MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006086	TCA	2	6	257903	257908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913598
5502	NC_006086	AGC	2	6	257910	257915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913598
5503	NC_006086	CAT	2	6	257937	257942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913598
5504	NC_006086	ATG	2	6	257995	258000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913598
5505	NC_006086	GCAGC	2	10	258052	258061	20 %	0 %	40 %	40 %	50913598
5506	NC_006086	TGG	2	6	258083	258088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913598
5507	NC_006086	CAAA	2	8	258129	258136	75 %	0 %	0 %	25 %	50913598
5508	NC_006086	GAA	2	6	258199	258204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913598
5509	NC_006086	A	6	6	258255	258260	100 %	0 %	0 %	0 %	50913598
5510	NC_006086	TTG	2	6	258279	258284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913599
5511	NC_006086	GAC	2	6	258296	258301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913599
5512	NC_006086	GAA	2	6	258365	258370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913599
5513	NC_006086	AATC	2	8	258382	258389	50 %	25 %	0 %	25 %	50913599
5514	NC_006086	GTG	2	6	258405	258410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913599
5515	NC_006086	GCT	2	6	258467	258472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913599
5516	NC_006086	ATG	3	9	258609	258617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913599
5517	NC_006086	AAC	2	6	258738	258743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913599
5518	NC_006086	ATT	2	6	258760	258765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913599
5519	NC_006086	GAA	2	6	258788	258793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913599
5520	NC_006086	A	6	6	258868	258873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_006086	AAAG	2	8	258900	258907	75 %	0 %	25 %	0 %	50913600
5522	NC_006086	AGA	2	6	258919	258924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913600
5523	NC_006086	AT	3	6	258927	258932	50 %	50 %	0 %	0 %	50913600
5524	NC_006086	TGC	2	6	259131	259136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913600
5525	NC_006086	TGA	2	6	259158	259163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913600
5526	NC_006086	TCAA	2	8	259220	259227	50 %	25 %	0 %	25 %	50913600
5527	NC_006086	GGT	2	6	259293	259298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913600
5528	NC_006086	TAC	2	6	259312	259317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913600
5529	NC_006086	TTGA	2	8	259342	259349	25 %	50 %	25 %	0 %	50913600
5530	NC_006086	ATTCC	2	10	259357	259366	20 %	40 %	0 %	40 %	50913600
5531	NC_006086	ATG	2	6	259381	259386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913600
5532	NC_006086	TTGA	2	8	259567	259574	25 %	50 %	25 %	0 %	50913600
5533	NC_006086	TCG	2	6	259626	259631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913600
5534	NC_006086	GTG	2	6	259736	259741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913600
5535	NC_006086	AAG	2	6	259787	259792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913600
5536	NC_006086	A	8	8	259825	259832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_006086	GTTCA	2	10	259857	259866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5538	NC_006086	T	7	7	259920	259926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_006086	A	6	6	259937	259942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_006086	TCT	2	6	260007	260012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_006086	ATC	2	6	260042	260047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_006086	T	6	6	260135	260140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_006086	ATA	2	6	260192	260197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_006086	TTA	2	6	260201	260206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_006086	TAG	2	6	260207	260212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_006086	CTGG	2	8	260252	260259	0 %	25 %	50 %	25 %	50913601
5547	NC_006086	TTA	2	6	260263	260268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913601
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5552	NC_006086	CTTG	2	8	260518	260525	0 %	50 %	25 %	25 %	50913601
5553	NC_006086	TTA	2	6	260570	260575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913601
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5555	NC_006086	TTG	2	6	260654	260659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913601
5556	NC_006086	GTC	2	6	260787	260792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913601
5557	NC_006086	ACC	2	6	260795	260800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913601
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5559	NC_006086	TACCCA	2	12	260953	260964	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50913601
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5562	NC_006086	AAAG	2	8	261090	261097	75 %	0 %	25 %	0 %	50913601
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5567	NC_006086	TGT	2	6	261262	261267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913602
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5571	NC_006086	GAG	2	6	261790	261795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913603
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5584	NC_006086	AGTT	2	8	262343	262350	25 %	50 %	25 %	0 %	50913603
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5597	NC_006086	A	6	6	262800	262805	100 %	0 %	0 %	0 %	50913604
5598	NC_006086	TACC	2	8	263086	263093	25 %	25 %	0 %	50 %	50913604
5599	NC_006086	ATT	2	6	263120	263125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913604
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5607	NC_006086	TGA	2	6	263436	263441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913604
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