MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004851	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004851	T	7	7	1076	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004851	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
4	NC_004851	T	7	7	1309	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	31983559
5	NC_004851	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
6	NC_004851	A	7	7	1535	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
7	NC_004851	T	7	7	1808	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	31983559
8	NC_004851	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
9	NC_004851	A	6	6	2168	2173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004851	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004851	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004851	T	6	6	2301	2306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004851	T	6	6	2320	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004851	T	6	6	2393	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	31983594
15	NC_004851	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	31983594
16	NC_004851	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
17	NC_004851	A	7	7	3507	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	31983555
18	NC_004851	T	6	6	3585	3590	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
19	NC_004851	T	6	6	3774	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
20	NC_004851	T	7	7	3815	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
21	NC_004851	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
22	NC_004851	A	6	6	4196	4201	100 %	0 %	0 %	0 %	31983555
23	NC_004851	A	8	8	4353	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	31983555
24	NC_004851	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004851	G	6	6	5563	5568	0 %	0 %	100 %	0 %	56403996
26	NC_004851	T	7	7	6102	6108	0 %	100 %	0 %	0 %	31983633
27	NC_004851	T	8	8	7005	7012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004851	A	6	6	7439	7444	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
29	NC_004851	T	7	7	7476	7482	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
30	NC_004851	T	6	6	7664	7669	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
31	NC_004851	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
32	NC_004851	G	6	6	7787	7792	0 %	0 %	100 %	0 %	56403997
33	NC_004851	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
34	NC_004851	A	7	7	8500	8506	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
35	NC_004851	T	8	8	8699	8706	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
36	NC_004851	A	8	8	8715	8722	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
37	NC_004851	T	6	6	8796	8801	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
38	NC_004851	T	6	6	8813	8818	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
39	NC_004851	T	6	6	9098	9103	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
40	NC_004851	T	6	6	10282	10287	0 %	100 %	0 %	0 %	31983551
41	NC_004851	A	6	6	11431	11436	100 %	0 %	0 %	0 %	31983672
42	NC_004851	T	7	7	11813	11819	0 %	100 %	0 %	0 %	31983672
43	NC_004851	T	6	6	11849	11854	0 %	100 %	0 %	0 %	31983672
44	NC_004851	A	6	6	12592	12597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004851	T	6	6	12700	12705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004851	T	6	6	13392	13397	0 %	100 %	0 %	0 %	56403999
47	NC_004851	A	7	7	13835	13841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004851	T	6	6	14408	14413	0 %	100 %	0 %	0 %	31983625
49	NC_004851	A	6	6	15448	15453	100 %	0 %	0 %	0 %	31983714
50	NC_004851	A	6	6	17760	17765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004851	A	6	6	18455	18460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004851	T	7	7	18814	18820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004851	T	9	9	18869	18877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55	NC_004851	A	6	6	19738	19743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004851	T	6	6	20527	20532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004851	A	8	8	20879	20886	100 %	0 %	0 %	0 %	56404000
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59	NC_004851	A	6	6	22473	22478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004851	A	6	6	22539	22544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004851	T	6	6	24292	24297	0 %	100 %	0 %	0 %	56404001
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64	NC_004851	A	6	6	24871	24876	100 %	0 %	0 %	0 %	56404001
65	NC_004851	A	6	6	25342	25347	100 %	0 %	0 %	0 %	56404002
66	NC_004851	C	8	8	25392	25399	0 %	0 %	0 %	100 %	56404002
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69	NC_004851	T	6	6	27061	27066	0 %	100 %	0 %	0 %	31983549
70	NC_004851	T	8	8	29209	29216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004851	T	6	6	29752	29757	0 %	100 %	0 %	0 %	56404004
72	NC_004851	C	6	6	30739	30744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_004851	G	6	6	31316	31321	0 %	0 %	100 %	0 %	31983773
74	NC_004851	T	6	6	32970	32975	0 %	100 %	0 %	0 %	31983629
75	NC_004851	A	6	6	34196	34201	100 %	0 %	0 %	0 %	31983673
76	NC_004851	A	7	7	34677	34683	100 %	0 %	0 %	0 %	31983673
77	NC_004851	T	6	6	34884	34889	0 %	100 %	0 %	0 %	31983673
78	NC_004851	A	6	6	35196	35201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_004851	T	6	6	37375	37380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004851	A	6	6	38157	38162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004851	T	7	7	38169	38175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004851	A	6	6	38207	38212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004851	A	6	6	38369	38374	100 %	0 %	0 %	0 %	157042767
89	NC_004851	A	6	6	38956	38961	100 %	0 %	0 %	0 %	56404007
90	NC_004851	G	6	6	39632	39637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004851	C	6	6	41001	41006	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_004851	A	6	6	41493	41498	100 %	0 %	0 %	0 %	31983584
93	NC_004851	C	6	6	41755	41760	0 %	0 %	0 %	100 %	31983584
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95	NC_004851	T	7	7	44458	44464	0 %	100 %	0 %	0 %	31983622
96	NC_004851	A	6	6	46328	46333	100 %	0 %	0 %	0 %	31983674
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99	NC_004851	A	6	6	47328	47333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004851	T	6	6	47774	47779	0 %	100 %	0 %	0 %	31983556
101	NC_004851	A	6	6	47783	47788	100 %	0 %	0 %	0 %	31983556
102	NC_004851	T	7	7	48090	48096	0 %	100 %	0 %	0 %	31983556
103	NC_004851	A	6	6	48471	48476	100 %	0 %	0 %	0 %	31983556
104	NC_004851	A	8	8	48628	48635	100 %	0 %	0 %	0 %	31983556
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106	NC_004851	T	7	7	49091	49097	0 %	100 %	0 %	0 %	31983556
107	NC_004851	A	6	6	49483	49488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_004851	A	6	6	50585	50590	100 %	0 %	0 %	0 %	31983630
110	NC_004851	A	6	6	51598	51603	100 %	0 %	0 %	0 %	31983728
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112	NC_004851	T	6	6	53698	53703	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
113	NC_004851	T	6	6	55006	55011	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
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115	NC_004851	T	6	6	55253	55258	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
116	NC_004851	C	6	6	55632	55637	0 %	0 %	0 %	100 %	31983545
117	NC_004851	T	6	6	55758	55763	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
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119	NC_004851	G	6	6	56029	56034	0 %	0 %	100 %	0 %	31983545
120	NC_004851	C	9	9	56225	56233	0 %	0 %	0 %	100 %	31983545
121	NC_004851	T	6	6	56934	56939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004851	A	8	8	56985	56992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_004851	G	6	6	57034	57039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004851	A	6	6	57675	57680	100 %	0 %	0 %	0 %	31983675
126	NC_004851	A	7	7	58156	58162	100 %	0 %	0 %	0 %	31983675
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128	NC_004851	A	6	6	58675	58680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_004851	A	6	6	60734	60739	100 %	0 %	0 %	0 %	31983620
131	NC_004851	A	6	6	60865	60870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_004851	T	7	7	61899	61905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004851	A	7	7	62049	62055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004851	T	6	6	64039	64044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004851	T	7	7	64271	64277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004851	T	7	7	64362	64368	0 %	100 %	0 %	0 %	31983583
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140	NC_004851	T	6	6	67683	67688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004851	A	7	7	68219	68225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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