MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004631	CTG	2	6	187316	187321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4002	NC_004631	ATT	2	6	187348	187353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140704
4003	NC_004631	CTG	2	6	187375	187380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4004	NC_004631	CTGT	2	8	187396	187403	0 %	50 %	25 %	25 %	29140704
4005	NC_004631	TGC	2	6	187505	187510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4006	NC_004631	CGC	2	6	187524	187529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140704
4007	NC_004631	TGG	2	6	187536	187541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140704
4008	NC_004631	TAT	2	6	187563	187568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140704
4009	NC_004631	TGC	2	6	187604	187609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4010	NC_004631	ATT	2	6	187657	187662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140704
4011	NC_004631	ACC	2	6	187705	187710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140704
4012	NC_004631	ATG	2	6	187711	187716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140704
4013	NC_004631	ATC	3	9	187720	187728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140704
4014	NC_004631	ATG	2	6	187729	187734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140704
4015	NC_004631	GTC	3	9	187735	187743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4016	NC_004631	TGG	2	6	187745	187750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140704
4017	NC_004631	TGA	2	6	187751	187756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140704
4018	NC_004631	TCG	2	6	187757	187762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4019	NC_004631	TGC	2	6	187776	187781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4020	NC_004631	AAC	2	6	187784	187789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140704
4021	NC_004631	GGT	2	6	187795	187800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140704
4022	NC_004631	CTG	2	6	187849	187854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4023	NC_004631	CGG	2	6	187879	187884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140704
4024	NC_004631	CGT	2	6	187915	187920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4025	NC_004631	ACC	2	6	187943	187948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140704
4026	NC_004631	TGA	2	6	187971	187976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140704
4027	NC_004631	TGG	2	6	188010	188015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140704
4028	NC_004631	GTC	2	6	188018	188023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140704
4029	NC_004631	CGG	2	6	188028	188033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140704
4030	NC_004631	GAGC	2	8	188103	188110	25 %	0 %	50 %	25 %	29140704
4031	NC_004631	CATC	2	8	188130	188137	25 %	25 %	0 %	50 %	29140704
4032	NC_004631	TGGC	2	8	188258	188265	0 %	25 %	50 %	25 %	29140704
4033	NC_004631	GCC	2	6	188492	188497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140704
4034	NC_004631	CA	3	6	188567	188572	50 %	0 %	0 %	50 %	29140704
4035	NC_004631	TC	3	6	188612	188617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_004631	TGCC	2	8	188647	188654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_004631	T	6	6	188824	188829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_004631	T	6	6	188837	188842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_004631	CTA	2	6	188907	188912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_004631	ACT	2	6	188913	188918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_004631	CAA	2	6	188950	188955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_004631	GAG	2	6	188982	188987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_004631	TCG	2	6	188991	188996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_004631	AGA	2	6	189001	189006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140705
4045	NC_004631	TGC	2	6	189031	189036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4046	NC_004631	GCT	2	6	189091	189096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4047	NC_004631	GAA	3	9	189116	189124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140705
4048	NC_004631	TCC	2	6	189154	189159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140705
4049	NC_004631	GCT	2	6	189200	189205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4050	NC_004631	ACC	2	6	189221	189226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140705
4051	NC_004631	CTG	2	6	189260	189265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4052	NC_004631	ACA	2	6	189285	189290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140705
4053	NC_004631	CTG	2	6	189362	189367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4054	NC_004631	ACG	2	6	189384	189389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4055	NC_004631	AGA	2	6	189391	189396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140705
4056	NC_004631	CCG	2	6	189473	189478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140705
4057	NC_004631	A	6	6	189486	189491	100 %	0 %	0 %	0 %	29140705
4058	NC_004631	TCACCG	2	12	189492	189503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29140705
4059	NC_004631	CGA	2	6	189532	189537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4060	NC_004631	TC	4	8	189538	189545	0 %	50 %	0 %	50 %	29140705
4061	NC_004631	CAAA	2	8	189655	189662	75 %	0 %	0 %	25 %	29140705
4062	NC_004631	A	6	6	189677	189682	100 %	0 %	0 %	0 %	29140705
4063	NC_004631	GTG	2	6	189710	189715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140705
4064	NC_004631	TTC	2	6	189724	189729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140705
4065	NC_004631	GCG	3	9	189798	189806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4066	NC_004631	CGG	2	6	189817	189822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4067	NC_004631	TCT	2	6	189837	189842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140705
4068	NC_004631	GC	3	6	189864	189869	0 %	0 %	50 %	50 %	29140705
4069	NC_004631	CTG	2	6	189965	189970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4070	NC_004631	CGA	2	6	190003	190008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4071	NC_004631	ACC	2	6	190055	190060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140705
4072	NC_004631	AGC	2	6	190127	190132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4073	NC_004631	TC	3	6	190140	190145	0 %	50 %	0 %	50 %	29140705
4074	NC_004631	GGTC	2	8	190159	190166	0 %	25 %	50 %	25 %	29140705
4075	NC_004631	GCG	2	6	190173	190178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4076	NC_004631	TAC	2	6	190240	190245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140705
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4080	NC_004631	CAC	2	6	190364	190369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140705
4081	NC_004631	CGG	2	6	190396	190401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4082	NC_004631	TGC	3	9	190452	190460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4083	NC_004631	CGG	2	6	190477	190482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4084	NC_004631	CGG	2	6	190521	190526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4085	NC_004631	TCTGG	2	10	190529	190538	0 %	40 %	40 %	20 %	29140705
4086	NC_004631	GCC	2	6	190547	190552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140705
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4090	NC_004631	CTG	2	6	190871	190876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4091	NC_004631	GAT	2	6	190882	190887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140705
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4093	NC_004631	CGT	2	6	190922	190927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
4094	NC_004631	TGGC	2	8	190946	190953	0 %	25 %	50 %	25 %	29140705
4095	NC_004631	GCT	2	6	190963	190968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
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4100	NC_004631	GCT	2	6	191161	191166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140705
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4103	NC_004631	TAC	2	6	191252	191257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140705
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4106	NC_004631	GGC	2	6	191425	191430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4107	NC_004631	CGG	2	6	191502	191507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140705
4108	NC_004631	TACC	2	8	191512	191519	25 %	25 %	0 %	50 %	29140705
4109	NC_004631	CT	3	6	191540	191545	0 %	50 %	0 %	50 %	29140705
4110	NC_004631	GGC	2	6	191644	191649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_004631	CTG	2	6	191710	191715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_004631	T	7	7	191723	191729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_004631	GCT	2	6	191737	191742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_004631	GGT	2	6	191846	191851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140706
4115	NC_004631	CG	3	6	191915	191920	0 %	0 %	50 %	50 %	29140706
4116	NC_004631	TGGA	2	8	191976	191983	25 %	25 %	50 %	0 %	29140706
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4118	NC_004631	TGA	2	6	191995	192000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140706
4119	NC_004631	TTA	2	6	192053	192058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140706
4120	NC_004631	AG	3	6	192065	192070	50 %	0 %	50 %	0 %	29140706
4121	NC_004631	GGA	2	6	192089	192094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140706
4122	NC_004631	GTC	2	6	192105	192110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140706
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4124	NC_004631	CAC	2	6	192211	192216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4254	NC_004631	GGA	2	6	198155	198160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_004631	CGG	2	6	204403	204408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140718
4375	NC_004631	ACC	2	6	204494	204499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140718
4376	NC_004631	TAT	2	6	204505	204510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140718
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4378	NC_004631	TTTAAC	2	12	204617	204628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29140718
4379	NC_004631	TTA	2	6	204670	204675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140718
4380	NC_004631	CG	4	8	204755	204762	0 %	0 %	50 %	50 %	29140718
4381	NC_004631	CGC	2	6	204785	204790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140718
4382	NC_004631	TGA	2	6	204792	204797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140718
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4398	NC_004631	ATG	2	6	205483	205488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140719
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4404	NC_004631	CTG	2	6	205753	205758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140719
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4413	NC_004631	ACT	2	6	206130	206135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4473	NC_004631	CGT	2	6	209119	209124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140723
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4477	NC_004631	GCGCT	2	10	209264	209273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4478	NC_004631	CGCGT	2	10	209316	209325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4479	NC_004631	TTC	2	6	209365	209370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140724
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4482	NC_004631	CCG	2	6	209474	209479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140724
4483	NC_004631	GCCGAT	2	12	209536	209547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29140724
4484	NC_004631	GCAC	2	8	209595	209602	25 %	0 %	25 %	50 %	29140724
4485	NC_004631	CCAGCA	2	12	209604	209615	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	29140724
4486	NC_004631	GCT	2	6	209627	209632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140724
4487	NC_004631	CAT	2	6	209646	209651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140724
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4489	NC_004631	CGC	2	6	209673	209678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140724
4490	NC_004631	GCC	2	6	209695	209700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140724
4491	NC_004631	CA	3	6	209739	209744	50 %	0 %	0 %	50 %	29140724
4492	NC_004631	CAAC	2	8	209781	209788	50 %	0 %	0 %	50 %	29140724
4493	NC_004631	GCC	2	6	209794	209799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140724
4494	NC_004631	CGCA	2	8	209824	209831	25 %	0 %	25 %	50 %	29140724
4495	NC_004631	GGCGT	2	10	209864	209873	0 %	20 %	60 %	20 %	29140724
4496	NC_004631	AGC	2	6	209897	209902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140724
4497	NC_004631	GC	3	6	209913	209918	0 %	0 %	50 %	50 %	29140724
4498	NC_004631	CG	3	6	209929	209934	0 %	0 %	50 %	50 %	29140724
4499	NC_004631	CAGG	2	8	209964	209971	25 %	0 %	50 %	25 %	29140724
4500	NC_004631	TGG	2	6	210078	210083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140724

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