MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004851	CTT	2	6	100909	100914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983628
2002	NC_004851	AGCGA	2	10	100922	100931	40 %	0 %	40 %	20 %	31983628
2003	NC_004851	CCG	2	6	100971	100976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983628
2004	NC_004851	ATC	3	9	101077	101085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983628
2005	NC_004851	GCGT	2	8	101136	101143	0 %	25 %	50 %	25 %	31983628
2006	NC_004851	ATG	2	6	101177	101182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983628
2007	NC_004851	GCG	2	6	101233	101238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983628
2008	NC_004851	GCTG	2	8	101315	101322	0 %	25 %	50 %	25 %	31983628
2009	NC_004851	CAA	2	6	101325	101330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983628
2010	NC_004851	CAG	2	6	101332	101337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983628
2011	NC_004851	TGT	2	6	101348	101353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983628
2012	NC_004851	GTTT	2	8	101379	101386	0 %	75 %	25 %	0 %	31983628
2013	NC_004851	TCG	2	6	101387	101392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983628
2014	NC_004851	CCTGA	2	10	101603	101612	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2015	NC_004851	CCA	2	6	101637	101642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_004851	C	6	6	101658	101663	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2017	NC_004851	GAC	2	6	101672	101677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_004851	CTGG	2	8	101701	101708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_004851	T	6	6	101793	101798	0 %	100 %	0 %	0 %	31983607
2020	NC_004851	CTG	2	6	101823	101828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983607
2021	NC_004851	CAGC	2	8	101898	101905	25 %	0 %	25 %	50 %	31983607
2022	NC_004851	ACCTT	2	10	102016	102025	20 %	40 %	0 %	40 %	31983607
2023	NC_004851	GA	3	6	102059	102064	50 %	0 %	50 %	0 %	31983607
2024	NC_004851	ACA	2	6	102164	102169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983607
2025	NC_004851	CG	3	6	102173	102178	0 %	0 %	50 %	50 %	31983607
2026	NC_004851	CAC	2	6	102182	102187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983607
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2029	NC_004851	GTC	2	6	102347	102352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983607
2030	NC_004851	CGAAC	2	10	102365	102374	40 %	0 %	20 %	40 %	31983607
2031	NC_004851	GCTCCT	2	12	102380	102391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	31983607
2032	NC_004851	GA	4	8	102400	102407	50 %	0 %	50 %	0 %	31983607
2033	NC_004851	GAAT	2	8	102410	102417	50 %	25 %	25 %	0 %	31983607
2034	NC_004851	GCGA	2	8	102465	102472	25 %	0 %	50 %	25 %	31983607
2035	NC_004851	CAG	2	6	102557	102562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983607
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2037	NC_004851	TTG	2	6	102801	102806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_004851	C	6	6	102883	102888	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2039	NC_004851	GAG	2	6	102945	102950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_004851	ATAA	2	8	102958	102965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_004851	CAT	2	6	103005	103010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_004851	GGA	2	6	103140	103145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_004851	CTG	2	6	103155	103160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_004851	CT	3	6	103227	103232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_004851	TATCTT	2	12	103343	103354	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2046	NC_004851	TGG	2	6	103357	103362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_004851	AGA	2	6	103397	103402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_004851	GCAG	2	8	103406	103413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2049	NC_004851	AT	3	6	103516	103521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_004851	ACA	2	6	103545	103550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_004851	TGAA	2	8	103554	103561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_004851	AGC	2	6	103590	103595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_004851	TAAG	2	8	103649	103656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_004851	TGG	2	6	103659	103664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_004851	CTAT	2	8	103677	103684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2056	NC_004851	TCGG	2	8	103694	103701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2057	NC_004851	A	6	6	103746	103751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_004851	GGT	2	6	103766	103771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_004851	TGCTGA	2	12	103871	103882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2060	NC_004851	TAA	2	6	103897	103902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_004851	GTT	2	6	103921	103926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_004851	GACG	2	8	103932	103939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2063	NC_004851	TGA	2	6	103940	103945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_004851	GTTC	2	8	103979	103986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2065	NC_004851	TAG	2	6	104018	104023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_004851	TGC	2	6	104048	104053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_004851	TCG	2	6	104060	104065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2074	NC_004851	TGC	2	6	104278	104283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404014
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2089	NC_004851	TG	3	6	105003	105008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_004851	GAT	2	6	105079	105084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2092	NC_004851	TTTAT	2	10	105122	105131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_004851	AAAT	2	8	105237	105244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_004851	TAA	2	6	105252	105257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_004851	TTATAA	2	12	105285	105296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_004851	AAT	2	6	105297	105302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_004851	AT	3	6	105369	105374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_004851	T	6	6	105384	105389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_004851	TGG	2	6	105414	105419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_004851	T	6	6	105421	105426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_004851	A	8	8	105441	105448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_004851	AGT	2	6	105452	105457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_004851	CAT	2	6	105556	105561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_004851	CAG	2	6	105638	105643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_004851	TAT	2	6	105753	105758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2107	NC_004851	TGTTT	2	10	105855	105864	0 %	80 %	20 %	0 %	31983531
2108	NC_004851	TGTT	2	8	105893	105900	0 %	75 %	25 %	0 %	31983531
2109	NC_004851	TCTTT	2	10	105907	105916	0 %	80 %	0 %	20 %	31983531
2110	NC_004851	AAAT	2	8	105941	105948	75 %	25 %	0 %	0 %	31983531
2111	NC_004851	ATG	2	6	106000	106005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983531
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2113	NC_004851	AT	3	6	106023	106028	50 %	50 %	0 %	0 %	31983531
2114	NC_004851	TTC	2	6	106062	106067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983531
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2117	NC_004851	AAGTT	2	10	106153	106162	40 %	40 %	20 %	0 %	31983531
2118	NC_004851	ATT	2	6	106186	106191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983531
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2121	NC_004851	T	6	6	106251	106256	0 %	100 %	0 %	0 %	31983531
2122	NC_004851	ATGCT	2	10	106321	106330	20 %	40 %	20 %	20 %	31983531
2123	NC_004851	AT	4	8	106379	106386	50 %	50 %	0 %	0 %	31983531
2124	NC_004851	AT	3	6	106422	106427	50 %	50 %	0 %	0 %	31983531
2125	NC_004851	GAA	2	6	106497	106502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983531
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2128	NC_004851	T	6	6	106577	106582	0 %	100 %	0 %	0 %	31983531
2129	NC_004851	TTA	2	6	106645	106650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983531
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2258	NC_004851	CAA	2	6	112018	112023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983588
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2263	NC_004851	GA	3	6	112157	112162	50 %	0 %	50 %	0 %	31983588
2264	NC_004851	T	6	6	112182	112187	0 %	100 %	0 %	0 %	31983588
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