MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004851	GTTCG	2	10	23456	23465	0 %	40 %	40 %	20 %	31983605
502	NC_004851	GAC	2	6	23478	23483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983605
503	NC_004851	TGT	2	6	23565	23570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983605
504	NC_004851	CTT	2	6	23635	23640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983605
505	NC_004851	TGG	2	6	23641	23646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983605
506	NC_004851	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	31983605
507	NC_004851	TC	3	6	23766	23771	0 %	50 %	0 %	50 %	31983605
508	NC_004851	TAA	2	6	23821	23826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983605
509	NC_004851	GAA	2	6	23912	23917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404001
510	NC_004851	TTC	2	6	23920	23925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404001
511	NC_004851	CCG	2	6	23949	23954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56404001
512	NC_004851	CAG	2	6	24048	24053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56404001
513	NC_004851	TTC	2	6	24068	24073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404001
514	NC_004851	TCA	2	6	24127	24132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404001
515	NC_004851	TGA	2	6	24173	24178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404001
516	NC_004851	CTG	2	6	24205	24210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404001
517	NC_004851	CTT	2	6	24224	24229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404001
518	NC_004851	TGTTT	2	10	24255	24264	0 %	80 %	20 %	0 %	56404001
519	NC_004851	T	6	6	24292	24297	0 %	100 %	0 %	0 %	56404001
520	NC_004851	T	7	7	24344	24350	0 %	100 %	0 %	0 %	56404001
521	NC_004851	CTTT	2	8	24352	24359	0 %	75 %	0 %	25 %	56404001
522	NC_004851	AT	3	6	24379	24384	50 %	50 %	0 %	0 %	56404001
523	NC_004851	CCCAG	2	10	24485	24494	20 %	0 %	20 %	60 %	56404001
524	NC_004851	AAT	2	6	24543	24548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404001
525	NC_004851	G	6	6	24561	24566	0 %	0 %	100 %	0 %	56404001
526	NC_004851	TGT	2	6	24598	24603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404001
527	NC_004851	ATT	2	6	24612	24617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404001
528	NC_004851	AAC	2	6	24633	24638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56404001
529	NC_004851	CA	3	6	24668	24673	50 %	0 %	0 %	50 %	56404001
530	NC_004851	GAA	2	6	24686	24691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404001
531	NC_004851	ATG	2	6	24693	24698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404001
532	NC_004851	GGGA	2	8	24704	24711	25 %	0 %	75 %	0 %	56404001
533	NC_004851	A	6	6	24871	24876	100 %	0 %	0 %	0 %	56404001
534	NC_004851	CATC	2	8	24929	24936	25 %	25 %	0 %	50 %	56404001
535	NC_004851	TGA	2	6	24955	24960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404001
536	NC_004851	GAA	2	6	24981	24986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404001
537	NC_004851	TTG	2	6	25032	25037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404001
538	NC_004851	AAGGT	2	10	25115	25124	40 %	20 %	40 %	0 %	56404002
539	NC_004851	GCTG	2	8	25235	25242	0 %	25 %	50 %	25 %	56404002
540	NC_004851	AGC	2	6	25310	25315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56404002
541	NC_004851	A	6	6	25342	25347	100 %	0 %	0 %	0 %	56404002
542	NC_004851	C	8	8	25392	25399	0 %	0 %	0 %	100 %	56404002
543	NC_004851	CAT	2	6	25402	25407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404002
544	NC_004851	TGA	2	6	25447	25452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404002
545	NC_004851	AGCGC	2	10	25515	25524	20 %	0 %	40 %	40 %	31983610
546	NC_004851	GAA	2	6	25593	25598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983610
547	NC_004851	TCA	2	6	25610	25615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983610
548	NC_004851	CGG	2	6	25654	25659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983610
549	NC_004851	CTCA	2	8	25730	25737	25 %	25 %	0 %	50 %	31983610
550	NC_004851	CAG	3	9	25858	25866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983610
551	NC_004851	ACG	2	6	25914	25919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983610
552	NC_004851	C	6	6	25939	25944	0 %	0 %	0 %	100 %	31983610
553	NC_004851	TCA	2	6	25951	25956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983610
554	NC_004851	TGA	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983610
555	NC_004851	TCAG	2	8	25981	25988	25 %	25 %	25 %	25 %	31983610
556	NC_004851	GAA	2	6	25989	25994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983610
557	NC_004851	TTC	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983610
558	NC_004851	GCA	2	6	26100	26105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983610
559	NC_004851	TCAAA	2	10	26153	26162	60 %	20 %	0 %	20 %	31983610
560	NC_004851	CAGA	2	8	26180	26187	50 %	0 %	25 %	25 %	31983610
561	NC_004851	TGG	2	6	26253	26258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983684
562	NC_004851	CGT	2	6	26284	26289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983684
563	NC_004851	ACA	2	6	26294	26299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983684
564	NC_004851	ACA	2	6	26317	26322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983684
565	NC_004851	GT	3	6	26335	26340	0 %	50 %	50 %	0 %	31983684
566	NC_004851	ATG	2	6	26365	26370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983684
567	NC_004851	AAC	2	6	26511	26516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983684
568	NC_004851	CCGT	2	8	26676	26683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
569	NC_004851	GAA	2	6	26725	26730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004851	TGT	2	6	26734	26739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004851	GTG	3	9	26747	26755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004851	ATT	2	6	26762	26767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004851	ATTC	2	8	26819	26826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_004851	GAT	2	6	26828	26833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004851	TAA	2	6	26834	26839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004851	GC	3	6	26849	26854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_004851	TGCA	2	8	26886	26893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_004851	T	8	8	26911	26918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004851	TAA	2	6	26920	26925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004851	TAAG	2	8	26974	26981	50 %	25 %	25 %	0 %	31983549
581	NC_004851	T	6	6	27061	27066	0 %	100 %	0 %	0 %	31983549
582	NC_004851	CTG	2	6	27085	27090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983549
583	NC_004851	CG	3	6	27112	27117	0 %	0 %	50 %	50 %	31983549
584	NC_004851	CAG	2	6	27178	27183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983549
585	NC_004851	GT	3	6	27310	27315	0 %	50 %	50 %	0 %	31983549
586	NC_004851	AGT	2	6	27327	27332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983549
587	NC_004851	CTG	2	6	27369	27374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983549
588	NC_004851	AGA	2	6	27377	27382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983549
589	NC_004851	TCA	2	6	27417	27422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983549
590	NC_004851	ACT	2	6	27439	27444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983549
591	NC_004851	ACCGC	2	10	27471	27480	20 %	0 %	20 %	60 %	31983549
592	NC_004851	TTATG	2	10	27554	27563	20 %	60 %	20 %	0 %	31983549
593	NC_004851	GAC	2	6	27576	27581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983549
594	NC_004851	GAG	2	6	27615	27620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983549
595	NC_004851	ACAAA	2	10	27632	27641	80 %	0 %	0 %	20 %	31983549
596	NC_004851	ATT	2	6	27663	27668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983549
597	NC_004851	TGC	2	6	27746	27751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983549
598	NC_004851	GCC	2	6	27776	27781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983549
599	NC_004851	TTCCA	2	10	27795	27804	20 %	40 %	0 %	40 %	31983549
600	NC_004851	ATT	2	6	27843	27848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983549
601	NC_004851	GGAT	2	8	27854	27861	25 %	25 %	50 %	0 %	31983549
602	NC_004851	GGT	2	6	27957	27962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983549
603	NC_004851	GA	3	6	28002	28007	50 %	0 %	50 %	0 %	31983549
604	NC_004851	GCG	2	6	28009	28014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983549
605	NC_004851	GTG	2	6	28063	28068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983549
606	NC_004851	GCA	2	6	28092	28097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983549
607	NC_004851	ACT	2	6	28147	28152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983549
608	NC_004851	ACCG	2	8	28170	28177	25 %	0 %	25 %	50 %	31983548
609	NC_004851	AAT	2	6	28211	28216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983548
610	NC_004851	GAA	2	6	28220	28225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983548
611	NC_004851	ACAG	2	8	28351	28358	50 %	0 %	25 %	25 %	31983548
612	NC_004851	ACA	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983548
613	NC_004851	CGT	2	6	28469	28474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983548
614	NC_004851	GCA	2	6	28478	28483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983548
615	NC_004851	GAT	2	6	28523	28528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983548
616	NC_004851	ATA	2	6	28587	28592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983548
617	NC_004851	AG	3	6	28661	28666	50 %	0 %	50 %	0 %	31983548
618	NC_004851	AGC	2	6	28702	28707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983548
619	NC_004851	AT	3	6	28812	28817	50 %	50 %	0 %	0 %	31983548
620	NC_004851	TGA	2	6	28822	28827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983548
621	NC_004851	GAA	2	6	28834	28839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983548
622	NC_004851	TTA	2	6	28860	28865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983548
623	NC_004851	CTG	2	6	28866	28871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983548
624	NC_004851	TAT	2	6	28906	28911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983548
625	NC_004851	ACGT	2	8	29032	29039	25 %	25 %	25 %	25 %	31983548
626	NC_004851	TTA	2	6	29200	29205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004851	T	8	8	29209	29216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004851	TCT	2	6	29255	29260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_004851	ATG	2	6	29350	29355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404003
630	NC_004851	AAC	2	6	29366	29371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56404003
631	NC_004851	CTGG	2	8	29509	29516	0 %	25 %	50 %	25 %	56404003
632	NC_004851	ATG	2	6	29598	29603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404004
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635	NC_004851	GGTT	2	8	29769	29776	0 %	50 %	50 %	0 %	56404004
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649	NC_004851	TTC	2	6	30519	30524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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752	NC_004851	T	6	6	36455	36460	0 %	100 %	0 %	0 %	31983722
753	NC_004851	ATA	2	6	36494	36499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983722
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761	NC_004851	CAA	2	6	36736	36741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56404005
762	NC_004851	AGA	2	6	36770	36775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404005
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