MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 plasmid pSAS

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005951	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398099
2	NC_005951	ATA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398099
3	NC_005951	GGT	2	6	411	416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49398099
4	NC_005951	AAC	2	6	418	423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49398099
5	NC_005951	TGA	2	6	476	481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398099
6	NC_005951	TAT	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398099
7	NC_005951	TGA	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398099
8	NC_005951	ATG	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005951	TAA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005951	TAT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005951	ATT	2	6	888	893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005951	GTT	2	6	897	902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005951	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005951	TGA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005951	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005951	GAA	3	9	1209	1217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005951	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005951	TAA	2	6	1337	1342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005951	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005951	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005951	AGC	2	6	1712	1717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_005951	GAT	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005951	GAT	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005951	GAA	2	6	1842	1847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005951	ATT	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005951	TGT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005951	ATG	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005951	AGA	2	6	1970	1975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005951	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005951	ATG	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005951	AAG	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005951	AGA	2	6	2114	2119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005951	AGA	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005951	ATT	2	6	2178	2183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398100
35	NC_005951	CAA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49398100
36	NC_005951	ATA	2	6	2434	2439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398100
37	NC_005951	AGT	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398100
38	NC_005951	TAA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005951	TAA	2	6	2622	2627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398101
40	NC_005951	TGA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398101
41	NC_005951	GAT	3	9	2782	2790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398101
42	NC_005951	CTT	2	6	2861	2866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398101
43	NC_005951	TAA	2	6	2898	2903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398101
44	NC_005951	GAT	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398101
45	NC_005951	TAT	3	9	3090	3098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398101
46	NC_005951	TAA	2	6	3117	3122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398101
47	NC_005951	AGA	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398101
48	NC_005951	AAC	2	6	3362	3367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49398101
49	NC_005951	ATT	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005951	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49398102
51	NC_005951	AGA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398103
52	NC_005951	TAT	2	6	4028	4033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398103
53	NC_005951	TAA	2	6	4055	4060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398103
54	NC_005951	ATG	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005951	CCT	2	6	4134	4139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_005951	GAC	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005951	TAA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005951	TGT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005951	AAG	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398104
60	NC_005951	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398104
61	NC_005951	CAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49398104
62	NC_005951	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398104
63	NC_005951	AAG	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398104
64	NC_005951	ATT	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398104
65	NC_005951	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005951	GAC	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49398105
67	NC_005951	TTC	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
68	NC_005951	TCT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
69	NC_005951	TCT	2	6	4778	4783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
70	NC_005951	CTT	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
71	NC_005951	TCG	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49398105
72	NC_005951	TTC	2	6	4864	4869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
73	NC_005951	TAG	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398105
74	NC_005951	TAG	2	6	4941	4946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398105
75	NC_005951	TTG	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49398105
76	NC_005951	GAC	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49398105
77	NC_005951	ATT	2	6	5128	5133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398105
78	NC_005951	CTA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49398105
79	NC_005951	TCT	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
80	NC_005951	TAA	2	6	5307	5312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398105
81	NC_005951	ATT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398105
82	NC_005951	TTC	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398105
83	NC_005951	ATC	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005951	TAA	3	9	5484	5492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005951	TAA	2	6	5618	5623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005951	ACT	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_005951	TAA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005951	AAT	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005951	ATT	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005951	TTA	2	6	5788	5793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005951	TAT	2	6	5828	5833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005951	ACA	2	6	5848	5853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005951	ATG	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005951	TTA	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005951	TAC	3	9	6116	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005951	AGA	2	6	6183	6188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005951	AGC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005951	AAG	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005951	GAA	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005951	ATC	2	6	6548	6553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005951	TGG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005951	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005951	GAA	3	9	6737	6745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005951	ATT	3	9	6782	6790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005951	AGA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005951	TCG	2	6	7353	7358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005951	GTA	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005951	CGA	2	6	7495	7500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_005951	GAC	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005951	TAA	2	6	7692	7697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005951	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005951	ATT	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005951	TAT	2	6	8006	8011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398106
114	NC_005951	GTT	2	6	8022	8027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49398106
115	NC_005951	GCT	3	9	8028	8036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49398106
116	NC_005951	CAG	2	6	8053	8058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49398106
117	NC_005951	TTA	2	6	8064	8069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398106
118	NC_005951	TTA	2	6	8076	8081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398106
119	NC_005951	TAT	2	6	8150	8155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398106
120	NC_005951	ATG	2	6	8269	8274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398106
121	NC_005951	ATA	2	6	8377	8382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398106
122	NC_005951	TCT	2	6	8464	8469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398106
123	NC_005951	TTG	2	6	8518	8523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49398106
124	NC_005951	TTA	3	9	8575	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398106
125	NC_005951	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398107
126	NC_005951	TGA	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49398107
127	NC_005951	GAA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398107
128	NC_005951	AGA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398107
129	NC_005951	CAT	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49398107
130	NC_005951	ATT	2	6	8932	8937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398107
131	NC_005951	TTA	2	6	8938	8943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398107
132	NC_005951	AGG	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49398107
133	NC_005951	TCT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005951	GAC	2	6	9055	9060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005951	GAT	2	6	9094	9099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005951	ATA	2	6	9100	9105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005951	CAT	2	6	9182	9187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_005951	TCA	2	6	9196	9201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005951	TAT	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005951	CAA	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_005951	TAG	2	6	9368	9373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_005951	TAA	2	6	18687	18692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398116
274	NC_005951	TTA	2	6	18718	18723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
275	NC_005951	TAT	2	6	18745	18750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
276	NC_005951	ATT	2	6	18751	18756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
277	NC_005951	AGA	2	6	18774	18779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49398116
278	NC_005951	ATT	2	6	18843	18848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
279	NC_005951	TTA	2	6	18874	18879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
280	NC_005951	TAT	2	6	18902	18907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
281	NC_005951	CTT	2	6	18918	18923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49398116
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298	NC_005951	ATT	2	6	20139	20144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
299	NC_005951	CAG	2	6	20145	20150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49398116
300	NC_005951	TAT	2	6	20187	20192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
301	NC_005951	ATA	2	6	20242	20247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49398116
302	NC_005951	TAT	2	6	20259	20264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398116
303	NC_005951	ATT	2	6	20356	20361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49398117
304	NC_005951	ATC	2	6	20380	20385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49398117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.