MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	CTGTTT	2	12	679	690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005230	CTTGGT	2	12	2059	2070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005230	TTTCAA	2	12	5474	5485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505677
4	NC_005230	AGAATT	2	12	8812	8823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	38505679
5	NC_005230	ATTCTG	2	12	11906	11917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	38505680
6	NC_005230	CATATT	2	12	13786	13797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505682
7	NC_005230	GGAAAT	2	12	14302	14313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	38505683
8	NC_005230	CTATTA	2	12	24158	24169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505693
9	NC_005230	GTCATT	2	12	27114	27125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	38505696
10	NC_005230	CTGTCC	2	12	27869	27880	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	38505697
11	NC_005230	GACAAC	2	12	33304	33315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	38505705
12	NC_005230	GGAATT	2	12	33759	33770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505705
13	NC_005230	CGAATA	2	12	36388	36399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	38505707
14	NC_005230	CACAGA	2	12	40704	40715	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	38505715
15	NC_005230	GCGAGG	2	12	42253	42264	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	38505717
16	NC_005230	TAGGGA	2	12	42529	42540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005230	AGCATT	2	12	42566	42577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_005230	TGGCAG	2	12	43129	43140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	38505718
19	NC_005230	AAGGTC	2	12	45898	45909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505723
20	NC_005230	TGACTA	2	12	48205	48216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505725
21	NC_005230	CAAGAG	2	12	49360	49371	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	38505727
22	NC_005230	CCATTA	2	12	56701	56712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505732
23	NC_005230	TAATAC	2	12	57844	57855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	38505733
24	NC_005230	AATTTA	2	12	58116	58127	50 %	50 %	0 %	0 %	38505733
25	NC_005230	AAGGCT	2	12	58963	58974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505734
26	NC_005230	ATTTTT	2	12	59604	59615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	38505734
27	NC_005230	CCTTTA	2	12	59890	59901	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	38505734
28	NC_005230	ATGGTT	2	12	60874	60885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	38505734
29	NC_005230	GTTAGC	2	12	60926	60937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	38505735
30	NC_005230	TTAATG	2	12	66564	66575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	38505741
31	NC_005230	TCCCTA	2	12	75594	75605	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	38505748
32	NC_005230	CCCGTT	2	12	77891	77902	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	38505750
33	NC_005230	CCATCC	2	12	86124	86135	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	38505758
34	NC_005230	GTCTAA	2	12	89736	89747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505761
35	NC_005230	AGGCAT	2	12	97694	97705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505768
36	NC_005230	TGACCC	2	12	98416	98427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	38505768
37	NC_005230	GAAAAT	2	12	101056	101067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	38505772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.