MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005230	AGG	2	6	51386	51391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_005230	TGT	2	6	51442	51447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_005230	TAAT	2	8	51470	51477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_005230	GAA	2	6	51505	51510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_005230	ATTT	2	8	51524	51531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_005230	ATC	2	6	51543	51548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505729
1007	NC_005230	TAA	2	6	51563	51568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505729
1008	NC_005230	ACC	2	6	51579	51584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505729
1009	NC_005230	CTA	2	6	51595	51600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505729
1010	NC_005230	AAG	2	6	51634	51639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505729
1011	NC_005230	TGG	2	6	51643	51648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505729
1012	NC_005230	AGA	2	6	51809	51814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505729
1013	NC_005230	ACTG	2	8	51840	51847	25 %	25 %	25 %	25 %	38505729
1014	NC_005230	T	6	6	51896	51901	0 %	100 %	0 %	0 %	38505729
1015	NC_005230	GTG	2	6	51906	51911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505729
1016	NC_005230	CTG	2	6	51915	51920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505729
1017	NC_005230	CCTA	2	8	52011	52018	25 %	25 %	0 %	50 %	38505729
1018	NC_005230	GCG	2	6	52056	52061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505729
1019	NC_005230	AGAA	2	8	52133	52140	75 %	0 %	25 %	0 %	38505729
1020	NC_005230	GTC	2	6	52171	52176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505729
1021	NC_005230	GGA	2	6	52265	52270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505729
1022	NC_005230	TTGCC	2	10	52360	52369	0 %	40 %	20 %	40 %	38505729
1023	NC_005230	AGTG	2	8	52476	52483	25 %	25 %	50 %	0 %	38505729
1024	NC_005230	GGT	2	6	52493	52498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505729
1025	NC_005230	AGCAA	2	10	52514	52523	60 %	0 %	20 %	20 %	38505729
1026	NC_005230	ACC	2	6	52531	52536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505729
1027	NC_005230	A	9	9	52579	52587	100 %	0 %	0 %	0 %	38505729
1028	NC_005230	TGA	2	6	52613	52618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505729
1029	NC_005230	CAAA	2	8	52750	52757	75 %	0 %	0 %	25 %	38505729
1030	NC_005230	AAT	2	6	52905	52910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505730
1031	NC_005230	GTGG	2	8	52977	52984	0 %	25 %	75 %	0 %	38505730
1032	NC_005230	GAC	2	6	53012	53017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505730
1033	NC_005230	ATC	2	6	53085	53090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505730
1034	NC_005230	ATA	2	6	53104	53109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505730
1035	NC_005230	TTC	2	6	53151	53156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505730
1036	NC_005230	CTG	2	6	53220	53225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505730
1037	NC_005230	AAG	2	6	53252	53257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505730
1038	NC_005230	CATT	2	8	53302	53309	25 %	50 %	0 %	25 %	38505730
1039	NC_005230	ATT	2	6	53358	53363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505730
1040	NC_005230	TAA	2	6	53412	53417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505730
1041	NC_005230	TCA	2	6	53449	53454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505730
1042	NC_005230	TCC	2	6	53502	53507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505730
1043	NC_005230	ATTG	2	8	53546	53553	25 %	50 %	25 %	0 %	38505730
1044	NC_005230	AG	3	6	53622	53627	50 %	0 %	50 %	0 %	38505730
1045	NC_005230	ATT	2	6	53635	53640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505730
1046	NC_005230	A	6	6	53644	53649	100 %	0 %	0 %	0 %	38505730
1047	NC_005230	T	6	6	53799	53804	0 %	100 %	0 %	0 %	38505730
1048	NC_005230	TCT	2	6	53818	53823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505730
1049	NC_005230	GTT	2	6	53843	53848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505730
1050	NC_005230	GATT	2	8	53915	53922	25 %	50 %	25 %	0 %	38505730
1051	NC_005230	TCA	2	6	53938	53943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505730
1052	NC_005230	TTA	2	6	54002	54007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505731
1053	NC_005230	TCG	2	6	54059	54064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505731
1054	NC_005230	CAA	2	6	54079	54084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505731
1055	NC_005230	TGA	2	6	54187	54192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505731
1056	NC_005230	ACT	2	6	54209	54214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505731
1057	NC_005230	CTC	2	6	54224	54229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505731
1058	NC_005230	TAA	2	6	54312	54317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505731
1059	NC_005230	GTCT	2	8	54344	54351	0 %	50 %	25 %	25 %	38505731
1060	NC_005230	CCT	3	9	54399	54407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505731
1061	NC_005230	AAC	2	6	54438	54443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505731
1062	NC_005230	ATC	2	6	54545	54550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505731
1063	NC_005230	GAC	2	6	54577	54582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505731
1064	NC_005230	TTG	2	6	54611	54616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505731
1065	NC_005230	CGT	2	6	54718	54723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505731
1066	NC_005230	TCT	2	6	54738	54743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505731
1067	NC_005230	ATC	2	6	54761	54766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505731
1068	NC_005230	ATC	2	6	54845	54850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505731
1069	NC_005230	CAT	3	9	54856	54864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505731
1070	NC_005230	TTGA	2	8	54920	54927	25 %	50 %	25 %	0 %	38505731
1071	NC_005230	CTG	2	6	54946	54951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505731
1072	NC_005230	TAA	2	6	54995	55000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505731
1073	NC_005230	TCT	2	6	55074	55079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505731
1074	NC_005230	AAT	2	6	55139	55144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505731
1075	NC_005230	TAAT	2	8	55231	55238	50 %	50 %	0 %	0 %	38505731
1076	NC_005230	AAT	2	6	55295	55300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505731
1077	NC_005230	TCGT	2	8	55307	55314	0 %	50 %	25 %	25 %	38505731
1078	NC_005230	ATG	2	6	55385	55390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505731
1079	NC_005230	CAT	2	6	55549	55554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505731
1080	NC_005230	CATA	2	8	55591	55598	50 %	25 %	0 %	25 %	38505731
1081	NC_005230	ATT	2	6	55622	55627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505731
1082	NC_005230	TGG	2	6	55702	55707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505731
1083	NC_005230	GTT	2	6	55865	55870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505731
1084	NC_005230	TCT	2	6	55878	55883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505731
1085	NC_005230	GTT	2	6	55917	55922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505731
1086	NC_005230	CAG	2	6	55975	55980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505731
1087	NC_005230	GAAG	2	8	56097	56104	50 %	0 %	50 %	0 %	38505731
1088	NC_005230	T	6	6	56198	56203	0 %	100 %	0 %	0 %	38505731
1089	NC_005230	TTC	2	6	56258	56263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505731
1090	NC_005230	CAA	2	6	56365	56370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505731
1091	NC_005230	TTAA	2	8	56410	56417	50 %	50 %	0 %	0 %	38505732
1092	NC_005230	ATC	2	6	56448	56453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505732
1093	NC_005230	GCCA	2	8	56561	56568	25 %	0 %	25 %	50 %	38505732
1094	NC_005230	TAA	2	6	56630	56635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505732
1095	NC_005230	CCATTA	2	12	56701	56712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505732
1096	NC_005230	AAG	2	6	56749	56754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505732
1097	NC_005230	AACT	2	8	56805	56812	50 %	25 %	0 %	25 %	38505732
1098	NC_005230	ACA	2	6	56858	56863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505732
1099	NC_005230	CGC	2	6	56871	56876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505732
1100	NC_005230	CGG	2	6	56903	56908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505732
1101	NC_005230	TGG	2	6	56929	56934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505732
1102	NC_005230	TTC	2	6	56947	56952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505732
1103	NC_005230	GGC	2	6	56957	56962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505732
1104	NC_005230	CTG	2	6	56966	56971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505732
1105	NC_005230	TTGTT	2	10	57067	57076	0 %	80 %	20 %	0 %	38505733
1106	NC_005230	TGAC	2	8	57123	57130	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
1107	NC_005230	T	7	7	57175	57181	0 %	100 %	0 %	0 %	38505733
1108	NC_005230	AAG	2	6	57203	57208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505733
1109	NC_005230	TTC	2	6	57236	57241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505733
1110	NC_005230	TAA	2	6	57252	57257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505733
1111	NC_005230	ATT	2	6	57416	57421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505733
1112	NC_005230	AAG	2	6	57595	57600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505733
1113	NC_005230	AAT	2	6	57609	57614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505733
1114	NC_005230	GATT	2	8	57625	57632	25 %	50 %	25 %	0 %	38505733
1115	NC_005230	AAT	2	6	57686	57691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505733
1116	NC_005230	ATCG	2	8	57785	57792	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
1117	NC_005230	TAATAC	2	12	57844	57855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	38505733
1118	NC_005230	GAG	2	6	57865	57870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505733
1119	NC_005230	GGTA	2	8	57874	57881	25 %	25 %	50 %	0 %	38505733
1120	NC_005230	T	6	6	57911	57916	0 %	100 %	0 %	0 %	38505733
1121	NC_005230	TAA	2	6	57926	57931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505733
1122	NC_005230	A	6	6	57937	57942	100 %	0 %	0 %	0 %	38505733
1123	NC_005230	ATC	2	6	57983	57988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505733
1124	NC_005230	CA	3	6	58054	58059	50 %	0 %	0 %	50 %	38505733
1125	NC_005230	CAT	2	6	58087	58092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505733
1126	NC_005230	AATTTA	2	12	58116	58127	50 %	50 %	0 %	0 %	38505733
1127	NC_005230	GGC	2	6	58169	58174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505733
1128	NC_005230	CGAT	2	8	58188	58195	25 %	25 %	25 %	25 %	38505733
1129	NC_005230	CCCT	2	8	58203	58210	0 %	25 %	0 %	75 %	38505733
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1357	NC_005230	GAA	2	6	71875	71880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1358	NC_005230	GGA	2	6	72017	72022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1362	NC_005230	ATA	2	6	72628	72633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1388	NC_005230	TTA	2	6	74450	74455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304569842
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