MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006086	T	6	6	234715	234720	0 %	100 %	0 %	0 %	50913574
5002	NC_006086	TTTTA	2	10	234725	234734	20 %	80 %	0 %	0 %	50913574
5003	NC_006086	TCT	2	6	234810	234815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913574
5004	NC_006086	TTA	2	6	234856	234861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913574
5005	NC_006086	TGA	2	6	234936	234941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913574
5006	NC_006086	CTAAT	2	10	234963	234972	40 %	40 %	0 %	20 %	50913574
5007	NC_006086	AT	3	6	234971	234976	50 %	50 %	0 %	0 %	50913574
5008	NC_006086	T	6	6	235064	235069	0 %	100 %	0 %	0 %	50913574
5009	NC_006086	TTCT	2	8	235092	235099	0 %	75 %	0 %	25 %	50913574
5010	NC_006086	ATA	2	6	235119	235124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913574
5011	NC_006086	GTG	2	6	235157	235162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913574
5012	NC_006086	GAT	2	6	235195	235200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913574
5013	NC_006086	T	7	7	235260	235266	0 %	100 %	0 %	0 %	50913574
5014	NC_006086	AAG	2	6	235314	235319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913574
5015	NC_006086	TAT	2	6	235369	235374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913574
5016	NC_006086	AAG	2	6	235389	235394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913574
5017	NC_006086	ATT	2	6	235471	235476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913574
5018	NC_006086	GAATG	2	10	235486	235495	40 %	20 %	40 %	0 %	50913574
5019	NC_006086	TTA	2	6	235500	235505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913574
5020	NC_006086	CAA	2	6	235533	235538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913574
5021	NC_006086	CAG	2	6	235563	235568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913574
5022	NC_006086	ATG	2	6	235628	235633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913574
5023	NC_006086	TGA	2	6	235702	235707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913574
5024	NC_006086	GAA	2	6	235712	235717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913574
5025	NC_006086	AAG	2	6	235755	235760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913574
5026	NC_006086	TAT	2	6	235888	235893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913574
5027	NC_006086	T	6	6	236019	236024	0 %	100 %	0 %	0 %	50913574
5028	NC_006086	ATA	2	6	236040	236045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913574
5029	NC_006086	GAT	2	6	236159	236164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913574
5030	NC_006086	ACTG	2	8	236218	236225	25 %	25 %	25 %	25 %	50913574
5031	NC_006086	ATT	2	6	236375	236380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913574
5032	NC_006086	ATC	2	6	236415	236420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913574
5033	NC_006086	CAAT	2	8	236464	236471	50 %	25 %	0 %	25 %	50913574
5034	NC_006086	T	6	6	236514	236519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_006086	CTTT	2	8	236542	236549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_006086	TAA	2	6	236562	236567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_006086	CAAG	2	8	236568	236575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_006086	A	6	6	236578	236583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_006086	TGAT	2	8	236604	236611	25 %	50 %	25 %	0 %	50913575
5040	NC_006086	CTG	2	6	236731	236736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913575
5041	NC_006086	ACA	2	6	236854	236859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913575
5042	NC_006086	AGA	2	6	236956	236961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913575
5043	NC_006086	ACT	2	6	237048	237053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913575
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5045	NC_006086	ACC	2	6	237134	237139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913575
5046	NC_006086	TG	3	6	237195	237200	0 %	50 %	50 %	0 %	50913575
5047	NC_006086	TGC	2	6	237244	237249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913575
5048	NC_006086	A	6	6	237281	237286	100 %	0 %	0 %	0 %	50913575
5049	NC_006086	GAGAT	2	10	237357	237366	40 %	20 %	40 %	0 %	50913575
5050	NC_006086	T	6	6	237408	237413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_006086	TAA	2	6	237437	237442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_006086	TAC	2	6	237532	237537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913576
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5055	NC_006086	TCGT	2	8	237677	237684	0 %	50 %	25 %	25 %	50913576
5056	NC_006086	A	7	7	237695	237701	100 %	0 %	0 %	0 %	50913576
5057	NC_006086	TGAT	2	8	237730	237737	25 %	50 %	25 %	0 %	50913576
5058	NC_006086	ATT	2	6	237742	237747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913576
5059	NC_006086	T	6	6	237857	237862	0 %	100 %	0 %	0 %	50913576
5060	NC_006086	GAAC	2	8	237891	237898	50 %	0 %	25 %	25 %	50913576
5061	NC_006086	GGT	2	6	237900	237905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913576
5062	NC_006086	CAG	2	6	237952	237957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_006086	TGTCT	2	10	237980	237989	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5064	NC_006086	GGGA	2	8	237992	237999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_006086	A	6	6	238016	238021	100 %	0 %	0 %	0 %	50913577
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5078	NC_006086	GA	3	6	238576	238581	50 %	0 %	50 %	0 %	50913577
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5081	NC_006086	TGG	2	6	238692	238697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913577
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5091	NC_006086	T	7	7	239430	239436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_006086	ACCG	2	8	239452	239459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_006086	TAAGA	2	10	239498	239507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_006086	CTG	2	6	239530	239535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_006086	GGCT	2	8	239699	239706	0 %	25 %	50 %	25 %	50913578
5096	NC_006086	CAG	2	6	239782	239787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913578
5097	NC_006086	GA	3	6	239801	239806	50 %	0 %	50 %	0 %	50913578
5098	NC_006086	CCA	2	6	239817	239822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913578
5099	NC_006086	GC	3	6	239834	239839	0 %	0 %	50 %	50 %	50913578
5100	NC_006086	CCTTC	2	10	239913	239922	0 %	40 %	0 %	60 %	50913578
5101	NC_006086	GCTAA	2	10	239956	239965	40 %	20 %	20 %	20 %	50913578
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5107	NC_006086	T	6	6	240088	240093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_006086	ATT	2	6	240104	240109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_006086	TAA	2	6	240143	240148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_006086	ACAA	2	8	240167	240174	75 %	0 %	0 %	25 %	50913579
5111	NC_006086	ACA	2	6	240277	240282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913579
5112	NC_006086	AGATGG	2	12	240424	240435	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	50913579
5113	NC_006086	ATTAGC	2	12	240439	240450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913579
5114	NC_006086	TTG	2	6	240471	240476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913579
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5116	NC_006086	TGG	2	6	240586	240591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913579
5117	NC_006086	TGG	2	6	240679	240684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913579
5118	NC_006086	TGT	2	6	240709	240714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913579
5119	NC_006086	TTA	2	6	240792	240797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913579
5120	NC_006086	T	7	7	240929	240935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_006086	TAA	2	6	240960	240965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_006086	AGA	2	6	240976	240981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_006086	TCA	2	6	241010	241015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_006086	TTG	2	6	241017	241022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_006086	AT	3	6	241053	241058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_006086	GAA	2	6	241068	241073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_006086	CGT	2	6	241172	241177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913580
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5244	NC_006086	TAAA	2	8	246377	246384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_006086	CAAT	2	8	246412	246419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5250	NC_006086	T	6	6	246575	246580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_006086	GTT	2	6	246636	246641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5382	NC_006086	TTTC	2	8	252129	252136	0 %	75 %	0 %	25 %	50913592
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5490	NC_006086	GTA	2	6	257296	257301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5492	NC_006086	TAA	2	6	257454	257459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5495	NC_006086	GAA	2	6	257545	257550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913598
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5500	NC_006086	TGGA	2	8	257782	257789	25 %	25 %	50 %	0 %	50913598

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