2	6	120005	120010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820214
2517	NC_006448	A	6	6	120031	120036	100 %	0 %	0 %	0 %	55820214
2518	NC_006448	ATA	2	6	120132	120137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820214
2519	NC_006448	GAA	2	6	120212	120217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820214
2520	NC_006448	AGC	3	9	120223	120231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820214
2521	NC_006448	CAGA	2	8	120287	120294	50 %	0 %	25 %	25 %	55820214
2522	NC_006448	CAG	2	6	120314	120319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820214
2523	NC_006448	TGA	2	6	120328	120333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820214
2524	NC_006448	AGA	2	6	120360	120365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820214
2525	NC_006448	ACC	2	6	120385	120390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820214
2526	NC_006448	A	7	7	120482	120488	100 %	0 %	0 %	0 %	55820214
2527	NC_006448	TTC	2	6	120510	120515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820214
2528	NC_006448	CAG	2	6	120591	120596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820214
2529	NC_006448	GAA	2	6	120626	120631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820214
2530	NC_006448	GAC	2	6	120665	120670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820215
2531	NC_006448	TTC	2	6	120737	120742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820215
2532	NC_006448	A	6	6	120827	120832	100 %	0 %	0 %	0 %	55820215
2533	NC_006448	GTA	2	6	120899	120904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820215
2534	NC_006448	ATA	2	6	120926	120931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820215
2535	NC_006448	ATCT	2	8	120967	120974	25 %	50 %	0 %	25 %	55820215
2536	NC_006448	AGA	2	6	121068	121073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820215
2537	NC_006448	TAT	2	6	121206	121211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820215
2538	NC_006448	T	6	6	121268	121273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_006448	T	7	7	121328	121334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_006448	T	8	8	121336	121343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_006448	ATA	2	6	121370	121375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_006448	TAA	2	6	121410	121415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_006448	CA	3	6	121491	121496	50 %	0 %	0 %	50 %	55820216
2544	NC_006448	GATT	2	8	121530	121537	25 %	50 %	25 %	0 %	55820216
2545	NC_006448	TTG	2	6	121649	121654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820216
2546	NC_006448	TGA	2	6	121680	121685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820216
2547	NC_006448	GTC	2	6	121702	121707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820216
2548	NC_006448	GCG	2	6	121753	121758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820216
2549	NC_006448	GCT	2	6	121764	121769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820216
2550	NC_006448	CAG	2	6	121790	121795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820216
2551	NC_006448	CAGTT	2	10	121907	121916	20 %	40 %	20 %	20 %	55820216
2552	NC_006448	CTC	2	6	122030	122035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820216
2553	NC_006448	TTTG	2	8	122079	122086	0 %	75 %	25 %	0 %	55820216
2554	NC_006448	AAGGT	2	10	122129	122138	40 %	20 %	40 %	0 %	55820216
2555	NC_006448	GAT	2	6	122227	122232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820216
2556	NC_006448	GAA	2	6	122266	122271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820216
2557	NC_006448	CATG	2	8	122334	122341	25 %	25 %	25 %	25 %	55820216
2558	NC_006448	TCG	2	6	122367	122372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820216
2559	NC_006448	TTAGT	2	10	122378	122387	20 %	60 %	20 %	0 %	55820216
2560	NC_006448	ATT	2	6	122426	122431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820216
2561	NC_006448	A	6	6	122484	122489	100 %	0 %	0 %	0 %	55820216
2562	NC_006448	AGA	3	9	122527	122535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2563	NC_006448	AGA	2	6	122542	122547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2564	NC_006448	GAA	2	6	122567	122572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2565	NC_006448	GAA	2	6	122609	122614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2566	NC_006448	AGA	2	6	122620	122625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2567	NC_006448	GAA	2	6	122648	122653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2568	NC_006448	GGA	2	6	122668	122673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820217
2569	NC_006448	AAAT	2	8	122680	122687	75 %	25 %	0 %	0 %	55820217
2570	NC_006448	AGA	2	6	122734	122739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2571	NC_006448	CAA	2	6	122744	122749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820217
2572	NC_006448	TGA	2	6	122839	122844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820217
2573	NC_006448	A	6	6	122849	122854	100 %	0 %	0 %	0 %	55820217
2574	NC_006448	AGGA	2	8	122898	122905	50 %	0 %	50 %	0 %	55820217
2575	NC_006448	GAA	2	6	122909	122914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820217
2576	NC_006448	GCA	2	6	122918	122923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820217
2577	NC_006448	GAT	2	6	122975	122980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820217
2578	NC_006448	CGG	2	6	122988	122993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820217
2579	NC_006448	GTA	3	9	123059	123067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820217
2580	NC_006448	A	7	7	123081	123087	100 %	0 %	0 %	0 %	55820217
2581	NC_006448	GA	3	6	123114	123119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_006448	AGA	2	6	123166	123171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_006448	A	6	6	123171	123176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_006448	AGAA	2	8	123181	123188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_006448	ATT	2	6	123220	123225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820218
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2587	NC_006448	CAG	2	6	123251	123256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2588	NC_006448	ATC	2	6	123286	123291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820218
2589	NC_006448	TTCA	2	8	123330	123337	25 %	50 %	0 %	25 %	55820218
2590	NC_006448	ATC	2	6	123349	123354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820218
2591	NC_006448	TGC	2	6	123363	123368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2592	NC_006448	GAA	2	6	123514	123519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820218
2593	NC_006448	TCA	2	6	123548	123553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820218
2594	NC_006448	GCA	2	6	123652	123657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2595	NC_006448	AGA	2	6	123690	123695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820218
2596	NC_006448	A	6	6	123695	123700	100 %	0 %	0 %	0 %	55820218
2597	NC_006448	TGG	3	9	123717	123725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820218
2598	NC_006448	TATC	2	8	123737	123744	25 %	50 %	0 %	25 %	55820218
2599	NC_006448	ACA	2	6	123791	123796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820218
2600	NC_006448	TGG	2	6	123801	123806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820218
2601	NC_006448	TGA	2	6	123807	123812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2602	NC_006448	A	6	6	123821	123826	100 %	0 %	0 %	0 %	55820218
2603	NC_006448	GAA	2	6	123844	123849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820218
2604	NC_006448	AAGA	2	8	123853	123860	75 %	0 %	25 %	0 %	55820218
2605	NC_006448	GCA	2	6	123913	123918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2606	NC_006448	AAGA	2	8	123928	123935	75 %	0 %	25 %	0 %	55820218
2607	NC_006448	TCA	2	6	123974	123979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820218
2608	NC_006448	TGA	2	6	124035	124040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2609	NC_006448	TTG	2	6	124136	124141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820218
2610	NC_006448	TGT	2	6	124164	124169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820218
2611	NC_006448	CAAA	2	8	124202	124209	75 %	0 %	0 %	25 %	55820218
2612	NC_006448	TGA	2	6	124221	124226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2613	NC_006448	AGT	2	6	124227	124232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2614	NC_006448	TGC	2	6	124242	124247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2615	NC_006448	GGT	2	6	124255	124260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820218
2616	NC_006448	CTT	2	6	124291	124296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820218
2617	NC_006448	ACA	2	6	124366	124371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820218
2618	NC_006448	TCT	2	6	124394	124399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820218
2619	NC_006448	GCA	2	6	124405	124410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2620	NC_006448	TTC	2	6	124439	124444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820218
2621	NC_006448	GCA	2	6	124462	124467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2622	NC_006448	GTG	2	6	124520	124525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820218
2623	NC_006448	GTATC	2	10	124565	124574	20 %	40 %	20 %	20 %	55820218
2624	NC_006448	AACA	2	8	124607	124614	75 %	0 %	0 %	25 %	55820218
2625	NC_006448	TGA	2	6	124644	124649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2626	NC_006448	ATG	2	6	124663	124668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
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2628	NC_006448	TGC	2	6	124809	124814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820218
2629	NC_006448	TGA	2	6	124827	124832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
2630	NC_006448	TGA	2	6	124863	124868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820218
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2643	NC_006448	AGT	2	6	125397	125402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2742	NC_006448	GGA	2	6	129758	129763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2747	NC_006448	TCGTG	2	10	130119	130128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2748	NC_006448	CAT	2	6	130178	130183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2750	NC_006448	GGA	2	6	130222	130227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2751	NC_006448	ATC	2	6	130246	130251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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