MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_006448	ACA	2	6	288356	288361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820388
6003	NC_006448	TAT	2	6	288362	288367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820388
6004	NC_006448	A	6	6	288400	288405	100 %	0 %	0 %	0 %	55820388
6005	NC_006448	GT	3	6	288426	288431	0 %	50 %	50 %	0 %	55820388
6006	NC_006448	TTA	2	6	288558	288563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820388
6007	NC_006448	TGG	2	6	288569	288574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820388
6008	NC_006448	GAA	3	9	288713	288721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820388
6009	NC_006448	TA	3	6	288765	288770	50 %	50 %	0 %	0 %	55820388
6010	NC_006448	A	7	7	288778	288784	100 %	0 %	0 %	0 %	55820388
6011	NC_006448	TTA	2	6	288786	288791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820388
6012	NC_006448	AT	3	6	288797	288802	50 %	50 %	0 %	0 %	55820388
6013	NC_006448	TTGAT	2	10	288964	288973	20 %	60 %	20 %	0 %	55820388
6014	NC_006448	T	6	6	288973	288978	0 %	100 %	0 %	0 %	55820388
6015	NC_006448	TGA	3	9	289061	289069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820388
6016	NC_006448	TATT	2	8	289083	289090	25 %	75 %	0 %	0 %	55820388
6017	NC_006448	GAA	2	6	289101	289106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820388
6018	NC_006448	GTA	2	6	289191	289196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820388
6019	NC_006448	TTA	2	6	289221	289226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820388
6020	NC_006448	TA	3	6	289243	289248	50 %	50 %	0 %	0 %	55820388
6021	NC_006448	AAG	2	6	289254	289259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820388
6022	NC_006448	AGA	2	6	289346	289351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820388
6023	NC_006448	GAG	2	6	289375	289380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_006448	A	6	6	289393	289398	100 %	0 %	0 %	0 %	55820389
6025	NC_006448	AAC	2	6	289400	289405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820389
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6027	NC_006448	TAT	2	6	289455	289460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820389
6028	NC_006448	T	6	6	289482	289487	0 %	100 %	0 %	0 %	55820389
6029	NC_006448	CAT	2	6	289545	289550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820389
6030	NC_006448	TGG	2	6	289572	289577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820389
6031	NC_006448	TCTG	2	8	289581	289588	0 %	50 %	25 %	25 %	55820389
6032	NC_006448	CAG	2	6	289672	289677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820389
6033	NC_006448	T	6	6	289719	289724	0 %	100 %	0 %	0 %	55820389
6034	NC_006448	TCA	2	6	289726	289731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820389
6035	NC_006448	GTG	2	6	289768	289773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820389
6036	NC_006448	ATA	2	6	289781	289786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820389
6037	NC_006448	AAACT	2	10	289792	289801	60 %	20 %	0 %	20 %	55820389
6038	NC_006448	GTT	2	6	289837	289842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820389
6039	NC_006448	GGTATC	2	12	289848	289859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55820389
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6042	NC_006448	CTAG	2	8	290029	290036	25 %	25 %	25 %	25 %	55820389
6043	NC_006448	AGC	2	6	290091	290096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820389
6044	NC_006448	TGT	2	6	290105	290110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820389
6045	NC_006448	GGT	2	6	290185	290190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820389
6046	NC_006448	T	7	7	290380	290386	0 %	100 %	0 %	0 %	55820389
6047	NC_006448	AT	3	6	290388	290393	50 %	50 %	0 %	0 %	55820389
6048	NC_006448	TCTT	2	8	290414	290421	0 %	75 %	0 %	25 %	55820389
6049	NC_006448	ATT	2	6	290437	290442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820389
6050	NC_006448	TTTA	2	8	290457	290464	25 %	75 %	0 %	0 %	55820389
6051	NC_006448	CTTTT	2	10	290489	290498	0 %	80 %	0 %	20 %	55820389
6052	NC_006448	AGG	2	6	290544	290549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820389
6053	NC_006448	GTA	2	6	290625	290630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_006448	TA	3	6	290655	290660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_006448	AC	3	6	290679	290684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_006448	GGGC	2	8	290707	290714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_006448	TTGA	2	8	290730	290737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_006448	T	6	6	290765	290770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_006448	TGT	2	6	290880	290885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_006448	TTGAT	2	10	290999	291008	20 %	60 %	20 %	0 %	55820390
6061	NC_006448	CGA	2	6	291019	291024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820390
6062	NC_006448	GAGCTA	2	12	291113	291124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820390
6063	NC_006448	CAAT	2	8	291278	291285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_006448	TAT	2	6	291298	291303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820391
6065	NC_006448	A	7	7	291311	291317	100 %	0 %	0 %	0 %	55820391
6066	NC_006448	TGCT	2	8	291357	291364	0 %	50 %	25 %	25 %	55820391
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6073	NC_006448	ATG	2	6	291720	291725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820391
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6077	NC_006448	ATC	2	6	291917	291922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820391
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6081	NC_006448	GAA	2	6	292043	292048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820391
6082	NC_006448	A	6	6	292142	292147	100 %	0 %	0 %	0 %	55820391
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6084	NC_006448	TAA	2	6	292271	292276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_006448	A	7	7	292319	292325	100 %	0 %	0 %	0 %	55820392
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6093	NC_006448	TCA	2	6	292916	292921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820392
6094	NC_006448	GTT	2	6	292934	292939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820392
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6096	NC_006448	CAA	3	9	292955	292963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820392
6097	NC_006448	AAG	2	6	292992	292997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820392
6098	NC_006448	TAA	2	6	293041	293046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820392
6099	NC_006448	CAAA	2	8	293061	293068	75 %	0 %	0 %	25 %	55820392
6100	NC_006448	ATG	2	6	293106	293111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820392
6101	NC_006448	ATG	2	6	293130	293135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820392
6102	NC_006448	GAA	2	6	293259	293264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_006448	GAA	2	6	293288	293293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820393
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6106	NC_006448	A	6	6	293366	293371	100 %	0 %	0 %	0 %	55820393
6107	NC_006448	TGC	2	6	293407	293412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820393
6108	NC_006448	T	6	6	293427	293432	0 %	100 %	0 %	0 %	55820393
6109	NC_006448	ATT	2	6	293525	293530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820393
6110	NC_006448	GAT	2	6	293582	293587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820393
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6112	NC_006448	GAT	3	9	293636	293644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820393
6113	NC_006448	ATG	2	6	293726	293731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820393
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6115	NC_006448	TGA	2	6	293788	293793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_006448	CAG	2	6	293802	293807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_006448	CAA	2	6	293869	293874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820394
6118	NC_006448	ATT	2	6	293879	293884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820394
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6120	NC_006448	TACT	2	8	293963	293970	25 %	50 %	0 %	25 %	55820394
6121	NC_006448	TGA	2	6	293992	293997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820394
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6123	NC_006448	TAT	2	6	294167	294172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820394
6124	NC_006448	A	6	6	294329	294334	100 %	0 %	0 %	0 %	55820395
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6126	NC_006448	TGG	2	6	294565	294570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820395
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6248	NC_006448	AGG	2	6	301018	301023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820404
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6363	NC_006448	TAA	2	6	307217	307222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6367	NC_006448	TTAA	2	8	307298	307305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6372	NC_006448	AGT	2	6	307543	307548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820411
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6499	NC_006448	CTT	2	6	312836	312841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820416
6500	NC_006448	AAGCT	2	10	312871	312880	40 %	20 %	20 %	20 %	55820416

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