MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	AAT	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005230	ATC	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005230	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005230	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505669
5	NC_005230	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505669
6	NC_005230	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
7	NC_005230	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
8	NC_005230	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505669
9	NC_005230	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505669
10	NC_005230	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505669
11	NC_005230	CCA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_005230	CTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005230	TCC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_005230	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505670
15	NC_005230	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505670
16	NC_005230	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
17	NC_005230	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
18	NC_005230	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505670
19	NC_005230	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
20	NC_005230	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
21	NC_005230	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505670
22	NC_005230	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
23	NC_005230	AAC	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005230	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505671
25	NC_005230	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505671
26	NC_005230	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505671
27	NC_005230	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505671
28	NC_005230	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505671
29	NC_005230	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505671
30	NC_005230	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505672
31	NC_005230	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505672
32	NC_005230	CAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005230	CAT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005230	TGG	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005230	AAT	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005230	AAT	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005230	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505673
38	NC_005230	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
39	NC_005230	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
40	NC_005230	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
41	NC_005230	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
42	NC_005230	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
43	NC_005230	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
44	NC_005230	TAT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005230	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505674
46	NC_005230	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
47	NC_005230	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
48	NC_005230	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505674
49	NC_005230	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
50	NC_005230	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505674
51	NC_005230	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
52	NC_005230	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505675
53	NC_005230	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
54	NC_005230	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505675
55	NC_005230	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
56	NC_005230	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505675
57	NC_005230	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505675
58	NC_005230	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005230	CCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_005230	CCA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_005230	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005230	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005230	AAC	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005230	ATC	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005230	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005230	AAT	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005230	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005230	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
69	NC_005230	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
70	NC_005230	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
71	NC_005230	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
72	NC_005230	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505676
73	NC_005230	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
74	NC_005230	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
75	NC_005230	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
76	NC_005230	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
77	NC_005230	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
78	NC_005230	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505676
79	NC_005230	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
80	NC_005230	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005230	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505677
82	NC_005230	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505677
83	NC_005230	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505677
84	NC_005230	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505677
85	NC_005230	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505677
86	NC_005230	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505677
87	NC_005230	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505677
88	NC_005230	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005230	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
90	NC_005230	TAG	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
91	NC_005230	CAG	3	9	6700	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505678
92	NC_005230	ATC	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505678
93	NC_005230	ATT	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505678
94	NC_005230	TGA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
95	NC_005230	GCG	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505678
96	NC_005230	ATT	2	6	7297	7302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505678
97	NC_005230	AGT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
98	NC_005230	GTC	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505678
99	NC_005230	AGA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505678
100	NC_005230	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
101	NC_005230	TGG	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505678
102	NC_005230	TCT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505678
103	NC_005230	AGC	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505678
104	NC_005230	AGA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505678
105	NC_005230	GTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505678
106	NC_005230	AAT	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505678
107	NC_005230	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
108	NC_005230	CCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
109	NC_005230	ACA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
110	NC_005230	CTT	2	6	8540	8545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505679
111	NC_005230	GAA	2	6	8627	8632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
112	NC_005230	GGT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505679
113	NC_005230	AAC	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
114	NC_005230	ATA	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505679
115	NC_005230	ACA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
116	NC_005230	ATC	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505679
117	NC_005230	CTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505679
118	NC_005230	ACC	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505679
119	NC_005230	ACA	2	6	9281	9286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
120	NC_005230	CTG	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505679
121	NC_005230	TTA	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505679
122	NC_005230	CAA	2	6	9595	9600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
123	NC_005230	GGA	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
124	NC_005230	GAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
125	NC_005230	AAC	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
126	NC_005230	TAA	2	6	10195	10200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505679
127	NC_005230	AGG	2	6	10210	10215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
128	NC_005230	CAA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
129	NC_005230	AGT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505679
130	NC_005230	CAA	3	9	10435	10443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
131	NC_005230	AGA	2	6	10528	10533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
132	NC_005230	TTG	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505679
133	NC_005230	GCC	2	6	10823	10828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505679
134	NC_005230	GTA	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505679
135	NC_005230	TCC	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505679
136	NC_005230	AGG	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
137	NC_005230	GAG	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
138	NC_005230	ATT	2	6	11246	11251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505679
139	NC_005230	TCC	2	6	11370	11375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505679
140	NC_005230	AAC	2	6	11379	11384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
141	NC_005230	CAA	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
142	NC_005230	ATT	2	6	11501	11506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005230	CTT	2	6	11555	11560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505680
144	NC_005230	AAG	2	6	12383	12388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505680
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149	NC_005230	GTT	2	6	12514	12519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005230	TCA	2	6	12563	12568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_005230	ATT	2	6	12569	12574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005230	CTA	2	6	12630	12635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_005230	ATT	2	6	12809	12814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505681
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262	NC_005230	CTA	2	6	18722	18727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_005230	CTA	2	6	18864	18869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_005230	TCG	2	6	18901	18906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_005230	CTA	2	6	18939	18944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_005230	TGG	2	6	18987	18992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_005230	CTA	2	6	19013	19018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_005230	TCG	2	6	19066	19071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_005230	CTA	2	6	19086	19091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505688
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395	NC_005230	AAG	2	6	29330	29335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505698
396	NC_005230	TAT	2	6	29361	29366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505699
397	NC_005230	TTG	2	6	29367	29372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505699
398	NC_005230	GGC	2	6	29382	29387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505699
399	NC_005230	GTA	2	6	29420	29425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505699
400	NC_005230	CAA	2	6	29432	29437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505699
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402	NC_005230	GCC	3	9	29551	29559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505699
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404	NC_005230	CAT	2	6	30003	30008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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407	NC_005230	TCT	2	6	30288	30293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_005230	AAC	2	6	38595	38600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505712

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