MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_006448	GCAT	2	8	1142826	1142833	25 %	25 %	25 %	25 %	55821296
23502	NC_006448	AGA	2	6	1142850	1142855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821296
23503	NC_006448	CTA	2	6	1142872	1142877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821296
23504	NC_006448	AGT	2	6	1142975	1142980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55821296
23505	NC_006448	T	6	6	1143046	1143051	0 %	100 %	0 %	0 %	55821296
23506	NC_006448	GCA	2	6	1143081	1143086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821296
23507	NC_006448	CAC	2	6	1143100	1143105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821296
23508	NC_006448	TCA	2	6	1143159	1143164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821296
23509	NC_006448	TCT	2	6	1143204	1143209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821296
23510	NC_006448	AAT	2	6	1143245	1143250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821296
23511	NC_006448	T	6	6	1143320	1143325	0 %	100 %	0 %	0 %	55821296
23512	NC_006448	CAA	2	6	1143364	1143369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821296
23513	NC_006448	CAG	2	6	1143382	1143387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821296
23514	NC_006448	CAAGTG	2	12	1143452	1143463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55821296
23515	NC_006448	CAA	2	6	1143499	1143504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821296
23516	NC_006448	CAG	2	6	1143523	1143528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55821296
23517	NC_006448	GTC	2	6	1143558	1143563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821296
23518	NC_006448	T	6	6	1143568	1143573	0 %	100 %	0 %	0 %	55821296
23519	NC_006448	CAAC	2	8	1143604	1143611	50 %	0 %	0 %	50 %	55821296
23520	NC_006448	TAAC	2	8	1143627	1143634	50 %	25 %	0 %	25 %	55821296
23521	NC_006448	ATA	2	6	1143639	1143644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821296
23522	NC_006448	AAG	2	6	1143804	1143809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23523	NC_006448	AT	3	6	1143872	1143877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23524	NC_006448	CT	3	6	1143918	1143923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23525	NC_006448	AAC	2	6	1143957	1143962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821297
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23528	NC_006448	GCAAA	2	10	1144111	1144120	60 %	0 %	20 %	20 %	55821297
23529	NC_006448	AAT	2	6	1144125	1144130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821297
23530	NC_006448	CTGA	2	8	1144160	1144167	25 %	25 %	25 %	25 %	55821297
23531	NC_006448	TGC	2	6	1144203	1144208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821297
23532	NC_006448	CAT	2	6	1144255	1144260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821297
23533	NC_006448	TTC	2	6	1144286	1144291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821297
23534	NC_006448	TAT	2	6	1144363	1144368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821297
23535	NC_006448	TTC	2	6	1144415	1144420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821297
23536	NC_006448	CTT	2	6	1144423	1144428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821297
23537	NC_006448	GAA	2	6	1144432	1144437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821297
23538	NC_006448	AAC	2	6	1144448	1144453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55821297
23539	NC_006448	CCT	2	6	1144465	1144470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23540	NC_006448	GACCAA	2	12	1144565	1144576	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161611284
23541	NC_006448	TTC	2	6	1144593	1144598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161611284
23542	NC_006448	TCT	2	6	1144670	1144675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161611284
23543	NC_006448	ACC	2	6	1144695	1144700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161611284
23544	NC_006448	AAG	2	6	1144754	1144759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161611284
23545	NC_006448	T	6	6	1144793	1144798	0 %	100 %	0 %	0 %	161611284
23546	NC_006448	AAT	2	6	1144800	1144805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161611284
23547	NC_006448	TGG	2	6	1144879	1144884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161611284
23548	NC_006448	CAT	2	6	1144895	1144900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161611284
23549	NC_006448	ACG	2	6	1144908	1144913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161611284
23550	NC_006448	ATC	2	6	1144933	1144938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161611284
23551	NC_006448	TTC	2	6	1145016	1145021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161611284
23552	NC_006448	TAG	2	6	1145092	1145097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161611284
23553	NC_006448	CAA	2	6	1145120	1145125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161611284
23554	NC_006448	TTC	2	6	1145160	1145165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161611284
23555	NC_006448	GCT	2	6	1145263	1145268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161611284
23556	NC_006448	CAA	2	6	1145270	1145275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161611284
23557	NC_006448	GCT	2	6	1145281	1145286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161611284
23558	NC_006448	TTC	2	6	1145349	1145354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161611284
23559	NC_006448	T	6	6	1145400	1145405	0 %	100 %	0 %	0 %	161611284
23560	NC_006448	CAC	2	6	1145450	1145455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161611284
23561	NC_006448	CAAA	2	8	1145553	1145560	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23562	NC_006448	A	7	7	1145558	1145564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23563	NC_006448	T	6	6	1145612	1145617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_006448	GAG	2	6	1145681	1145686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23565	NC_006448	ACC	2	6	1145759	1145764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23566	NC_006448	TCAAT	2	10	1145809	1145818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23567	NC_006448	T	7	7	1145822	1145828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23568	NC_006448	A	6	6	1145931	1145936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23569	NC_006448	CTT	2	6	1145937	1145942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23570	NC_006448	T	7	7	1146047	1146053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23571	NC_006448	T	7	7	1146069	1146075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23572	NC_006448	A	7	7	1146084	1146090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23573	NC_006448	CTG	3	9	1146222	1146230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821299
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23579	NC_006448	CTG	2	6	1146519	1146524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821299
23580	NC_006448	CCA	2	6	1146530	1146535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55821299
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23585	NC_006448	GACT	2	8	1146881	1146888	25 %	25 %	25 %	25 %	55821299
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23588	NC_006448	CTT	2	6	1147059	1147064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821299
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23590	NC_006448	ATT	2	6	1147183	1147188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821299
23591	NC_006448	AG	3	6	1147260	1147265	50 %	0 %	50 %	0 %	55821299
23592	NC_006448	TTG	2	6	1147273	1147278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55821299
23593	NC_006448	AGCCT	2	10	1147482	1147491	20 %	20 %	20 %	40 %	55821299
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23601	NC_006448	AATC	2	8	1147986	1147993	50 %	25 %	0 %	25 %	55821299
23602	NC_006448	GCT	3	9	1148003	1148011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821299
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23604	NC_006448	AAT	2	6	1148110	1148115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55821299
23605	NC_006448	GAA	2	6	1148139	1148144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821299
23606	NC_006448	T	7	7	1148177	1148183	0 %	100 %	0 %	0 %	55821299
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23609	NC_006448	GCT	2	6	1148342	1148347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821299
23610	NC_006448	GCTA	2	8	1148368	1148375	25 %	25 %	25 %	25 %	55821299
23611	NC_006448	AG	3	6	1148386	1148391	50 %	0 %	50 %	0 %	55821299
23612	NC_006448	TTC	2	6	1148416	1148421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821299
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23616	NC_006448	ATTCA	2	10	1148611	1148620	40 %	40 %	0 %	20 %	55821299
23617	NC_006448	CT	3	6	1148684	1148689	0 %	50 %	0 %	50 %	55821299
23618	NC_006448	TCT	2	6	1148714	1148719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821299
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23724	NC_006448	T	8	8	1153706	1153713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23732	NC_006448	TAAT	2	8	1153960	1153967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23733	NC_006448	CATG	2	8	1154118	1154125	25 %	25 %	25 %	25 %	55821304
23734	NC_006448	TTCA	2	8	1154245	1154252	25 %	50 %	0 %	25 %	55821304
23735	NC_006448	GATA	2	8	1154253	1154260	50 %	25 %	25 %	0 %	55821304
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23981	NC_006448	ATT	2	6	1167097	1167102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55821318
23982	NC_006448	GAAA	2	8	1167136	1167143	75 %	0 %	25 %	0 %	55821318
23983	NC_006448	CTT	2	6	1167156	1167161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821318
23984	NC_006448	TGAC	2	8	1167205	1167212	25 %	25 %	25 %	25 %	55821318
23985	NC_006448	CTT	2	6	1167225	1167230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55821318
23986	NC_006448	AGA	2	6	1167263	1167268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55821318
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23988	NC_006448	TCAC	2	8	1167287	1167294	25 %	25 %	0 %	50 %	55821318
23989	NC_006448	TGC	2	6	1167340	1167345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55821318
23990	NC_006448	CTTTT	2	10	1167378	1167387	0 %	80 %	0 %	20 %	55821318
23991	NC_006448	CAT	2	6	1167390	1167395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55821318
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