MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 93684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_004741	CGGTG	2	10	3150878	3150887	0 %	20 %	60 %	20 %	30064373
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64004	NC_004741	CGTCAC	2	12	3151224	3151235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	30064374
64005	NC_004741	GTC	2	6	3151350	3151355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064374
64006	NC_004741	TCC	2	6	3151410	3151415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30064374
64007	NC_004741	CTGCT	2	10	3151455	3151464	0 %	40 %	20 %	40 %	30064374
64008	NC_004741	TGCAC	2	10	3151476	3151485	20 %	20 %	20 %	40 %	30064374
64009	NC_004741	CTG	2	6	3151505	3151510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064374
64010	NC_004741	T	6	6	3151515	3151520	0 %	100 %	0 %	0 %	30064374
64011	NC_004741	TTA	2	6	3151526	3151531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30064374
64012	NC_004741	AAC	2	6	3151576	3151581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64013	NC_004741	A	7	7	3151592	3151598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64014	NC_004741	ACA	2	6	3151627	3151632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64015	NC_004741	GCA	2	6	3151643	3151648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64016	NC_004741	A	6	6	3151670	3151675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64017	NC_004741	AGA	2	6	3151692	3151697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64018	NC_004741	GTC	2	6	3151772	3151777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064375
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64020	NC_004741	ATGG	2	8	3151843	3151850	25 %	25 %	50 %	0 %	30064375
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64022	NC_004741	CG	3	6	3151911	3151916	0 %	0 %	50 %	50 %	30064375
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64033	NC_004741	TGA	2	6	3152573	3152578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064376
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64068	NC_004741	A	6	6	3154297	3154302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64119	NC_004741	GCA	2	6	3157352	3157357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064381
64120	NC_004741	TGC	2	6	3157438	3157443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064381
64121	NC_004741	CCG	2	6	3157502	3157507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064381
64122	NC_004741	ACC	2	6	3157513	3157518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064381
64123	NC_004741	GCA	2	6	3157526	3157531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064381
64124	NC_004741	C	6	6	3157564	3157569	0 %	0 %	0 %	100 %	30064381
64125	NC_004741	CGC	2	6	3157598	3157603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064381
64126	NC_004741	CAG	2	6	3157626	3157631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064381
64127	NC_004741	CGG	2	6	3157653	3157658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064381
64128	NC_004741	ATC	2	6	3157672	3157677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064381
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64130	NC_004741	T	6	6	3157708	3157713	0 %	100 %	0 %	0 %	30064381
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64132	NC_004741	TAAA	2	8	3157758	3157765	75 %	25 %	0 %	0 %	30064381
64133	NC_004741	GT	3	6	3157813	3157818	0 %	50 %	50 %	0 %	30064382
64134	NC_004741	GGT	2	6	3157838	3157843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064382
64135	NC_004741	CA	3	6	3157931	3157936	50 %	0 %	0 %	50 %	30064382
64136	NC_004741	CAG	2	6	3157952	3157957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064382
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64138	NC_004741	TGA	2	6	3157989	3157994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064382
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64140	NC_004741	GCA	4	12	3158116	3158127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064382
64141	NC_004741	GCTCA	2	10	3158186	3158195	20 %	20 %	20 %	40 %	30064382
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64143	NC_004741	CCAG	2	8	3158574	3158581	25 %	0 %	25 %	50 %	30064382
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64147	NC_004741	CTG	2	6	3158771	3158776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064383
64148	NC_004741	AC	3	6	3158783	3158788	50 %	0 %	0 %	50 %	30064383
64149	NC_004741	CCA	2	6	3158794	3158799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064383
64150	NC_004741	CAT	2	6	3159017	3159022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064383
64151	NC_004741	GT	3	6	3159037	3159042	0 %	50 %	50 %	0 %	30064383
64152	NC_004741	T	6	6	3159066	3159071	0 %	100 %	0 %	0 %	30064383
64153	NC_004741	TGA	2	6	3159078	3159083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064383
64154	NC_004741	TGCAGC	2	12	3159084	3159095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	30064384
64155	NC_004741	TCA	2	6	3159198	3159203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064384
64156	NC_004741	CCA	2	6	3159247	3159252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064384
64157	NC_004741	C	6	6	3159276	3159281	0 %	0 %	0 %	100 %	30064384
64158	NC_004741	ATC	2	6	3159387	3159392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064384
64159	NC_004741	TCA	2	6	3159471	3159476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064384
64160	NC_004741	GCG	2	6	3159504	3159509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064384
64161	NC_004741	CCG	2	6	3159530	3159535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064384
64162	NC_004741	A	7	7	3159595	3159601	100 %	0 %	0 %	0 %	30064384
64163	NC_004741	AAT	2	6	3159626	3159631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064384
64164	NC_004741	AAT	2	6	3159834	3159839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64165	NC_004741	CAC	2	6	3159870	3159875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64166	NC_004741	GAA	2	6	3159889	3159894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64167	NC_004741	AGCA	2	8	3159975	3159982	50 %	0 %	25 %	25 %	30064385
64168	NC_004741	GCC	2	6	3160013	3160018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064385
64169	NC_004741	TGC	2	6	3160027	3160032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064385
64170	NC_004741	A	6	6	3160038	3160043	100 %	0 %	0 %	0 %	30064385
64171	NC_004741	GC	3	6	3160052	3160057	0 %	0 %	50 %	50 %	30064385
64172	NC_004741	CGCGA	2	10	3160115	3160124	20 %	0 %	40 %	40 %	30064385
64173	NC_004741	GCGT	2	8	3160195	3160202	0 %	25 %	50 %	25 %	30064385
64174	NC_004741	AGC	2	6	3160219	3160224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064385
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64178	NC_004741	CGAA	2	8	3160449	3160456	50 %	0 %	25 %	25 %	30064385
64179	NC_004741	TAA	2	6	3160468	3160473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064385
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64186	NC_004741	TTG	2	6	3160878	3160883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064385
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64195	NC_004741	CAAG	2	8	3161098	3161105	50 %	0 %	25 %	25 %	30064385
64196	NC_004741	CGT	2	6	3161305	3161310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064385
64197	NC_004741	CGCA	2	8	3161323	3161330	25 %	0 %	25 %	50 %	30064385
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64202	NC_004741	GCTG	3	12	3161614	3161625	0 %	25 %	50 %	25 %	30064386
64203	NC_004741	TGA	2	6	3161635	3161640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064386
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64205	NC_004741	GAC	2	6	3161666	3161671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486437
64206	NC_004741	ACC	2	6	3161708	3161713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161486437
64207	NC_004741	ACA	2	6	3161718	3161723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161486437
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64209	NC_004741	AGCA	2	8	3161808	3161815	50 %	0 %	25 %	25 %	161486437
64210	NC_004741	TGGCA	2	10	3161827	3161836	20 %	20 %	40 %	20 %	161486437
64211	NC_004741	ATG	2	6	3161903	3161908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486437
64212	NC_004741	GCG	3	9	3161922	3161930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486437
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64214	NC_004741	CGACG	2	10	3161998	3162007	20 %	0 %	40 %	40 %	161486437
64215	NC_004741	CAGCC	2	10	3162024	3162033	20 %	0 %	20 %	60 %	161486437
64216	NC_004741	ACC	2	6	3162083	3162088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161486437
64217	NC_004741	CAAA	2	8	3162127	3162134	75 %	0 %	0 %	25 %	161486437
64218	NC_004741	TAC	2	6	3162301	3162306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064388
64219	NC_004741	GAA	2	6	3162337	3162342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064388
64220	NC_004741	CCG	2	6	3162347	3162352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064388
64221	NC_004741	GTG	2	6	3162376	3162381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064388
64222	NC_004741	TGA	2	6	3162407	3162412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064388
64223	NC_004741	AC	3	6	3162432	3162437	50 %	0 %	0 %	50 %	30064388
64224	NC_004741	GGC	2	6	3162570	3162575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064388
64225	NC_004741	CTGG	2	8	3162591	3162598	0 %	25 %	50 %	25 %	30064388
64226	NC_004741	GATC	2	8	3162666	3162673	25 %	25 %	25 %	25 %	30064388
64227	NC_004741	TGC	2	6	3162710	3162715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064388
64228	NC_004741	CTG	2	6	3162723	3162728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064388
64229	NC_004741	CGA	2	6	3162816	3162821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064388
64230	NC_004741	TGC	2	6	3162908	3162913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064388
64231	NC_004741	CCA	2	6	3162926	3162931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064388
64232	NC_004741	GCTG	2	8	3162953	3162960	0 %	25 %	50 %	25 %	30064388
64233	NC_004741	CAA	2	6	3162987	3162992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064388
64234	NC_004741	CTG	2	6	3163039	3163044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064388
64235	NC_004741	GAT	2	6	3163063	3163068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064388
64236	NC_004741	TCT	2	6	3163103	3163108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064388
64237	NC_004741	AGC	2	6	3163158	3163163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064388
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64276	NC_004741	AT	3	6	3165390	3165395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64277	NC_004741	ATA	2	6	3165408	3165413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64340	NC_004741	TCCT	2	8	3168405	3168412	0 %	50 %	0 %	50 %	30064395
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64343	NC_004741	GTGAT	2	10	3168679	3168688	20 %	40 %	40 %	0 %	30064395
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64348	NC_004741	TGGC	2	8	3168878	3168885	0 %	25 %	50 %	25 %	30064396
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64353	NC_004741	TGA	2	6	3169189	3169194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064397
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