MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006086	AAC	2	6	211390	211395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913549
4502	NC_006086	CGA	2	6	211467	211472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913549
4503	NC_006086	CGC	3	9	211475	211483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50913549
4504	NC_006086	GCC	2	6	211511	211516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50913549
4505	NC_006086	GC	3	6	211523	211528	0 %	0 %	50 %	50 %	50913549
4506	NC_006086	A	6	6	211529	211534	100 %	0 %	0 %	0 %	50913549
4507	NC_006086	TGAT	2	8	211554	211561	25 %	50 %	25 %	0 %	50913549
4508	NC_006086	TAT	2	6	211591	211596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913549
4509	NC_006086	GAT	2	6	211649	211654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913549
4510	NC_006086	AAT	2	6	211655	211660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913549
4511	NC_006086	ATT	2	6	211676	211681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913549
4512	NC_006086	ACAA	2	8	211765	211772	75 %	0 %	0 %	25 %	50913550
4513	NC_006086	TGG	2	6	211791	211796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913550
4514	NC_006086	AGC	2	6	211797	211802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913550
4515	NC_006086	CTAA	2	8	211814	211821	50 %	25 %	0 %	25 %	50913550
4516	NC_006086	AGT	2	6	211852	211857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913550
4517	NC_006086	TGGAT	2	10	211872	211881	20 %	40 %	40 %	0 %	50913550
4518	NC_006086	TTTA	2	8	211894	211901	25 %	75 %	0 %	0 %	50913550
4519	NC_006086	CAG	2	6	211932	211937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913550
4520	NC_006086	A	6	6	211958	211963	100 %	0 %	0 %	0 %	50913550
4521	NC_006086	TTTA	2	8	212000	212007	25 %	75 %	0 %	0 %	50913550
4522	NC_006086	AGC	2	6	212025	212030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913550
4523	NC_006086	TAG	2	6	212055	212060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913550
4524	NC_006086	T	6	6	212201	212206	0 %	100 %	0 %	0 %	50913550
4525	NC_006086	ACC	2	6	212254	212259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913550
4526	NC_006086	ATTG	2	8	212305	212312	25 %	50 %	25 %	0 %	50913550
4527	NC_006086	TAT	2	6	212386	212391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913550
4528	NC_006086	ATG	2	6	212411	212416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913550
4529	NC_006086	GTA	2	6	212432	212437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913550
4530	NC_006086	GTT	2	6	212572	212577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913550
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4533	NC_006086	TAT	2	6	212677	212682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913550
4534	NC_006086	CAA	2	6	212903	212908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913550
4535	NC_006086	GAT	2	6	212933	212938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913550
4536	NC_006086	CCTAA	2	10	212945	212954	40 %	20 %	0 %	40 %	50913550
4537	NC_006086	A	6	6	213036	213041	100 %	0 %	0 %	0 %	50913550
4538	NC_006086	GCA	2	6	213074	213079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913550
4539	NC_006086	ATCT	2	8	213108	213115	25 %	50 %	0 %	25 %	50913550
4540	NC_006086	GGC	2	6	213130	213135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913550
4541	NC_006086	ACA	2	6	213152	213157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913550
4542	NC_006086	A	6	6	213179	213184	100 %	0 %	0 %	0 %	50913550
4543	NC_006086	CAC	2	6	213210	213215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913550
4544	NC_006086	A	6	6	213314	213319	100 %	0 %	0 %	0 %	50913550
4545	NC_006086	GCC	2	6	213422	213427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50913550
4546	NC_006086	A	6	6	213428	213433	100 %	0 %	0 %	0 %	50913550
4547	NC_006086	CAAA	2	8	213444	213451	75 %	0 %	0 %	25 %	50913550
4548	NC_006086	TAA	2	6	213599	213604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_006086	T	6	6	213666	213671	0 %	100 %	0 %	0 %	50913551
4550	NC_006086	ATG	2	6	213759	213764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913551
4551	NC_006086	TGG	2	6	213790	213795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913551
4552	NC_006086	ACC	2	6	213813	213818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913551
4553	NC_006086	TTA	2	6	213929	213934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913551
4554	NC_006086	GTG	2	6	214027	214032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913551
4555	NC_006086	A	6	6	214083	214088	100 %	0 %	0 %	0 %	50913551
4556	NC_006086	GAA	2	6	214104	214109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913551
4557	NC_006086	A	6	6	214132	214137	100 %	0 %	0 %	0 %	50913551
4558	NC_006086	A	6	6	214225	214230	100 %	0 %	0 %	0 %	50913551
4559	NC_006086	GAAA	2	8	214310	214317	75 %	0 %	25 %	0 %	50913551
4560	NC_006086	GAT	2	6	214401	214406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913551
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4563	NC_006086	CTG	2	6	214549	214554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913551
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4565	NC_006086	TCT	2	6	214576	214581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913551
4566	NC_006086	CAT	2	6	214619	214624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913551
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4571	NC_006086	TAT	2	6	214972	214977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913551
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4574	NC_006086	AAG	2	6	215262	215267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913551
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4582	NC_006086	TGC	2	6	216091	216096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913551
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4587	NC_006086	TAA	2	6	216293	216298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_006086	A	6	6	216302	216307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_006086	GCT	2	6	216327	216332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_006086	ATAG	2	8	216413	216420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_006086	GTT	2	6	216501	216506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913552
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4593	NC_006086	GA	3	6	216619	216624	50 %	0 %	50 %	0 %	50913552
4594	NC_006086	AAG	2	6	216769	216774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913552
4595	NC_006086	GGCA	2	8	216794	216801	25 %	0 %	50 %	25 %	50913552
4596	NC_006086	TGA	2	6	216814	216819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913552
4597	NC_006086	CGTG	2	8	216894	216901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_006086	ATA	2	6	216902	216907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_006086	A	6	6	216912	216917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_006086	AGC	2	6	216928	216933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_006086	CATT	2	8	216941	216948	25 %	50 %	0 %	25 %	50913553
4602	NC_006086	ATT	2	6	217035	217040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913553
4603	NC_006086	TAA	2	6	217136	217141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913553
4604	NC_006086	TGA	2	6	217157	217162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913553
4605	NC_006086	ACC	2	6	217200	217205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913553
4606	NC_006086	GATGTT	2	12	217278	217289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50913553
4607	NC_006086	AAG	2	6	217303	217308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913553
4608	NC_006086	TAAA	2	8	217414	217421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_006086	ATGG	2	8	217489	217496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_006086	ATTT	2	8	217500	217507	25 %	75 %	0 %	0 %	50913554
4611	NC_006086	CAT	2	6	217527	217532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913554
4612	NC_006086	TTA	2	6	217546	217551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913554
4613	NC_006086	TGA	2	6	217555	217560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913554
4614	NC_006086	TCTTTG	2	12	217591	217602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50913554
4615	NC_006086	A	6	6	217625	217630	100 %	0 %	0 %	0 %	50913554
4616	NC_006086	TGT	2	6	217641	217646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913554
4617	NC_006086	AGAT	2	8	217660	217667	50 %	25 %	25 %	0 %	50913554
4618	NC_006086	AACC	2	8	217702	217709	50 %	0 %	0 %	50 %	50913554
4619	NC_006086	A	7	7	217729	217735	100 %	0 %	0 %	0 %	50913554
4620	NC_006086	TCA	2	6	217754	217759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913554
4621	NC_006086	TAA	2	6	217852	217857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913554
4622	NC_006086	GGAAA	2	10	217974	217983	60 %	0 %	40 %	0 %	50913554
4623	NC_006086	A	6	6	217995	218000	100 %	0 %	0 %	0 %	50913554
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4625	NC_006086	TGT	2	6	218085	218090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913554
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4746	NC_006086	TCTAA	2	10	224083	224092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4747	NC_006086	TTA	2	6	224098	224103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_006086	ATA	3	9	224280	224288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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