MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006086	TAA	2	6	187910	187915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913528
4002	NC_006086	TCA	2	6	187944	187949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913528
4003	NC_006086	AGCT	2	8	187991	187998	25 %	25 %	25 %	25 %	50913528
4004	NC_006086	TCT	2	6	188016	188021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913528
4005	NC_006086	TGA	2	6	188058	188063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913528
4006	NC_006086	ACC	2	6	188093	188098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913528
4007	NC_006086	GGCA	2	8	188108	188115	25 %	0 %	50 %	25 %	50913528
4008	NC_006086	AGA	2	6	188141	188146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913528
4009	NC_006086	A	7	7	188171	188177	100 %	0 %	0 %	0 %	50913528
4010	NC_006086	GAT	2	6	188180	188185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913528
4011	NC_006086	T	6	6	188211	188216	0 %	100 %	0 %	0 %	50913528
4012	NC_006086	TAT	2	6	188297	188302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_006086	GAAA	2	8	188326	188333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_006086	T	7	7	188417	188423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_006086	A	7	7	188443	188449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_006086	TAA	2	6	188467	188472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_006086	A	6	6	188491	188496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_006086	T	6	6	188500	188505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_006086	TAA	2	6	188510	188515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_006086	AT	3	6	188524	188529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_006086	CCTG	2	8	188546	188553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_006086	CTT	2	6	188601	188606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_006086	GTT	3	9	188695	188703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913529
4024	NC_006086	AAGGTA	2	12	188723	188734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50913529
4025	NC_006086	GGT	2	6	188785	188790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913529
4026	NC_006086	TGAT	2	8	188813	188820	25 %	50 %	25 %	0 %	50913529
4027	NC_006086	AAG	2	6	188824	188829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913529
4028	NC_006086	TTC	2	6	188860	188865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913529
4029	NC_006086	A	6	6	188870	188875	100 %	0 %	0 %	0 %	50913529
4030	NC_006086	ATG	2	6	188942	188947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913529
4031	NC_006086	GAC	2	6	188955	188960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913529
4032	NC_006086	AAG	2	6	189029	189034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913529
4033	NC_006086	AAC	2	6	189060	189065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913529
4034	NC_006086	GCT	2	6	189100	189105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913529
4035	NC_006086	A	6	6	189197	189202	100 %	0 %	0 %	0 %	50913529
4036	NC_006086	GAA	2	6	189241	189246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913529
4037	NC_006086	ATG	2	6	189305	189310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913529
4038	NC_006086	TGG	2	6	189414	189419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913529
4039	NC_006086	CAA	2	6	189456	189461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913529
4040	NC_006086	AGT	2	6	189462	189467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913529
4041	NC_006086	TGA	2	6	189528	189533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913529
4042	NC_006086	GTC	2	6	189584	189589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913529
4043	NC_006086	GGTT	2	8	189601	189608	0 %	50 %	50 %	0 %	50913529
4044	NC_006086	GTC	2	6	189632	189637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913529
4045	NC_006086	CT	4	8	189658	189665	0 %	50 %	0 %	50 %	50913529
4046	NC_006086	TG	3	6	189709	189714	0 %	50 %	50 %	0 %	50913529
4047	NC_006086	AAC	2	6	189764	189769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913529
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4049	NC_006086	TGA	2	6	189840	189845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913529
4050	NC_006086	TCG	2	6	189873	189878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913529
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4052	NC_006086	ATCT	2	8	189966	189973	25 %	50 %	0 %	25 %	50913529
4053	NC_006086	TTG	2	6	190027	190032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_006086	TAGT	2	8	190040	190047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_006086	TAG	2	6	190059	190064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_006086	GAG	2	6	190108	190113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_006086	TAG	2	6	190187	190192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_006086	T	7	7	190204	190210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_006086	AGG	2	6	190285	190290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_006086	A	6	6	190308	190313	100 %	0 %	0 %	0 %	50913530
4061	NC_006086	AGG	2	6	190355	190360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913530
4062	NC_006086	CTC	2	6	190373	190378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913530
4063	NC_006086	AAAC	2	8	190380	190387	75 %	0 %	0 %	25 %	50913530
4064	NC_006086	TGA	2	6	190436	190441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913530
4065	NC_006086	GAAAA	2	10	190486	190495	80 %	0 %	20 %	0 %	50913530
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4068	NC_006086	GGATT	2	10	190603	190612	20 %	40 %	40 %	0 %	50913530
4069	NC_006086	GAT	2	6	190677	190682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913530
4070	NC_006086	A	7	7	190696	190702	100 %	0 %	0 %	0 %	50913530
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4073	NC_006086	GGT	2	6	190797	190802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913530
4074	NC_006086	TGT	2	6	190814	190819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913530
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4085	NC_006086	GCT	2	6	191295	191300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913530
4086	NC_006086	A	6	6	191301	191306	100 %	0 %	0 %	0 %	50913530
4087	NC_006086	AAAACT	2	12	191338	191349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50913530
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4089	NC_006086	TAA	2	6	191394	191399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_006086	CAG	2	6	191430	191435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_006086	TAT	2	6	191446	191451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_006086	A	7	7	191483	191489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_006086	T	6	6	191494	191499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_006086	CAT	2	6	191514	191519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913531
4095	NC_006086	TCC	2	6	191549	191554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913531
4096	NC_006086	A	7	7	191672	191678	100 %	0 %	0 %	0 %	50913531
4097	NC_006086	GAA	2	6	191698	191703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913531
4098	NC_006086	TGT	2	6	191760	191765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913531
4099	NC_006086	AC	3	6	191771	191776	50 %	0 %	0 %	50 %	50913531
4100	NC_006086	CTT	2	6	191830	191835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913531
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4103	NC_006086	AAG	2	6	191903	191908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913531
4104	NC_006086	AAG	2	6	191948	191953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913531
4105	NC_006086	ACA	2	6	191975	191980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913531
4106	NC_006086	T	6	6	192098	192103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_006086	GT	3	6	192119	192124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_006086	ACAA	2	8	192125	192132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_006086	CAT	2	6	192151	192156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_006086	CTA	2	6	192199	192204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_006086	ATA	2	6	192265	192270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_006086	ACT	2	6	192306	192311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_006086	T	8	8	192314	192321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_006086	T	7	7	192329	192335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_006086	TAA	2	6	192359	192364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_006086	ATA	2	6	192410	192415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_006086	GGT	2	6	192419	192424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913532
4118	NC_006086	A	6	6	192438	192443	100 %	0 %	0 %	0 %	50913532
4119	NC_006086	TTA	2	6	192513	192518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913532
4120	NC_006086	A	7	7	192558	192564	100 %	0 %	0 %	0 %	50913532
4121	NC_006086	AGA	2	6	192620	192625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913532
4122	NC_006086	TCATG	2	10	192629	192638	20 %	40 %	20 %	20 %	50913532
4123	NC_006086	CA	3	6	192639	192644	50 %	0 %	0 %	50 %	50913532
4124	NC_006086	GGA	2	6	192671	192676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913532
4125	NC_006086	TGG	3	9	192686	192694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913532
4126	NC_006086	TAC	2	6	192786	192791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913532
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4128	NC_006086	A	6	6	192885	192890	100 %	0 %	0 %	0 %	50913532
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4255	NC_006086	AAT	2	6	198501	198506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913538
4256	NC_006086	A	7	7	198538	198544	100 %	0 %	0 %	0 %	50913538
4257	NC_006086	TTG	2	6	198556	198561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913538
4258	NC_006086	TTC	2	6	198583	198588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913538
4259	NC_006086	A	6	6	198629	198634	100 %	0 %	0 %	0 %	50913538
4260	NC_006086	CAG	2	6	198639	198644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913538
4261	NC_006086	CAA	2	6	198732	198737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913538
4262	NC_006086	TGG	2	6	198746	198751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913538
4263	NC_006086	AGG	2	6	198781	198786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913538
4264	NC_006086	TGA	2	6	198790	198795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913538
4265	NC_006086	ATC	2	6	198893	198898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913538
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4267	NC_006086	TGC	2	6	198934	198939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913538
4268	NC_006086	CTTGT	2	10	198941	198950	0 %	60 %	20 %	20 %	50913538
4269	NC_006086	AGCA	2	8	198988	198995	50 %	0 %	25 %	25 %	50913538
4270	NC_006086	T	6	6	199051	199056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_006086	TAA	2	6	199180	199185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_006086	T	6	6	199196	199201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_006086	TCC	2	6	199435	199440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913539
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4275	NC_006086	ACT	2	6	199609	199614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913539
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4277	NC_006086	TTC	2	6	199729	199734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913539
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4280	NC_006086	GAA	2	6	199839	199844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913539
4281	NC_006086	AATC	2	8	199858	199865	50 %	25 %	0 %	25 %	50913539
4282	NC_006086	GCAAC	2	10	199874	199883	40 %	0 %	20 %	40 %	50913539
4283	NC_006086	CAAG	2	8	200073	200080	50 %	0 %	25 %	25 %	50913539
4284	NC_006086	A	6	6	200119	200124	100 %	0 %	0 %	0 %	50913539
4285	NC_006086	GCTA	2	8	200205	200212	25 %	25 %	25 %	25 %	50913539
4286	NC_006086	CAT	2	6	200288	200293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913539
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4288	NC_006086	AGA	2	6	200336	200341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913539
4289	NC_006086	CCAATC	2	12	200499	200510	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50913539
4290	NC_006086	GAGT	2	8	200549	200556	25 %	25 %	50 %	0 %	50913539
4291	NC_006086	TTC	2	6	200566	200571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913539
4292	NC_006086	GTC	2	6	200668	200673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913539
4293	NC_006086	TAT	2	6	200715	200720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913539
4294	NC_006086	CA	3	6	200737	200742	50 %	0 %	0 %	50 %	50913539
4295	NC_006086	CTC	2	6	200769	200774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913539
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4298	NC_006086	ACCA	2	8	200882	200889	50 %	0 %	0 %	50 %	50913539
4299	NC_006086	GAT	2	6	200921	200926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913539
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4302	NC_006086	GAT	2	6	201081	201086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913539
4303	NC_006086	GTT	2	6	201087	201092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913539
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4307	NC_006086	AAGGT	2	10	201556	201565	40 %	20 %	40 %	0 %	50913539
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4310	NC_006086	CAT	2	6	201665	201670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913539
4311	NC_006086	CAAA	2	8	201688	201695	75 %	0 %	0 %	25 %	50913539
4312	NC_006086	CGTCA	2	10	201753	201762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4313	NC_006086	GTT	2	6	201847	201852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4314	NC_006086	TTA	3	9	201869	201877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4315	NC_006086	CTT	2	6	201926	201931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4316	NC_006086	TG	3	6	201932	201937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4317	NC_006086	T	6	6	201948	201953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4318	NC_006086	CTTTAT	2	12	201990	202001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4319	NC_006086	A	6	6	202128	202133	100 %	0 %	0 %	0 %	50913540
4320	NC_006086	GCC	2	6	202266	202271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50913540
4321	NC_006086	GCT	3	9	202296	202304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913540
4322	NC_006086	AGA	2	6	202316	202321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913540
4323	NC_006086	TCA	2	6	202330	202335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913540
4324	NC_006086	TCA	2	6	202423	202428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913540
4325	NC_006086	CAT	2	6	202436	202441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913540
4326	NC_006086	CGA	2	6	202456	202461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913540
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4330	NC_006086	A	6	6	202671	202676	100 %	0 %	0 %	0 %	50913540
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4332	NC_006086	CTT	2	6	202709	202714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913540
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4335	NC_006086	TTC	2	6	202857	202862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913540
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4337	NC_006086	TGTT	2	8	202930	202937	0 %	75 %	25 %	0 %	50913540
4338	NC_006086	TTC	2	6	203030	203035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913540
4339	NC_006086	CTT	2	6	203094	203099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913540
4340	NC_006086	GTG	2	6	203188	203193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913540
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4342	NC_006086	ATTT	2	8	203219	203226	25 %	75 %	0 %	0 %	50913540
4343	NC_006086	TGCTGT	2	12	203252	203263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	50913540
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4346	NC_006086	TCT	2	6	203380	203385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913540
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4348	NC_006086	AACAA	2	10	203492	203501	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4349	NC_006086	TAA	2	6	203502	203507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_006086	GGA	2	6	203517	203522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4351	NC_006086	A	6	6	203522	203527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_006086	TCAG	2	8	203631	203638	25 %	25 %	25 %	25 %	50913541
4353	NC_006086	CTT	2	6	203639	203644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913541
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4358	NC_006086	GT	4	8	203890	203897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4359	NC_006086	ACA	2	6	203956	203961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913542
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4361	NC_006086	TAC	2	6	204057	204062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913542
4362	NC_006086	CAT	2	6	204068	204073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913542
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4364	NC_006086	CA	3	6	204261	204266	50 %	0 %	0 %	50 %	50913542
4365	NC_006086	TGG	2	6	204325	204330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913542
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4367	NC_006086	CTTA	2	8	204385	204392	25 %	50 %	0 %	25 %	50913542
4368	NC_006086	ATG	2	6	204443	204448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_006086	AGC	2	6	204569	204574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913543
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4371	NC_006086	GTTG	2	8	204644	204651	0 %	50 %	50 %	0 %	50913543
4372	NC_006086	GTG	2	6	204745	204750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913543
4373	NC_006086	CGA	2	6	204778	204783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913543
4374	NC_006086	AGC	2	6	204797	204802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913543
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4376	NC_006086	ACC	2	6	204922	204927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913543
4377	NC_006086	CTT	2	6	204942	204947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913543
4378	NC_006086	ATTG	2	8	204992	204999	25 %	50 %	25 %	0 %	50913543
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4380	NC_006086	AGA	2	6	205109	205114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913543
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