MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006448	A	6	6	48943	48948	100 %	0 %	0 %	0 %	55820146
1002	NC_006448	ATG	2	6	48981	48986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820146
1003	NC_006448	TCT	2	6	48996	49001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820146
1004	NC_006448	TTG	2	6	49003	49008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820146
1005	NC_006448	AGG	2	6	49089	49094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820146
1006	NC_006448	TTG	2	6	49124	49129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006448	TAG	2	6	49170	49175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820147
1008	NC_006448	CTAT	2	8	49241	49248	25 %	50 %	0 %	25 %	55820147
1009	NC_006448	GTT	2	6	49338	49343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006448	AAG	2	6	49387	49392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006448	AATAA	2	10	49441	49450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006448	A	7	7	49453	49459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006448	CTT	2	6	49546	49551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_006448	GAA	2	6	49650	49655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820148
1015	NC_006448	AATA	2	8	49656	49663	75 %	25 %	0 %	0 %	55820148
1016	NC_006448	GCTTG	2	10	49668	49677	0 %	40 %	40 %	20 %	55820148
1017	NC_006448	AGC	2	6	49792	49797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820148
1018	NC_006448	ACAA	2	8	49921	49928	75 %	0 %	0 %	25 %	55820148
1019	NC_006448	ATC	2	6	49971	49976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820148
1020	NC_006448	ATG	2	6	50010	50015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820148
1021	NC_006448	GCT	2	6	50118	50123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820148
1022	NC_006448	CCA	2	6	50175	50180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820148
1023	NC_006448	TTG	2	6	50182	50187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820148
1024	NC_006448	AAC	2	6	50344	50349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820148
1025	NC_006448	TC	3	6	50512	50517	0 %	50 %	0 %	50 %	55820148
1026	NC_006448	TCA	2	6	50520	50525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820148
1027	NC_006448	ATC	2	6	50535	50540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820148
1028	NC_006448	TTGA	2	8	50559	50566	25 %	50 %	25 %	0 %	55820148
1029	NC_006448	TTGA	2	8	50685	50692	25 %	50 %	25 %	0 %	55820148
1030	NC_006448	CTT	2	6	50778	50783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820148
1031	NC_006448	CTCA	2	8	50811	50818	25 %	25 %	0 %	50 %	55820148
1032	NC_006448	AGA	2	6	50819	50824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820148
1033	NC_006448	CGA	2	6	50828	50833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820148
1034	NC_006448	TAT	2	6	50850	50855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820148
1035	NC_006448	TGA	2	6	50867	50872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820148
1036	NC_006448	T	6	6	50938	50943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_006448	T	6	6	50976	50981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_006448	AGGA	2	8	51015	51022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_006448	ATC	2	6	51099	51104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_006448	ATGA	2	8	51111	51118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_006448	CTT	2	6	51139	51144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_006448	TGA	2	6	51212	51217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_006448	AAT	2	6	51223	51228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_006448	AT	3	6	51257	51262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_006448	AGC	2	6	51280	51285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_006448	T	6	6	51316	51321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_006448	T	6	6	51361	51366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006448	CTT	2	6	51367	51372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_006448	TTA	2	6	51382	51387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006448	T	6	6	51459	51464	0 %	100 %	0 %	0 %	55820149
1051	NC_006448	ATT	2	6	51471	51476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820149
1052	NC_006448	CTT	2	6	51500	51505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820149
1053	NC_006448	AATC	2	8	51546	51553	50 %	25 %	0 %	25 %	55820149
1054	NC_006448	TAG	2	6	51604	51609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820149
1055	NC_006448	GAC	2	6	51638	51643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820149
1056	NC_006448	ATG	2	6	51681	51686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820149
1057	NC_006448	TTGA	2	8	51711	51718	25 %	50 %	25 %	0 %	55820149
1058	NC_006448	GAT	2	6	51750	51755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820149
1059	NC_006448	CGGT	2	8	51772	51779	0 %	25 %	50 %	25 %	55820149
1060	NC_006448	TAG	2	6	51813	51818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820149
1061	NC_006448	TAA	2	6	51860	51865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820149
1062	NC_006448	CTG	2	6	51893	51898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820149
1063	NC_006448	GCTT	2	8	51916	51923	0 %	50 %	25 %	25 %	55820149
1064	NC_006448	TCT	3	9	52028	52036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820149
1065	NC_006448	CAT	2	6	52041	52046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820149
1066	NC_006448	ATT	2	6	52108	52113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820149
1067	NC_006448	T	8	8	52112	52119	0 %	100 %	0 %	0 %	55820149
1068	NC_006448	CAG	2	6	52163	52168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820149
1069	NC_006448	T	6	6	52176	52181	0 %	100 %	0 %	0 %	55820149
1070	NC_006448	TTG	2	6	52200	52205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820149
1071	NC_006448	ATT	2	6	52230	52235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820149
1072	NC_006448	GAG	2	6	52244	52249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820149
1073	NC_006448	CAAG	2	8	52256	52263	50 %	0 %	25 %	25 %	55820149
1074	NC_006448	CCTT	2	8	52376	52383	0 %	50 %	0 %	50 %	55820149
1075	NC_006448	AAC	2	6	52396	52401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820149
1076	NC_006448	ACA	2	6	52451	52456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820149
1077	NC_006448	TAT	2	6	52494	52499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_006448	TTA	2	6	52627	52632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_006448	TA	3	6	52684	52689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_006448	CTG	2	6	52771	52776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_006448	T	7	7	52792	52798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_006448	TGC	2	6	52800	52805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_006448	AAC	2	6	52908	52913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_006448	CTTTT	2	10	52917	52926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_006448	ATG	2	6	52951	52956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_006448	T	7	7	52967	52973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_006448	A	6	6	52981	52986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_006448	CTT	2	6	53053	53058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820150
1089	NC_006448	CTGTTG	2	12	53065	53076	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55820150
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1091	NC_006448	TGA	2	6	53218	53223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820150
1092	NC_006448	TGA	2	6	53248	53253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820150
1093	NC_006448	CGT	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820150
1094	NC_006448	TGTA	2	8	53281	53288	25 %	50 %	25 %	0 %	55820150
1095	NC_006448	AGAT	2	8	53323	53330	50 %	25 %	25 %	0 %	55820150
1096	NC_006448	CCAACA	2	12	53454	53465	50 %	0 %	0 %	50 %	55820150
1097	NC_006448	CAAG	2	8	53557	53564	50 %	0 %	25 %	25 %	55820150
1098	NC_006448	GTC	2	6	53636	53641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820150
1099	NC_006448	GCA	2	6	53760	53765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820150
1100	NC_006448	T	6	6	53804	53809	0 %	100 %	0 %	0 %	55820150
1101	NC_006448	CTTT	2	8	53884	53891	0 %	75 %	0 %	25 %	55820150
1102	NC_006448	CATC	2	8	53911	53918	25 %	25 %	0 %	50 %	55820150
1103	NC_006448	TCA	2	6	54039	54044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820150
1104	NC_006448	CTT	2	6	54076	54081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820150
1105	NC_006448	TCT	2	6	54096	54101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820150
1106	NC_006448	CAA	2	6	54193	54198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820150
1107	NC_006448	TGAT	2	8	54234	54241	25 %	50 %	25 %	0 %	55820150
1108	NC_006448	T	6	6	54514	54519	0 %	100 %	0 %	0 %	55820150
1109	NC_006448	CTG	2	6	54529	54534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820150
1110	NC_006448	GAG	2	6	54544	54549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820150
1111	NC_006448	AAC	2	6	54659	54664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820150
1112	NC_006448	CTG	2	6	54676	54681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820150
1113	NC_006448	ATT	2	6	54746	54751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_006448	AAG	2	6	54787	54792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_006448	A	6	6	54802	54807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_006448	AG	3	6	54865	54870	50 %	0 %	50 %	0 %	55820151
1117	NC_006448	GAT	2	6	54893	54898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820151
1118	NC_006448	TGA	2	6	55019	55024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820151
1119	NC_006448	TGA	2	6	55181	55186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820151
1120	NC_006448	TGA	2	6	55284	55289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820151
1121	NC_006448	CTC	2	6	55293	55298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820152
1122	NC_006448	AGA	2	6	55321	55326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820152
1123	NC_006448	CCT	2	6	55336	55341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820152
1124	NC_006448	CTGG	2	8	55415	55422	0 %	25 %	50 %	25 %	55820152
1125	NC_006448	CAA	2	6	55439	55444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820152
1126	NC_006448	AAC	2	6	55473	55478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820152
1127	NC_006448	GAG	2	6	55487	55492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820152
1128	NC_006448	GCAG	2	8	55501	55508	25 %	0 %	50 %	25 %	55820152
1129	NC_006448	GAA	2	6	55610	55615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820152
1130	NC_006448	GAG	2	6	55625	55630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820152
1131	NC_006448	A	6	6	55648	55653	100 %	0 %	0 %	0 %	55820153
1132	NC_006448	GCA	2	6	55667	55672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820153
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1256	NC_006448	TA	3	6	62054	62059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_006448	CAT	2	6	62062	62067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_006448	AAAG	2	8	62079	62086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_006448	TATG	2	8	62099	62106	25 %	50 %	25 %	0 %	55820159
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