MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-04

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005005	AT	3	6	217	222	50 %	50 %	0 %	0 %	32470556
2	NC_005005	AT	3	6	518	523	50 %	50 %	0 %	0 %	32470556
3	NC_005005	TA	3	6	1068	1073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005005	CT	3	6	1880	1885	0 %	50 %	0 %	50 %	32470557
5	NC_005005	TA	3	6	2998	3003	50 %	50 %	0 %	0 %	32470557
6	NC_005005	CT	3	6	3109	3114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005005	TA	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005005	CA	3	6	4768	4773	50 %	0 %	0 %	50 %	32470560
9	NC_005005	AT	4	8	5077	5084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005005	TA	3	6	5104	5109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005005	TA	3	6	5211	5216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005005	AT	3	6	5503	5508	50 %	50 %	0 %	0 %	32470561
13	NC_005005	TA	3	6	5658	5663	50 %	50 %	0 %	0 %	32470561
14	NC_005005	AT	3	6	5762	5767	50 %	50 %	0 %	0 %	32470561
15	NC_005005	CA	3	6	6204	6209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005005	AT	3	6	6299	6304	50 %	50 %	0 %	0 %	32470562
17	NC_005005	CA	4	8	6456	6463	50 %	0 %	0 %	50 %	32470562
18	NC_005005	TA	3	6	6621	6626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005005	TC	3	6	7219	7224	0 %	50 %	0 %	50 %	32470563
20	NC_005005	TA	3	6	7245	7250	50 %	50 %	0 %	0 %	32470563
21	NC_005005	AT	3	6	7400	7405	50 %	50 %	0 %	0 %	32470563
22	NC_005005	AT	4	8	7499	7506	50 %	50 %	0 %	0 %	32470563
23	NC_005005	TA	4	8	7634	7641	50 %	50 %	0 %	0 %	32470563
24	NC_005005	AT	3	6	7890	7895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005005	AT	3	6	8888	8893	50 %	50 %	0 %	0 %	32470564
26	NC_005005	AT	4	8	8934	8941	50 %	50 %	0 %	0 %	32470564
27	NC_005005	TC	3	6	8994	8999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005005	TA	3	6	9270	9275	50 %	50 %	0 %	0 %	32470565
29	NC_005005	AT	4	8	10490	10497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005005	AG	3	6	10510	10515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005005	CT	3	6	10544	10549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005005	TA	3	6	10809	10814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005005	TA	4	8	11127	11134	50 %	50 %	0 %	0 %	32470567
34	NC_005005	TA	3	6	11315	11320	50 %	50 %	0 %	0 %	32470567
35	NC_005005	GA	3	6	11493	11498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005005	AT	3	6	11925	11930	50 %	50 %	0 %	0 %	32470568
37	NC_005005	TA	4	8	11942	11949	50 %	50 %	0 %	0 %	32470568
38	NC_005005	AC	3	6	12242	12247	50 %	0 %	0 %	50 %	32470568
39	NC_005005	TA	3	6	12518	12523	50 %	50 %	0 %	0 %	32470568
40	NC_005005	AT	4	8	13440	13447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005005	TA	3	6	13449	13454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005005	TG	3	6	13564	13569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005005	AT	3	6	13596	13601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005005	AT	3	6	13696	13701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005005	AT	3	6	13950	13955	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
46	NC_005005	TA	3	6	14095	14100	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
47	NC_005005	AT	3	6	14494	14499	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
48	NC_005005	TA	3	6	14815	14820	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
49	NC_005005	AT	3	6	14906	14911	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
50	NC_005005	TA	3	6	15017	15022	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
51	NC_005005	GA	3	6	15192	15197	50 %	0 %	50 %	0 %	32470570
52	NC_005005	TA	3	6	15331	15336	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
53	NC_005005	AT	3	6	15353	15358	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
54	NC_005005	TA	3	6	15823	15828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005005	TA	3	6	16478	16483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005005	AC	3	6	16745	16750	50 %	0 %	0 %	50 %	32470571

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.