MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005230	CA	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	38505669
3	NC_005230	AT	3	6	599	604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005230	AT	3	6	1133	1138	50 %	50 %	0 %	0 %	38505670
5	NC_005230	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	38505674
6	NC_005230	TC	3	6	3890	3895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005230	AT	3	6	4419	4424	50 %	50 %	0 %	0 %	38505676
8	NC_005230	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
9	NC_005230	TG	3	6	5205	5210	0 %	50 %	50 %	0 %	38505676
10	NC_005230	GA	3	6	6034	6039	50 %	0 %	50 %	0 %	38505677
11	NC_005230	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	38505678
12	NC_005230	AG	3	6	7092	7097	50 %	0 %	50 %	0 %	38505678
13	NC_005230	AT	3	6	8946	8951	50 %	50 %	0 %	0 %	38505679
14	NC_005230	CT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005230	GA	3	6	12732	12737	50 %	0 %	50 %	0 %	38505681
16	NC_005230	TG	3	6	14535	14540	0 %	50 %	50 %	0 %	38505683
17	NC_005230	GT	3	6	15919	15924	0 %	50 %	50 %	0 %	38505685
18	NC_005230	AT	3	6	16860	16865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005230	GA	3	6	17596	17601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005230	CT	3	6	17969	17974	0 %	50 %	0 %	50 %	38505686
21	NC_005230	AT	3	6	20166	20171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005230	AT	4	8	22737	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	38505692
23	NC_005230	GA	3	6	22813	22818	50 %	0 %	50 %	0 %	38505692
24	NC_005230	AT	3	6	22911	22916	50 %	50 %	0 %	0 %	38505692
25	NC_005230	AT	3	6	23140	23145	50 %	50 %	0 %	0 %	38505692
26	NC_005230	CT	3	6	23855	23860	0 %	50 %	0 %	50 %	38505692
27	NC_005230	GA	3	6	24273	24278	50 %	0 %	50 %	0 %	38505693
28	NC_005230	AT	3	6	24437	24442	50 %	50 %	0 %	0 %	38505693
29	NC_005230	AG	3	6	29754	29759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005230	TC	4	8	30151	30158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005230	GA	3	6	32279	32284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005230	TG	3	6	33800	33805	0 %	50 %	50 %	0 %	38505705
33	NC_005230	TC	3	6	34764	34769	0 %	50 %	0 %	50 %	38505705
34	NC_005230	AT	3	6	37819	37824	50 %	50 %	0 %	0 %	38505711
35	NC_005230	GC	3	6	38371	38376	0 %	0 %	50 %	50 %	38505712
36	NC_005230	AG	3	6	39861	39866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005230	AG	3	6	40217	40222	50 %	0 %	50 %	0 %	38505713
38	NC_005230	GA	3	6	40714	40719	50 %	0 %	50 %	0 %	38505715
39	NC_005230	AG	3	6	42675	42680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005230	AG	4	8	42823	42830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005230	GA	3	6	42987	42992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005230	TA	3	6	45039	45044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005230	TA	3	6	45061	45066	50 %	50 %	0 %	0 %	38505722
44	NC_005230	CT	4	8	46015	46022	0 %	50 %	0 %	50 %	38505723
45	NC_005230	CT	3	6	46024	46029	0 %	50 %	0 %	50 %	38505723
46	NC_005230	GA	3	6	46464	46469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005230	TA	3	6	47006	47011	50 %	50 %	0 %	0 %	38505724
48	NC_005230	GC	3	6	47302	47307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005230	AG	3	6	48002	48007	50 %	0 %	50 %	0 %	38505725
50	NC_005230	TG	3	6	48770	48775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005230	AG	3	6	53622	53627	50 %	0 %	50 %	0 %	38505730
52	NC_005230	CA	3	6	58054	58059	50 %	0 %	0 %	50 %	38505733
53	NC_005230	TC	3	6	60342	60347	0 %	50 %	0 %	50 %	38505734
54	NC_005230	TC	3	6	61015	61020	0 %	50 %	0 %	50 %	38505735
55	NC_005230	AT	3	6	61818	61823	50 %	50 %	0 %	0 %	38505735
56	NC_005230	CT	3	6	63816	63821	0 %	50 %	0 %	50 %	38505736
57	NC_005230	AG	3	6	63854	63859	50 %	0 %	50 %	0 %	38505736
58	NC_005230	CA	3	6	66902	66907	50 %	0 %	0 %	50 %	38505742
59	NC_005230	AC	3	6	68020	68025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005230	CT	3	6	70442	70447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005230	TC	3	6	73139	73144	0 %	50 %	0 %	50 %	38505745
62	NC_005230	GT	3	6	75517	75522	0 %	50 %	50 %	0 %	38505748
63	NC_005230	GA	3	6	77106	77111	50 %	0 %	50 %	0 %	38505749
64	NC_005230	CT	3	6	77676	77681	0 %	50 %	0 %	50 %	38505750
65	NC_005230	GA	3	6	80236	80241	50 %	0 %	50 %	0 %	38505753
66	NC_005230	TC	3	6	80341	80346	0 %	50 %	0 %	50 %	38505753
67	NC_005230	GA	3	6	82541	82546	50 %	0 %	50 %	0 %	38505754
68	NC_005230	GA	3	6	83379	83384	50 %	0 %	50 %	0 %	38505755
69	NC_005230	GA	3	6	83822	83827	50 %	0 %	50 %	0 %	38505756
70	NC_005230	CT	3	6	87630	87635	0 %	50 %	0 %	50 %	38505758
71	NC_005230	CT	3	6	88634	88639	0 %	50 %	0 %	50 %	38505760
72	NC_005230	TA	3	6	100230	100235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005230	GA	3	6	100729	100734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005230	TA	3	6	100820	100825	50 %	50 %	0 %	0 %	38505772
75	NC_005230	AT	3	6	100859	100864	50 %	50 %	0 %	0 %	38505772
76	NC_005230	AC	3	6	101985	101990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.