MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 93684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004741	TTCA	2	8	296796	296803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_004741	CCA	2	6	296900	296905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061844
6003	NC_004741	AAC	2	6	296991	296996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061844
6004	NC_004741	AGC	2	6	297006	297011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061844
6005	NC_004741	AGC	3	9	297055	297063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061844
6006	NC_004741	GGC	2	6	297084	297089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061844
6007	NC_004741	T	6	6	297127	297132	0 %	100 %	0 %	0 %	30061844
6008	NC_004741	ACA	2	6	297139	297144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061844
6009	NC_004741	G	7	7	297284	297290	0 %	0 %	100 %	0 %	30061844
6010	NC_004741	T	6	6	297380	297385	0 %	100 %	0 %	0 %	30061844
6011	NC_004741	GC	4	8	297388	297395	0 %	0 %	50 %	50 %	30061844
6012	NC_004741	GAT	2	6	297413	297418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061844
6013	NC_004741	CGC	2	6	297443	297448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_004741	CGG	2	6	297452	297457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_004741	CCTTT	2	10	297561	297570	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6016	NC_004741	TCG	2	6	297612	297617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061845
6017	NC_004741	TTA	2	6	297618	297623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061845
6018	NC_004741	G	6	6	297630	297635	0 %	0 %	100 %	0 %	30061845
6019	NC_004741	TCG	2	6	297666	297671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061845
6020	NC_004741	TCT	2	6	297678	297683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061845
6021	NC_004741	ACC	2	6	297685	297690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061845
6022	NC_004741	ATT	2	6	297715	297720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061845
6023	NC_004741	TGCAT	2	10	297779	297788	20 %	40 %	20 %	20 %	30061845
6024	NC_004741	GAT	3	9	297808	297816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061845
6025	NC_004741	CAT	2	6	297931	297936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061845
6026	NC_004741	TTATAT	2	12	297942	297953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061845
6027	NC_004741	GTGA	2	8	297985	297992	25 %	25 %	50 %	0 %	30061845
6028	NC_004741	CG	3	6	298023	298028	0 %	0 %	50 %	50 %	30061845
6029	NC_004741	CGC	2	6	298178	298183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_004741	CGC	2	6	298279	298284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_004741	AAC	2	6	298394	298399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061846
6032	NC_004741	GCA	2	6	298413	298418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6033	NC_004741	GCG	2	6	298431	298436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061846
6034	NC_004741	CAG	2	6	298441	298446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6035	NC_004741	CGC	2	6	298462	298467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6036	NC_004741	CAG	2	6	298588	298593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6037	NC_004741	ATT	2	6	298606	298611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061846
6038	NC_004741	CGAA	2	8	298640	298647	50 %	0 %	25 %	25 %	30061846
6039	NC_004741	TGC	2	6	298659	298664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6040	NC_004741	GCC	2	6	298688	298693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6041	NC_004741	CAG	2	6	298780	298785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6042	NC_004741	TCC	2	6	298835	298840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061846
6043	NC_004741	CGA	2	6	298858	298863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6044	NC_004741	TCA	2	6	298889	298894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061846
6045	NC_004741	CCG	2	6	299109	299114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6046	NC_004741	TCA	2	6	299126	299131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061846
6047	NC_004741	TGA	2	6	299145	299150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061846
6048	NC_004741	CTGG	2	8	299161	299168	0 %	25 %	50 %	25 %	30061846
6049	NC_004741	GCA	3	9	299205	299213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6050	NC_004741	CGC	2	6	299244	299249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6051	NC_004741	CCA	2	6	299286	299291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061846
6052	NC_004741	CCA	2	6	299295	299300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061846
6053	NC_004741	TGT	2	6	299360	299365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061846
6054	NC_004741	CGC	2	6	299422	299427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6055	NC_004741	CAC	2	6	299509	299514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061846
6056	NC_004741	TGG	2	6	299573	299578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061846
6057	NC_004741	CGC	3	9	299629	299637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6058	NC_004741	AGC	2	6	299645	299650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6059	NC_004741	AGGGA	2	10	299651	299660	40 %	0 %	60 %	0 %	30061846
6060	NC_004741	CCA	2	6	299667	299672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061846
6061	NC_004741	TCA	2	6	299688	299693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061846
6062	NC_004741	GGC	2	6	299710	299715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061846
6063	NC_004741	CGC	3	9	299754	299762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061846
6064	NC_004741	ATC	3	9	299780	299788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061846
6065	NC_004741	TGCGCC	2	12	299879	299890	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	30061846
6066	NC_004741	GAC	2	6	300001	300006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061846
6067	NC_004741	CGC	2	6	300058	300063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061847
6068	NC_004741	GGT	2	6	300089	300094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061847
6069	NC_004741	TAAA	2	8	300108	300115	75 %	25 %	0 %	0 %	30061847
6070	NC_004741	A	6	6	300173	300178	100 %	0 %	0 %	0 %	30061847
6071	NC_004741	GCT	2	6	300205	300210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061847
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6073	NC_004741	TGGAGA	2	12	300294	300305	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	30061847
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6075	NC_004741	GC	3	6	300372	300377	0 %	0 %	50 %	50 %	30061847
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6078	NC_004741	CGATG	2	10	300466	300475	20 %	20 %	40 %	20 %	30061847
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6081	NC_004741	TCG	2	6	300535	300540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061847
6082	NC_004741	TGC	2	6	300606	300611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061847
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6087	NC_004741	CTATTG	2	12	300937	300948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	30061848
6088	NC_004741	G	6	6	300967	300972	0 %	0 %	100 %	0 %	30061848
6089	NC_004741	CG	3	6	300995	301000	0 %	0 %	50 %	50 %	30061848
6090	NC_004741	CGTA	2	8	301010	301017	25 %	25 %	25 %	25 %	30061848
6091	NC_004741	AAG	2	6	301093	301098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061848
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6094	NC_004741	CGG	2	6	301417	301422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061848
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6100	NC_004741	CGC	2	6	301821	301826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061848
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6102	NC_004741	TGG	2	6	301846	301851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061848
6103	NC_004741	ATG	2	6	301907	301912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061848
6104	NC_004741	TAT	2	6	301918	301923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_004741	ATT	2	6	301940	301945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_004741	TTCT	2	8	302050	302057	0 %	75 %	0 %	25 %	30061849
6107	NC_004741	AAT	2	6	302058	302063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061849
6108	NC_004741	TGCT	2	8	302116	302123	0 %	50 %	25 %	25 %	30061849
6109	NC_004741	GC	3	6	302151	302156	0 %	0 %	50 %	50 %	30061849
6110	NC_004741	TGC	2	6	302168	302173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061849
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6113	NC_004741	CAAAA	2	10	302269	302278	80 %	0 %	0 %	20 %	30061850
6114	NC_004741	CAG	2	6	302298	302303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061850
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6120	NC_004741	TGA	2	6	302536	302541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061850
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6122	NC_004741	TAT	2	6	302662	302667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061851
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6124	NC_004741	ATT	2	6	302760	302765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061851
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6167	NC_004741	TGT	2	6	304511	304516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6269	NC_004741	AT	3	6	310295	310300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6359	NC_004741	T	6	6	314785	314790	0 %	100 %	0 %	0 %	30061863
6360	NC_004741	AC	3	6	314816	314821	50 %	0 %	0 %	50 %	30061863
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6362	NC_004741	TTTC	2	8	315007	315014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6363	NC_004741	TCCT	2	8	315154	315161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6364	NC_004741	TAA	2	6	315187	315192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061864
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6367	NC_004741	AT	3	6	315436	315441	50 %	50 %	0 %	0 %	30061864
6368	NC_004741	A	7	7	315443	315449	100 %	0 %	0 %	0 %	30061864
6369	NC_004741	ACA	2	6	315508	315513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6370	NC_004741	TTA	2	6	315562	315567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6371	NC_004741	CAGA	2	8	315591	315598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6372	NC_004741	TGA	2	6	315607	315612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6373	NC_004741	CGG	2	6	315671	315676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061865
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