MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 54151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005070	ATC	2	6	22514	22519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_005070	TG	3	6	22694	22699	0 %	50 %	50 %	0 %	33864558
503	NC_005070	AGG	2	6	22731	22736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864558
504	NC_005070	TGA	2	6	22790	22795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864558
505	NC_005070	TTCA	2	8	22814	22821	25 %	50 %	0 %	25 %	33864558
506	NC_005070	GCA	2	6	22825	22830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864558
507	NC_005070	GTGCCG	2	12	22887	22898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33864558
508	NC_005070	TGA	2	6	22905	22910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864558
509	NC_005070	A	7	7	22916	22922	100 %	0 %	0 %	0 %	33864558
510	NC_005070	TCA	2	6	22945	22950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864558
511	NC_005070	GCG	2	6	23049	23054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864558
512	NC_005070	AGC	2	6	23153	23158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864558
513	NC_005070	TCC	2	6	23319	23324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864558
514	NC_005070	CAG	2	6	23363	23368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864558
515	NC_005070	GTG	2	6	23379	23384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864558
516	NC_005070	GCT	2	6	23507	23512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864558
517	NC_005070	GCG	3	9	23594	23602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864558
518	NC_005070	TCC	2	6	23605	23610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864558
519	NC_005070	GCCG	2	8	23686	23693	0 %	0 %	50 %	50 %	33864558
520	NC_005070	CTG	2	6	23711	23716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864558
521	NC_005070	TGC	2	6	23757	23762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864558
522	NC_005070	GCA	2	6	23803	23808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864558
523	NC_005070	CCA	2	6	23818	23823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864558
524	NC_005070	CCA	2	6	23827	23832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864558
525	NC_005070	TCG	2	6	23901	23906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864558
526	NC_005070	AGGA	2	8	23946	23953	50 %	0 %	50 %	0 %	33864558
527	NC_005070	GTT	2	6	24012	24017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864558
528	NC_005070	AGG	2	6	24032	24037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864558
529	NC_005070	GCT	2	6	24048	24053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864558
530	NC_005070	GTTG	2	8	24060	24067	0 %	50 %	50 %	0 %	33864558
531	NC_005070	GTTC	3	12	24132	24143	0 %	50 %	25 %	25 %	33864558
532	NC_005070	GATC	2	8	24154	24161	25 %	25 %	25 %	25 %	33864558
533	NC_005070	AGC	2	6	24288	24293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864558
534	NC_005070	GCG	2	6	24369	24374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864558
535	NC_005070	GGC	2	6	24380	24385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864558
536	NC_005070	CGG	2	6	24410	24415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_005070	TG	3	6	24451	24456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_005070	AGC	2	6	24485	24490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_005070	GCG	2	6	24513	24518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864559
540	NC_005070	GACC	2	8	24625	24632	25 %	0 %	25 %	50 %	33864559
541	NC_005070	GCA	2	6	24646	24651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864559
542	NC_005070	AGG	2	6	24762	24767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864559
543	NC_005070	CAG	2	6	24776	24781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864559
544	NC_005070	GGT	2	6	24814	24819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864559
545	NC_005070	GCA	2	6	24841	24846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864559
546	NC_005070	AGC	2	6	24927	24932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864559
547	NC_005070	GGT	2	6	24952	24957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864559
548	NC_005070	GTT	2	6	24964	24969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864559
549	NC_005070	AG	3	6	25003	25008	50 %	0 %	50 %	0 %	33864559
550	NC_005070	CGG	2	6	25119	25124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864559
551	NC_005070	TGC	2	6	25135	25140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864559
552	NC_005070	GGA	2	6	25153	25158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864559
553	NC_005070	ACT	2	6	25172	25177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864560
554	NC_005070	CTG	2	6	25183	25188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864560
555	NC_005070	TGATGC	2	12	25200	25211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33864560
556	NC_005070	GCA	2	6	25235	25240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864560
557	NC_005070	ACC	2	6	25253	25258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864560
558	NC_005070	GGC	2	6	25414	25419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864560
559	NC_005070	CTT	2	6	25440	25445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864560
560	NC_005070	GCC	3	9	25471	25479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864560
561	NC_005070	CAG	2	6	25504	25509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864560
562	NC_005070	GATT	2	8	25536	25543	25 %	50 %	25 %	0 %	33864560
563	NC_005070	CAC	2	6	25644	25649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864560
564	NC_005070	GGA	2	6	25663	25668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864560
565	NC_005070	GCG	2	6	25680	25685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864560
566	NC_005070	GCG	2	6	25739	25744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864560
567	NC_005070	GCGT	2	8	25793	25800	0 %	25 %	50 %	25 %	33864560
568	NC_005070	CCG	2	6	25832	25837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864560
569	NC_005070	G	6	6	25894	25899	0 %	0 %	100 %	0 %	33864560
570	NC_005070	CAA	2	6	26100	26105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864560
571	NC_005070	CGAA	2	8	26193	26200	50 %	0 %	25 %	25 %	33864560
572	NC_005070	GCT	2	6	26202	26207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864560
573	NC_005070	GGA	2	6	26208	26213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864560
574	NC_005070	CAT	2	6	26224	26229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864560
575	NC_005070	AGC	2	6	26243	26248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864560
576	NC_005070	CAC	3	9	26251	26259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864560
577	NC_005070	GTT	2	6	26268	26273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864560
578	NC_005070	G	6	6	26416	26421	0 %	0 %	100 %	0 %	33864561
579	NC_005070	CCG	2	6	26479	26484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864561
580	NC_005070	TGGG	2	8	26496	26503	0 %	25 %	75 %	0 %	33864561
581	NC_005070	GTGA	2	8	26535	26542	25 %	25 %	50 %	0 %	33864562
582	NC_005070	GTG	2	6	26556	26561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864562
583	NC_005070	TC	3	6	26615	26620	0 %	50 %	0 %	50 %	33864562
584	NC_005070	GCT	2	6	26624	26629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864562
585	NC_005070	CGC	2	6	26637	26642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864562
586	NC_005070	G	6	6	26659	26664	0 %	0 %	100 %	0 %	33864562
587	NC_005070	GGT	2	6	26726	26731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864562
588	NC_005070	GCTG	2	8	26755	26762	0 %	25 %	50 %	25 %	33864562
589	NC_005070	TGG	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864562
590	NC_005070	GGA	2	6	26915	26920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864562
591	NC_005070	CGCTT	2	10	26928	26937	0 %	40 %	20 %	40 %	33864562
592	NC_005070	GATGG	2	10	26951	26960	20 %	20 %	60 %	0 %	33864562
593	NC_005070	TGG	2	6	26974	26979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864562
594	NC_005070	GCTG	2	8	27038	27045	0 %	25 %	50 %	25 %	33864562
595	NC_005070	GCC	2	6	27148	27153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864562
596	NC_005070	ACC	2	6	27156	27161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864562
597	NC_005070	GTT	2	6	27173	27178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864562
598	NC_005070	CTGC	2	8	27317	27324	0 %	25 %	25 %	50 %	33864562
599	NC_005070	CAGG	2	8	27326	27333	25 %	0 %	50 %	25 %	33864562
600	NC_005070	GCC	2	6	27412	27417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864562
601	NC_005070	GCC	2	6	27497	27502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864563
602	NC_005070	CAG	2	6	27550	27555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864563
603	NC_005070	CTG	2	6	27679	27684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864563
604	NC_005070	CTT	2	6	27697	27702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864563
605	NC_005070	GGC	2	6	27778	27783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864564
606	NC_005070	CTTCA	2	10	27802	27811	20 %	40 %	0 %	40 %	33864564
607	NC_005070	GCT	2	6	27833	27838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864564
608	NC_005070	CAG	2	6	27879	27884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864564
609	NC_005070	GCA	2	6	27890	27895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864564
610	NC_005070	CCG	2	6	27941	27946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864564
611	NC_005070	TG	3	6	28034	28039	0 %	50 %	50 %	0 %	33864564
612	NC_005070	GCGG	2	8	28126	28133	0 %	0 %	75 %	25 %	33864564
613	NC_005070	CAC	2	6	28138	28143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864564
614	NC_005070	TCG	2	6	28190	28195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864564
615	NC_005070	CCA	2	6	28217	28222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864564
616	NC_005070	CCAG	2	8	28248	28255	25 %	0 %	25 %	50 %	33864564
617	NC_005070	C	6	6	28268	28273	0 %	0 %	0 %	100 %	33864564
618	NC_005070	TCA	2	6	28287	28292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864564
619	NC_005070	CGG	2	6	28293	28298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864564
620	NC_005070	CGC	2	6	28299	28304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864564
621	NC_005070	CGG	2	6	28364	28369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864564
622	NC_005070	CCA	2	6	28404	28409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864564
623	NC_005070	GCTC	2	8	28429	28436	0 %	25 %	25 %	50 %	33864564
624	NC_005070	CGT	2	6	28476	28481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864564
625	NC_005070	GGCAG	2	10	28518	28527	20 %	0 %	60 %	20 %	33864564
626	NC_005070	CTG	2	6	28534	28539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864564
627	NC_005070	GGT	2	6	28618	28623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864564
628	NC_005070	GCTG	2	8	28742	28749	0 %	25 %	50 %	25 %	33864565
629	NC_005070	GGT	2	6	28772	28777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864565
630	NC_005070	TTC	2	6	28866	28871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864565
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689	NC_005070	CTTC	2	8	31300	31307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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756	NC_005070	CAGCCA	2	12	34237	34248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	33864570
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759	NC_005070	TGA	2	6	34390	34395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864570
760	NC_005070	GGT	2	6	34424	34429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864570
761	NC_005070	CGGC	2	8	34488	34495	0 %	0 %	50 %	50 %	33864570
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764	NC_005070	GGT	2	6	34625	34630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864571
765	NC_005070	CGG	2	6	34636	34641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864571
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768	NC_005070	CAAC	2	8	34748	34755	50 %	0 %	0 %	50 %	33864571
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773	NC_005070	GAAGG	2	10	34994	35003	40 %	0 %	60 %	0 %	33864571
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789	NC_005070	TGG	2	6	35555	35560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864572
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810	NC_005070	TGG	2	6	36353	36358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864573
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824	NC_005070	CATCGG	2	12	36976	36987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33864574
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863	NC_005070	CGG	2	6	38835	38840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864575
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865	NC_005070	GCG	2	6	38944	38949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864575
866	NC_005070	CATC	2	8	39009	39016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
867	NC_005070	TGT	2	6	39129	39134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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869	NC_005070	GCT	2	6	39187	39192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
870	NC_005070	AGTC	2	8	39207	39214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
871	NC_005070	GTTG	2	8	39215	39222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
872	NC_005070	CAG	3	9	39247	39255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
873	NC_005070	GGC	2	6	39320	39325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864576
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882	NC_005070	GCT	2	6	39581	39586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864576
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