MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004851	GCAGAA	2	12	144270	144281	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	31983746
3002	NC_004851	TTA	2	6	144287	144292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983746
3003	NC_004851	GAT	2	6	144309	144314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983746
3004	NC_004851	CCA	2	6	144385	144390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983747
3005	NC_004851	GTT	2	6	144400	144405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983747
3006	NC_004851	GC	3	6	144461	144466	0 %	0 %	50 %	50 %	31983747
3007	NC_004851	TA	3	6	144473	144478	50 %	50 %	0 %	0 %	31983747
3008	NC_004851	A	6	6	144525	144530	100 %	0 %	0 %	0 %	31983747
3009	NC_004851	GAA	2	6	144536	144541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983747
3010	NC_004851	ATC	2	6	144566	144571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_004851	ATTG	2	8	144605	144612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_004851	T	6	6	144633	144638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_004851	GCC	2	6	144686	144691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_004851	GCT	2	6	144709	144714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_004851	CAT	2	6	144719	144724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_004851	CTG	2	6	144818	144823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983706
3017	NC_004851	CGC	2	6	144903	144908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983706
3018	NC_004851	TCG	2	6	144985	144990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983706
3019	NC_004851	TCA	2	6	144995	145000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983706
3020	NC_004851	TCT	2	6	145009	145014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983706
3021	NC_004851	TGT	2	6	145031	145036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983706
3022	NC_004851	GGC	2	6	145076	145081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983706
3023	NC_004851	GCT	2	6	145094	145099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983706
3024	NC_004851	CCAG	2	8	145103	145110	25 %	0 %	25 %	50 %	31983706
3025	NC_004851	CTG	2	6	145128	145133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983706
3026	NC_004851	TCA	2	6	145296	145301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983639
3027	NC_004851	AGA	2	6	145315	145320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983639
3028	NC_004851	T	6	6	145325	145330	0 %	100 %	0 %	0 %	31983639
3029	NC_004851	CTT	3	9	145417	145425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983639
3030	NC_004851	A	7	7	145430	145436	100 %	0 %	0 %	0 %	31983639
3031	NC_004851	GGA	2	6	145465	145470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983639
3032	NC_004851	CTT	2	6	145476	145481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983639
3033	NC_004851	GCC	2	6	145602	145607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_004851	CTTA	2	8	145646	145653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_004851	TAA	2	6	145654	145659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_004851	TTCAT	2	10	145736	145745	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3037	NC_004851	TCAA	2	8	145766	145773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_004851	CGC	2	6	145963	145968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_004851	GCAG	2	8	145987	145994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_004851	CCA	2	6	146019	146024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_004851	CAT	2	6	146034	146039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_004851	CAT	2	6	146056	146061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_004851	TCGT	2	8	146075	146082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_004851	CAC	3	9	146134	146142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_004851	GCA	3	9	146154	146162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_004851	GCCTGC	2	12	146177	146188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_004851	TGC	2	6	146223	146228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_004851	CA	3	6	146272	146277	50 %	0 %	0 %	50 %	56404022
3049	NC_004851	CAG	2	6	146334	146339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56404022
3050	NC_004851	ATG	2	6	146441	146446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404022
3051	NC_004851	CAG	2	6	146534	146539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_004851	TCA	2	6	146581	146586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_004851	CAG	2	6	146736	146741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983748
3054	NC_004851	CAGG	2	8	146753	146760	25 %	0 %	50 %	25 %	31983748
3055	NC_004851	CA	3	6	146869	146874	50 %	0 %	0 %	50 %	31983748
3056	NC_004851	GT	3	6	146964	146969	0 %	50 %	50 %	0 %	31983651
3057	NC_004851	CCG	2	6	146980	146985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983651
3058	NC_004851	TGA	2	6	147042	147047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983651
3059	NC_004851	AAC	2	6	147186	147191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983651
3060	NC_004851	TGA	2	6	147222	147227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983651
3061	NC_004851	TCTT	2	8	147252	147259	0 %	75 %	0 %	25 %	31983651
3062	NC_004851	ATG	3	9	147299	147307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983651
3063	NC_004851	CAG	2	6	147398	147403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983651
3064	NC_004851	ATT	2	6	147408	147413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983651
3065	NC_004851	T	6	6	147412	147417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004851	GCG	2	6	147481	147486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_004851	GGT	2	6	147535	147540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56404023
3068	NC_004851	GAA	2	6	147870	147875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_004851	T	7	7	147878	147884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_004851	AATAT	2	10	147899	147908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_004851	ATG	2	6	147929	147934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404024
3072	NC_004851	GAC	2	6	147948	147953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56404024
3073	NC_004851	TTA	2	6	148031	148036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404024
3074	NC_004851	TGA	2	6	148075	148080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404024
3075	NC_004851	C	6	6	148099	148104	0 %	0 %	0 %	100 %	56404024
3076	NC_004851	TAA	2	6	148173	148178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404024
3077	NC_004851	GTT	2	6	148182	148187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404024
3078	NC_004851	AT	3	6	148237	148242	50 %	50 %	0 %	0 %	56404024
3079	NC_004851	TTG	2	6	148366	148371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404024
3080	NC_004851	ATT	2	6	148388	148393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404024
3081	NC_004851	T	6	6	148429	148434	0 %	100 %	0 %	0 %	56404024
3082	NC_004851	ATTA	2	8	148465	148472	50 %	50 %	0 %	0 %	56404024
3083	NC_004851	AATT	2	8	148480	148487	50 %	50 %	0 %	0 %	56404024
3084	NC_004851	TTG	2	6	148505	148510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404024
3085	NC_004851	AT	3	6	148513	148518	50 %	50 %	0 %	0 %	56404024
3086	NC_004851	ATC	2	6	148606	148611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404024
3087	NC_004851	TAT	2	6	148618	148623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404024
3088	NC_004851	G	7	7	148738	148744	0 %	0 %	100 %	0 %	56404024
3089	NC_004851	TTA	2	6	148760	148765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404024
3090	NC_004851	TGA	2	6	148774	148779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404024
3091	NC_004851	A	6	6	148815	148820	100 %	0 %	0 %	0 %	56404024
3092	NC_004851	T	8	8	148936	148943	0 %	100 %	0 %	0 %	56404024
3093	NC_004851	AT	3	6	148978	148983	50 %	50 %	0 %	0 %	56404024
3094	NC_004851	TTA	2	6	148992	148997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404024
3095	NC_004851	ACTT	2	8	149035	149042	25 %	50 %	0 %	25 %	56404024
3096	NC_004851	ATG	2	6	149070	149075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404024
3097	NC_004851	TTTC	2	8	149081	149088	0 %	75 %	0 %	25 %	56404024
3098	NC_004851	GTTA	2	8	149092	149099	25 %	50 %	25 %	0 %	56404024
3099	NC_004851	AT	4	8	149151	149158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_004851	ATA	2	6	149180	149185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_004851	TTC	2	6	149199	149204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_004851	AGAA	2	8	149387	149394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_004851	ATT	2	6	149433	149438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_004851	TAT	2	6	149443	149448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_004851	T	7	7	149471	149477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_004851	AT	3	6	149515	149520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_004851	AT	3	6	149569	149574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_004851	ATA	2	6	149632	149637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_004851	T	7	7	149662	149668	0 %	100 %	0 %	0 %	31983529
3110	NC_004851	G	8	8	149691	149698	0 %	0 %	100 %	0 %	31983529
3111	NC_004851	A	6	6	149723	149728	100 %	0 %	0 %	0 %	31983529
3112	NC_004851	TGT	2	6	149754	149759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983529
3113	NC_004851	G	6	6	149779	149784	0 %	0 %	100 %	0 %	31983529
3114	NC_004851	CTC	2	6	149801	149806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983529
3115	NC_004851	ATT	2	6	149853	149858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983529
3116	NC_004851	ATGGA	2	10	149900	149909	40 %	20 %	40 %	0 %	31983529
3117	NC_004851	TA	3	6	149917	149922	50 %	50 %	0 %	0 %	31983529
3118	NC_004851	CTT	2	6	149924	149929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983529
3119	NC_004851	TGG	2	6	149997	150002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983529
3120	NC_004851	ATA	2	6	150011	150016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983529
3121	NC_004851	ATG	2	6	150017	150022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983529
3122	NC_004851	TGG	2	6	150042	150047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983529
3123	NC_004851	AATC	2	8	150078	150085	50 %	25 %	0 %	25 %	31983529
3124	NC_004851	TGG	2	6	150099	150104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983529
3125	NC_004851	GCG	2	6	150107	150112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983529
3126	NC_004851	TGG	2	6	150138	150143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983529
3127	NC_004851	TAA	2	6	150173	150178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983529
3128	NC_004851	ATT	2	6	150187	150192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983529
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