MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005230	CTATTA	2	12	24158	24169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505693
502	NC_005230	TAT	2	6	24180	24185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505693
503	NC_005230	TAA	2	6	24195	24200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505693
504	NC_005230	CAA	2	6	24223	24228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505693
505	NC_005230	GA	3	6	24273	24278	50 %	0 %	50 %	0 %	38505693
506	NC_005230	TGC	2	6	24297	24302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505693
507	NC_005230	GTC	2	6	24374	24379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505693
508	NC_005230	AT	3	6	24437	24442	50 %	50 %	0 %	0 %	38505693
509	NC_005230	ATT	2	6	24446	24451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505693
510	NC_005230	A	6	6	24454	24459	100 %	0 %	0 %	0 %	38505693
511	NC_005230	CCA	2	6	24473	24478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505693
512	NC_005230	T	7	7	24498	24504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_005230	T	7	7	24532	24538	0 %	100 %	0 %	0 %	38505694
514	NC_005230	CGA	2	6	24607	24612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505694
515	NC_005230	TTG	2	6	24768	24773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505694
516	NC_005230	CAA	2	6	24796	24801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505694
517	NC_005230	A	6	6	24854	24859	100 %	0 %	0 %	0 %	38505694
518	NC_005230	ACA	2	6	24869	24874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505694
519	NC_005230	TCA	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_005230	TGG	2	6	24976	24981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505695
521	NC_005230	AAT	2	6	25009	25014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505695
522	NC_005230	TTG	2	6	25304	25309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505695
523	NC_005230	CTTT	2	8	25355	25362	0 %	75 %	0 %	25 %	38505695
524	NC_005230	ACC	2	6	25505	25510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505695
525	NC_005230	CAAGC	2	10	25653	25662	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
526	NC_005230	CAAGC	2	10	25683	25692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
527	NC_005230	CAT	2	6	25829	25834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_005230	AAT	2	6	25872	25877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_005230	TGT	2	6	25920	25925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_005230	ATT	2	6	25929	25934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_005230	TTG	2	6	25972	25977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_005230	AGT	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_005230	CCA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_005230	TTTGT	2	10	26295	26304	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
535	NC_005230	AAC	2	6	26314	26319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_005230	ACC	2	6	26368	26373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505696
537	NC_005230	TAC	2	6	26415	26420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505696
538	NC_005230	TGG	2	6	26436	26441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505696
539	NC_005230	CCG	2	6	26522	26527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505696
540	NC_005230	A	6	6	26529	26534	100 %	0 %	0 %	0 %	38505696
541	NC_005230	C	6	6	26557	26562	0 %	0 %	0 %	100 %	38505696
542	NC_005230	CTCA	2	8	26676	26683	25 %	25 %	0 %	50 %	38505696
543	NC_005230	CAA	2	6	26731	26736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505696
544	NC_005230	A	6	6	26735	26740	100 %	0 %	0 %	0 %	38505696
545	NC_005230	CCA	2	6	26756	26761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505696
546	NC_005230	CTC	2	6	26985	26990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505696
547	NC_005230	TGG	2	6	26992	26997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505696
548	NC_005230	ATC	2	6	27033	27038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505696
549	NC_005230	CCA	2	6	27082	27087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505696
550	NC_005230	GTCATT	2	12	27114	27125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	38505696
551	NC_005230	ATT	3	9	27123	27131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505696
552	NC_005230	CCT	2	6	27227	27232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505696
553	NC_005230	C	6	6	27268	27273	0 %	0 %	0 %	100 %	38505696
554	NC_005230	CCG	2	6	27326	27331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505696
555	NC_005230	GAC	2	6	27353	27358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505696
556	NC_005230	CAA	2	6	27393	27398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505696
557	NC_005230	CGG	2	6	27425	27430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505696
558	NC_005230	GGTA	2	8	27489	27496	25 %	25 %	50 %	0 %	38505696
559	NC_005230	TAA	2	6	27511	27516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505696
560	NC_005230	A	6	6	27540	27545	100 %	0 %	0 %	0 %	38505696
561	NC_005230	ATC	2	6	27597	27602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505696
562	NC_005230	T	6	6	27659	27664	0 %	100 %	0 %	0 %	38505697
563	NC_005230	ATG	2	6	27669	27674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505697
564	NC_005230	CGC	2	6	27699	27704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505697
565	NC_005230	CACT	2	8	27741	27748	25 %	25 %	0 %	50 %	38505697
566	NC_005230	TGG	2	6	27823	27828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505697
567	NC_005230	CTGTCC	2	12	27869	27880	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	38505697
568	NC_005230	GCG	2	6	27942	27947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505697
569	NC_005230	TGG	2	6	27987	27992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505697
570	NC_005230	GGAA	2	8	28072	28079	50 %	0 %	50 %	0 %	38505697
571	NC_005230	A	6	6	28164	28169	100 %	0 %	0 %	0 %	38505697
572	NC_005230	CGC	2	6	28229	28234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505697
573	NC_005230	ACCC	2	8	28268	28275	25 %	0 %	0 %	75 %	38505697
574	NC_005230	TGG	2	6	28316	28321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505697
575	NC_005230	CTT	2	6	28504	28509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505697
576	NC_005230	GTT	2	6	28594	28599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505697
577	NC_005230	T	6	6	28608	28613	0 %	100 %	0 %	0 %	38505697
578	NC_005230	AAAG	2	8	28665	28672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_005230	A	6	6	28753	28758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_005230	ATT	2	6	28761	28766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_005230	A	7	7	28838	28844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_005230	AATT	2	8	28985	28992	50 %	50 %	0 %	0 %	38505698
583	NC_005230	TAA	2	6	29027	29032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505698
584	NC_005230	TAAG	2	8	29141	29148	50 %	25 %	25 %	0 %	38505698
585	NC_005230	GTA	2	6	29177	29182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505698
586	NC_005230	T	6	6	29192	29197	0 %	100 %	0 %	0 %	38505698
587	NC_005230	TTG	2	6	29224	29229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505698
588	NC_005230	AAG	2	6	29330	29335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505698
589	NC_005230	TAT	2	6	29361	29366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505699
590	NC_005230	TTG	2	6	29367	29372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505699
591	NC_005230	GGC	2	6	29382	29387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505699
592	NC_005230	T	7	7	29388	29394	0 %	100 %	0 %	0 %	38505699
593	NC_005230	GTA	2	6	29420	29425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505699
594	NC_005230	CAA	2	6	29432	29437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505699
595	NC_005230	CGA	2	6	29516	29521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505699
596	NC_005230	GCC	3	9	29551	29559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505699
597	NC_005230	AATG	2	8	29734	29741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_005230	AG	3	6	29754	29759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_005230	CTGCA	2	10	29882	29891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
600	NC_005230	GCC	2	6	29962	29967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_005230	CAT	2	6	30003	30008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_005230	TTC	2	6	30012	30017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_005230	G	6	6	30030	30035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
604	NC_005230	CTG	2	6	30065	30070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_005230	G	7	7	30085	30091	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
606	NC_005230	TC	4	8	30151	30158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_005230	A	6	6	30274	30279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_005230	TCT	2	6	30288	30293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_005230	AGG	2	6	30294	30299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_005230	ATG	2	6	30303	30308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_005230	AAT	2	6	30309	30314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_005230	TCG	2	6	30396	30401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505700
613	NC_005230	AGA	2	6	30429	30434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505700
614	NC_005230	ATT	2	6	30563	30568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505700
615	NC_005230	GTT	2	6	30585	30590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505700
616	NC_005230	T	6	6	30624	30629	0 %	100 %	0 %	0 %	38505700
617	NC_005230	CAAA	2	8	30641	30648	75 %	0 %	0 %	25 %	38505700
618	NC_005230	ACT	2	6	30695	30700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505701
619	NC_005230	ACAA	2	8	30807	30814	75 %	0 %	0 %	25 %	38505701
620	NC_005230	CATT	2	8	30829	30836	25 %	50 %	0 %	25 %	38505701
621	NC_005230	TCG	2	6	30919	30924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505701
622	NC_005230	CAT	2	6	30968	30973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505701
623	NC_005230	CAC	2	6	30996	31001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505701
624	NC_005230	GAC	2	6	31084	31089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505702
625	NC_005230	CAT	2	6	31156	31161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505702
626	NC_005230	GCC	2	6	31171	31176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505702
627	NC_005230	CAC	3	9	31228	31236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505702
628	NC_005230	CCAC	2	8	31288	31295	25 %	0 %	0 %	75 %	38505702
629	NC_005230	CAA	2	6	31497	31502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_005230	AGA	2	6	31571	31576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_005230	ACAAT	2	10	31599	31608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_005230	CCA	2	6	31727	31732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_005230	CGG	2	6	31745	31750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_005230	TTC	2	6	31779	31784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_005230	ACG	2	6	31806	31811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_005230	TAA	2	6	31816	31821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_005230	CAATC	2	10	31829	31838	40 %	20 %	0 %	40 %	38505703
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644	NC_005230	ATTC	2	8	32227	32234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
645	NC_005230	ATT	2	6	32272	32277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_005230	GA	3	6	32279	32284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
647	NC_005230	CGC	2	6	32318	32323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505704
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649	NC_005230	ATCT	2	8	32485	32492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
650	NC_005230	CTCC	2	8	32556	32563	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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652	NC_005230	ATG	2	6	32625	32630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_005230	G	7	7	32633	32639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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755	NC_005230	TGGC	2	8	38388	38395	0 %	25 %	50 %	25 %	38505712
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761	NC_005230	T	7	7	38902	38908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
762	NC_005230	CGC	2	6	39081	39086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
763	NC_005230	AGT	2	6	39104	39109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_005230	GGA	2	6	39413	39418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_005230	TCC	2	6	39545	39550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
767	NC_005230	CAA	2	6	39584	39589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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769	NC_005230	CCTGC	2	10	39632	39641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1000	NC_005230	AGA	2	6	51319	51324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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