MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 93684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004741	ATC	2	6	145652	145657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061698
3002	NC_004741	TTCA	2	8	145673	145680	25 %	50 %	0 %	25 %	30061698
3003	NC_004741	TAA	2	6	145699	145704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061698
3004	NC_004741	GTT	2	6	145786	145791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061698
3005	NC_004741	CCG	2	6	145792	145797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061698
3006	NC_004741	GC	3	6	145839	145844	0 %	0 %	50 %	50 %	30061698
3007	NC_004741	CGC	2	6	145990	145995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061698
3008	NC_004741	GTTT	2	8	146125	146132	0 %	75 %	25 %	0 %	30061698
3009	NC_004741	TCC	2	6	146145	146150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061698
3010	NC_004741	GAC	3	9	146219	146227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061698
3011	NC_004741	TCG	2	6	146250	146255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061698
3012	NC_004741	TAG	2	6	146290	146295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061698
3013	NC_004741	GGC	2	6	146329	146334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061698
3014	NC_004741	GCA	2	6	146347	146352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061698
3015	NC_004741	TTC	2	6	146404	146409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061699
3016	NC_004741	CG	3	6	146458	146463	0 %	0 %	50 %	50 %	30061699
3017	NC_004741	CCG	2	6	146513	146518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061699
3018	NC_004741	CGT	2	6	146532	146537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061699
3019	NC_004741	ACCAAT	2	12	146575	146586	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	30061699
3020	NC_004741	CCAGCA	2	12	146643	146654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	30061699
3021	NC_004741	AGT	2	6	146693	146698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061699
3022	NC_004741	TCGC	2	8	146702	146709	0 %	25 %	25 %	50 %	30061699
3023	NC_004741	ACTG	2	8	146753	146760	25 %	25 %	25 %	25 %	30061699
3024	NC_004741	GCG	2	6	146882	146887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061699
3025	NC_004741	GCAG	2	8	146943	146950	25 %	0 %	50 %	25 %	30061699
3026	NC_004741	CGG	2	6	146970	146975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061699
3027	NC_004741	TCA	2	6	147077	147082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061699
3028	NC_004741	TGAAG	2	10	147155	147164	40 %	20 %	40 %	0 %	30061699
3029	NC_004741	TGG	2	6	147168	147173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061699
3030	NC_004741	ATG	2	6	147199	147204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_004741	TGG	2	6	147235	147240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_004741	ACCGC	2	10	147260	147269	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3033	NC_004741	GAT	2	6	147272	147277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_004741	GCGGT	2	10	147279	147288	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_004741	TTA	2	6	147293	147298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_004741	TGG	2	6	147322	147327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_004741	TGT	2	6	147366	147371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004741	CTC	2	6	147427	147432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_004741	TGT	2	6	147434	147439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_004741	TGC	2	6	147557	147562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_004741	TTG	2	6	147616	147621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_004741	TGC	2	6	147627	147632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_004741	ATG	2	6	147652	147657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_004741	TTCCAT	2	12	147682	147693	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	30061700
3045	NC_004741	TCCT	2	8	147700	147707	0 %	50 %	0 %	50 %	30061700
3046	NC_004741	GTG	2	6	147725	147730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061700
3047	NC_004741	A	6	6	147928	147933	100 %	0 %	0 %	0 %	30061700
3048	NC_004741	GTGAT	2	10	147974	147983	20 %	40 %	40 %	0 %	30061701
3049	NC_004741	GCTG	2	8	148040	148047	0 %	25 %	50 %	25 %	30061701
3050	NC_004741	GGA	2	6	148070	148075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061701
3051	NC_004741	TCT	2	6	148125	148130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061701
3052	NC_004741	CTG	2	6	148135	148140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061701
3053	NC_004741	TGGC	2	8	148173	148180	0 %	25 %	50 %	25 %	30061701
3054	NC_004741	AATCTG	2	12	148255	148266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	30061701
3055	NC_004741	ACA	2	6	148269	148274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061701
3056	NC_004741	TAT	2	6	148424	148429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_004741	TTA	2	6	148460	148465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004741	AG	3	6	148471	148476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_004741	ATAA	2	8	148513	148520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004741	TGTA	2	8	148552	148559	25 %	50 %	25 %	0 %	30061702
3061	NC_004741	TTC	2	6	148640	148645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061702
3062	NC_004741	GCGT	2	8	148719	148726	0 %	25 %	50 %	25 %	30061702
3063	NC_004741	GGGC	2	8	148803	148810	0 %	0 %	75 %	25 %	30061702
3064	NC_004741	CGG	2	6	148827	148832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061702
3065	NC_004741	GAA	2	6	148886	148891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061702
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3067	NC_004741	TGC	2	6	148971	148976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061702
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3070	NC_004741	ACG	3	9	149046	149054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486546
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3072	NC_004741	TGG	2	6	149100	149105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486546
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3074	NC_004741	CAG	2	6	149220	149225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486546
3075	NC_004741	GAC	2	6	149246	149251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486546
3076	NC_004741	GCAACT	2	12	149261	149272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161486546
3077	NC_004741	CGT	2	6	149292	149297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486546
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3080	NC_004741	TCT	2	6	149399	149404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161486546
3081	NC_004741	CAG	2	6	149415	149420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486546
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3085	NC_004741	CA	3	6	149594	149599	50 %	0 %	0 %	50 %	161486546
3086	NC_004741	TTC	2	6	149649	149654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161486546
3087	NC_004741	CAG	2	6	149682	149687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486546
3088	NC_004741	GCGAG	2	10	149692	149701	20 %	0 %	60 %	20 %	161486546
3089	NC_004741	GGC	2	6	149745	149750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486546
3090	NC_004741	CG	3	6	149760	149765	0 %	0 %	50 %	50 %	161486546
3091	NC_004741	ACC	2	6	149847	149852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161486546
3092	NC_004741	ACGG	2	8	149862	149869	25 %	0 %	50 %	25 %	161486546
3093	NC_004741	TCT	2	6	149926	149931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161486546
3094	NC_004741	TGT	2	6	149948	149953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486546
3095	NC_004741	GCA	2	6	149957	149962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486546
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3098	NC_004741	GGCGT	2	10	150130	150139	0 %	20 %	60 %	20 %	161486546
3099	NC_004741	CGC	3	9	150191	150199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486546
3100	NC_004741	CCAG	2	8	150203	150210	25 %	0 %	25 %	50 %	161486546
3101	NC_004741	TTG	2	6	150226	150231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486546
3102	NC_004741	TGC	2	6	150286	150291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486546
3103	NC_004741	CAT	2	6	150418	150423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_004741	A	7	7	150431	150437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_004741	CGG	2	6	150505	150510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486545
3106	NC_004741	CTGA	2	8	150532	150539	25 %	25 %	25 %	25 %	161486545
3107	NC_004741	CTGC	2	8	150577	150584	0 %	25 %	25 %	50 %	161486545
3108	NC_004741	ATCAG	2	10	150768	150777	40 %	20 %	20 %	20 %	161486545
3109	NC_004741	ATC	2	6	150812	150817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486545
3110	NC_004741	AAC	2	6	150843	150848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161486545
3111	NC_004741	ATGA	2	8	150860	150867	50 %	25 %	25 %	0 %	161486545
3112	NC_004741	TCG	2	6	150891	150896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486545
3113	NC_004741	AAT	2	6	150902	150907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486545
3114	NC_004741	GCA	2	6	150913	150918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486545
3115	NC_004741	TGC	2	6	150942	150947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486545
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3117	NC_004741	ATG	2	6	150980	150985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486545
3118	NC_004741	CGT	2	6	151003	151008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486545
3119	NC_004741	TAA	2	6	151053	151058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486545
3120	NC_004741	CGT	2	6	151102	151107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486545
3121	NC_004741	TCT	2	6	151215	151220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161486545
3122	NC_004741	CCAG	2	8	151228	151235	25 %	0 %	25 %	50 %	161486545
3123	NC_004741	GCG	2	6	151275	151280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486545
3124	NC_004741	AG	3	6	151284	151289	50 %	0 %	50 %	0 %	161486545
3125	NC_004741	TG	3	6	151338	151343	0 %	50 %	50 %	0 %	161486545
3126	NC_004741	A	6	6	151362	151367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_004741	TTAC	2	8	152039	152046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3231	NC_004741	A	6	6	156264	156269	100 %	0 %	0 %	0 %	30061709
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3242	NC_004741	TGG	2	6	156672	156677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061709
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3245	NC_004741	AGCG	2	8	156836	156843	25 %	0 %	50 %	25 %	30061709
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3247	NC_004741	CG	3	6	156892	156897	0 %	0 %	50 %	50 %	30061709
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3369	NC_004741	GCC	2	6	162848	162853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061713
3370	NC_004741	GAT	2	6	162883	162888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061713
3371	NC_004741	TTG	2	6	162902	162907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061713
3372	NC_004741	GCT	2	6	162925	162930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3373	NC_004741	TGG	2	6	162951	162956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713
3374	NC_004741	CGA	2	6	162999	163004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3375	NC_004741	GC	3	6	163023	163028	0 %	0 %	50 %	50 %	30061713
3376	NC_004741	CAC	2	6	163045	163050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061713
3377	NC_004741	TGC	2	6	163087	163092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
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3380	NC_004741	CAAT	2	8	163206	163213	50 %	25 %	0 %	25 %	30061713
3381	NC_004741	CAT	2	6	163232	163237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061713
3382	NC_004741	TGC	2	6	163347	163352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3383	NC_004741	TGA	2	6	163381	163386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061713
3384	NC_004741	TGGCG	2	10	163387	163396	0 %	20 %	60 %	20 %	30061713
3385	NC_004741	GGC	2	6	163432	163437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
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3387	NC_004741	GCT	2	6	163465	163470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
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3390	NC_004741	GCG	2	6	163540	163545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
3391	NC_004741	CTG	2	6	163547	163552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3392	NC_004741	CGT	2	6	163569	163574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
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3399	NC_004741	GCG	2	6	163791	163796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
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3401	NC_004741	TGG	3	9	163815	163823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713
3402	NC_004741	GGC	2	6	163915	163920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
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3405	NC_004741	TGGTG	2	10	164029	164038	0 %	40 %	60 %	0 %	30061713
3406	NC_004741	GTT	2	6	164077	164082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061713
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3408	NC_004741	GCG	2	6	164102	164107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
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3421	NC_004741	CA	3	6	164553	164558	50 %	0 %	0 %	50 %	30061713
3422	NC_004741	TGG	2	6	164574	164579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713
3423	NC_004741	CTG	2	6	164588	164593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3424	NC_004741	TTCCA	2	10	164628	164637	20 %	40 %	0 %	40 %	30061713
3425	NC_004741	CGG	2	6	164643	164648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
3426	NC_004741	GCT	2	6	164650	164655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061713
3427	NC_004741	GCA	2	6	164773	164778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
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3433	NC_004741	CAG	2	6	165021	165026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3434	NC_004741	TTCA	2	8	165087	165094	25 %	50 %	0 %	25 %	30061714
3435	NC_004741	ACG	2	6	165189	165194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3436	NC_004741	ACC	2	6	165195	165200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061714
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3441	NC_004741	TCG	2	6	165343	165348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061714
3442	NC_004741	GCG	2	6	165383	165388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061714
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3444	NC_004741	CGA	2	6	165419	165424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061714
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3449	NC_004741	TCGG	2	8	165760	165767	0 %	25 %	50 %	25 %	30061714
3450	NC_004741	CGG	2	6	165791	165796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061714
3451	NC_004741	GCC	2	6	165936	165941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061714
3452	NC_004741	CG	3	6	165992	165997	0 %	0 %	50 %	50 %	30061714
3453	NC_004741	GCT	2	6	166061	166066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3454	NC_004741	GCT	2	6	166111	166116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3458	NC_004741	GGC	2	6	166366	166371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3459	NC_004741	GTC	2	6	166373	166378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3460	NC_004741	GCTG	2	8	166393	166400	0 %	25 %	50 %	25 %	30061715
3461	NC_004741	CTG	2	6	166464	166469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
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3470	NC_004741	CGC	2	6	166827	166832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061715
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3472	NC_004741	TATT	2	8	166905	166912	25 %	75 %	0 %	0 %	30061715
3473	NC_004741	TTGA	2	8	166964	166971	25 %	50 %	25 %	0 %	30061715
3474	NC_004741	TAT	2	6	167029	167034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061715
3475	NC_004741	TAA	2	6	167059	167064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061715
3476	NC_004741	TGC	2	6	167088	167093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
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3478	NC_004741	G	6	6	167134	167139	0 %	0 %	100 %	0 %	30061715
3479	NC_004741	TG	3	6	167154	167159	0 %	50 %	50 %	0 %	30061715
3480	NC_004741	GCG	2	6	167193	167198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3481	NC_004741	TCG	2	6	167262	167267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061715
3482	NC_004741	ACC	2	6	167279	167284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061715
3483	NC_004741	GC	3	6	167304	167309	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3484	NC_004741	GGC	2	6	167446	167451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3485	NC_004741	CG	3	6	167459	167464	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3486	NC_004741	TTCTGG	2	12	167481	167492	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	30061715
3487	NC_004741	ATT	2	6	167528	167533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061715
3488	NC_004741	CGG	2	6	167569	167574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061715
3489	NC_004741	GC	3	6	167600	167605	0 %	0 %	50 %	50 %	30061715
3490	NC_004741	CAGC	2	8	167655	167662	25 %	0 %	25 %	50 %	30061715
3491	NC_004741	ATT	3	9	167704	167712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_004741	TGA	2	6	167761	167766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061716
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