MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006448	TAT	2	6	25515	25520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820124
502	NC_006448	CTAGT	2	10	25535	25544	20 %	40 %	20 %	20 %	55820124
503	NC_006448	ATT	2	6	25590	25595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820124
504	NC_006448	TAAA	2	8	25620	25627	75 %	25 %	0 %	0 %	55820124
505	NC_006448	TAA	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006448	T	6	6	25660	25665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006448	AGT	2	6	25695	25700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006448	TAT	2	6	25707	25712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820125
509	NC_006448	A	6	6	25714	25719	100 %	0 %	0 %	0 %	55820125
510	NC_006448	CAG	2	6	25730	25735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
511	NC_006448	GTG	2	6	25745	25750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820125
512	NC_006448	CAG	2	6	25760	25765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
513	NC_006448	GCT	2	6	25804	25809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820125
514	NC_006448	CAA	2	6	25840	25845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820125
515	NC_006448	CAATC	2	10	25871	25880	40 %	20 %	0 %	40 %	55820125
516	NC_006448	A	6	6	25904	25909	100 %	0 %	0 %	0 %	55820125
517	NC_006448	CAA	2	6	26035	26040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820125
518	NC_006448	CTA	2	6	26051	26056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820125
519	NC_006448	GTT	2	6	26128	26133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820125
520	NC_006448	TAA	2	6	26139	26144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820125
521	NC_006448	TGC	2	6	26184	26189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820125
522	NC_006448	AAG	2	6	26195	26200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820125
523	NC_006448	TAA	2	6	26232	26237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820125
524	NC_006448	ACA	2	6	26251	26256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820125
525	NC_006448	CAA	2	6	26275	26280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820125
526	NC_006448	AGC	2	6	26292	26297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
527	NC_006448	GCT	2	6	26311	26316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820125
528	NC_006448	CTG	2	6	26369	26374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820125
529	NC_006448	CTT	2	6	26456	26461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820125
530	NC_006448	AGC	2	6	26466	26471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
531	NC_006448	CTT	2	6	26483	26488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820125
532	NC_006448	AGC	2	6	26496	26501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
533	NC_006448	TCA	2	6	26584	26589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820125
534	NC_006448	GCT	2	6	26764	26769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820125
535	NC_006448	CAG	2	6	26786	26791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
536	NC_006448	TAA	2	6	26862	26867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820125
537	NC_006448	AGC	2	6	26904	26909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820125
538	NC_006448	ATG	2	6	26963	26968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820125
539	NC_006448	GTG	2	6	26969	26974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820125
540	NC_006448	CATCAG	2	12	26999	27010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55820125
541	NC_006448	ATTCA	2	10	27017	27026	40 %	40 %	0 %	20 %	55820125
542	NC_006448	CAT	2	6	27092	27097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820125
543	NC_006448	TGG	2	6	27105	27110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820125
544	NC_006448	ACA	2	6	27141	27146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_006448	TTTTA	2	10	27174	27183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_006448	ATA	2	6	27189	27194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006448	AAT	2	6	27210	27215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_006448	A	7	7	27224	27230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006448	ATTT	2	8	27281	27288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006448	A	6	6	27307	27312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_006448	TAG	2	6	27326	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006448	GGA	2	6	27339	27344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820126
553	NC_006448	GTC	2	6	27381	27386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820126
554	NC_006448	AGC	2	6	27399	27404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820126
555	NC_006448	TCA	2	6	27504	27509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820126
556	NC_006448	TTC	2	6	27518	27523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820126
557	NC_006448	CAAT	2	8	27605	27612	50 %	25 %	0 %	25 %	55820126
558	NC_006448	GTT	2	6	27613	27618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820126
559	NC_006448	TTA	2	6	27624	27629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820126
560	NC_006448	GTTG	2	8	27684	27691	0 %	50 %	50 %	0 %	55820126
561	NC_006448	CTC	2	6	27746	27751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820126
562	NC_006448	ATT	2	6	27812	27817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820126
563	NC_006448	TGA	2	6	27840	27845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820126
564	NC_006448	GTT	3	9	27850	27858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820126
565	NC_006448	TGG	2	6	27870	27875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820126
566	NC_006448	CGT	2	6	27937	27942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820126
567	NC_006448	TTGA	2	8	28012	28019	25 %	50 %	25 %	0 %	55820126
568	NC_006448	TGAT	2	8	28025	28032	25 %	50 %	25 %	0 %	55820126
569	NC_006448	CAT	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820126
570	NC_006448	ATA	2	6	28136	28141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820126
571	NC_006448	TTG	2	6	28166	28171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820126
572	NC_006448	AGA	2	6	28194	28199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820126
573	NC_006448	TGAT	2	8	28205	28212	25 %	50 %	25 %	0 %	55820126
574	NC_006448	TGATT	2	10	28236	28245	20 %	60 %	20 %	0 %	55820126
575	NC_006448	AG	3	6	28365	28370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_006448	TCT	2	6	28382	28387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_006448	T	6	6	28389	28394	0 %	100 %	0 %	0 %	55820127
578	NC_006448	TAA	2	6	28431	28436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820127
579	NC_006448	TTGT	2	8	28540	28547	0 %	75 %	25 %	0 %	55820127
580	NC_006448	TAA	2	6	28580	28585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820127
581	NC_006448	A	6	6	28618	28623	100 %	0 %	0 %	0 %	55820127
582	NC_006448	TAA	2	6	28676	28681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_006448	TCT	2	6	28710	28715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_006448	CTT	2	6	28827	28832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820128
585	NC_006448	GCT	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820128
586	NC_006448	GAT	2	6	28890	28895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820128
587	NC_006448	AAT	2	6	28908	28913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820128
588	NC_006448	ACCTT	2	10	28982	28991	20 %	40 %	0 %	40 %	55820128
589	NC_006448	TGG	2	6	29014	29019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820128
590	NC_006448	TTC	2	6	29086	29091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_006448	CGT	2	6	29095	29100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_006448	ATG	2	6	29166	29171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_006448	ATG	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006448	T	6	6	29354	29359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006448	AAT	2	6	29399	29404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006448	TAA	2	6	29443	29448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820129
597	NC_006448	CAAT	2	8	29492	29499	50 %	25 %	0 %	25 %	55820129
598	NC_006448	AGC	2	6	29572	29577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820129
599	NC_006448	GCT	2	6	29645	29650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820129
600	NC_006448	TTG	2	6	29838	29843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820129
601	NC_006448	ACA	2	6	29852	29857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820129
602	NC_006448	TTTTG	2	10	29866	29875	0 %	80 %	20 %	0 %	55820129
603	NC_006448	CCAA	2	8	29945	29952	50 %	0 %	0 %	50 %	55820129
604	NC_006448	A	6	6	30008	30013	100 %	0 %	0 %	0 %	55820129
605	NC_006448	TGT	2	6	30025	30030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820129
606	NC_006448	TGA	2	6	30034	30039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820129
607	NC_006448	AACT	2	8	30051	30058	50 %	25 %	0 %	25 %	55820129
608	NC_006448	CTA	2	6	30231	30236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820129
609	NC_006448	CTG	2	6	30267	30272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820129
610	NC_006448	GAT	2	6	30278	30283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820129
611	NC_006448	A	6	6	30333	30338	100 %	0 %	0 %	0 %	55820129
612	NC_006448	ATT	2	6	30359	30364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820129
613	NC_006448	GCTATT	2	12	30458	30469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55820129
614	NC_006448	GAA	2	6	30578	30583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820129
615	NC_006448	T	6	6	30687	30692	0 %	100 %	0 %	0 %	55820130
616	NC_006448	GGT	2	6	30699	30704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820130
617	NC_006448	ATG	2	6	30756	30761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820130
618	NC_006448	ATG	2	6	30769	30774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820130
619	NC_006448	TGC	2	6	30881	30886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820130
620	NC_006448	ATT	2	6	30914	30919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820130
621	NC_006448	GAA	2	6	31116	31121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820130
622	NC_006448	GAA	2	6	31191	31196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820130
623	NC_006448	ATGAA	2	10	31219	31228	60 %	20 %	20 %	0 %	55820130
624	NC_006448	TGA	2	6	31250	31255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820130
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626	NC_006448	AGA	2	6	31340	31345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820130
627	NC_006448	TCT	2	6	31365	31370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_006448	TAA	2	6	31442	31447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006448	CTG	2	6	31470	31475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_006448	TTA	2	6	31518	31523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_006448	TGA	2	6	31747	31752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820131
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876	NC_006448	T	7	7	42519	42525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
877	NC_006448	TAT	2	6	42592	42597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820139
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879	NC_006448	CAAC	2	8	42658	42665	50 %	0 %	0 %	50 %	55820139
880	NC_006448	AT	3	6	42703	42708	50 %	50 %	0 %	0 %	55820139
881	NC_006448	GATT	2	8	42714	42721	25 %	50 %	25 %	0 %	55820139
882	NC_006448	TGAT	2	8	42792	42799	25 %	50 %	25 %	0 %	55820139
883	NC_006448	A	6	6	42825	42830	100 %	0 %	0 %	0 %	55820139
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