MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006448	ATG	2	6	215853	215858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820308
4502	NC_006448	ACC	2	6	215891	215896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820308
4503	NC_006448	ACC	2	6	215963	215968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820308
4504	NC_006448	CAT	2	6	215987	215992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820308
4505	NC_006448	GAGT	2	8	216299	216306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_006448	GTGA	2	8	216391	216398	25 %	25 %	50 %	0 %	55820309
4507	NC_006448	GCTG	2	8	216434	216441	0 %	25 %	50 %	25 %	55820309
4508	NC_006448	CCA	2	6	216606	216611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820309
4509	NC_006448	ATC	2	6	216713	216718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820309
4510	NC_006448	TCT	2	6	216722	216727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820309
4511	NC_006448	ACG	2	6	216809	216814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820309
4512	NC_006448	AAG	2	6	216850	216855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820309
4513	NC_006448	AG	3	6	216933	216938	50 %	0 %	50 %	0 %	55820309
4514	NC_006448	TTA	2	6	216974	216979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820309
4515	NC_006448	CTT	2	6	217020	217025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820309
4516	NC_006448	T	6	6	217072	217077	0 %	100 %	0 %	0 %	55820309
4517	NC_006448	GAG	2	6	217111	217116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820309
4518	NC_006448	GTT	2	6	217142	217147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820309
4519	NC_006448	A	6	6	217271	217276	100 %	0 %	0 %	0 %	55820310
4520	NC_006448	AGA	2	6	217289	217294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4521	NC_006448	CTG	2	6	217324	217329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820310
4522	NC_006448	AAG	2	6	217374	217379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4523	NC_006448	TGA	2	6	217382	217387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820310
4524	NC_006448	GAA	2	6	217404	217409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4525	NC_006448	TCT	2	6	217630	217635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820310
4526	NC_006448	GAC	2	6	217646	217651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820310
4527	NC_006448	CTA	2	6	217684	217689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820310
4528	NC_006448	AAG	2	6	217705	217710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4529	NC_006448	GGA	2	6	217802	217807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820310
4530	NC_006448	TCC	2	6	217849	217854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820310
4531	NC_006448	TGG	3	9	217880	217888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4532	NC_006448	CA	3	6	217898	217903	50 %	0 %	0 %	50 %	55820310
4533	NC_006448	ACAG	2	8	217937	217944	50 %	0 %	25 %	25 %	55820310
4534	NC_006448	TTCT	3	12	217965	217976	0 %	75 %	0 %	25 %	55820310
4535	NC_006448	AGCA	2	8	217998	218005	50 %	0 %	25 %	25 %	55820310
4536	NC_006448	AAT	2	6	218028	218033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820310
4537	NC_006448	GCCA	2	8	218070	218077	25 %	0 %	25 %	50 %	55820310
4538	NC_006448	TGC	2	6	218096	218101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820310
4539	NC_006448	ATA	2	6	218173	218178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820310
4540	NC_006448	CAAC	2	8	218188	218195	50 %	0 %	0 %	50 %	55820310
4541	NC_006448	GAT	2	6	218226	218231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820310
4542	NC_006448	GCTGAT	2	12	218247	218258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55820310
4543	NC_006448	TGA	2	6	218315	218320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820310
4544	NC_006448	GAA	2	6	218355	218360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4545	NC_006448	CTA	2	6	218362	218367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820310
4546	NC_006448	TGAG	2	8	218380	218387	25 %	25 %	50 %	0 %	55820310
4547	NC_006448	GATG	2	8	218426	218433	25 %	25 %	50 %	0 %	55820310
4548	NC_006448	GCA	2	6	218453	218458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820310
4549	NC_006448	GGT	2	6	218577	218582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4550	NC_006448	TGG	2	6	218659	218664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4551	NC_006448	ACCT	2	8	218707	218714	25 %	25 %	0 %	50 %	55820310
4552	NC_006448	CAAC	2	8	218746	218753	50 %	0 %	0 %	50 %	55820310
4553	NC_006448	TGG	2	6	218756	218761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4554	NC_006448	AGA	2	6	218903	218908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4555	NC_006448	GGT	3	9	218925	218933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4556	NC_006448	TGG	2	6	218984	218989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4557	NC_006448	GTG	2	6	219034	219039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820310
4558	NC_006448	AAG	2	6	219060	219065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820310
4559	NC_006448	TAT	2	6	219074	219079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820310
4560	NC_006448	ATG	2	6	219111	219116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820310
4561	NC_006448	ACT	2	6	219301	219306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820310
4562	NC_006448	GTAATA	2	12	219460	219471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	55820310
4563	NC_006448	GACA	2	8	219482	219489	50 %	0 %	25 %	25 %	55820310
4564	NC_006448	ATG	2	6	219508	219513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820310
4565	NC_006448	CAAG	2	8	219522	219529	50 %	0 %	25 %	25 %	55820310
4566	NC_006448	A	6	6	219636	219641	100 %	0 %	0 %	0 %	55820311
4567	NC_006448	ACT	2	6	219676	219681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820311
4568	NC_006448	TAG	2	6	219692	219697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820311
4569	NC_006448	A	6	6	219747	219752	100 %	0 %	0 %	0 %	55820311
4570	NC_006448	AAC	2	6	219846	219851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820312
4571	NC_006448	AGTTC	2	10	219866	219875	20 %	40 %	20 %	20 %	55820312
4572	NC_006448	TTC	2	6	219890	219895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820312
4573	NC_006448	TCA	2	6	219900	219905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820312
4574	NC_006448	TGA	2	6	219916	219921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820312
4575	NC_006448	TTG	2	6	219923	219928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820312
4576	NC_006448	TGCT	2	8	219988	219995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_006448	T	6	6	219997	220002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_006448	TAA	2	6	220007	220012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_006448	GCC	2	6	220037	220042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_006448	T	6	6	220047	220052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_006448	CATT	2	8	220078	220085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4582	NC_006448	AAAG	2	8	220143	220150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_006448	ATTC	2	8	220168	220175	25 %	50 %	0 %	25 %	55820313
4584	NC_006448	GAA	2	6	220341	220346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820313
4585	NC_006448	TTG	2	6	220369	220374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820313
4586	NC_006448	TGT	2	6	220403	220408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820313
4587	NC_006448	GAA	3	9	220479	220487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820313
4588	NC_006448	ATC	2	6	220566	220571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820313
4589	NC_006448	AAG	2	6	220591	220596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820313
4590	NC_006448	ACA	2	6	220618	220623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820313
4591	NC_006448	GCT	2	6	220662	220667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820313
4592	NC_006448	GA	3	6	220764	220769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_006448	GAT	2	6	220821	220826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820314
4594	NC_006448	GGA	2	6	220888	220893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820314
4595	NC_006448	TTTGG	2	10	220947	220956	0 %	60 %	40 %	0 %	55820314
4596	NC_006448	TTA	2	6	220994	220999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820314
4597	NC_006448	T	6	6	221011	221016	0 %	100 %	0 %	0 %	55820314
4598	NC_006448	TTA	2	6	221084	221089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820314
4599	NC_006448	T	6	6	221129	221134	0 %	100 %	0 %	0 %	55820314
4600	NC_006448	GCA	2	6	221203	221208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820314
4601	NC_006448	GGT	2	6	221233	221238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820314
4602	NC_006448	TGT	2	6	221256	221261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820314
4603	NC_006448	TTG	2	6	221285	221290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820314
4604	NC_006448	CCT	2	6	221292	221297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820314
4605	NC_006448	TCT	2	6	221321	221326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_006448	GA	3	6	221329	221334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_006448	T	6	6	221342	221347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_006448	A	6	6	221353	221358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_006448	GTT	2	6	221417	221422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_006448	CTT	2	6	221517	221522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820315
4611	NC_006448	ATA	2	6	221631	221636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820315
4612	NC_006448	AGT	2	6	221693	221698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820315
4613	NC_006448	AGA	2	6	221714	221719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820315
4614	NC_006448	CTGT	2	8	221720	221727	0 %	50 %	25 %	25 %	55820315
4615	NC_006448	TGG	2	6	221752	221757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820315
4616	NC_006448	TCA	2	6	221780	221785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820315
4617	NC_006448	CAA	2	6	221788	221793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_006448	TAA	2	6	221844	221849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_006448	GTTG	2	8	221898	221905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_006448	AGT	2	6	221964	221969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_006448	TAA	2	6	221970	221975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_006448	ATC	2	6	222022	222027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_006448	ATC	2	6	222180	222185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820316
4624	NC_006448	TGG	2	6	222190	222195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820316
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4626	NC_006448	CAT	2	6	222267	222272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820316
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5000	NC_006448	GAT	2	6	241216	241221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820334

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