MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-04

Total Repeats: 525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005005	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005005	ACA	2	6	147	152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470556
3	NC_005005	ATA	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470556
4	NC_005005	A	7	7	171	177	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
5	NC_005005	CGA	2	6	184	189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470556
6	NC_005005	ATT	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470556
7	NC_005005	AT	3	6	217	222	50 %	50 %	0 %	0 %	32470556
8	NC_005005	A	6	6	270	275	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
9	NC_005005	TAA	2	6	298	303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470556
10	NC_005005	A	7	7	325	331	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
11	NC_005005	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
12	NC_005005	GTA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470556
13	NC_005005	ATC	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470556
14	NC_005005	AAG	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470556
15	NC_005005	A	7	7	443	449	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
16	NC_005005	A	7	7	453	459	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
17	NC_005005	A	7	7	495	501	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
18	NC_005005	GAA	2	6	512	517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470556
19	NC_005005	AT	3	6	518	523	50 %	50 %	0 %	0 %	32470556
20	NC_005005	ATA	2	6	531	536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470556
21	NC_005005	A	7	7	536	542	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
22	NC_005005	A	6	6	551	556	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
23	NC_005005	AAC	2	6	572	577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470556
24	NC_005005	A	6	6	688	693	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
25	NC_005005	TAT	2	6	713	718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470556
26	NC_005005	AGT	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470556
27	NC_005005	A	7	7	757	763	100 %	0 %	0 %	0 %	32470556
28	NC_005005	TAG	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470556
29	NC_005005	TAA	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470556
30	NC_005005	GAA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470556
31	NC_005005	TAG	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470556
32	NC_005005	TA	3	6	1068	1073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005005	TTA	2	6	1134	1139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005005	CTA	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
35	NC_005005	TCT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
36	NC_005005	TCT	3	9	1207	1215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
37	NC_005005	TAT	2	6	1219	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470557
38	NC_005005	TTGTT	2	10	1233	1242	0 %	80 %	20 %	0 %	32470557
39	NC_005005	ATA	2	6	1259	1264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470557
40	NC_005005	GAT	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470557
41	NC_005005	ATT	3	9	1343	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470557
42	NC_005005	CTT	3	9	1384	1392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
43	NC_005005	ATT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470557
44	NC_005005	TTTCTT	2	12	1531	1542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32470557
45	NC_005005	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470557
46	NC_005005	T	6	6	1637	1642	0 %	100 %	0 %	0 %	32470557
47	NC_005005	CAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470557
48	NC_005005	CAT	2	6	1663	1668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
49	NC_005005	TTTG	2	8	1684	1691	0 %	75 %	25 %	0 %	32470557
50	NC_005005	TCA	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
51	NC_005005	TCA	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
52	NC_005005	ATG	3	9	1775	1783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470557
53	NC_005005	GAT	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470557
54	NC_005005	T	7	7	1818	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	32470557
55	NC_005005	TGAT	2	8	1853	1860	25 %	50 %	25 %	0 %	32470557
56	NC_005005	CT	3	6	1880	1885	0 %	50 %	0 %	50 %	32470557
57	NC_005005	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
58	NC_005005	TAGT	2	8	1923	1930	25 %	50 %	25 %	0 %	32470557
59	NC_005005	TTG	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470557
60	NC_005005	TTTCT	2	10	1978	1987	0 %	80 %	0 %	20 %	32470557
61	NC_005005	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
62	NC_005005	CAAA	2	8	2158	2165	75 %	0 %	0 %	25 %	32470557
63	NC_005005	AATA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	32470557
64	NC_005005	TTCT	2	8	2243	2250	0 %	75 %	0 %	25 %	32470557
65	NC_005005	AAT	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470557
66	NC_005005	TCT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
67	NC_005005	T	7	7	2307	2313	0 %	100 %	0 %	0 %	32470557
68	NC_005005	TAA	2	6	2319	2324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470557
69	NC_005005	TTTC	2	8	2364	2371	0 %	75 %	0 %	25 %	32470557
70	NC_005005	TTC	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
71	NC_005005	T	6	6	2419	2424	0 %	100 %	0 %	0 %	32470557
72	NC_005005	TTTAAT	2	12	2493	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470557
73	NC_005005	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470557
74	NC_005005	TTA	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470557
75	NC_005005	TTTA	2	8	2576	2583	25 %	75 %	0 %	0 %	32470557
76	NC_005005	TCA	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
77	NC_005005	AGTA	2	8	2666	2673	50 %	25 %	25 %	0 %	32470557
78	NC_005005	GTT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470557
79	NC_005005	ATC	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
80	NC_005005	ATT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470557
81	NC_005005	T	6	6	2977	2982	0 %	100 %	0 %	0 %	32470557
82	NC_005005	TA	3	6	2998	3003	50 %	50 %	0 %	0 %	32470557
83	NC_005005	TCA	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470557
84	NC_005005	ACG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470557
85	NC_005005	CAA	2	6	3034	3039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470557
86	NC_005005	CCT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_005005	CT	3	6	3109	3114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_005005	T	6	6	3114	3119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005005	TTG	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005005	TTATA	2	10	3223	3232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005005	TA	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005005	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005005	CAAA	2	8	3313	3320	75 %	0 %	0 %	25 %	32470558
94	NC_005005	AAC	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470558
95	NC_005005	AAC	2	6	3360	3365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470558
96	NC_005005	A	6	6	3380	3385	100 %	0 %	0 %	0 %	32470558
97	NC_005005	AAG	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470558
98	NC_005005	TGG	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470558
99	NC_005005	AAAC	2	8	3427	3434	75 %	0 %	0 %	25 %	32470558
100	NC_005005	TGA	2	6	3460	3465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470558
101	NC_005005	GAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470558
102	NC_005005	TAA	2	6	3502	3507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470558
103	NC_005005	AAC	3	9	3524	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470558
104	NC_005005	AAC	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470558
105	NC_005005	ATTA	2	8	3563	3570	50 %	50 %	0 %	0 %	32470558
106	NC_005005	GATG	2	8	3587	3594	25 %	25 %	50 %	0 %	32470559
107	NC_005005	A	7	7	3609	3615	100 %	0 %	0 %	0 %	32470559
108	NC_005005	A	6	6	3647	3652	100 %	0 %	0 %	0 %	32470559
109	NC_005005	A	6	6	3659	3664	100 %	0 %	0 %	0 %	32470559
110	NC_005005	TAGA	2	8	3667	3674	50 %	25 %	25 %	0 %	32470559
111	NC_005005	AAAG	2	8	3675	3682	75 %	0 %	25 %	0 %	32470559
112	NC_005005	AGA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470559
113	NC_005005	AAAT	2	8	3806	3813	75 %	25 %	0 %	0 %	32470559
114	NC_005005	AAG	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470559
115	NC_005005	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005005	TAG	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005005	AAT	3	9	3893	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005005	A	6	6	3921	3926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005005	ACTT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_005005	AATT	2	8	3951	3958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005005	TTG	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005005	TTA	2	6	4039	4044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005005	TAT	2	6	4050	4055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470560
124	NC_005005	TAAA	2	8	4060	4067	75 %	25 %	0 %	0 %	32470560
125	NC_005005	CGT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470560
126	NC_005005	TTA	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470560
127	NC_005005	T	7	7	4173	4179	0 %	100 %	0 %	0 %	32470560
128	NC_005005	TCT	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470560
129	NC_005005	AATA	2	8	4239	4246	75 %	25 %	0 %	0 %	32470560
130	NC_005005	TTG	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470560
131	NC_005005	TAA	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470560
132	NC_005005	TAA	2	6	4300	4305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470560
133	NC_005005	TTC	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470560
134	NC_005005	TCA	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470560
135	NC_005005	TAG	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470560
136	NC_005005	CATA	2	8	4468	4475	50 %	25 %	0 %	25 %	32470560
137	NC_005005	TTA	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470560
138	NC_005005	TAAAT	2	10	4703	4712	60 %	40 %	0 %	0 %	32470560
139	NC_005005	TTA	2	6	4714	4719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470560
140	NC_005005	T	7	7	4724	4730	0 %	100 %	0 %	0 %	32470560
141	NC_005005	T	6	6	4741	4746	0 %	100 %	0 %	0 %	32470560
142	NC_005005	CA	3	6	4768	4773	50 %	0 %	0 %	50 %	32470560
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277	NC_005005	ATAA	2	8	8952	8959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_005005	AAT	2	6	9028	9033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_005005	TTA	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470565
282	NC_005005	ATC	2	6	9103	9108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470565
283	NC_005005	CTT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470565
284	NC_005005	ACA	2	6	9200	9205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470565
285	NC_005005	GAT	2	6	9207	9212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470565
286	NC_005005	ATA	2	6	9252	9257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470565
287	NC_005005	GTC	2	6	9261	9266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470565
288	NC_005005	TA	3	6	9270	9275	50 %	50 %	0 %	0 %	32470565
289	NC_005005	TTTC	2	8	9329	9336	0 %	75 %	0 %	25 %	32470565
290	NC_005005	TAA	2	6	9391	9396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470565
291	NC_005005	TTCA	2	8	9412	9419	25 %	50 %	0 %	25 %	32470565
292	NC_005005	ATC	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470565
293	NC_005005	CTT	2	6	9450	9455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470565
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296	NC_005005	T	6	6	9618	9623	0 %	100 %	0 %	0 %	32470565
297	NC_005005	TGA	2	6	9676	9681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470565
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299	NC_005005	CAA	2	6	9764	9769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_005005	TTG	2	6	9853	9858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470566
301	NC_005005	TTTA	2	8	9941	9948	25 %	75 %	0 %	0 %	32470566
302	NC_005005	GAA	2	6	10005	10010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470566
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312	NC_005005	CT	3	6	10544	10549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
313	NC_005005	TATAT	2	10	10553	10562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_005005	T	7	7	10576	10582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_005005	AAC	2	6	10585	10590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
316	NC_005005	TTA	2	6	10633	10638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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318	NC_005005	ATT	2	6	10686	10691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_005005	TAT	2	6	10752	10757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_005005	A	6	6	13456	13461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_005005	TAT	2	6	13712	13717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_005005	A	6	6	13942	13947	100 %	0 %	0 %	0 %	32470570
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415	NC_005005	AAAG	2	8	14052	14059	75 %	0 %	25 %	0 %	32470570
416	NC_005005	TAA	2	6	14064	14069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470570
417	NC_005005	TA	3	6	14095	14100	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
418	NC_005005	A	6	6	14100	14105	100 %	0 %	0 %	0 %	32470570
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