MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 93684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_004741	GCG	2	6	47606	47611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061614
1004	NC_004741	GCA	2	6	47678	47683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061614
1005	NC_004741	CTG	2	6	47693	47698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061614
1006	NC_004741	TCT	2	6	47723	47728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061614
1007	NC_004741	GGA	2	6	47731	47736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061614
1008	NC_004741	GAA	2	6	47762	47767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061614
1009	NC_004741	CG	3	6	47772	47777	0 %	0 %	50 %	50 %	30061614
1010	NC_004741	TGG	2	6	47847	47852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061614
1011	NC_004741	GGAT	2	8	47928	47935	25 %	25 %	50 %	0 %	30061614
1012	NC_004741	GCG	2	6	47954	47959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061614
1013	NC_004741	AACC	2	8	47998	48005	50 %	0 %	0 %	50 %	30061614
1014	NC_004741	ATT	2	6	48050	48055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061614
1015	NC_004741	GCCCGC	2	12	48056	48067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061614
1016	NC_004741	CAGG	2	8	48095	48102	25 %	0 %	50 %	25 %	30061614
1017	NC_004741	CCG	2	6	48214	48219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061614
1018	NC_004741	TGG	2	6	48234	48239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061614
1019	NC_004741	CG	3	6	48275	48280	0 %	0 %	50 %	50 %	30061614
1020	NC_004741	ATC	2	6	48317	48322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061614
1021	NC_004741	TGGC	2	8	48361	48368	0 %	25 %	50 %	25 %	30061614
1022	NC_004741	AGA	2	6	48376	48381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061614
1023	NC_004741	GAAAC	2	10	48416	48425	60 %	0 %	20 %	20 %	30061614
1024	NC_004741	TAA	2	6	48434	48439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061614
1025	NC_004741	TGTT	2	8	48471	48478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004741	GCG	2	6	48495	48500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_004741	CAG	2	6	48527	48532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_004741	CAT	2	6	48552	48557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004741	CGA	2	6	48570	48575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_004741	T	7	7	48606	48612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004741	GCG	2	6	48642	48647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061615
1032	NC_004741	CCTG	2	8	48695	48702	0 %	25 %	25 %	50 %	30061615
1033	NC_004741	TAAA	2	8	48733	48740	75 %	25 %	0 %	0 %	30061615
1034	NC_004741	GCC	2	6	48754	48759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061615
1035	NC_004741	AATC	2	8	48769	48776	50 %	25 %	0 %	25 %	30061615
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1042	NC_004741	CGC	3	9	49190	49198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061616
1043	NC_004741	GCAG	2	8	49258	49265	25 %	0 %	50 %	25 %	30061616
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1056	NC_004741	CAG	2	6	49814	49819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061616
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1058	NC_004741	GCA	2	6	49966	49971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061616
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1060	NC_004741	AATG	2	8	50035	50042	50 %	25 %	25 %	0 %	30061617
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1064	NC_004741	AC	3	6	50387	50392	50 %	0 %	0 %	50 %	30061617
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1069	NC_004741	GTG	3	9	50682	50690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061618
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1081	NC_004741	AAT	2	6	51540	51545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061619
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1099	NC_004741	CAG	2	6	52570	52575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061620
1100	NC_004741	GTCA	2	8	52607	52614	25 %	25 %	25 %	25 %	30061620
1101	NC_004741	CAG	2	6	52631	52636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061620
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1105	NC_004741	CCCCA	2	10	52806	52815	20 %	0 %	0 %	80 %	30061620
1106	NC_004741	GCC	2	6	52820	52825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061620
1107	NC_004741	CTG	2	6	52835	52840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061620
1108	NC_004741	GC	4	8	52905	52912	0 %	0 %	50 %	50 %	30061620
1109	NC_004741	CGT	2	6	52999	53004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061620
1110	NC_004741	CTG	2	6	53018	53023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061620
1111	NC_004741	CGA	2	6	53061	53066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061620
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1113	NC_004741	ATC	2	6	53097	53102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061620
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1118	NC_004741	GCGTC	2	10	53311	53320	0 %	20 %	40 %	40 %	30061620
1119	NC_004741	GCT	2	6	53329	53334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061620
1120	NC_004741	ACG	2	6	53397	53402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061620
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1122	NC_004741	G	6	6	53440	53445	0 %	0 %	100 %	0 %	30061620
1123	NC_004741	AGC	2	6	53484	53489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061620
1124	NC_004741	TTC	2	6	53499	53504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061620
1125	NC_004741	CAA	2	6	53552	53557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_004741	GCA	2	6	53594	53599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061621
1127	NC_004741	TGT	2	6	53680	53685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061621
1128	NC_004741	AGC	2	6	53738	53743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061621
1129	NC_004741	GCTT	2	8	53776	53783	0 %	50 %	25 %	25 %	30061621
1130	NC_004741	GTA	3	9	53799	53807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061621
1131	NC_004741	CAA	2	6	53813	53818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061621
1132	NC_004741	CTG	2	6	53842	53847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061621
1133	NC_004741	ACCT	2	8	53856	53863	25 %	25 %	0 %	50 %	30061621
1134	NC_004741	CAG	2	6	53888	53893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061621
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1152	NC_004741	TGCGT	2	10	54844	54853	0 %	40 %	40 %	20 %	30061621
1153	NC_004741	ACG	2	6	54984	54989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061621
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1158	NC_004741	AGT	2	6	55193	55198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061621
1159	NC_004741	TGG	3	9	55199	55207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061621
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1170	NC_004741	TCG	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061621
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1198	NC_004741	GCG	2	6	57053	57058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1233	NC_004741	ATA	2	6	58501	58506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061624
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1246	NC_004741	CAG	2	6	59685	59690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1247	NC_004741	CAG	3	9	59742	59750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
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1249	NC_004741	ACC	2	6	59842	59847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061624
1250	NC_004741	ACG	2	6	59895	59900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
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1252	NC_004741	GCA	2	6	60017	60022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1253	NC_004741	CAG	2	6	60077	60082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1254	NC_004741	AG	3	6	60087	60092	50 %	0 %	50 %	0 %	30061624
1255	NC_004741	ATC	2	6	60109	60114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061624
1256	NC_004741	CAGC	2	8	60149	60156	25 %	0 %	25 %	50 %	30061624
1257	NC_004741	CG	3	6	60161	60166	0 %	0 %	50 %	50 %	30061624
1258	NC_004741	GGC	2	6	60173	60178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061624
1259	NC_004741	CAT	2	6	60185	60190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061624
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1261	NC_004741	TCT	2	6	60448	60453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061624
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1266	NC_004741	GTG	2	6	60741	60746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_004741	T	8	8	60832	60839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_004741	GTG	2	6	60955	60960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061625
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1283	NC_004741	TCAA	2	8	61590	61597	50 %	25 %	0 %	25 %	30061625
1284	NC_004741	TGA	2	6	61620	61625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061625
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1312	NC_004741	A	6	6	63208	63213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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