MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004851	ATTT	2	8	49123	49130	25 %	75 %	0 %	0 %	31983556
1002	NC_004851	CAA	2	6	49137	49142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983556
1003	NC_004851	AAT	2	6	49238	49243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004851	TGTA	2	8	49266	49273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004851	TGT	2	6	49296	49301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004851	ATT	2	6	49357	49362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_004851	TAT	2	6	49370	49375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004851	AT	4	8	49386	49393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004851	GATA	2	8	49429	49436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004851	ATG	2	6	49470	49475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_004851	A	6	6	49483	49488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004851	CAA	2	6	49522	49527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983727
1013	NC_004851	TGC	2	6	49539	49544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983727
1014	NC_004851	ATG	2	6	49564	49569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983727
1015	NC_004851	TTCCAT	2	12	49594	49605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	31983727
1016	NC_004851	TCCT	2	8	49612	49619	0 %	50 %	0 %	50 %	31983727
1017	NC_004851	GTG	2	6	49637	49642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983727
1018	NC_004851	A	6	6	49840	49845	100 %	0 %	0 %	0 %	31983631
1019	NC_004851	GTGAT	2	10	49886	49895	20 %	40 %	40 %	0 %	31983631
1020	NC_004851	GCTG	2	8	49952	49959	0 %	25 %	50 %	25 %	31983631
1021	NC_004851	GGA	2	6	49982	49987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983631
1022	NC_004851	TCT	2	6	50037	50042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983631
1023	NC_004851	CTG	2	6	50047	50052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983631
1024	NC_004851	AATCTG	2	12	50167	50178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31983631
1025	NC_004851	ACA	2	6	50181	50186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983631
1026	NC_004851	CAC	2	6	50461	50466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983630
1027	NC_004851	A	6	6	50585	50590	100 %	0 %	0 %	0 %	31983630
1028	NC_004851	CTG	2	6	50599	50604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004851	CAT	2	6	50695	50700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_004851	GAA	2	6	50742	50747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004851	GTT	2	6	50807	50812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983600
1032	NC_004851	TGG	2	6	50857	50862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983600
1033	NC_004851	TTAC	2	8	50995	51002	25 %	50 %	0 %	25 %	31983600
1034	NC_004851	TCA	2	6	51037	51042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983600
1035	NC_004851	GTAT	2	8	51182	51189	25 %	50 %	25 %	0 %	31983600
1036	NC_004851	AC	3	6	51199	51204	50 %	0 %	0 %	50 %	31983600
1037	NC_004851	GTGG	2	8	51362	51369	0 %	25 %	75 %	0 %	31983600
1038	NC_004851	CGA	2	6	51384	51389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983600
1039	NC_004851	GCAGAA	2	12	51420	51431	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	31983600
1040	NC_004851	TTA	2	6	51437	51442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983600
1041	NC_004851	GAT	2	6	51459	51464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983600
1042	NC_004851	GCA	2	6	51528	51533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983728
1043	NC_004851	TGAA	2	8	51560	51567	50 %	25 %	25 %	0 %	31983728
1044	NC_004851	TGG	2	6	51572	51577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983728
1045	NC_004851	AGA	2	6	51578	51583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983728
1046	NC_004851	A	6	6	51598	51603	100 %	0 %	0 %	0 %	31983728
1047	NC_004851	TTA	2	6	51657	51662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983728
1048	NC_004851	TGA	2	6	51666	51671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983728
1049	NC_004851	GGCGGA	2	12	51678	51689	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	31983728
1050	NC_004851	CAG	2	6	51698	51703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983728
1051	NC_004851	GTCT	2	8	51721	51728	0 %	50 %	25 %	25 %	31983728
1052	NC_004851	TTC	2	6	51748	51753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983728
1053	NC_004851	CTG	2	6	51784	51789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983728
1054	NC_004851	CTG	2	6	51895	51900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983728
1055	NC_004851	ATAA	2	8	51923	51930	75 %	25 %	0 %	0 %	31983728
1056	NC_004851	CGT	2	6	51992	51997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983694
1057	NC_004851	AGG	2	6	52005	52010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983694
1058	NC_004851	TTCA	2	8	52049	52056	25 %	50 %	0 %	25 %	31983694
1059	NC_004851	CTG	2	6	52133	52138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983694
1060	NC_004851	GGC	2	6	52171	52176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983694
1061	NC_004851	GTA	2	6	52193	52198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983694
1062	NC_004851	GCT	2	6	52285	52290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983694
1063	NC_004851	GTG	2	6	52319	52324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983694
1064	NC_004851	GAT	2	6	52325	52330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983694
1065	NC_004851	GCA	2	6	52446	52451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983694
1066	NC_004851	TGGCGG	2	12	52470	52481	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	31983694
1067	NC_004851	CAG	2	6	52482	52487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983694
1068	NC_004851	AT	3	6	52507	52512	50 %	50 %	0 %	0 %	31983694
1069	NC_004851	GGC	2	6	52591	52596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_004851	TCA	2	6	52867	52872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983545
1071	NC_004851	TC	3	6	52906	52911	0 %	50 %	0 %	50 %	31983545
1072	NC_004851	CAG	2	6	52946	52951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1073	NC_004851	GTC	2	6	52994	52999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1074	NC_004851	GGT	2	6	53167	53172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983545
1075	NC_004851	ATG	2	6	53264	53269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983545
1076	NC_004851	CCAC	2	8	53334	53341	25 %	0 %	0 %	75 %	31983545
1077	NC_004851	T	6	6	53349	53354	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
1078	NC_004851	GCT	2	6	53369	53374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1079	NC_004851	TAAA	2	8	53410	53417	75 %	25 %	0 %	0 %	31983545
1080	NC_004851	CATT	2	8	53506	53513	25 %	50 %	0 %	25 %	31983545
1081	NC_004851	AAGG	2	8	53591	53598	50 %	0 %	50 %	0 %	31983545
1082	NC_004851	CAT	2	6	53689	53694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983545
1083	NC_004851	T	6	6	53698	53703	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
1084	NC_004851	CTG	2	6	53741	53746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1085	NC_004851	TCA	2	6	53769	53774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983545
1086	NC_004851	CTGG	2	8	53814	53821	0 %	25 %	50 %	25 %	31983545
1087	NC_004851	TAT	2	6	53848	53853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983545
1088	NC_004851	TGT	2	6	53899	53904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983545
1089	NC_004851	TAT	2	6	53926	53931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983545
1090	NC_004851	GCATCA	2	12	54153	54164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31983545
1091	NC_004851	TGT	2	6	54275	54280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983545
1092	NC_004851	GCT	2	6	54425	54430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1093	NC_004851	ACC	2	6	54506	54511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983545
1094	NC_004851	TC	3	6	54518	54523	0 %	50 %	0 %	50 %	31983545
1095	NC_004851	GAT	2	6	54537	54542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983545
1096	NC_004851	AGA	2	6	54619	54624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983545
1097	NC_004851	TGG	2	6	54694	54699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983545
1098	NC_004851	CTGG	2	8	54800	54807	0 %	25 %	50 %	25 %	31983545
1099	NC_004851	AAG	2	6	54808	54813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983545
1100	NC_004851	TCG	2	6	54814	54819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1101	NC_004851	CTT	2	6	54866	54871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983545
1102	NC_004851	GGCT	2	8	54987	54994	0 %	25 %	50 %	25 %	31983545
1103	NC_004851	T	6	6	55006	55011	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
1104	NC_004851	TTA	2	6	55035	55040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983545
1105	NC_004851	CTG	2	6	55068	55073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1106	NC_004851	GAA	2	6	55088	55093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983545
1107	NC_004851	ATA	2	6	55145	55150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983545
1108	NC_004851	CTC	2	6	55165	55170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983545
1109	NC_004851	C	6	6	55172	55177	0 %	0 %	0 %	100 %	31983545
1110	NC_004851	T	6	6	55253	55258	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
1111	NC_004851	ATG	2	6	55275	55280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983545
1112	NC_004851	GCC	2	6	55293	55298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983545
1113	NC_004851	ATT	2	6	55319	55324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983545
1114	NC_004851	TCC	2	6	55343	55348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983545
1115	NC_004851	GAC	2	6	55411	55416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1116	NC_004851	CTG	2	6	55469	55474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983545
1117	NC_004851	C	6	6	55632	55637	0 %	0 %	0 %	100 %	31983545
1118	NC_004851	ATT	2	6	55736	55741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983545
1119	NC_004851	AGG	2	6	55752	55757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983545
1120	NC_004851	T	6	6	55758	55763	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
1121	NC_004851	CTTT	2	8	55783	55790	0 %	75 %	0 %	25 %	31983545
1122	NC_004851	CAT	2	6	55846	55851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983545
1123	NC_004851	GTG	2	6	55938	55943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983545
1124	NC_004851	TAGT	2	8	55962	55969	25 %	50 %	25 %	0 %	31983545
1125	NC_004851	T	8	8	56000	56007	0 %	100 %	0 %	0 %	31983545
1126	NC_004851	G	6	6	56029	56034	0 %	0 %	100 %	0 %	31983545
1127	NC_004851	ATC	2	6	56112	56117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983545
1128	NC_004851	GTT	2	6	56123	56128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983545
1129	NC_004851	GC	3	6	56140	56145	0 %	0 %	50 %	50 %	31983545
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1391	NC_004851	AACAT	2	10	70358	70367	60 %	20 %	0 %	20 %	31983652
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