MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	38505669
2	NC_005230	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005230	T	6	6	715	720	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
4	NC_005230	T	6	6	1168	1173	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
5	NC_005230	T	6	6	1248	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
6	NC_005230	A	6	6	1735	1740	100 %	0 %	0 %	0 %	38505671
7	NC_005230	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005230	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	38505673
9	NC_005230	G	6	6	2790	2795	0 %	0 %	100 %	0 %	38505673
10	NC_005230	T	6	6	3058	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	38505674
11	NC_005230	A	7	7	4183	4189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005230	A	7	7	4445	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
13	NC_005230	A	6	6	4489	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
14	NC_005230	G	6	6	4648	4653	0 %	0 %	100 %	0 %	38505676
15	NC_005230	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
16	NC_005230	A	7	7	5003	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
17	NC_005230	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
18	NC_005230	G	6	6	5890	5895	0 %	0 %	100 %	0 %	38505677
19	NC_005230	A	6	6	7101	7106	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
20	NC_005230	A	7	7	7277	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
21	NC_005230	A	6	6	7733	7738	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
22	NC_005230	A	6	6	7862	7867	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
23	NC_005230	T	6	6	8183	8188	0 %	100 %	0 %	0 %	38505678
24	NC_005230	T	6	6	8510	8515	0 %	100 %	0 %	0 %	38505678
25	NC_005230	A	7	7	8743	8749	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
26	NC_005230	A	6	6	9249	9254	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
27	NC_005230	A	7	7	9464	9470	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
28	NC_005230	A	7	7	10096	10102	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
29	NC_005230	A	6	6	10572	10577	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
30	NC_005230	T	6	6	10995	11000	0 %	100 %	0 %	0 %	38505679
31	NC_005230	A	6	6	11089	11094	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
32	NC_005230	T	9	9	12649	12657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005230	T	8	8	12717	12724	0 %	100 %	0 %	0 %	38505681
34	NC_005230	T	7	7	12793	12799	0 %	100 %	0 %	0 %	38505681
35	NC_005230	A	7	7	13494	13500	100 %	0 %	0 %	0 %	38505682
36	NC_005230	T	6	6	13675	13680	0 %	100 %	0 %	0 %	38505682
37	NC_005230	A	6	6	14068	14073	100 %	0 %	0 %	0 %	38505682
38	NC_005230	T	7	7	14160	14166	0 %	100 %	0 %	0 %	38505682
39	NC_005230	A	6	6	14492	14497	100 %	0 %	0 %	0 %	38505683
40	NC_005230	A	6	6	14562	14567	100 %	0 %	0 %	0 %	38505683
41	NC_005230	A	7	7	14725	14731	100 %	0 %	0 %	0 %	38505683
42	NC_005230	A	7	7	14776	14782	100 %	0 %	0 %	0 %	38505683
43	NC_005230	A	6	6	14846	14851	100 %	0 %	0 %	0 %	38505684
44	NC_005230	A	6	6	14897	14902	100 %	0 %	0 %	0 %	38505684
45	NC_005230	C	6	6	15344	15349	0 %	0 %	0 %	100 %	38505684
46	NC_005230	T	6	6	15625	15630	0 %	100 %	0 %	0 %	38505684
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48	NC_005230	T	6	6	15932	15937	0 %	100 %	0 %	0 %	38505685
49	NC_005230	G	7	7	16147	16153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005230	T	6	6	20205	20210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005230	T	7	7	20856	20862	0 %	100 %	0 %	0 %	38505691
52	NC_005230	T	6	6	22365	22370	0 %	100 %	0 %	0 %	38505692
53	NC_005230	T	6	6	22658	22663	0 %	100 %	0 %	0 %	38505692
54	NC_005230	A	6	6	22683	22688	100 %	0 %	0 %	0 %	38505692
55	NC_005230	A	6	6	22846	22851	100 %	0 %	0 %	0 %	38505692
56	NC_005230	A	6	6	23060	23065	100 %	0 %	0 %	0 %	38505692
57	NC_005230	A	6	6	23627	23632	100 %	0 %	0 %	0 %	38505692
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60	NC_005230	A	6	6	24454	24459	100 %	0 %	0 %	0 %	38505693
61	NC_005230	T	7	7	24498	24504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005230	T	7	7	24532	24538	0 %	100 %	0 %	0 %	38505694
63	NC_005230	A	6	6	24854	24859	100 %	0 %	0 %	0 %	38505694
64	NC_005230	A	6	6	26529	26534	100 %	0 %	0 %	0 %	38505696
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67	NC_005230	C	6	6	27268	27273	0 %	0 %	0 %	100 %	38505696
68	NC_005230	A	6	6	27540	27545	100 %	0 %	0 %	0 %	38505696
69	NC_005230	T	6	6	27659	27664	0 %	100 %	0 %	0 %	38505697
70	NC_005230	A	6	6	28164	28169	100 %	0 %	0 %	0 %	38505697
71	NC_005230	T	6	6	28608	28613	0 %	100 %	0 %	0 %	38505697
72	NC_005230	A	6	6	28753	28758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005230	A	7	7	28838	28844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_005230	C	6	6	35425	35430	0 %	0 %	0 %	100 %	38505705
91	NC_005230	T	7	7	35768	35774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_005230	A	7	7	49414	49420	100 %	0 %	0 %	0 %	38505727
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.