MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 1359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	GTA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005232	CTG	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005232	CGA	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005232	CCG	2	6	203	208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_005232	CAA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005232	TCT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005232	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
8	NC_005232	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505826
9	NC_005232	GGA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505826
10	NC_005232	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505826
11	NC_005232	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
12	NC_005232	AGG	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505826
13	NC_005232	TCC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505826
14	NC_005232	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505826
15	NC_005232	CAG	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505826
16	NC_005232	TTG	2	6	1474	1479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505826
17	NC_005232	GCC	2	6	1548	1553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505826
18	NC_005232	ATG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505826
19	NC_005232	TGG	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505826
20	NC_005232	GAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
21	NC_005232	CGG	2	6	1937	1942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505826
22	NC_005232	CAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505826
23	NC_005232	TTA	2	6	1965	1970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505826
24	NC_005232	GTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505826
25	NC_005232	GAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
26	NC_005232	TGG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505826
27	NC_005232	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505826
28	NC_005232	CGC	2	6	2357	2362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505826
29	NC_005232	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505826
30	NC_005232	CGG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505826
31	NC_005232	CAT	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505826
32	NC_005232	GCG	2	6	3008	3013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505826
33	NC_005232	GTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005232	ATT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005232	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005232	CAG	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005232	ATT	2	6	3481	3486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005232	GAA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505827
39	NC_005232	CAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505827
40	NC_005232	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505827
41	NC_005232	ACA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505828
42	NC_005232	TGA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505828
43	NC_005232	GCC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505829
44	NC_005232	GCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505829
45	NC_005232	CTG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505829
46	NC_005232	CGG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505829
47	NC_005232	GGC	2	6	4397	4402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505829
48	NC_005232	CTG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505830
49	NC_005232	CGC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505830
50	NC_005232	CGA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505830
51	NC_005232	GGC	2	6	4825	4830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505830
52	NC_005232	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505830
53	NC_005232	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505830
54	NC_005232	GGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505830
55	NC_005232	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505831
56	NC_005232	GGC	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505831
57	NC_005232	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505831
58	NC_005232	CCG	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505831
59	NC_005232	GCC	2	6	5668	5673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505831
60	NC_005232	TGG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505831
61	NC_005232	CGG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505831
62	NC_005232	GTG	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505831
63	NC_005232	CCA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505831
64	NC_005232	GGT	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505831
65	NC_005232	CAT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505831
66	NC_005232	CCG	2	6	6005	6010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505831
67	NC_005232	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505831
68	NC_005232	TGA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505831
69	NC_005232	GGA	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505831
70	NC_005232	GCC	2	6	6315	6320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_005232	ACC	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_005232	AGT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505832
73	NC_005232	CAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505832
74	NC_005232	TGG	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505832
75	NC_005232	CAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505832
76	NC_005232	GGC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505832
77	NC_005232	ACT	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505832
78	NC_005232	GGA	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505832
79	NC_005232	CCA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505832
80	NC_005232	CAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505832
81	NC_005232	TGA	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505832
82	NC_005232	CAC	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505832
83	NC_005232	TGA	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505832
84	NC_005232	GCG	2	6	7210	7215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505832
85	NC_005232	TTC	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505832
86	NC_005232	GAG	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505832
87	NC_005232	ATT	2	6	7482	7487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005232	CTC	2	6	7527	7532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_005232	GGA	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005232	GGC	2	6	7616	7621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505833
91	NC_005232	ACT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505833
92	NC_005232	AAT	2	6	7658	7663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505833
93	NC_005232	ACT	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505833
94	NC_005232	AAG	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505833
95	NC_005232	CCT	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505833
96	NC_005232	GAA	2	6	7913	7918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505833
97	NC_005232	GCC	2	6	8107	8112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
98	NC_005232	CCG	2	6	8224	8229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
99	NC_005232	GGC	2	6	8305	8310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505833
100	NC_005232	ACC	2	6	8340	8345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505833
101	NC_005232	CCG	2	6	8359	8364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
102	NC_005232	GGA	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505833
103	NC_005232	GGA	2	6	8461	8466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505833
104	NC_005232	CGC	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
105	NC_005232	ACT	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505833
106	NC_005232	GAA	2	6	8607	8612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005232	TGG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505834
108	NC_005232	ACA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505834
109	NC_005232	CAA	2	6	8742	8747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505834
110	NC_005232	CAC	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505834
111	NC_005232	CCG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505834
112	NC_005232	AAT	2	6	8994	8999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505834
113	NC_005232	CGC	2	6	9080	9085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505834
114	NC_005232	CAA	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505834
115	NC_005232	GTA	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505834
116	NC_005232	GAA	2	6	9216	9221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505834
117	NC_005232	GAG	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505834
118	NC_005232	GGT	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505834
119	NC_005232	AAT	2	6	9445	9450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505834
120	NC_005232	AGG	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505835
121	NC_005232	ACT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505835
122	NC_005232	GAT	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505835
123	NC_005232	TGG	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505835
124	NC_005232	ATA	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505835
125	NC_005232	TCA	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505835
126	NC_005232	CAC	2	6	10361	10366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_005232	ATG	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505836
128	NC_005232	GTG	2	6	10668	10673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505836
129	NC_005232	ACT	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505836
130	NC_005232	AGG	2	6	10813	10818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505836
131	NC_005232	TTA	2	6	10997	11002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005232	ATT	2	6	11026	11031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005232	ATA	2	6	11147	11152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005232	TAT	2	6	11230	11235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005232	CAA	2	6	11298	11303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_005232	GCA	2	6	21735	21740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505843
262	NC_005232	AAG	2	6	21818	21823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_005232	GTC	3	9	21858	21866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505844
264	NC_005232	CGG	2	6	21939	21944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505844
265	NC_005232	AAG	2	6	21969	21974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505844
266	NC_005232	CGA	2	6	21996	22001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505844
267	NC_005232	AAT	2	6	22547	22552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505846
268	NC_005232	AAG	2	6	22581	22586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505846
269	NC_005232	AGA	2	6	22591	22596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505846
270	NC_005232	ATA	2	6	22668	22673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505846
271	NC_005232	ATG	2	6	22830	22835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505846
272	NC_005232	AGA	2	6	22852	22857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505846
273	NC_005232	AGT	2	6	22897	22902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505846
274	NC_005232	AGT	2	6	22906	22911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505846
275	NC_005232	CCT	2	6	23038	23043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_005232	GTT	2	6	23247	23252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505847
277	NC_005232	TGT	2	6	23271	23276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505847
278	NC_005232	GTT	2	6	23300	23305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505847
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280	NC_005232	GCC	2	6	23393	23398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505847
281	NC_005232	TTG	2	6	23421	23426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505847
282	NC_005232	CTG	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505847
283	NC_005232	GGC	2	6	23570	23575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505847
284	NC_005232	GTT	2	6	23623	23628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505847
285	NC_005232	GTT	2	6	23649	23654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505847
286	NC_005232	GCC	2	6	23687	23692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505847
287	NC_005232	TCC	2	6	23768	23773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505847
288	NC_005232	GCC	2	6	23804	23809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505847
289	NC_005232	TGG	2	6	23852	23857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_005232	ATC	2	6	23925	23930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505848
291	NC_005232	AAT	2	6	23931	23936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505848
292	NC_005232	GAC	2	6	24092	24097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505848
293	NC_005232	CCA	2	6	24233	24238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_005232	AAG	2	6	24273	24278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505849
295	NC_005232	CGC	2	6	24289	24294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505849
296	NC_005232	ATG	2	6	24305	24310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505849
297	NC_005232	GGA	2	6	24337	24342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505849
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299	NC_005232	AAG	2	6	24500	24505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_005232	ATT	2	6	24557	24562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_005232	CCA	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_005232	AAT	2	6	24733	24738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505850
303	NC_005232	GAA	2	6	24785	24790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505850
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305	NC_005232	ATT	2	6	24945	24950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505850
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309	NC_005232	CAT	2	6	25293	25298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505851
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312	NC_005232	TAT	2	6	25420	25425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505851
313	NC_005232	ACC	2	6	25448	25453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505851
314	NC_005232	CCA	2	6	25509	25514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
315	NC_005232	GAA	2	6	25718	25723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505852
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317	NC_005232	GGA	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
318	NC_005232	TGA	2	6	25870	25875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_005232	GAA	2	6	26009	26014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
322	NC_005232	CCA	2	6	26067	26072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
323	NC_005232	ACC	2	6	26102	26107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505853
324	NC_005232	ACC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505853
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334	NC_005232	TTC	2	6	27627	27632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505855
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338	NC_005232	AAG	2	6	27925	27930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
339	NC_005232	AGG	2	6	27943	27948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
340	NC_005232	GCC	2	6	28066	28071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505856
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356	NC_005232	TCG	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505856
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369	NC_005232	GTC	2	6	30991	30996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505856
370	NC_005232	GGA	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505856
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372	NC_005232	GTG	2	6	31185	31190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505856
373	NC_005232	CTA	2	6	31264	31269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505856
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375	NC_005232	TCC	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505857
376	NC_005232	CAC	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505857
377	NC_005232	CGC	2	6	31556	31561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505857
378	NC_005232	TAC	2	6	31649	31654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505858
379	NC_005232	GAA	2	6	32026	32031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
380	NC_005232	TTG	2	6	32140	32145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505859
381	NC_005232	GGC	2	6	32218	32223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505859
382	NC_005232	TTG	3	9	32247	32255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505859
383	NC_005232	CCT	2	6	32274	32279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505859
384	NC_005232	GTC	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505859
385	NC_005232	TTG	2	6	32414	32419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505859
386	NC_005232	ATT	2	6	32479	32484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505859
387	NC_005232	TGG	2	6	32521	32526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505859
388	NC_005232	AAT	2	6	32582	32587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_005232	CAA	2	6	32907	32912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505861
390	NC_005232	ACA	3	9	32978	32986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505861
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