MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004851	TCA	2	6	76359	76364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983676
1502	NC_004851	CGG	2	6	76469	76474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983676
1503	NC_004851	CTT	2	6	76475	76480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983676
1504	NC_004851	GC	3	6	76499	76504	0 %	0 %	50 %	50 %	31983676
1505	NC_004851	TCC	2	6	76510	76515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983676
1506	NC_004851	GCCG	2	8	76517	76524	0 %	0 %	50 %	50 %	31983676
1507	NC_004851	T	7	7	76525	76531	0 %	100 %	0 %	0 %	31983676
1508	NC_004851	TCC	2	6	76556	76561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983676
1509	NC_004851	CGT	2	6	76595	76600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1510	NC_004851	GAC	2	6	76783	76788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1511	NC_004851	AGA	2	6	76810	76815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983676
1512	NC_004851	GGC	2	6	76841	76846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983676
1513	NC_004851	CAG	2	6	76850	76855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1514	NC_004851	CAG	2	6	76886	76891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1515	NC_004851	T	6	6	77007	77012	0 %	100 %	0 %	0 %	31983676
1516	NC_004851	GGCA	2	8	77023	77030	25 %	0 %	50 %	25 %	31983676
1517	NC_004851	CCGC	2	8	77166	77173	0 %	0 %	25 %	75 %	31983676
1518	NC_004851	AGGA	2	8	77178	77185	50 %	0 %	50 %	0 %	31983676
1519	NC_004851	TGGT	2	8	77196	77203	0 %	50 %	50 %	0 %	31983676
1520	NC_004851	CAC	3	9	77239	77247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983676
1521	NC_004851	ACG	2	6	77295	77300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_004851	AGG	2	6	77381	77386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_004851	ATT	2	6	77430	77435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004851	TG	3	6	77501	77506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_004851	GCC	2	6	77570	77575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_004851	TTC	2	6	77746	77751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_004851	ATG	2	6	77817	77822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004851	ATT	2	6	77826	77831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_004851	CAGAC	2	10	77851	77860	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1530	NC_004851	CAC	2	6	77897	77902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_004851	ATA	2	6	77906	77911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_004851	TTC	2	6	77926	77931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983552
1533	NC_004851	T	8	8	77956	77963	0 %	100 %	0 %	0 %	31983552
1534	NC_004851	TTC	2	6	77982	77987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983552
1535	NC_004851	T	6	6	78004	78009	0 %	100 %	0 %	0 %	31983552
1536	NC_004851	ATT	2	6	78010	78015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983552
1537	NC_004851	TAAT	2	8	78062	78069	50 %	50 %	0 %	0 %	31983552
1538	NC_004851	CTG	2	6	78092	78097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983552
1539	NC_004851	AAT	2	6	78159	78164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983552
1540	NC_004851	ACAA	2	8	78193	78200	75 %	0 %	0 %	25 %	31983552
1541	NC_004851	T	6	6	78243	78248	0 %	100 %	0 %	0 %	31983552
1542	NC_004851	AAGTT	2	10	78253	78262	40 %	40 %	20 %	0 %	31983552
1543	NC_004851	ATT	2	6	78312	78317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983552
1544	NC_004851	GAG	2	6	78390	78395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983552
1545	NC_004851	G	6	6	78397	78402	0 %	0 %	100 %	0 %	31983552
1546	NC_004851	TCTG	2	8	78476	78483	0 %	50 %	25 %	25 %	31983552
1547	NC_004851	TCA	2	6	78490	78495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983552
1548	NC_004851	TAA	3	9	78496	78504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983552
1549	NC_004851	CT	3	6	78548	78553	0 %	50 %	0 %	50 %	31983552
1550	NC_004851	TCC	2	6	78630	78635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983552
1551	NC_004851	TTCC	2	8	78638	78645	0 %	50 %	0 %	50 %	31983552
1552	NC_004851	TAG	2	6	78651	78656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983552
1553	NC_004851	ATAA	2	8	78879	78886	75 %	25 %	0 %	0 %	31983552
1554	NC_004851	GGA	2	6	78924	78929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983552
1555	NC_004851	TTG	2	6	78935	78940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983552
1556	NC_004851	TGTC	2	8	78946	78953	0 %	50 %	25 %	25 %	31983552
1557	NC_004851	TCA	2	6	79006	79011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983552
1558	NC_004851	CAGT	2	8	79025	79032	25 %	25 %	25 %	25 %	31983552
1559	NC_004851	T	7	7	79032	79038	0 %	100 %	0 %	0 %	31983552
1560	NC_004851	C	7	7	79121	79127	0 %	0 %	0 %	100 %	31983552
1561	NC_004851	T	6	6	79199	79204	0 %	100 %	0 %	0 %	31983552
1562	NC_004851	TCATT	2	10	79217	79226	20 %	60 %	0 %	20 %	31983552
1563	NC_004851	A	6	6	79235	79240	100 %	0 %	0 %	0 %	31983552
1564	NC_004851	CAA	2	6	79265	79270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983552
1565	NC_004851	AATA	2	8	79271	79278	75 %	25 %	0 %	0 %	31983552
1566	NC_004851	TCT	2	6	79303	79308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983552
1567	NC_004851	TCAC	2	8	79309	79316	25 %	25 %	0 %	50 %	31983552
1568	NC_004851	TGA	2	6	79354	79359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983552
1569	NC_004851	ACT	2	6	79374	79379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983552
1570	NC_004851	GACA	2	8	79418	79425	50 %	0 %	25 %	25 %	31983552
1571	NC_004851	TAA	2	6	79467	79472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983552
1572	NC_004851	A	6	6	79471	79476	100 %	0 %	0 %	0 %	31983552
1573	NC_004851	CTC	2	6	79477	79482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983552
1574	NC_004851	TTTA	2	8	79551	79558	25 %	75 %	0 %	0 %	31983552
1575	NC_004851	TA	3	6	79614	79619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_004851	GTT	2	6	79655	79660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_004851	GAT	2	6	79678	79683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_004851	G	6	6	79730	79735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_004851	G	6	6	79761	79766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_004851	TAT	2	6	79851	79856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_004851	AT	3	6	79884	79889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_004851	AT	3	6	79943	79948	50 %	50 %	0 %	0 %	31983558
1583	NC_004851	AAT	2	6	79976	79981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983558
1584	NC_004851	T	7	7	80046	80052	0 %	100 %	0 %	0 %	31983558
1585	NC_004851	ATA	2	6	80199	80204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983558
1586	NC_004851	TA	4	8	80203	80210	50 %	50 %	0 %	0 %	31983558
1587	NC_004851	GAAA	2	8	80240	80247	75 %	0 %	25 %	0 %	31983558
1588	NC_004851	T	7	7	80265	80271	0 %	100 %	0 %	0 %	31983558
1589	NC_004851	TTC	2	6	80293	80298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983558
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1592	NC_004851	T	6	6	80444	80449	0 %	100 %	0 %	0 %	31983558
1593	NC_004851	TAA	2	6	80490	80495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983558
1594	NC_004851	CTT	2	6	80592	80597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983558
1595	NC_004851	A	6	6	80643	80648	100 %	0 %	0 %	0 %	31983558
1596	NC_004851	AT	3	6	80687	80692	50 %	50 %	0 %	0 %	31983558
1597	NC_004851	T	6	6	80770	80775	0 %	100 %	0 %	0 %	31983558
1598	NC_004851	A	6	6	80800	80805	100 %	0 %	0 %	0 %	31983558
1599	NC_004851	T	8	8	80826	80833	0 %	100 %	0 %	0 %	31983558
1600	NC_004851	ATC	2	6	80836	80841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983558
1601	NC_004851	TAA	2	6	80961	80966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983558
1602	NC_004851	AT	3	6	81027	81032	50 %	50 %	0 %	0 %	31983558
1603	NC_004851	GA	3	6	81135	81140	50 %	0 %	50 %	0 %	31983558
1604	NC_004851	CTA	2	6	81146	81151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983558
1605	NC_004851	TGC	2	6	81160	81165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983558
1606	NC_004851	TAA	2	6	81189	81194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983558
1607	NC_004851	T	7	7	81215	81221	0 %	100 %	0 %	0 %	31983558
1608	NC_004851	TGT	2	6	81236	81241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983558
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1610	NC_004851	AT	3	6	81342	81347	50 %	50 %	0 %	0 %	31983558
1611	NC_004851	TAAT	2	8	81379	81386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004851	TA	4	8	81433	81440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004851	TAT	2	6	81469	81474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_004851	T	6	6	81548	81553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_004851	ATT	2	6	81559	81564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_004851	TAA	2	6	81574	81579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_004851	A	7	7	81618	81624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_004851	GAT	2	6	81696	81701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_004851	T	6	6	81701	81706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_004851	T	6	6	81739	81744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_004851	AT	3	6	81764	81769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004851	ATT	2	6	81771	81776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_004851	T	7	7	81789	81795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_004851	TG	3	6	81855	81860	0 %	50 %	50 %	0 %	31983733
1625	NC_004851	GCC	2	6	81990	81995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983733
1626	NC_004851	TGG	2	6	82032	82037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983733
1627	NC_004851	GGCG	2	8	82072	82079	0 %	0 %	75 %	25 %	31983733
1628	NC_004851	CGTTC	2	10	82144	82153	0 %	40 %	20 %	40 %	56404010
1629	NC_004851	GA	3	6	82263	82268	50 %	0 %	50 %	0 %	56404010
1630	NC_004851	ACAAG	2	10	82313	82322	60 %	0 %	20 %	20 %	56404010
1631	NC_004851	TTC	2	6	82332	82337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404010
1632	NC_004851	TTC	2	6	82353	82358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404010
1633	NC_004851	CCAG	2	8	82376	82383	25 %	0 %	25 %	50 %	56404010
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1635	NC_004851	CGTAAA	2	12	82544	82555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56404011
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