MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006086	GAG	2	6	21349	21354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006086	GA	3	6	21479	21484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006086	TA	3	6	21533	21538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006086	CTAA	2	8	21560	21567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_006086	TAG	2	6	21662	21667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006086	GA	3	6	21775	21780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006086	CT	3	6	21890	21895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_006086	GAT	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006086	AGG	2	6	21953	21958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006086	CGG	2	6	21999	22004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_006086	GA	3	6	22097	22102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006086	TAGG	2	8	22215	22222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_006086	GTT	2	6	22259	22264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006086	TAC	2	6	22269	22274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_006086	CCT	2	6	22357	22362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_006086	TTGG	2	8	22398	22405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_006086	AATC	2	8	22407	22414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_006086	GGT	2	6	22493	22498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006086	TCG	2	6	22608	22613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_006086	CGT	2	6	22688	22693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_006086	AGGGA	2	10	22826	22835	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006086	C	6	6	22864	22869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_006086	GA	3	6	22912	22917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006086	AGTGTA	2	12	22939	22950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006086	ACTAAT	2	12	22967	22978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_006086	CAG	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_006086	GCTTA	2	10	23192	23201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
528	NC_006086	AC	3	6	23205	23210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_006086	AGT	2	6	23386	23391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_006086	T	6	6	23396	23401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_006086	CGT	2	6	23726	23731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_006086	GAG	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006086	T	6	6	23834	23839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_006086	CTC	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_006086	AGA	2	6	24002	24007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006086	AAAT	2	8	24079	24086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006086	AG	3	6	24130	24135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006086	GGC	2	6	24162	24167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_006086	ACCT	2	8	24253	24260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_006086	AG	3	6	24305	24310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006086	CGA	2	6	24407	24412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_006086	GCA	2	6	24481	24486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_006086	CGC	2	6	24528	24533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_006086	GTGA	2	8	24534	24541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006086	TGT	2	6	24567	24572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_006086	AGA	2	6	24576	24581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006086	ATG	2	6	24582	24587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_006086	CCA	2	6	24603	24608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_006086	TAAC	2	8	24617	24624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_006086	CAG	2	6	24650	24655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_006086	AGCG	2	8	24705	24712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_006086	T	6	6	24720	24725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006086	AT	3	6	24834	24839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006086	GGA	2	6	24840	24845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_006086	CT	3	6	24865	24870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_006086	GAA	2	6	25104	25109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006086	GGT	2	6	25178	25183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006086	GTC	2	6	25192	25197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_006086	TCGTG	2	10	25201	25210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
560	NC_006086	CAT	2	6	25260	25265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_006086	TAA	2	6	25295	25300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_006086	GGA	2	6	25304	25309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006086	ATC	2	6	25328	25333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_006086	AC	3	6	25355	25360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_006086	TGGT	2	8	25370	25377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_006086	CGC	2	6	25494	25499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_006086	AC	3	6	25524	25529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_006086	CAC	2	6	25539	25544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_006086	AGCC	2	8	25587	25594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_006086	GAT	2	6	25610	25615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006086	CCT	2	6	25666	25671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_006086	AGG	2	6	25765	25770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006086	CTA	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_006086	CA	3	6	25890	25895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_006086	AGCG	2	8	25933	25940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
576	NC_006086	TA	3	6	25954	25959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006086	ATT	2	6	26053	26058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_006086	A	7	7	26077	26083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_006086	TAA	2	6	26090	26095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006086	GTTAA	2	10	26097	26106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
582	NC_006086	GAA	2	6	26143	26148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_006086	ACG	2	6	26160	26165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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586	NC_006086	GAAG	2	8	26265	26272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_006086	TAG	2	6	26331	26336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_006086	GCGA	2	8	26339	26346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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593	NC_006086	CT	3	6	26561	26566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_006086	GGGAG	2	10	26616	26625	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_006086	ATTC	2	8	27205	27212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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606	NC_006086	GAG	2	6	27350	27355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_006086	TA	3	6	27534	27539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006086	CTAA	2	8	27561	27568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_006086	TAG	2	6	27663	27668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006086	GA	3	6	27776	27781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006086	CT	3	6	27891	27896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_006086	GAT	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_006086	TAGG	2	8	28216	28223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_006086	TAC	2	6	28270	28275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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621	NC_006086	TTGG	2	8	28399	28406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006086	AATC	2	8	28408	28415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_006086	GGT	2	6	28494	28499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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625	NC_006086	CGT	2	6	28689	28694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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627	NC_006086	C	6	6	28865	28870	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
628	NC_006086	GA	3	6	28913	28918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_006086	ACTAAT	2	12	28968	28979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
631	NC_006086	CAG	2	6	29130	29135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_006086	GCTTA	2	10	29193	29202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
633	NC_006086	AC	3	6	29206	29211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_006086	AGT	2	6	29387	29392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_006086	T	6	6	29835	29840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_006086	CTC	2	6	29906	29911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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641	NC_006086	TAT	2	6	30078	30083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_006086	ATT	2	6	30188	30193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_006086	GCGT	2	8	30255	30262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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