MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004851	TTG	2	6	194374	194379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983528
4002	NC_004851	GGT	2	6	194450	194455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983528
4003	NC_004851	A	6	6	194484	194489	100 %	0 %	0 %	0 %	31983528
4004	NC_004851	ATG	2	6	194628	194633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004851	A	6	6	194665	194670	100 %	0 %	0 %	0 %	31983572
4006	NC_004851	TTCA	2	8	194778	194785	25 %	50 %	0 %	25 %	31983572
4007	NC_004851	TGGG	2	8	194815	194822	0 %	25 %	75 %	0 %	31983572
4008	NC_004851	TCG	2	6	194841	194846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983572
4009	NC_004851	CGA	2	6	194852	194857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983572
4010	NC_004851	AAT	2	6	194904	194909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983572
4011	NC_004851	TGA	2	6	194948	194953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983572
4012	NC_004851	A	6	6	195119	195124	100 %	0 %	0 %	0 %	31983572
4013	NC_004851	GCC	2	6	195127	195132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983572
4014	NC_004851	TCA	2	6	195138	195143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983572
4015	NC_004851	TGAT	2	8	195158	195165	25 %	50 %	25 %	0 %	31983572
4016	NC_004851	G	6	6	195196	195201	0 %	0 %	100 %	0 %	31983572
4017	NC_004851	GGA	2	6	195216	195221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983572
4018	NC_004851	TCAG	2	8	195240	195247	25 %	25 %	25 %	25 %	31983572
4019	NC_004851	T	7	7	195318	195324	0 %	100 %	0 %	0 %	31983572
4020	NC_004851	ATT	2	6	195349	195354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983572
4021	NC_004851	TGA	2	6	195362	195367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983572
4022	NC_004851	TCAG	2	8	195371	195378	25 %	25 %	25 %	25 %	31983572
4023	NC_004851	ATG	2	6	195407	195412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983572
4024	NC_004851	A	8	8	195413	195420	100 %	0 %	0 %	0 %	31983572
4025	NC_004851	CCA	2	6	195445	195450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983572
4026	NC_004851	ATGC	2	8	195455	195462	25 %	25 %	25 %	25 %	31983572
4027	NC_004851	TGG	2	6	195521	195526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983572
4028	NC_004851	GTT	2	6	195634	195639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_004851	GT	3	6	195676	195681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004851	GGA	2	6	195696	195701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_004851	ATTTA	2	10	195724	195733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_004851	T	6	6	195826	195831	0 %	100 %	0 %	0 %	31983619
4033	NC_004851	TGA	2	6	195857	195862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983619
4034	NC_004851	TGCC	2	8	195886	195893	0 %	25 %	25 %	50 %	31983619
4035	NC_004851	CAGC	2	8	195967	195974	25 %	0 %	25 %	50 %	31983619
4036	NC_004851	ACG	2	6	196036	196041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
4037	NC_004851	CAG	2	6	196063	196068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
4038	NC_004851	TGA	2	6	196071	196076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983619
4039	NC_004851	GCC	2	6	196099	196104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983619
4040	NC_004851	ATA	2	6	196150	196155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983619
4041	NC_004851	ACC	2	6	196178	196183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983619
4042	NC_004851	CTTCAT	2	12	196245	196256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	31983619
4043	NC_004851	TGC	2	6	196303	196308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983619
4044	NC_004851	CA	3	6	196364	196369	50 %	0 %	0 %	50 %	31983619
4045	NC_004851	GCG	2	6	196390	196395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983619
4046	NC_004851	CAG	2	6	196447	196452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
4047	NC_004851	GCA	2	6	196636	196641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
4048	NC_004851	T	7	7	196723	196729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_004851	AGC	2	6	196731	196736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_004851	TGA	2	6	196741	196746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_004851	GAC	2	6	196793	196798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_004851	TTA	2	6	196858	196863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_004851	CAGAC	2	10	196962	196971	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4054	NC_004851	GTG	2	6	197025	197030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_004851	TG	3	6	197179	197184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_004851	CAG	2	6	197247	197252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_004851	GGTTCG	2	12	197276	197287	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4058	NC_004851	GAT	2	6	197367	197372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_004851	GCC	2	6	197399	197404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_004851	TCA	2	6	197464	197469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_004851	TCTG	2	8	197478	197485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_004851	TAA	2	6	197509	197514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_004851	TTG	2	6	197562	197567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_004851	T	7	7	197627	197633	0 %	100 %	0 %	0 %	31983693
4065	NC_004851	AT	3	6	197635	197640	50 %	50 %	0 %	0 %	31983693
4066	NC_004851	CAGC	2	8	197701	197708	25 %	0 %	25 %	50 %	31983693
4067	NC_004851	GGC	2	6	197741	197746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983693
4068	NC_004851	AGGA	2	8	197774	197781	50 %	0 %	50 %	0 %	31983693
4069	NC_004851	ATT	2	6	197883	197888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983693
4070	NC_004851	AGGA	2	8	197915	197922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_004851	GTG	2	6	197968	197973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983762
4072	NC_004851	GCA	2	6	197997	198002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983762
4073	NC_004851	ATC	2	6	198008	198013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983762
4074	NC_004851	GCA	2	6	198024	198029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983762
4075	NC_004851	CGT	2	6	198037	198042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983762
4076	NC_004851	GGA	2	6	198078	198083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983762
4077	NC_004851	GAT	2	6	198097	198102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983762
4078	NC_004851	TGA	2	6	198106	198111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983762
4079	NC_004851	GCC	2	6	198141	198146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983571
4080	NC_004851	TTA	2	6	198169	198174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983571
4081	NC_004851	AAT	2	6	198180	198185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983571
4082	NC_004851	GT	4	8	198277	198284	0 %	50 %	50 %	0 %	31983571
4083	NC_004851	GCA	2	6	198289	198294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983571
4084	NC_004851	CGT	2	6	198296	198301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983571
4085	NC_004851	T	6	6	198368	198373	0 %	100 %	0 %	0 %	31983571
4086	NC_004851	AT	3	6	198381	198386	50 %	50 %	0 %	0 %	31983571
4087	NC_004851	TC	3	6	198607	198612	0 %	50 %	0 %	50 %	31983570
4088	NC_004851	GGT	2	6	198731	198736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983570
4089	NC_004851	ATT	2	6	198741	198746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983570
4090	NC_004851	CCT	2	6	198749	198754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_004851	ATG	2	6	198824	198829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983763
4092	NC_004851	ATT	2	6	198867	198872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983763
4093	NC_004851	GCA	2	6	198903	198908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983763
4094	NC_004851	GGCC	2	8	198922	198929	0 %	0 %	50 %	50 %	31983763
4095	NC_004851	AAC	2	6	198939	198944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983763
4096	NC_004851	GACCT	2	10	199064	199073	20 %	20 %	20 %	40 %	31983763
4097	NC_004851	ATG	2	6	199097	199102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983763
4098	NC_004851	G	7	7	199112	199118	0 %	0 %	100 %	0 %	31983763
4099	NC_004851	GACG	2	8	199194	199201	25 %	0 %	50 %	25 %	31983763
4100	NC_004851	AC	3	6	199284	199289	50 %	0 %	0 %	50 %	31983764
4101	NC_004851	GGT	2	6	199296	199301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983764
4102	NC_004851	GGC	2	6	199584	199589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983764
4103	NC_004851	AAC	2	6	199703	199708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983764
4104	NC_004851	CGCA	2	8	199720	199727	25 %	0 %	25 %	50 %	31983764
4105	NC_004851	GCA	2	6	199764	199769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4106	NC_004851	CTG	2	6	199831	199836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4107	NC_004851	GCC	2	6	199857	199862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983764
4108	NC_004851	AGC	2	6	199919	199924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4109	NC_004851	CAT	2	6	200010	200015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983764
4110	NC_004851	CCGT	2	8	200103	200110	0 %	25 %	25 %	50 %	31983764
4111	NC_004851	ATG	2	6	200176	200181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983764
4112	NC_004851	GCT	2	6	200215	200220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4113	NC_004851	TCGC	2	8	200226	200233	0 %	25 %	25 %	50 %	31983764
4114	NC_004851	CGT	2	6	200284	200289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4115	NC_004851	GGAA	2	8	200298	200305	50 %	0 %	50 %	0 %	31983764
4116	NC_004851	TCG	2	6	200333	200338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4117	NC_004851	CTG	2	6	200377	200382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983764
4118	NC_004851	G	6	6	200499	200504	0 %	0 %	100 %	0 %	31983764
4119	NC_004851	CCA	2	6	200519	200524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983764
4120	NC_004851	TCA	2	6	200525	200530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983764
4121	NC_004851	AG	3	6	200591	200596	50 %	0 %	50 %	0 %	31983654
4122	NC_004851	CTGG	2	8	200717	200724	0 %	25 %	50 %	25 %	31983654
4123	NC_004851	GGT	2	6	200879	200884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983654
4124	NC_004851	TTC	2	6	200891	200896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983654
4125	NC_004851	CAG	2	6	200903	200908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983654
4126	NC_004851	CCGG	2	8	200921	200928	0 %	0 %	50 %	50 %	31983654
4127	NC_004851	A	6	6	200929	200934	100 %	0 %	0 %	0 %	31983654
4128	NC_004851	CGG	2	6	200996	201001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983654
4129	NC_004851	GTT	2	6	201045	201050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983654
4130	NC_004851	CCTG	2	8	201077	201084	0 %	25 %	25 %	50 %	31983654
4131	NC_004851	CA	3	6	201182	201187	50 %	0 %	0 %	50 %	31983654
4132	NC_004851	CCT	2	6	201298	201303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983654
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4136	NC_004851	CTG	2	6	201465	201470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983654
4137	NC_004851	TGC	2	6	201488	201493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983654
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4139	NC_004851	CTG	2	6	201594	201599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983654
4140	NC_004851	CGT	2	6	201610	201615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983654
4141	NC_004851	TTC	2	6	201634	201639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983654
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4151	NC_004851	GCA	2	6	201962	201967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983654
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4243	NC_004851	TAA	2	6	207109	207114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983690
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4245	NC_004851	T	7	7	207227	207233	0 %	100 %	0 %	0 %	31983688
4246	NC_004851	AT	3	6	207235	207240	50 %	50 %	0 %	0 %	31983688
4247	NC_004851	GGC	2	6	207341	207346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983688
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4250	NC_004851	GAAT	2	8	207604	207611	50 %	25 %	25 %	0 %	31983766
4251	NC_004851	CCGGG	2	10	207629	207638	0 %	0 %	60 %	40 %	31983766
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4370	NC_004851	CATA	2	8	212858	212865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4371	NC_004851	CAA	2	6	212945	212950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4372	NC_004851	AAG	2	6	212976	212981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983767
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4374	NC_004851	A	6	6	213115	213120	100 %	0 %	0 %	0 %	31983767
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4500	NC_004851	A	6	6	219497	219502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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