MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005229	T	6	6	55	60	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005229	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	38505536
3	NC_005229	T	7	7	489	495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005229	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	38505537
5	NC_005229	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005229	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005229	T	6	6	3316	3321	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
8	NC_005229	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
9	NC_005229	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
10	NC_005229	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
11	NC_005229	C	6	6	6461	6466	0 %	0 %	0 %	100 %	38505540
12	NC_005229	C	7	7	7516	7522	0 %	0 %	0 %	100 %	38505540
13	NC_005229	A	6	6	7825	7830	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
14	NC_005229	A	6	6	7964	7969	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
15	NC_005229	T	6	6	8212	8217	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
16	NC_005229	A	7	7	9247	9253	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
17	NC_005229	T	6	6	9873	9878	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
18	NC_005229	A	6	6	10636	10641	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
19	NC_005229	T	6	6	11298	11303	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
20	NC_005229	G	6	6	12864	12869	0 %	0 %	100 %	0 %	38505540
21	NC_005229	T	6	6	13232	13237	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
22	NC_005229	T	6	6	13281	13286	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
23	NC_005229	T	6	6	14322	14327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005229	T	7	7	15133	15139	0 %	100 %	0 %	0 %	38505541
25	NC_005229	T	7	7	15153	15159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005229	T	7	7	15195	15201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005229	A	6	6	16796	16801	100 %	0 %	0 %	0 %	38505545
28	NC_005229	A	6	6	17221	17226	100 %	0 %	0 %	0 %	38505546
29	NC_005229	A	6	6	17414	17419	100 %	0 %	0 %	0 %	38505546
30	NC_005229	A	7	7	17720	17726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005229	T	7	7	17865	17871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005229	A	6	6	17979	17984	100 %	0 %	0 %	0 %	38505547
33	NC_005229	T	7	7	18016	18022	0 %	100 %	0 %	0 %	38505547
34	NC_005229	A	6	6	18056	18061	100 %	0 %	0 %	0 %	38505547
35	NC_005229	A	6	6	18405	18410	100 %	0 %	0 %	0 %	38505547
36	NC_005229	A	7	7	18809	18815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005229	T	6	6	19043	19048	0 %	100 %	0 %	0 %	38505548
38	NC_005229	T	7	7	19250	19256	0 %	100 %	0 %	0 %	38505548
39	NC_005229	A	6	6	19259	19264	100 %	0 %	0 %	0 %	38505548
40	NC_005229	T	6	6	19910	19915	0 %	100 %	0 %	0 %	38505548
41	NC_005229	A	7	7	20613	20619	100 %	0 %	0 %	0 %	38505549
42	NC_005229	T	6	6	20647	20652	0 %	100 %	0 %	0 %	38505549
43	NC_005229	A	6	6	20962	20967	100 %	0 %	0 %	0 %	38505549
44	NC_005229	T	6	6	21031	21036	0 %	100 %	0 %	0 %	38505549
45	NC_005229	A	6	6	21085	21090	100 %	0 %	0 %	0 %	38505549
46	NC_005229	T	7	7	21328	21334	0 %	100 %	0 %	0 %	38505549
47	NC_005229	T	6	6	21351	21356	0 %	100 %	0 %	0 %	38505549
48	NC_005229	T	7	7	21375	21381	0 %	100 %	0 %	0 %	38505549
49	NC_005229	T	6	6	21426	21431	0 %	100 %	0 %	0 %	38505549
50	NC_005229	T	6	6	22179	22184	0 %	100 %	0 %	0 %	38505551
51	NC_005229	C	6	6	23875	23880	0 %	0 %	0 %	100 %	38505553
52	NC_005229	A	6	6	24212	24217	100 %	0 %	0 %	0 %	38505555
53	NC_005229	A	6	6	25282	25287	100 %	0 %	0 %	0 %	38505557
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55	NC_005229	A	6	6	27216	27221	100 %	0 %	0 %	0 %	38505559
56	NC_005229	T	6	6	27763	27768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005229	T	6	6	27796	27801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005229	T	6	6	28312	28317	0 %	100 %	0 %	0 %	38505561
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60	NC_005229	T	7	7	28851	28857	0 %	100 %	0 %	0 %	38505561
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62	NC_005229	A	6	6	29503	29508	100 %	0 %	0 %	0 %	38505561
63	NC_005229	T	6	6	30172	30177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005229	T	6	6	30196	30201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005229	A	6	6	30765	30770	100 %	0 %	0 %	0 %	38505563
66	NC_005229	G	7	7	31004	31010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005229	A	6	6	31417	31422	100 %	0 %	0 %	0 %	38505564
68	NC_005229	A	8	8	31633	31640	100 %	0 %	0 %	0 %	38505564
69	NC_005229	A	6	6	31715	31720	100 %	0 %	0 %	0 %	38505564
70	NC_005229	A	7	7	32168	32174	100 %	0 %	0 %	0 %	38505565
71	NC_005229	A	6	6	33303	33308	100 %	0 %	0 %	0 %	38505567
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77	NC_005229	C	6	6	36378	36383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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98	NC_005229	A	6	6	42429	42434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005229	A	6	6	43024	43029	100 %	0 %	0 %	0 %	38505579
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111	NC_005229	C	6	6	48069	48074	0 %	0 %	0 %	100 %	38505584
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113	NC_005229	A	7	7	49282	49288	100 %	0 %	0 %	0 %	38505585
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115	NC_005229	A	6	6	50845	50850	100 %	0 %	0 %	0 %	38505587
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119	NC_005229	A	7	7	54097	54103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_005229	T	7	7	68610	68616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005229	T	6	6	69069	69074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.